Family Finder

Nikitoss написал:

[q]

[/q]

Ну... корреляция не 100%-ная, но общая взаимосвязь присутствует. Я взяла два своих произвольных совпаденца и посмотрела на снипы и сентиморганы наших общих участков (приложила график) - зависимость видна.

А общая хромосома действительно вводит в заблуждение, согласна.
У меня тоже на некоторых участках SNP Poor Region - предполагаю, что это зависит от особенностей хромосом и тестовой политики компании, а не качества биологического материала. У меня, например, большие участки на 13, 14 и 15 хромосомах. У вас?

По поводу X-match: вы на свой вопрос сами и ответили - можно сразу исключить линию отца отца женщины, что сужает поиски.

Temych написал:

[q]

Кто знает, как происходит разбивка совпадений по вкладкам Paternal (0), Maternal (0), Both (0)? Тест моей матери уже в базе есть.

[/q]

У вас присоединен к дереву хотя бы один совпаденец на ФФ? Если у вас мать уже в базе есть, можно ее и присоединить. Только после этого функция заработает.

Temych написал:

[q]

Кто знает, как происходит разбивка совпадений по вкладкам Paternal (0), Maternal (0), Both (0)? Тест моей матери уже в базе есть.

[/q]

В моем случае в этих вкладках ничего не отображалось, пока аутосомный тест не сделала моя мать и тогда получилось следующее:
All =1550, Paternal = 3, Maternal = 235, Both = 0.
Поскольку ближайший родственник относительно моей мамы не тестировался, то в ее случае последние 3 вкладки равны нулю.

Но у меня тоже есть недопонимания и вопрос ко всем! Если 1550-3-235=1312 а не 0, то кто эти 1312 ? к какой линии они относятся?
И второй вопрос откуда в моём случае взялись 3 совпаденца по отцовской линии? Да, я их знаю, это мои пятиюродные, но из ближайших по отцу никто не делал тест.

>> Ответ на сообщение пользователя Nikitoss от 8 мая 2020 22:57

Ого! Вы знаете своих пятиюродных, завидую

Ну поскольку у каждого человека хромосомы только от двух человек, то зная значения одного родителя, можно дедуктировать, что второе значение - от друого родителя. Например, у вас на определенном SNP значится AG, а у вашей матери GG. Отсюда следует, что мать вам передала G, а A следовательно от отца. Проделав так со всеми 700 000 снипами, можно получить цепочку ДНК вашего отца.

Если, например, у вас AG и у матери - AG, то тут непонятно: мать могла передать как A, так и G. В таком случае применяется статистический алгоритм, суть которого заключается в том, что смотрится, какой самый популярный вариант конкретного снипа имеет место быть, если окружающие снипы такие-то и такие-то. Ну это упрощенно.

Misslipa написал:

[q]

В таком случае применяется статистический алгоритм, суть которого заключается в том, что смотрится, какой самый популярный вариант конкретного снипа имеет место быть, если окружающие снипы такие-то и такие-то. Ну это упрощенно.

[/q]

Я так понимаю статистический алгоритм применяет сам сайт, после вашего подтверждения с кем-либо близкого родства. Есть ли программы, утилиты, которые могли бы позволить таким образом восстановить чью-то днк?


Misslipa написал:

[q]

Проделав так со всеми 700 000 снипами, можно получить цепочку ДНК вашего отца.

[/q]

Спасибо все доходчиво объяснили!