ДНК-генеалогия
Генетические методы реконструкции родословного дерева
Mich_Glitch | Наверх ##
20 октября 2008 19:54 20 октября 2008 19:55 napobo3 написал: [q] Mich_Glitch написал:
[q] ...6 октября 2008 года опубликовали мои результаты. То есть с момента заказа до получения результатов прошло три недели. [/q]
Пожалуйста поделитесь со мной своими результатами (мой логин в 23ия такой же, как и в этом форуме). Когда получу свои результаты - тоже поделюсь. [/q]
Сейчас немного выложу результатов. У Вас когда будет результат - пошлете приглашение (можно extended, а не basic). Я его с удовольствием приму. Мой публичный профиль создан на имя Michael Temosh. Пока ко мне ближе всех Mike Polcari 74.24%. У родственников совпадения идут процентов с 80. Всех дальше Нигериец 68.26%. Затем Китаец 71.28%. Потом Японец 71.29%. Затем с 73.9% идут европейцы из конкретных людей, выславших мне приглашения. Я сравниваюсь с 4 людьми по basic и с двумя по extended. Речь идет о совпадении среди полумиллиона рассматриваемых снипов. Их потому и рассматривают, что они самые вариабельные. А вообще у всех людей на земле совпадает около 99% полного генома. | | |
Mich_Glitch | Наверх ##
20 октября 2008 20:31 20 октября 2008 20:33 napobo3 написал: [q] Mich_Glitch написал:
[q] Получил результаты из www.23andMe.com и www.dnatribes.com.Сейчас я в отъезде.Через две недели все подробно доложу. [/q]
Считаем дни...особенно интересны Ваши мысли на тему сравнения результатов 23andMe теста между Y-совпаденцами.[/q]
татиа написал: [q] Mich_Glitch, а как там результаты Вашего теста, который Вы посылали, по Вашим прогнозам, когда будут результаты? [/q]
Итак сначала о разностях. Вот так выглядит моя гаплогруппа, полученная на Family Tree DNA:  То есть имею J2b1. А вот 23andMe дают уже несколько иную картинку:  То есть J2b1b. Вопрос к уважаемому remsy, который хоть и не имеет картонных орденов за заслуги перед отечеством  , тем не менее, по моему мнению, является одним из лучших специалистов по ДНК-генеалогии на данном форуме. Я бы его назвал лучшим, но сегодня на форуме зарегистрировалась сама Балановская (см. соседнюю ветку https://forum.vgd.ru/post/25/20151/p343556.htm#pp343556 )!!!  Я первый поставил ей плюсик со всем свои почтением. Но хватит реверансов. Вопрос: Данная разницу в результатах ( J2b1 vs J2b1b) связана: а) с выходом новой спецификации? б) с частичным уточнением старой? в) с тем, что Family Tree DNA просто не рассматривает соответствующего гаплогруппе снипа? г) является внутренним стандартом от 23andMe? | | |
remsy Москва Сообщений: 112 На сайте с 2005 г. Рейтинг: 32
| Наверх ##
20 октября 2008 22:26 20 октября 2008 22:34 [q] Данная разницу в результатах (J2b1 vs J2b1b) связана: а) с выходом новой спецификации? б) с частичным уточнением старой? в) с тем, что Family Tree DNA просто не рассматривает соответствующего гаплогруппе снипа? г) является внутренним стандартом от 23andMe?[/q] а) с выходом новой спецификации?
J2b1b - это из старой номенклатуры ISOGG 2007 J2b1b = J2b1 http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpJ08.html | | |
Mich_Glitch | Наверх ##
20 октября 2008 23:52 remsy написал: [q] а) с выходом новой спецификации?
J2b1b - это из старой номенклатуры ISOGG 2007
J2b1b = J2b1
http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpJ08.html [/q]
Похоже Вы правы. Используется старая номенклатура, да и то не в полном объеме:  А Вы как полагаете, дорогая Gontar? | | |
Mich_Glitch | Наверх ##
20 октября 2008 23:55 Gontar написал: [q] Я послала кое-кому свои статьи, которые были еще в 2003-2004 году. [/q]
Кое-кому - это самое то. А еще лучше кое-куда. Не на одном форуме, ни в одной ветки я не разу не видел малейшего проблеска самостоятельной мысли у Вас. Да и вообще с мыслями у Вас туго. Вам бы философию марксизма-ленинизма преподавать. Но, увы. | | |
remsy Москва Сообщений: 112 На сайте с 2005 г. Рейтинг: 32
| Наверх ##
20 октября 2008 23:59 [q] Используется старая номенклатура, да и то не в полном объеме:[/q]
Да, странно, все что связанно с J2a* они применяют YCC2008, а с J2b* старую ISOGG2007. Компиляторы блин  Так что ваш результат полностью идентичен. А что снипы они не показывают какие тестировали? | | |
Mich_Glitch | Наверх ##
21 октября 2008 0:05 Похоже и по мито- используется старая номенклатура:  Был я Н6а1, а стал Н6а*. | | |
remsy Москва Сообщений: 112 На сайте с 2005 г. Рейтинг: 32
| Наверх ##
21 октября 2008 0:11 [q] Был я Н6а1, а стал Н6а*.[/q]
Я уверен, что это из-за того, что они не делают FGS  мутации для H6a1 находятся в CR, а они видимо сделали HVS1+HVS2 вот и записали в H6a* | | |
татиа Москва Сообщений: 2741 На сайте с 2006 г. Рейтинг: 1285
| Наверх ##
21 октября 2008 0:13 21 октября 2008 0:22 Mich_Glitch, Ваше мнение, где мне этот тест делать? --- Ищу Есковых, Панковых, Головиных, Горяйновых, Тишиных, Пахомовых
Громницких, Робаковских, Зеленских, Сакунов, Михно, Плошенко, Плохих, Ярмак
Остапенко, Братченко, Панкратьевых
ВСЕ МОИ И МОИХ ПРЕДКОВ ДАННЫЕ РАЗМЕЩЕНЫ НА САЙТЕ ВГД ДОБРОВОЛЬНО. | | |
Mich_Glitch | Наверх ##
21 октября 2008 0:15 remsy написал: [q] А что снипы они не показывают какие тестировали?[/q]
Показывают. Суммарный документ состоит из полумиллиона строк. Например вот фрагмент из мито: rs41531144 MT 217 T i3002253 MT 222 C i3002262 MT 223 T i3002267 MT 225 G i3000535 MT 226 T i3000546 MT 227 A rs41323649 MT 228 G i3001447 MT 228 G i3000561 MT 234 A i4001195 MT 235 -- i3000578 MT 236 -- i3000585 MT 237 -- i4001196 MT 238 -- i3000595 MT 239 C i3000603 MT 241 A i3000612 MT 242 C i4001318 MT 244 AЗакавыка в том, что я не знаю перевода из одной номенклатуры в другую Как к примеру будет М205 из Y хромосомы? Может Gontar подскажет?  Шучу, шучу... Например, когда я знаю, что в мито у меня в 239 позиции С, то найти этого не составляет труда. А вот CRS в качестве референтного образца они не приводят. То есть, я как бы имею FGS, но для того чтобы выдернуть все значения по отличиям, надо брать fasta файл для CRS и один за одним все снипы сравнивать. Все 16 с половиной тысяч!!! Это, я скажу, будут помуторнее извлечения данных из соренсоновского заменителя. | | |
|