Family Finder

Nikitoss íàïèñàë:

[q]

[/q]

Íó... êîððåëÿöèÿ íå 100%-íàÿ, íî îáùàÿ âçàèìîñâÿçü ïðèñóòñòâóåò. ß âçÿëà äâà ñâîèõ ïðîèçâîëüíûõ ñîâïàäåíöà è ïîñìîòðåëà íà ñíèïû è ñåíòèìîðãàíû íàøèõ îáùèõ ó÷àñòêîâ (ïðèëîæèëà ãðàôèê) - çàâèñèìîñòü âèäíà.

À îáùàÿ õðîìîñîìà äåéñòâèòåëüíî ââîäèò â çàáëóæäåíèå, ñîãëàñíà.
Ó ìåíÿ òîæå íà íåêîòîðûõ ó÷àñòêàõ SNP Poor Region - ïðåäïîëàãàþ, ÷òî ýòî çàâèñèò îò îñîáåííîñòåé õðîìîñîì è òåñòîâîé ïîëèòèêè êîìïàíèè, à íå êà÷åñòâà áèîëîãè÷åñêîãî ìàòåðèàëà. Ó ìåíÿ, íàïðèìåð, áîëüøèå ó÷àñòêè íà 13, 14 è 15 õðîìîñîìàõ. Ó âàñ?

Ïî ïîâîäó X-match: âû íà ñâîé âîïðîñ ñàìè è îòâåòèëè - ìîæíî ñðàçó èñêëþ÷èòü ëèíèþ îòöà îòöà æåíùèíû, ÷òî ñóæàåò ïîèñêè.

Temych íàïèñàë:

[q]

Êòî çíàåò, êàê ïðîèñõîäèò ðàçáèâêà ñîâïàäåíèé ïî âêëàäêàì Paternal (0), Maternal (0), Both (0)? Òåñò ìîåé ìàòåðè óæå â áàçå åñòü.

[/q]

Ó âàñ ïðèñîåäèíåí ê äåðåâó õîòÿ áû îäèí ñîâïàäåíåö íà ÔÔ? Åñëè ó âàñ ìàòü óæå â áàçå åñòü, ìîæíî åå è ïðèñîåäèíèòü. Òîëüêî ïîñëå ýòîãî ôóíêöèÿ çàðàáîòàåò.

Temych íàïèñàë:

[q]

Êòî çíàåò, êàê ïðîèñõîäèò ðàçáèâêà ñîâïàäåíèé ïî âêëàäêàì Paternal (0), Maternal (0), Both (0)? Òåñò ìîåé ìàòåðè óæå â áàçå åñòü.

[/q]

 ìîåì ñëó÷àå â ýòèõ âêëàäêàõ íè÷åãî íå îòîáðàæàëîñü, ïîêà àóòîñîìíûé òåñò íå ñäåëàëà ìîÿ ìàòü è òîãäà ïîëó÷èëîñü ñëåäóþùåå:
All =1550, Paternal = 3, Maternal = 235, Both = 0.
Ïîñêîëüêó áëèæàéøèé ðîäñòâåííèê îòíîñèòåëüíî ìîåé ìàìû íå òåñòèðîâàëñÿ, òî â åå ñëó÷àå ïîñëåäíèå 3 âêëàäêè ðàâíû íóëþ.

Íî ó ìåíÿ òîæå åñòü íåäîïîíèìàíèÿ è âîïðîñ êî âñåì! Åñëè 1550-3-235=1312 à íå 0, òî êòî ýòè 1312 ? ê êàêîé ëèíèè îíè îòíîñÿòñÿ?
È âòîðîé âîïðîñ îòêóäà â ìî¸ì ñëó÷àå âçÿëèñü 3 ñîâïàäåíöà ïî îòöîâñêîé ëèíèè? Äà, ÿ èõ çíàþ, ýòî ìîè ïÿòèþðîäíûå, íî èç áëèæàéøèõ ïî îòöó íèêòî íå äåëàë òåñò.

>> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Nikitoss îò 8 ìàÿ 2020 22:57

Îãî! Âû çíàåòå ñâîèõ ïÿòèþðîäíûõ, çàâèäóþ

Íó ïîñêîëüêó ó êàæäîãî ÷åëîâåêà õðîìîñîìû òîëüêî îò äâóõ ÷åëîâåê, òî çíàÿ çíà÷åíèÿ îäíîãî ðîäèòåëÿ, ìîæíî äåäóêòèðîâàòü, ÷òî âòîðîå çíà÷åíèå - îò äðóîãî ðîäèòåëÿ. Íàïðèìåð, ó âàñ íà îïðåäåëåííîì SNP çíà÷èòñÿ AG, à ó âàøåé ìàòåðè GG. Îòñþäà ñëåäóåò, ÷òî ìàòü âàì ïåðåäàëà G, à A ñëåäîâàòåëüíî îò îòöà. Ïðîäåëàâ òàê ñî âñåìè 700 000 ñíèïàìè, ìîæíî ïîëó÷èòü öåïî÷êó ÄÍÊ âàøåãî îòöà.

Åñëè, íàïðèìåð, ó âàñ AG è ó ìàòåðè - AG, òî òóò íåïîíÿòíî: ìàòü ìîãëà ïåðåäàòü êàê A, òàê è G.  òàêîì ñëó÷àå ïðèìåíÿåòñÿ ñòàòèñòè÷åñêèé àëãîðèòì, ñóòü êîòîðîãî çàêëþ÷àåòñÿ â òîì, ÷òî ñìîòðèòñÿ, êàêîé ñàìûé ïîïóëÿðíûé âàðèàíò êîíêðåòíîãî ñíèïà èìååò ìåñòî áûòü, åñëè îêðóæàþùèå ñíèïû òàêèå-òî è òàêèå-òî. Íó ýòî óïðîùåííî.

Misslipa íàïèñàë:

[q]

 òàêîì ñëó÷àå ïðèìåíÿåòñÿ ñòàòèñòè÷åñêèé àëãîðèòì, ñóòü êîòîðîãî çàêëþ÷àåòñÿ â òîì, ÷òî ñìîòðèòñÿ, êàêîé ñàìûé ïîïóëÿðíûé âàðèàíò êîíêðåòíîãî ñíèïà èìååò ìåñòî áûòü, åñëè îêðóæàþùèå ñíèïû òàêèå-òî è òàêèå-òî. Íó ýòî óïðîùåííî.

[/q]

ß òàê ïîíèìàþ ñòàòèñòè÷åñêèé àëãîðèòì ïðèìåíÿåò ñàì ñàéò, ïîñëå âàøåãî ïîäòâåðæäåíèÿ ñ êåì-ëèáî áëèçêîãî ðîäñòâà. Åñòü ëè ïðîãðàììû, óòèëèòû, êîòîðûå ìîãëè áû ïîçâîëèòü òàêèì îáðàçîì âîññòàíîâèòü ÷üþ-òî äíê?


Misslipa íàïèñàë:

[q]

Ïðîäåëàâ òàê ñî âñåìè 700 000 ñíèïàìè, ìîæíî ïîëó÷èòü öåïî÷êó ÄÍÊ âàøåãî îòöà.

[/q]

Ñïàñèáî âñå äîõîä÷èâî îáúÿñíèëè!