Gedmatch

Если закон о запрете передачи генетических данных из России за рубеж примут, то Гедматч наверняка заблокируют первым.

tirael написал:

[q]

Здравствуйте.
Подскажите, как проверить на совпадение загруженный мною кит с любым другим из базы, если мне известен номер?

[/q]

Заходите на сайт. Слева вверху будут 3 полосочки горизонтальные.
Нажимаете на эти полосочки. Затем на FREE TOOlS, затем на One-to-Many.
Это общая база.
Если Вам нужен проект про российским базам, то нажимаете на Ancestor Projects, дальше на Search Projects - ищете нужный регион, если есть.
Затем нажимаете на зелёную кнопку -JOIN, далее опускаететесь вниз страницы, и ставите в окошке галочку напротив номера Вашего кита - Select which kit(s) you want to put in this project:

И нажимаете на зелёную кнопку - SUBMIT, ваша заявка будет отправлена админу группы.

Можете ещё сравниться с общей базой через функцию - One-to-many DNA Comparison

Лёна написал:

[q]

Заходите на сайт. Слева вверху будут 3 полосочки горизонтальные.
Нажимаете на эти полосочки. Затем на FREE TOOlS, затем на One-to-Many.
Это общая база.

[/q]

Лёна, я правильно понимаю, что 1 ко 1 сравнить свой кит с любым другим нельзя, только в списке One-to-Many искать второй кит. Если он там есть, то возможно имеется общий предок, если его там нет, то генетически скорее всего мы не родственники, либо родство очень дальнее и оно не попало в этот список?

И всё же. Дались вам эти участки!
Понятно, когда интересно. Когда хочется разобраться, что у машинки внутри.
Но если речь идёт о задачах генеалогических, то путём теста мы пытаемся выяснить, связаны две персоны общим предком, или нет. И как давно жил этот общий предок.

Как делаю попарное сравнение я:

1. Иду в One-to-one Autosomal в выкидывающимся списке Free Tools.

2. Ввожу Kit Number 1 и Kit Number 2. (Предполагается, что номера обоих сравниваемых наборов мне известны.)

3. Выставляю опцию Position Only. На что мне картинки?

4. Отмечаю квадратик Display Only Chromosomes with Matched Segments. Т.е. будут показываться только совпадающие участки хромосом.

5. Все остальные настройки оставляю по умолчанию. Лишь изредка меняю Minimum segment cM size с 7 сМ по умолчанию на 5 сМ. (Зачем это делаю, объясню в пункте 8.) 4 сМ и 3 сМ не использую никогда. Так как в этом случае не показывается TMRCA (ВБОП - Время до Ближайшего Общего Предка).

6. Жму на Compare.

7. Что меня интересует, так это именно ВБОП, измеренный в поколениях. То есть, что-то типа Estimated number of generations to MRCA = 2.8.

8. Если строка Estimated number of generations to MRCA = ... не появилась, то это значит, что по результатам теста, родство не обнаруженно. Вот тогда-то и меняю Minimum segment cM size на 5 сМ. Иногда при таких настройках показывается родство.

9. Качество сравнения оцениваю по количеству использованных снипов. Т.е. смотрю строчку SNPs used for this comparison. Чем значение там выше, тем лучше. (Максимум, что видел, это 868044 SNPs used for this comparison.)

>> Ответ на сообщение пользователя PedigreeResearcher от 3 февраля 2026 18:21

Спасибо большое!
Все мы учимся, как лучше понять.
Тем более, когда в таких делах не особенно разбираешься.