Family Finder

На сайте ВГД собираются люди, увлеченные генеалогией, историей, геральдикой и т.д. Здесь вы найдете собеседников, экспертов, умелых помощников в поисках предков и родственников. Вам подскажут где искать документы о павших в боях и пропавших без вести, в какой архив обратиться при исследовании родословной своей семьи, помогут определить по старой фотографии принадлежность к воинским частям, ведомствам и чину. ВГД - поиск людей в прошлом, настоящем и будущем!

Misslipa написал:

[q]
А что там в графе SNPs показывает? Число? Если да, то это общее количество одинаковых снипов, которые идут подряд. Эта информация коррелирует с сентиморганами, то есть чем больше число снипов, тем длиннее общий участок и тем ближе/вероятнее родство.
[/q]

Да в этой графе стоит число. Понимаю, что чем больше снипов и сантиморганов, тем лучше, но корреляции я не проследил.
Вот, например, если сравнивать себя с одним случайным совпаденцем:
1) на разных хромосомах может быть одно то же значение сантиморганов, но разное количество совпадающих снипов.
2) на одной и той же хромосоме 2 участка с одинаковыми снипами, но разными сантиморганами.
Если же сравнить себя в браузере хромосом с двумя и более совпаденцами, то также нет связи этих параметров.

Misslipa написал:

[q]
Что касается 22 аутосом, а не 44 - то да, к сожалению, многие провайдеры показывают одну общую хромосому вместо двух. То есть это как бы гибрид, который не разделен на отцовскую и материнскую часть. Поэтому когда есть совпадения, то без анализа непонятно - это по материнской или отцовской линии.
[/q]

Такая общая хромосома вводит в заблуждение. При анализе меня с матерью, на выходе на диаграмме получаю почти 100% общих сегментов, хотя половина досталась от отца.
На некоторых хромосомах пишут SNP poor region. Это у каждого такое? Если да, то всегда на одних и тех же участках? Зависит ли качество от исходного биоматериала?

Misslipa написал:

[q]
К тому же начальные и конечные позиции можно скачать в виде Экселя и использовать уже на других сайтах.
[/q]

Сырые данные уже перекачивал. Начальные и конечные позиции можно ли упорядочивать в Excel? Поскольку в данном файле данные формируются в виде одной графы, где параметры перечисленные через запятую.

Если аутосомный тест сделала женщина и у ней в разделе Matches у совпаденца указано X-Match, то это означает материнскую или отцовскую линию. (ну кроме отца отца). Если же нет X-Match, то это означает всё тоже самое. В чём смысл? Что упустил и как этот параметр тогда полезен?

Nikitoss написал:

[q]
Сырые данные уже перекачивал. Начальные и конечные позиции можно ли упорядочивать в Excel? Поскольку в данном файле данные формируются в виде одной графы, где параметры перечисленные через запятую.
[/q]

Да, можно.

Меню в Excel "Данные" - Команда "Текст по столбцам" - выбирать "Текст с разделителями" дальше всё будет понятно.

Nikitoss написал:

[q]
[/q]

Ну... корреляция не 100%-ная, но общая взаимосвязь присутствует. Я взяла два своих произвольных совпаденца и посмотрела на снипы и сентиморганы наших общих участков (приложила график) - зависимость видна.

А общая хромосома действительно вводит в заблуждение, согласна.
У меня тоже на некоторых участках SNP Poor Region - предполагаю, что это зависит от особенностей хромосом и тестовой политики компании, а не качества биологического материала. У меня, например, большие участки на 13, 14 и 15 хромосомах. У вас?

По поводу X-match: вы на свой вопрос сами и ответили - можно сразу исключить линию отца отца женщины, что сужает поиски.

Кто знает, как происходит разбивка совпадений по вкладкам Paternal (0), Maternal (0), Both (0)? Тест моей матери уже в базе есть.

Temych написал:

[q]
Кто знает, как происходит разбивка совпадений по вкладкам Paternal (0), Maternal (0), Both (0)? Тест моей матери уже в базе есть.
[/q]

У вас присоединен к дереву хотя бы один совпаденец на ФФ? Если у вас мать уже в базе есть, можно ее и присоединить. Только после этого функция заработает.

Misslipa написал:

[q]
У меня, например, большие участки на 13, 14 и 15 хромосомах. У вас?
[/q]

Тоже самое и ещё большие участки на хромосомах 1, 21 и 22. SNP Poor Region присутствует на 9 из 22 хромосом.

Misslipa написал:

[q]
По поводу X-match: вы на свой вопрос сами и ответили - можно сразу исключить линию отца отца женщины, что сужает поиски.
[/q]

Но ведь даже когда нет совпадения по X-match, также можно исключить линию деда по отцу, я прав? Если да, то все равно не вижу разницы.

Temych написал:

[q]
Кто знает, как происходит разбивка совпадений по вкладкам Paternal (0), Maternal (0), Both (0)? Тест моей матери уже в базе есть.
[/q]

В моем случае в этих вкладках ничего не отображалось, пока аутосомный тест не сделала моя мать и тогда получилось следующее:
All =1550, Paternal = 3, Maternal = 235, Both = 0.
Поскольку ближайший родственник относительно моей мамы не тестировался, то в ее случае последние 3 вкладки равны нулю.

Но у меня тоже есть недопонимания и вопрос ко всем! Если 1550-3-235=1312 а не 0, то кто эти 1312 ? к какой линии они относятся?
И второй вопрос откуда в моём случае взялись 3 совпаденца по отцовской линии? Да, я их знаю, это мои пятиюродные, но из ближайших по отцу никто не делал тест.

Nikitoss написал:

[q]

Но ведь даже когда нет совпадения по X-match, также можно исключить линию деда по отцу, я прав? Если да, то все равно не вижу разницы.
[/q]

А почему при отсутствии совпадения X-match вы хотите исключить линию деда по отцу?
Дед через сына не может своим внукам передать только Х хромосому, но остальные то хромосомы передает.

>> Ответ на сообщение пользователя Nikitoss от 8 мая 2020 22:57

Ого! Вы знаете своих пятиюродных, завидую

Ну поскольку у каждого человека хромосомы только от двух человек, то зная значения одного родителя, можно дедуктировать, что второе значение - от друого родителя. Например, у вас на определенном SNP значится AG, а у вашей матери GG. Отсюда следует, что мать вам передала G, а A следовательно от отца. Проделав так со всеми 700 000 снипами, можно получить цепочку ДНК вашего отца.

Если, например, у вас AG и у матери - AG, то тут непонятно: мать могла передать как A, так и G. В таком случае применяется статистический алгоритм, суть которого заключается в том, что смотрится, какой самый популярный вариант конкретного снипа имеет место быть, если окружающие снипы такие-то и такие-то. Ну это упрощенно.

аутосомный тест на ФТДНА / FTDNA