ДНК-генеалогия. Вопросы новичков
И ответы опытных ))
Наташа СМОрганизатор Смоленского Генеалогического клуба  город-герой Смоленск Сообщений: 3071 На сайте с 2012 г. Рейтинг: 2579 | Наверх ##
17 апреля 2013 15:30 17 апреля 2013 15:31 Благодаря форумчанам заразилась идеей сделать ДНК-тест  Но поняла, что очень трудно выбирать нужную информацию по крупинкам из разных тем, из дневников участников и т.д. Постепенно забываешь, что где прочитал ,а второй раз не всегда найти получается. Да еще, частенько, и понять не можешь незнакомые аббревиатуры и слова, а просить каждый раз перевести " с русского на русский" - как-то неудобно  И так, на фоне дискуссий опытных форумчан чувствуешь себя не совсем разумным существом))) А вопросов куча!!!  Хотя, я уверена, у всех начинающих, одни и те же вопросы, сомнения и т.д. Интерес к этому делу всё растет и желающих всё больше и больше. Поэтому очень прошу знающих и опытных в этом деле исследователей, помочь нам, новичкам, в освоении ДНК-генеалогии Понимаю, что многие у себя выкладывали ранее какие-то советы и рекомендации, делились опытом - просто оставьте здесь ссылочки, пожалуйста. Думаю, так новички (в том числе, и я) быстрее разберутся и будут Вам очень благодарны! Ну и конечно, я думаю, ДНК-сообщество только выиграет, если благодаря этой теме к нему присоединятся новенькие "днк-наркоманы", как выразился кто-то из форумчан
---
Филимоновы - мещане г. Велижа
Вайсблит - Украина
Рейслер - Австро-Венгрия, Кишинёв
Масловы - Ст.Некрасовка, Измаил
----
Работаю в архивах Смоленска с 2013г. Помогу в ваших поисках.
Мой телеграм-канал https://t.me/gen_sysk
| | Лайк (7) |
tmaua Киев Сообщений: 989 На сайте с 2021 г. Рейтинг: 532 | Наверх ##
26 ноября 2021 13:13 26 ноября 2021 13:16 yakto написал: [q]
Вот кстати, на скриншоте tmaua видно, что участки разного размера, а оценка в сМ почти одинаковая. Несоразмерность указывает на сомнительный результат совпадения или завышенный в оценке совпадения. Гедматч подсветил участок желтым (не называя сомнительным, а называя наполовину совпадением biggrin1.gif ).[/q]
Если рассмотреть детальнее желтый и первый зеленый кусочек, оба имеющие +- 7 сМ, то получим такую картину. Самому хотелось бы четко и однозначтно понять эту картинку. 1 - исходная картинка (тут зеленый и желный цвет не указывают ни на что, просто цвет) 2 - детальная картинка для желкого кусочка 3 - детальная картинка для первого зеленого кусочка Пока я ее трактую так: " Желтый кусочек очень длинный, но в нем очень маленькая плотность SNP (т.е. мало SNP есть в этом кусочке). В желтом кусочке на всей его длинне (с 37М по 74М) найдено 576 совпавших SNP. Гедматч используя матаппарат поставил такому желтому кусочку значение Q-value=162. Первый зеленый кусочек очень короткий, но в нем приличная плотность SNP (т.е. много SNP есть в этом кусочке). В зеленом кусочке на всей его длинне (с 136М по 137М) найдено 215 совпавших SNP. Гедматч используя матаппарат поставил такому зеленому кусочку значение Q-value=33. Т.е. гедматч считает более вероятностным правильность желтого кусочка. " Ваши мнения?
 --- ( Кузуб Комендант) - Лепляво
(Пелых Власенко Игнатенко Андрущенко) - Канев
(Губарь Рыбалко Татаренко) - Белополье
(Щенявский Янушевич Соколовский Пионтковский | | |
Evgeny Kolchugin Московская обл. Сообщений: 995 На сайте с 2013 г. Рейтинг: 1236 | Наверх ##
26 ноября 2021 13:43 yakto, блестящее объяснение! Лично я, поломав голову над темой, оставил попытки детального изучения механизма оценки результатов и полагаюсь на выводы лаборатории. Для близкого родства их мнение достаточно надежно, а для дальнего - не очень-то и нужно)) На самом деле, методика оценки - это огромная научная тема. Взять хотя бы тот факт, что все аутосомы парные. Поэтому совпадение каждого маркера может иметься как по одной, так и по двум хромосомам в паре. А учитывая, что маркеров сотни тысяч... В общем, бой в Крыму, всё в дыму.  ---
https://kolchugin-story.ru
Жизнь каждого человека достойна романа. /Ирвин Польстер/
Кольчугины и Дудниковы: с. Терновка Пензенского у. Пензенской губ.
Прошины и Гришновы: Бутчинская вол. Жиздринского у. Калужской губ. | | |
yakto Глубокая провинция Сообщений: 343 На сайте с 2015 г. Рейтинг: 247 | Наверх ##
26 ноября 2021 14:10 26 ноября 2021 14:17 tmaua написал: [q] Т.е. гедматч считает более вероятностным правильность желтого кусочка.[/q]
Зачем вам эти дебри? SNP Density не дает вам никакой практической информации, кроме того, что на малом участке хромосомы расположено больше локусов. Количество SNP - это не количество совпаших локусов, а количество участвующих в сравнении. Q-value - это математически рассчитанная вероятность верности совпадения. Логично, что при большем количестве локусов в сравнении (даже с меньшим количеством соответствия) - величина будет больше. Чем больше мы сравнили, тем больше вероятность, что сравнили правильно. Тоже бесполезный показатель. Gedmatch - всего лишь инструмент для визуализации результатов вашего теста в сравнении с другими. Он парсит ваш ROW-файл, загоняет в базу данных, а дальше работают формулы. То же самое вы можете сделать самостоятельно, имея на руках несколько результатов. Ваши вопросы должны быть ближе к поверхности. Что вы хотите увидеть? У вас есть маленькое совпадение со всеми тремя персонами. При таком объеме сМ установить родство невозможно, опираясь только на эти результаты. Родство очень далекое, с общим предком жившим более чем 6-8 поколений назад. В шестом поколении у вас 64 предка, в 8-ом - 256. Для документального сравнения предков в поиске соответствия нужно открыть всех, что практически нереально. Только невероятная удача поможет вам установить конкретное родство с этими людьми. При условии, что вы действительно родственники. P.S. У меня таких родственников около 3 тысяч, у супруги - около 8 тысяч. Такой объем совпадений говорит об очееень дальнем родстве. Когда мы почти все родственники... Или не родственники вовсе, потому что программы ошибаются. ---
Фамилии: Колесниковы, Ефановы (с.Донское), Долейш (Чехия), Малеевы (Мартыновка), Косаревы-Косыревы (Карс, США, Самара, Кавказ), Назаровы (х.Скельновский), Коноза, Солодовник (Кризское), Нефедовы (Никулино), Лиховские (Рост. обл.) ТГ:@aleksan_sergeevich | | Лайк (2) |
tmauaКиев Сообщений: 989 На сайте с 2021 г. Рейтинг: 532 | Наверх ##
26 ноября 2021 14:53 26 ноября 2021 14:55 yakto написал: [q]
Ваши вопросы должны быть ближе к поверхности. Что вы хотите увидеть?
У вас есть маленькое совпадение со всеми тремя персонами. При таком объеме сМ установить родство невозможно, опираясь только на эти результаты.
Родство очень далекое, с общим предком жившим более чем 6-8 поколений назад.
В шестом поколении у вас 64 предка, в 8-ом - 256. Для документального сравнения предков в поиске соответствия нужно открыть всех, что практически нереально.
Только невероятная удача поможет вам установить конкретное родство с этими людьми.
При условии, что вы действительно родственники.
P.S. У меня таких родственников около 3 тысяч, у супруги - около 8 тысяч. Такой объем совпадений говорит об очееень дальнем родстве. Когда мы почти все родственники... Или не родственники вовсе, потому что программы ошибаются.[/q]
Про дальность родства и сложность его определения по причине удвоения прямых родственников на каждом уровне я согласен. Хочется полного понимания каждого термина и колонки в таблице чтобы понимать саму суть процесса сравнения. Привык изучать инструмент измерения, а не просто доверять его показаниям. :-) yakto написал: [q]
Количество SNP - это не количество совпаших локусов, а количество участвующих в сравнении.[/q]
Вот, а я почему-то был уверен, что это кол. совпавших SNP. Спасибо за прояснение. yakto написал: [q]
SNP Density не дает вам никакой практической информации, кроме того, что на малом участке хромосомы расположено больше локусов.[/q]
Не раз слышал такую фразу, в моем совпадении 5 сМ больше SNP чем в твоем совпадении 7сМ - поэтому мой кусок 5 сМ может быть более весомым чем твой кусок 7 сМ. Как можно это прокомментировать? --- ( Кузуб Комендант) - Лепляво
(Пелых Власенко Игнатенко Андрущенко) - Канев
(Губарь Рыбалко Татаренко) - Белополье
(Щенявский Янушевич Соколовский Пионтковский | | |
| pelevinmm85
Николо-Макарово
Сообщений: 274
На сайте с 2017 г.
Рейтинг: 262
| Наверх ##
26 ноября 2021 15:14 yakto написал: [q] ...Или не родственники вовсе, потому что программы ошибаются.[/q]
А как два человека могут быть НЕ родственниками? Вроде все друг другу родственники. Тут, наверно, вопрос только в том, получены ли у двух людей "совпадающие" SNP от одного и того же некоторого предка, как предполагается результатами теста или же, от разных (у которых, кстати, в итоге они опять же могли быть либо получены от некоторого более дальнего общего предка, либо возникнуть самостоятельно в результате мутации). | | |
yaktoГлубокая провинция Сообщений: 343 На сайте с 2015 г. Рейтинг: 247 | Наверх ##
26 ноября 2021 15:34 26 ноября 2021 15:34 tmaua написал: [q] Не раз слышал такую фразу, в моем совпадении 5 сМ больше SNP чем в твоем совпадении 7сМ - поэтому мой кусок 5 сМ может быть более весомым чем твой кусок 7 сМ.
Как можно это прокомментировать? [/q]
Только что прокомментировано выше. Приоритет количества сравниваемых SNP независимо от оценки вероятности совпадения. Такая ситуация характерна только для малых сМ. При близком родстве результаты более определенные и достоверные. Поэтому противоречий не возникает. pelevinmm85 написал: [q] Вроде все друг другу родственники[/q]
Да, бактерии тоже наши родственники. Иногда они приходят погостить, а мы им не рады. Болеть начинаем.. Речь идет о родстве в обозримом прошлом, а не о родстве вообще в рамках теории эволюции. ---
Фамилии: Колесниковы, Ефановы (с.Донское), Долейш (Чехия), Малеевы (Мартыновка), Косаревы-Косыревы (Карс, США, Самара, Кавказ), Назаровы (х.Скельновский), Коноза, Солодовник (Кризское), Нефедовы (Никулино), Лиховские (Рост. обл.) ТГ:@aleksan_sergeevich | | Лайк (1) |
| koryto
Сообщений: 226
На сайте с 2009 г.
Рейтинг: 103
| Наверх ##
29 ноября 2021 22:00 Женщина сдала ДНК-тест и обнаружила, что её отец ей не родной. Спросить подробности уже не у кого, но очень хочется попытаться найти биологического отца. Как это сделать? Пока в голову приходит только такой вариант: закинуть результаты её теста во все возможные генеалогические базы и спрашивать ближайших генетических родственников оттуда, не было ли у них родственников, которые были в нужное время в нужном месте. Может быть есть идеи получше?
| | |
Наташа СМОрганизатор Смоленского Генеалогического клуба город-герой Смоленск Сообщений: 3071 На сайте с 2012 г. Рейтинг: 2579 | Наверх ##
29 ноября 2021 23:09 koryto написал: [q] Женщина сдала ДНК-тест и обнаружила, что её отец ей не родной. Спросить подробности уже не у кого, [/q]
Погодите, а как она пришла к такому выводу? С кем производилось сравнение? ---
Филимоновы - мещане г. Велижа
Вайсблит - Украина
Рейслер - Австро-Венгрия, Кишинёв
Масловы - Ст.Некрасовка, Измаил
----
Работаю в архивах Смоленска с 2013г. Помогу в ваших поисках.
Мой телеграм-канал https://t.me/gen_sysk
| | |
| koryto
Сообщений: 226
На сайте с 2009 г.
Рейтинг: 103
| Наверх ##
29 ноября 2021 23:43 Наташа СМ написал: [q]
Погодите, а как она пришла к такому выводу? С кем производилось сравнение?
[/q]
Со своими двоюродными братьями по отцовской и материнской линии. Двоюродный брат по отцовской линии (сын сестры отца) не является её генетическим родственником. | | |
yaktoГлубокая провинция Сообщений: 343 На сайте с 2015 г. Рейтинг: 247 | Наверх ##
30 ноября 2021 9:27 koryto написал: [q] Двоюродный брат по отцовской линии (сын сестры отца) не является её генетическим родственником.[/q]
Для начала надо исключить все варианты. Может сестра не родная или сын у сестры приемный.. Такая возможность исключена? koryto написал: [q] спрашивать ближайших генетических родственников[/q]
Может так случиться, что ближайшие генетические родственники будут не ближе 4-5 поколений и вообще из других предковых линий (не отца). Поэтому надо рассматривать только совпадения исключенные по материнской линии и общие по отцовской. Так как общих по отцовской у вас нет, то неплохо бы иметь результат теста матери, чтоб увидеть все отцовские матчи. koryto написал: [q] очень хочется попытаться найти биологического отца[/q]
Как показывает практика, задача практически невыполнимая. База результатов аутосомных тестов по России очень маленькая. Гораздо проще поехать на место проживания и опросить соседей старожилов. Они то уж точно знают, кто с кем встречался, и предложат вероятные альтернативы. ---
Фамилии: Колесниковы, Ефановы (с.Донское), Долейш (Чехия), Малеевы (Мартыновка), Косаревы-Косыревы (Карс, США, Самара, Кавказ), Назаровы (х.Скельновский), Коноза, Солодовник (Кризское), Нефедовы (Никулино), Лиховские (Рост. обл.) ТГ:@aleksan_sergeevich | | |
|
Мой (Lesla) канал в Телеграмме, где буду пробовать рассказывать новичкам о применении методов ДНК-тестирования в генеалогии - https://t.me/gen_gen25