ДНК-генеалогия. Вопросы новичков
И ответы опытных ))
Наташа СМ город-герой Смоленск Сообщений: 3078 На сайте с 2012 г. Рейтинг: 2512 | Наверх ##
17 апреля 2013 15:30 17 апреля 2013 15:31 Благодаря форумчанам заразилась идеей сделать ДНК-тест  Но поняла, что очень трудно выбирать нужную информацию по крупинкам из разных тем, из дневников участников и т.д. Постепенно забываешь, что где прочитал ,а второй раз не всегда найти получается. Да еще, частенько, и понять не можешь незнакомые аббревиатуры и слова, а просить каждый раз перевести " с русского на русский" - как-то неудобно  И так, на фоне дискуссий опытных форумчан чувствуешь себя не совсем разумным существом))) А вопросов куча!!!  Хотя, я уверена, у всех начинающих, одни и те же вопросы, сомнения и т.д. Интерес к этому делу всё растет и желающих всё больше и больше. Поэтому очень прошу знающих и опытных в этом деле исследователей, помочь нам, новичкам, в освоении ДНК-генеалогии Понимаю, что многие у себя выкладывали ранее какие-то советы и рекомендации, делились опытом - просто оставьте здесь ссылочки, пожалуйста. Думаю, так новички (в том числе, и я) быстрее разберутся и будут Вам очень благодарны! Ну и конечно, я думаю, ДНК-сообщество только выиграет, если благодаря этой теме к нему присоединятся новенькие "днк-наркоманы", как выразился кто-то из форумчан
---
Филимоновы - мещане г. Велижа
Вайсблит - Украина
Рейслер - Австро-Венгрия, Кишинёв
----
Работаю в архивах Смоленска с 2013г. Помогу в ваших поисках.
Мой телеграм-канал https://t.me/gen_sysk
| | Лайк (6) |
| Tulimov Новичок
Сообщений: 20
На сайте с 2006 г.
Рейтинг: 18 | Наверх ##
16 января 2022 18:46 Получаю первые данные (пока только аутосомный пришел) и как же нелегко в этом разобраться )) Читаешь, читаешь и все бес толку... Так, что особо тапками не кидайте за вопросы Итак FTDNA: 1. Хромосомы (если я правильно понял графичисеки отображаются они... эти длинные полосы...) парные. Слева мужская часть, справа женская? Или тут нет зависимости и все это в случайном порядке отображается 2. "Длина" этих линий уменьшается с каждой последующей... Так и не понял почему... 3. Есть некая "серая заштрихованная зона". Что сие означает? Недостаточно данных в имеющийся БД? 4. Я так понимаю, что менее 20 сМ это уже или очень далеко (очень маленькая вероятность), или просто ошибка? Есть некая "граница" количественного показателя этого сМ, где однозначно можно говорить, что "это очень далеко"?
  ---
Тулимовы, Бахтины, Каштыловы, Сахины, Лобановы, Батовы (Ярославская обл., Костромская обл.), Лебедевы (предположительно Калининская обл. по состоянию на 1941 год) | | |
| I_Sokka
Санкт-Петербург
Сообщений: 502
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 462
| Наверх ##
16 января 2022 20:13 16 января 2022 20:18 Tulimov написал: [q] 1. Хромосомы (если я правильно понял графичисеки отображаются они... эти длинные полосы...) парные. Слева мужская часть, справа женская? Или тут нет зависимости и все это в случайном порядке отображается[/q]
Нет, такой систематики нет. Вы видите совпадения и по отцу, и по матери вдоль всей хромосомы. Из хромосомного браузера просто так нельзя увидеть от какого предка идет совпадение. Для этого вам надо сравнивать несколько человек разом - например, протестировать родителей, их братьев и сестер или ваших двоюродных. Далее сравнивая совпадение между вами и человеком с известным документальным происхождением и совпаденцем по ДНК вы можете предположить в каком направлении копать документы. Tulimov написал: [q] 2. "Длина" этих линий уменьшается с каждой последующей... Так и не понял почему... [/q]
Здесь ничего понимать не надо, хромосомы становятся короче физически, в 1-й хромосоме 249 250 621 нуклеотидных оснований, ав 22-й хромосоме 51 304 566 нуклеотидных оснований. Просто факт. https://ru.wikipedia.org/wiki/...0%BC%D0%B0Tulimov написал: [q] 3. Есть некая "серая заштрихованная зона". Что сие означает? Недостаточно данных в имеющийся БД?[/q]
Зона, где снипы плохо читаются или вообще не тестируются на чипе. В ДНК-сопадения не засчитываются и создают искуственный "разрыв" - совпадение проходящее через такой участок будет разделено, и учтено, как два участка. Tulimov написал: [q] 4. Я так понимаю, что менее 20 сМ это уже или очень далеко (очень маленькая вероятность), или просто ошибка? Есть некая "граница" количественного показателя этого сМ, где однозначно можно говорить, что "это очень далеко"? [/q]
Смотрите схему родства по результатам аутосомного теста: https://forum.molgen.org/index...#msg50469320 сМ - многовато для ошибки, хотя не исключено. "Очень далеко" - это зависит от проработанности вашего семейного дерева и деревьев совпаденцев. Мне удалось найти связи с до четверо- и пятиюродных родственников, что укладывается в совпадения более 45-50 сМ. Более удаленных совпаденцев пока не удалось присоединить к моему дереву, хотя для некоторых из них я выстроил их семейные деревья. К сожалению отсутствие документов пока не позволяет продвинуться дальше, а для анализа кто к какой ветке может относиться требуется большее количество ДНК-тестов. ---
Ищу Сокка или Сокко (Печенкин), Катала (Бондарев), Метсо (Семёнов), Тузберг. приход, и деревня, Марково (Markkova, Markowa), Мгинский или Кировский район Лен. Обл.
Ищу Никитинские, Мартыновы, Бобины, Онучины - Ракуло-Кокшенский погост, Вельский уезд, Вологодская губерния. | | Лайк (2) |
| Tulimov Новичок
Сообщений: 20
На сайте с 2006 г.
Рейтинг: 18 | Наверх ##
16 января 2022 21:03 >> Ответ на сообщение пользователя I_Sokka от 16 января 2022 20:13 Спасибо большое! Относительно "Зона, где снипы плохо читаются или вообще не тестируются на чипе." Здесь речь идет о том, что недостаточно качественный мой образец? Т.е. возможно ли как-то исправить данное повторной сдачей? ---
Тулимовы, Бахтины, Каштыловы, Сахины, Лобановы, Батовы (Ярославская обл., Костромская обл.), Лебедевы (предположительно Калининская обл. по состоянию на 1941 год) | | |
| I_Sokka
Санкт-Петербург
Сообщений: 502
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 462
| Наверх ##
16 января 2022 21:16 Tulimov написал: [q] Относительно "Зона, где снипы плохо читаются или вообще не тестируются на чипе."
Здесь речь идет о том, что недостаточно качественный мой образец? [/q]
Нет, это не связано с качеством вашего образца. Некоторые области хромосом не читаются или читаются плохо, например кончики хромосом, теломеры, и узкая серединка хромосом, центромеры. Технические ограничения. Количество снипов на чипе ограничено, около 620 тысяч, поэтому участки малоинтересные или сложные могли исключить из тестирования. Дизайн чипа. Повторная сдача не требуется. ---
Ищу Сокка или Сокко (Печенкин), Катала (Бондарев), Метсо (Семёнов), Тузберг. приход, и деревня, Марково (Markkova, Markowa), Мгинский или Кировский район Лен. Обл.
Ищу Никитинские, Мартыновы, Бобины, Онучины - Ракуло-Кокшенский погост, Вельский уезд, Вологодская губерния. | | Лайк (4) |
| Tulimov Новичок
Сообщений: 20
На сайте с 2006 г.
Рейтинг: 18 | Наверх ##
16 января 2022 21:51 16 января 2022 21:51 I_Sokka написал: [q]
Дизайн чипа.
[/q]
Благодарю. Т.е. сдача аналогичного анализа в другой лаборатории (иной чип, другая технология) теоретически (хотя, возможно, не значительно) может дополнить результат? Это так... размышление.. И еще вопрос, если позволите, по обозначениям: 1. FTDAN: Shared DNA и Longest Block. 2. GedMatch: Total cM, Largest, Gen Если можно в двух словах Как это интерпретировать? Спасибо! ---
Тулимовы, Бахтины, Каштыловы, Сахины, Лобановы, Батовы (Ярославская обл., Костромская обл.), Лебедевы (предположительно Калининская обл. по состоянию на 1941 год) | | |
Maya_Pearl Гродно Сообщений: 156 На сайте с 2014 г. Рейтинг: 52 | Наверх ##
16 января 2022 21:55 16 января 2022 21:57 Есть у меня 3 совпаденца. Как выяснилось, между собой они дальние родственники. Но я не могу найти как они связаны со мной.
Такое совпадение на данном участке может о чем-то говорить?
  | | |
| I_Sokka
Санкт-Петербург
Сообщений: 502
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 462
| Наверх ##
16 января 2022 22:22 16 января 2022 22:34 Tulimov написал: [q] Т.е. сдача аналогичного анализа в другой лаборатории (иной чип, другая технология) теоретически (хотя, возможно, не значительно) может дополнить результат? Это так... размышление..[/q]
Да, может. Но... FTDNA, Ancestry, 23andme, MyHeritage, Genotek все уже работают на чипе GSA (с некоторыми модификациями). Существенного дополнения от таких тестов уже не получите. У остальных пользователей тоже никаких дополнений нет... Living DNA использует чип Affymetrix, который отличается от GSA. Atlas делает на каком-то другом чипе, но чип больше на здоровье ориентирован. И LivingDNA, и Atlas довольно сложно перенести куда-то в другое место. LivingDNA можно перенести в MyHeritage и GEDmatch, но в остальном только проблемы. Синтетический сборник из всех тестов тоже можно сделать, но кроме GEDmatch его никуда не загрузить, да и GEDmatch берет и вырезает все снипы какие ему не по душе. Есть еще чипы на 2,5 и 5 миллионов снипов, но я не видел, чтобы они были доступны через генеалогические компании, да как результаты потом загрузить? Т.е. проблема использования результатов. Есть еще полногеномное секвенирование WGS или NGS, которое вам даст более 95% вашей ДНК. Но опять же проблема использования результатов. В YFull можно проанализировать данные для выяснения снипа/гаплогруппы/субклада по прямой мужской линии и определения мито/гаплогруппы (что может заменить тесты BigY и mtFull в FTDNA). Аутосомные данные тоже можно вытянуть, но официально их пока не принимают - на GEDmatch можно загрузить, в остальные места на свой страх и риск, да и знать надо как все это сделать. Для мужчины стоящий тест. С полным геномом тоже, как правило, идут всякие отчеты по здоровью и если интересно здоровье, то тоже привлекательный тест. Tulimov написал: [q] 1. FTDAN: Shared DNA и Longest Block.[/q]
Shared DNA - общая ДНК в сМ, сантиморганах. Longest block - наиболее длинный участок. Чем цифры больше, тем ближе совпаденец (для обоих показателей). Tulimov написал: [q] 2. GedMatch: Total cM, Largest, Gen[/q]
Total cM - общая ДНК в сМ, сантиморганах. Lagest - наиболее длинный участок Gen - поколения, оценка родства по поколениям. Tulimov написал: [q] Если можно в двух словах Как это интерпретировать?[/q]
Смотрите схему о родстве по результатам аутосомного теста. Ссылку я вам уже дал. ---
Ищу Сокка или Сокко (Печенкин), Катала (Бондарев), Метсо (Семёнов), Тузберг. приход, и деревня, Марково (Markkova, Markowa), Мгинский или Кировский район Лен. Обл.
Ищу Никитинские, Мартыновы, Бобины, Онучины - Ракуло-Кокшенский погост, Вельский уезд, Вологодская губерния. | | Лайк (2) |
| I_Sokka
Санкт-Петербург
Сообщений: 502
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 462
| Наверх ##
16 января 2022 22:33 Maya_Pearl написал: [q] Есть у меня 3 совпаденца. Как выяснилось, между собой они дальние родственники. Но я не могу найти как они связаны со мной.
Такое совпадение на данном участке может о чем-то говорить?[/q]
Только то, что участок унаследован от общего предка. Далее можно посмотреть кто у них общие предки и попытаться найти подсоединение к себе. ---
Ищу Сокка или Сокко (Печенкин), Катала (Бондарев), Метсо (Семёнов), Тузберг. приход, и деревня, Марково (Markkova, Markowa), Мгинский или Кировский район Лен. Обл.
Ищу Никитинские, Мартыновы, Бобины, Онучины - Ракуло-Кокшенский погост, Вельский уезд, Вологодская губерния. | | Лайк (2) |
Darigar Москва Сообщений: 226 На сайте с 2019 г. Рейтинг: 361 | Наверх ##
16 января 2022 23:09 16 января 2022 23:11 I_Sokka написал: [q]
Аутосомные данные тоже можно вытянуть, но официально их пока не принимают - на GEDmatch можно загрузить, в остальные места на свой страх и риск.[/q]
Можно из WGS вытянуть не большой аутосомный файл а только в каком то 1 формате, 23&Me на пример или люболй другой. можно 5-ой или 3-ей версии и тд. на FTDNA и MH грузятся. но надо будет потанцевать с бубном. Те что покрываю на 90% меж собой можно даже скомбинировать. Там вроде бы ограничение на 1М SNP для файлов при загрузке на сайты эти. | | Лайк (1) |
Maya_PearlГродно Сообщений: 156 На сайте с 2014 г. Рейтинг: 52 | Наверх ##
16 января 2022 23:39 I_Sokka написал: [q]
Maya_Pearl написал:
[q]
Есть у меня 3 совпаденца. Как выяснилось, между собой они дальние родственники. Но я не могу найти как они связаны со мной.
Такое совпадение на данном участке может о чем-то говорить?
[/q]
Только то, что участок унаследован от общего предка. Далее можно посмотреть кто у них общие предки и попытаться найти подсоединение к себе.[/q]
Какой-то одинаковый участок унаследован от этого общего предка. Это меня и заинтересовало. А эта связь со мной вроде бы и вырисовывается, но чего-то не хватает, что бы ее найти. | | |
|
Мой (Lesla) канал в Телеграмме, где буду пробовать рассказывать новичкам о применении методов ДНК-тестирования в генеалогии - https://t.me/gen_gen25