ÄÍÊ-ãåíåàëîãèÿ. Âîïðîñû íîâè÷êîâ
È îòâåòû îïûòíûõ ))
Íàòàøà ÑÌÎðãàíèçàòîð Ñìîëåíñêîãî Ãåíåàëîãè÷åñêîãî êëóáà  ãîðîä-ãåðîé Ñìîëåíñê Ñîîáùåíèé: 3085 Íà ñàéòå ñ 2012 ã. Ðåéòèíã: 2628 | Íàâåðõ ##
17 àïðåëÿ 2013 15:30 17 àïðåëÿ 2013 15:31 Áëàãîäàðÿ ôîðóì÷àíàì çàðàçèëàñü èäååé ñäåëàòü ÄÍÊ-òåñò  Íî ïîíÿëà, ÷òî î÷åíü òðóäíî âûáèðàòü íóæíóþ èíôîðìàöèþ ïî êðóïèíêàì èç ðàçíûõ òåì, èç äíåâíèêîâ ó÷àñòíèêîâ è ò.ä. Ïîñòåïåííî çàáûâàåøü, ÷òî ãäå ïðî÷èòàë ,à âòîðîé ðàç íå âñåãäà íàéòè ïîëó÷àåòñÿ. Äà åùå, ÷àñòåíüêî, è ïîíÿòü íå ìîæåøü íåçíàêîìûå àááðåâèàòóðû è ñëîâà, à ïðîñèòü êàæäûé ðàç ïåðåâåñòè " ñ ðóññêîãî íà ðóññêèé" - êàê-òî íåóäîáíî  È òàê, íà ôîíå äèñêóññèé îïûòíûõ ôîðóì÷àí ÷óâñòâóåøü ñåáÿ íå ñîâñåì ðàçóìíûì ñóùåñòâîì))) À âîïðîñîâ êó÷à!!!  Õîòÿ, ÿ óâåðåíà, ó âñåõ íà÷èíàþùèõ, îäíè è òå æå âîïðîñû, ñîìíåíèÿ è ò.ä. Èíòåðåñ ê ýòîìó äåëó âñ¸ ðàñòåò è æåëàþùèõ âñ¸ áîëüøå è áîëüøå. Ïîýòîìó î÷åíü ïðîøó çíàþùèõ è îïûòíûõ â ýòîì äåëå èññëåäîâàòåëåé, ïîìî÷ü íàì, íîâè÷êàì, â îñâîåíèè ÄÍÊ-ãåíåàëîãèè Ïîíèìàþ, ÷òî ìíîãèå ó ñåáÿ âûêëàäûâàëè ðàíåå êàêèå-òî ñîâåòû è ðåêîìåíäàöèè, äåëèëèñü îïûòîì - ïðîñòî îñòàâüòå çäåñü ññûëî÷êè, ïîæàëóéñòà. Äóìàþ, òàê íîâè÷êè (â òîì ÷èñëå, è ÿ) áûñòðåå ðàçáåðóòñÿ è áóäóò Âàì î÷åíü áëàãîäàðíû! Íó è êîíå÷íî, ÿ äóìàþ, ÄÍÊ-ñîîáùåñòâî òîëüêî âûèãðàåò, åñëè áëàãîäàðÿ ýòîé òåìå ê íåìó ïðèñîåäèíÿòñÿ íîâåíüêèå "äíê-íàðêîìàíû", êàê âûðàçèëñÿ êòî-òî èç ôîðóì÷àí
---
Ôèëèìîíîâû - Ñìîëåíñêàÿ ãóáåðíèÿ, Ïîðå÷ñêèé è Äóõîâùèíñêèé óåçäû, ìåùàíå ã.Âåëèæà
Âàéñáëèò - Óêðàèíà
Ðåéñëåð - Àâñòðî-Âåíãðèÿ, Êèøèí¸â
Ìàñëîâû - Ñò.Íåêðàñîâêà, Èçìàèë
----
Ðàáîòàþ â àðõèâàõ Ñìîëåíñêà ñ 2013ã. Ïîìîãó â âàøèõ ïîèñêàõ.
Ìîé òåëåãðàì-êàíàë https://t.me/gen_sysk
| | Ëàéê (8) |
tmaua Êèåâ Ñîîáùåíèé: 989 Íà ñàéòå ñ 2021 ã. Ðåéòèíã: 536 | Íàâåðõ ##
25 íîÿáðÿ 2021 15:05 25 íîÿáðÿ 2021 15:12 yakto íàïèñàë: [q] Çíà÷åíèå òðèàíãóëÿöèè ïðåóâåëè÷åíî.
Íà÷íåì ñ òîãî, ÷òî MH âåñüìà ïðèáëèçèòåëüíî ñðàâíèâàåò ñíèïû, âûäàåò çàâûøåííûå îöåíêè è ïîêàçûâàåò îãðîìíûå ó÷àñòêè òðèàíãóëÿöèè íà êîòîðûõ èìåþòñÿ ìàëåíüêèå ñîâïàäåíèÿ.
Ó ìåíÿ íà MH 3 òûñ. ñîâïàäåíèé, ïî÷òè ïî êàæäîìó ïîêàçûâàåò òðèàíãóëèðîâàííûå ó÷àñòêè. ß äåëàë âûáîðêó ïî òðèàíãóëÿöèè íà îäíîì ìàëåíüêîì ó÷àñòêå îäíîé õðîìîñîìû. Íå âäàâàÿñü â äîëãèå ïîäðîáíîñòè, ñêàæó, ÷òî â èòîãå ðîäñòâî ïî âûáîðêå îêàçàëîñü íà ðàçíûõ ïðåäêîâûõ ëèíèÿõ.
Òî åñòü ñàìî ïðåäñòàâëåíèå òðèàíãóëÿöèè ëîæíîå. Ïîõîæå, MH åùå íàäî ïîðàáîòàòü íàä àëãîðèòìîì ýòîé ôè÷è. [/q]
ß íà ÌH òàêæå âèäåë ìíîãî ïðîòèâîðå÷èâûõ ñîâïàäåíèé. Èíîãäà MH íå âèäèò íè÷åãî, íî ãåäìàò÷ âèäèò âåñîìûé êóñîê ñ ïðèëè÷íûì êîë. ñíèïîâ. Èíîãäà MH âèäèò ñîâïàäåíèå, íî ãåäìàò÷ âèäèò âåñüìà ñêðîìíûé ðåçóëüòàò íà ãðàíè ôîëà. Íåêîòîðûå òîâàðèùè ãîâîðÿò, ÷òî òðèàíãóëÿöèÿ âðàòü íå ìîæåò è ýòî 100% äîñòîâåðíîñòü. ß òàê íå ñ÷èòàþ. Äóìàþ òðèàíãóëÿöèÿ äîäàåò âåñîìîñòè äàííîìó êóñêó íî ýòî òî÷íî íå 100% âåðîÿòíîñòü ïðàâäû. Ó ñåáÿ óæå íàñ÷èòàë ïÿòîê ñîâïàäåíöåâ ãäå òðèàíãóëÿöèÿ ñ îäíèì ñîâïàäåíöåì íà îäíîé õðîìîñîìå èäåò ïî îòöó, à íà âòîðîé õðîìîñîìå (ñ ýòèì æå ñîâïàäåíöåì) ïî ìàòåðè. Ïðè÷åì àøêåíàçè â ðîäó 0%, áëèçêîðîäñòâåííûõ ñâÿçåé ïîêà íåçàìå÷åíî è ãåäìàò÷ ãîâîðèò îá îòñóòñòâèè áëèçêîðîäñòâåííûõ ñâÿçåé â ãåíîìå ìîåì. Îòñþäà äåëàþ âûâîä àíàëîãè÷íûé âàùåìó: "àëãîðèòì MH ñûðîâàò, íàäî ïåðåïðîâåðÿòü äðóãèìè èíñòðóìåíòàìè". --- ( Êóçóá Êîìåíäàíò) - Ëåïëÿâî
(Ïåëûõ Âëàñåíêî Èãíàòåíêî Àíäðóùåíêî) - Êàíåâ
(Ãóáàðü Ðûáàëêî Òàòàðåíêî) - Áåëîïîëüå
(Ùåíÿâñêèé ßíóøåâè÷ Ñîêîëîâñêèé Ïèîíòêîâñêèé | | Ëàéê (1) |
yakto Ãëóáîêàÿ ïðîâèíöèÿ Ñîîáùåíèé: 340 Íà ñàéòå ñ 2015 ã. Ðåéòèíã: 252 | Íàâåðõ ##
25 íîÿáðÿ 2021 15:25 25 íîÿáðÿ 2021 15:30 Íîâè÷êàì âàæíî ïîíèìàòü, ÷òî ñîâïàäåíèÿ â cM - ýòî íå äëèíà èäåíòè÷íûõ ó÷àñòêîâ íóêëåîòèäíûõ ïîñëåäîâàòåëüíîñòåé, à îöåíêà âåðîÿòíîñòè èõ ñîâïàäåíèÿ íà îïðåäåëåííîì ó÷àñòêå ïîñëåäîâàòåëüíîñòè. Ïðàâèëî âåðîÿòíîñòíîãî ñîâïàäåíèÿ õîðîøî ðàáîòàåò íà áîëüøèõ ó÷àñòêàõ õðîìîñîìíîãî ìàòåðèàëà è ïëîõî - íà ìàëåíüêèõ. Ïîýòîìó ñîâïàäåíèÿ ìåíüøå 8-10 ñÌ íåêîòîðûå ÄÍÊ-ëàáîðàòîðèè äàæå íå ïðèíèìàþò âî âíèìàíèå è íå áåðóò â ðàñ÷åò. Õîòÿ íå èñêëþ÷åíî, ÷òî ôðàãìåíò â 3 ñÌ ïîêàæåò âàøå ðîäñòâî ñ îáùèì ïðåäêîì â 11-îì ïîêîëåíèè. Ýòî ÷àñòíûé ñëó÷àé, à íå çàêîíîìåðíîñòü.  ---
Ôàìèëèè: Êîëåñíèêîâû, Åôàíîâû (ñ.Äîíñêîå), Äîëåéø (×åõèÿ), Ìàëååâû (Ìàðòûíîâêà), Êîñàðåâû-Êîñûðåâû (Êàðñ, ÑØÀ, Ñàìàðà, Êàâêàç), Íàçàðîâû (õ.Ñêåëüíîâñêèé), Êîíîçà, Ñîëîäîâíèê (Êðèçñêîå), Íåôåäîâû (Íèêóëèíî), Ëèõîâñêèå (Ðîñò. îáë.) ÒÃ:@aleksan_sergeevich | | Ëàéê (2) |
Evgeny Kolchugin Ìîñêîâñêàÿ îáë. Ñîîáùåíèé: 1009 Íà ñàéòå ñ 2013 ã. Ðåéòèíã: 1298 | Íàâåðõ ##
25 íîÿáðÿ 2021 18:56 25 íîÿáðÿ 2021 19:04 yakto íàïèñàë: [q] Íîâè÷êàì âàæíî ïîíèìàòü, ÷òî ñîâïàäåíèÿ â cM - ýòî íå äëèíà èäåíòè÷íûõ ó÷àñòêîâ íóêëåîòèäíûõ ïîñëåäîâàòåëüíîñòåé, à îöåíêà âåðîÿòíîñòè èõ ñîâïàäåíèÿ íà îïðåäåëåííîì ó÷àñòêå ïîñëåäîâàòåëüíîñòè.[/q]
Ïî ñìûñëó ýòî âåðíî. Íî òîëüêî íå âåðîÿòíîñòü ñîâïàäåíèÿ, à íàîáîðîò, âåðîÿòíîñòü ðàçäåëåíèÿ îáùåãî ñîâïàäàþùåãî ó÷àñòêà (èìåþùåãî îäèíàêîâóþ ïîñëåäîâàòåëüíîñòüþ íóêëåîòèäîâ) ïðè ïåðåäà÷å ñëåäóþùåìó ïîêîëåíèþ.  îðãàíèçìå ÷åëîâåêà îäèí ñàíòèìîðãàí ñîîòâåòñòâóåò ïðèìåðíî îäíîé ìåãàáàçå (îäíîìó ìèëëèîíó ïàð îñíîâàíèé). Íî ýòà âåðîÿòíîñòü çàâèñèò îò ñöåïëåííîñòè íóêëåîòèäîâ â ðàçíûõ ó÷àñòêàõ õðîìîñîìû. Ïîýòîìó áîëåå êîðîòêèå ó÷àñòêè ìîãóò èìåòü áÎëüøóþ îöåíêó â ñÌ (ïðè ìàëîé ñöåïëåííîñòè), è íàîáîðîò. ---
https://kolchugin-story.ru
Æèçíü êàæäîãî ÷åëîâåêà äîñòîéíà ðîìàíà. /Èðâèí Ïîëüñòåð/
Êîëü÷óãèíû è Äóäíèêîâû: ñ. Òåðíîâêà Ïåíçåíñêîãî ó. Ïåíçåíñêîé ãóá.
Ïðîøèíû è Ãðèøíîâû: Áóò÷èíñêàÿ âîë. Æèçäðèíñêîãî ó. Êàëóæñêîé ãóá. | | |
tmauaÊèåâ Ñîîáùåíèé: 989 Íà ñàéòå ñ 2021 ã. Ðåéòèíã: 536 | Íàâåðõ ##
25 íîÿáðÿ 2021 19:26 25 íîÿáðÿ 2021 19:27 Evgeny Kolchugin íàïèñàë: [q] Íî ýòà âåðîÿòíîñòü çàâèñèò îò ñöåïëåííîñòè íóêëåîòèäîâ â ðàçíûõ ó÷àñòêàõ õðîìîñîìû. Ïîýòîìó áîëåå êîðîòêèå ó÷àñòêè ìîãóò èìåòü áÎëüøóþ îöåíêó â ñÌ (ïðè ìàëîé ñöåïëåííîñòè), è íàîáîðîò.[/q]
Ãåäìàò÷ êîãäà ðèñóåò êàðòèíêó, íåêîòîðûå øèðîêèå êóñêè (æåëòûé) ïî ñÌ èäåíòè÷íû ìàëåíüêèì (çåëåíûì). ß äóìàë, ýòî ïî ïðè÷èíå áîëüøåãî êîë. ñîâïàâøèõ SNP òàê ïðîèñõîäèò. Èëè òàêàÿ ïðîðèñîâêà êàê-ðàç è âûçâàíà ìåíüøåé ñöåïëåííîñòüþ íóêëåîòèäîâ â çåëåíåíüêèõ êóñêàõ?
 --- ( Êóçóá Êîìåíäàíò) - Ëåïëÿâî
(Ïåëûõ Âëàñåíêî Èãíàòåíêî Àíäðóùåíêî) - Êàíåâ
(Ãóáàðü Ðûáàëêî Òàòàðåíêî) - Áåëîïîëüå
(Ùåíÿâñêèé ßíóøåâè÷ Ñîêîëîâñêèé Ïèîíòêîâñêèé | | |
| Tulimov Íîâè÷îê
Ñîîáùåíèé: 20
Íà ñàéòå ñ 2006 ã.
Ðåéòèíã: 18 | Íàâåðõ ##
25 íîÿáðÿ 2021 23:51 25 íîÿáðÿ 2021 23:53 Óâàæàåìûå Ãóðó! Âèäèìî ëàáîðàòîðèÿì óæå íåîáõîäèìî âñåì âàì äîïëà÷èâàòü! ß åùå íå äîæäàëñÿ ïîëó÷åíèÿ ñâîèõ ðåçóëüòàòîâ, à ìíå óæå ñòðàøíî â íèõ ñìîòðåòü è îùóùåíèå ïîëíîé áåñïîëåçíîñòè äàííîãî ìåðîïðèÿòèÿ  Îãðîìíåéøàÿ ïðîñüáà, ñ ó÷åòîì òîãî, ÷òî áåñåäà âåäåòñÿ â ðàçäåëå "âîïðîñû íîâè÷êîâ", íåëüçÿ ëè êàê-òî, ïî âîçìîæíîñòè è â îáÿçàòåëüíîì ïîðÿäêå áåç òàêîâîé, ïîÿñíÿòü óïîòðåáëÿåìûå ñëîæíîâûãîâàðèâàåìûå (îáíàæàþ ýòî ñëîâî) òåðìèíû îáùåäîñòóïíûìè êîììåíòàðèÿìè Òàê ñêàçàòü, âñå ïèñàòü èìåííî, êàê äëÿ ÷àéíèêîâ! ß ïîíèìàë, ÷òî áóäåò íå ëåãêî, íî íå íàñòîëüêî æå Äàéòå ìíå îáíÿòü ëèöî òîãî ÷åëîâåêà, êîòîðûé âòÿíóë ìåíÿ â ýòó àôåðó! ---
Òóëèìîâû, Áàõòèíû, Êàøòûëîâû, Ñàõèíû, Ëîáàíîâû, Áàòîâû (ßðîñëàâñêàÿ îáë., Êîñòðîìñêàÿ îáë.), Ëåáåäåâû (ïðåäïîëîæèòåëüíî Êàëèíèíñêàÿ îáë. ïî ñîñòîÿíèþ íà 1941 ãîä) | | Ëàéê (2) |
Evgeny KolchuginÌîñêîâñêàÿ îáë. Ñîîáùåíèé: 1009 Íà ñàéòå ñ 2013 ã. Ðåéòèíã: 1298 | Íàâåðõ ##
26 íîÿáðÿ 2021 2:00 tmaua íàïèñàë: [q] Ãåäìàò÷ êîãäà ðèñóåò êàðòèíêó, íåêîòîðûå øèðîêèå êóñêè (æåëòûé) ïî ñÌ èäåíòè÷íû ìàëåíüêèì (çåëåíûì).
ß äóìàë, ýòî ïî ïðè÷èíå áîëüøåãî êîë. ñîâïàâøèõ SNP òàê ïðîèñõîäèò. Èëè òàêàÿ ïðîðèñîâêà êàê-ðàç è âûçâàíà ìåíüøåé ñöåïëåííîñòüþ íóêëåîòèäîâ â çåëåíåíüêèõ êóñêàõ?[/q]
ß äóìàþ, ïîñëåäíåå îáúÿñíåíèå. Ôèçè÷åñêè îíè ðàçíîé äëèíû. Òàì è êîëè÷åñòâî ñíèïîâ, óêàçàííîå äëÿ æåëòîãî è çåëåíûõ ôðàãìåíòîâ, ñèëüíî ðàçëè÷àåòñÿ. ---
https://kolchugin-story.ru
Æèçíü êàæäîãî ÷åëîâåêà äîñòîéíà ðîìàíà. /Èðâèí Ïîëüñòåð/
Êîëü÷óãèíû è Äóäíèêîâû: ñ. Òåðíîâêà Ïåíçåíñêîãî ó. Ïåíçåíñêîé ãóá.
Ïðîøèíû è Ãðèøíîâû: Áóò÷èíñêàÿ âîë. Æèçäðèíñêîãî ó. Êàëóæñêîé ãóá. | | |
Evgeny KolchuginÌîñêîâñêàÿ îáë. Ñîîáùåíèé: 1009 Íà ñàéòå ñ 2013 ã. Ðåéòèíã: 1298 | Íàâåðõ ##
26 íîÿáðÿ 2021 2:30 Tulimov íàïèñàë: [q] Îãðîìíåéøàÿ ïðîñüáà, ñ ó÷åòîì òîãî, ÷òî áåñåäà âåäåòñÿ â ðàçäåëå "âîïðîñû íîâè÷êîâ", íåëüçÿ ëè êàê-òî, ïî âîçìîæíîñòè è â îáÿçàòåëüíîì ïîðÿäêå áåç òàêîâîé, ïîÿñíÿòü óïîòðåáëÿåìûå ñëîæíîâûãîâàðèâàåìûå (îáíàæàþ ýòî ñëîâî) òåðìèíû îáùåäîñòóïíûìè êîììåíòàðèÿìè
Òàê ñêàçàòü, âñå ïèñàòü èìåííî, êàê äëÿ ÷àéíèêîâ!
[/q]
Íå áåñïîêîéòåñü, ïðèâûêíåòå, ïåðåñòàíåòå îáðàùàòü âíèìàíèå. Ëè÷íî ÿ äî ñèõ ïîð íå óâåðåí, ÷òî ñàì ïîíèìàþ òî, î ÷åì ãîâîðþ. È âû ñêîðî íàó÷èòåñü.  ìîåì ïîíèìàíèè, ó÷àñòîê äëèíîé 1 ñÌ îçíà÷àåò 1% âåðîÿòíîñòè òîãî, ÷òî ýòî ó÷àñòîê ðàçäåëèòñÿ (èëè ìîã ðàçäåëèòüñÿ ðàíåå) ïðè ïåðåäà÷å ïî íàñëåäñòâó â òå÷åíèå îäíîãî ïîêîëåíèÿ. Òî åñòü (ñðåäíÿÿ) âåðîÿòíîñòü ñóùåñòâîâàíèÿ ýòîãî ó÷àñòêà â íåèçìåííîì âèäå - 100 ïîêîëåíèé. Ñîîòâåòñòâåííî, 10 ñÌ - 10 ïîêîëåíèé, 20 ñÌ - 5 ïîêîëåíèé. Îáùåå êîëè÷åñòâî ñÌ ïðè áëèçêîì ðîäñòâå ãîðàçäî áîëüøå 100. Ýòî îáúÿñíÿåòñÿ áîëüøèì êîëè÷åñòâîì ñîâïàäàþùèõ ó÷àñòêîâ õðîìîñîì è òåì, ÷òî âåðîÿòíîñòü ðàçäåëåíèÿ îöåíèâàåòñÿ äëÿ êàæäîãî èç íèõ èíäèâèäóàëüíî, à ïîòîì ðåçóëüòàòû ïðîñòî ñóììèðóþòñÿ. Ñóùåñòâóþò òàáëèöû, ïîêàçûâàþùèå îðèåíòèðîâî÷íîå îáùåå êîëè÷åñòâî ñÌ ïðè ðàçíûõ ñòåïåíÿõ ðîäñòâà. ---
https://kolchugin-story.ru
Æèçíü êàæäîãî ÷åëîâåêà äîñòîéíà ðîìàíà. /Èðâèí Ïîëüñòåð/
Êîëü÷óãèíû è Äóäíèêîâû: ñ. Òåðíîâêà Ïåíçåíñêîãî ó. Ïåíçåíñêîé ãóá.
Ïðîøèíû è Ãðèøíîâû: Áóò÷èíñêàÿ âîë. Æèçäðèíñêîãî ó. Êàëóæñêîé ãóá. | | |
yaktoÃëóáîêàÿ ïðîâèíöèÿ Ñîîáùåíèé: 340 Íà ñàéòå ñ 2015 ã. Ðåéòèíã: 252 | Íàâåðõ ##
26 íîÿáðÿ 2021 10:49 26 íîÿáðÿ 2021 11:59 Evgeny Kolchugin íàïèñàë: [q] ó÷àñòîê äëèíîé 1 ñÌ[/q]
Óæå ïîÿñíÿë âûøå Ñàíòèìîðãàí - íå åäèíèöà èçìåðåíèÿ äëèíû, à åäèíèöà èçìåðåíèÿ âåðîÿòíîñòè êðîññèíãîâåðà íà ó÷àñòêå ÄÍÊ-ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ìåæäó äâóìÿ ëîêóñàìè. Åñëè õîòèòå, óïðîùåííî, ðàññòîÿíèå ìåæäó äâóìÿ êðîññèíãîâåðàìè íà ó÷àñòêå ãåíîìà. Êîãäà âû äåëàåòå àóòîñîìíûé òåñò ÄÍÊ, îïðåäåëÿåòñÿ íå âñÿ íóêëåîòèäíàÿ ïîñëåäîâàòåëüíîñòü âàøåãî ãåíîìà (êàê ïðè ïîëíîì ñåêâåíèðîâàíèè), à òîëüêî îòäåëüíûõ ëîêóñîâ - SNP (Single Nucleotide Polymorphism, ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ÄÍÊ ðàçìåðîì â îäèí íóêëåîòèä:A, T, G, C). Òèïîâîé òåñò âêëþ÷àåò â ñåáÿ íàáîð îêîëî 600 òûñ. SNP. À âîò íà äèñòàíöèè ìåæäó äâóìÿ ëîêóñàìè ïðåäïîëàãàåòñÿ, ÷òî âåðîÿòíîñòü êðîññèíãîâåðà ñîñòàâëÿåò íå áîëåå 1%. Òî åñòü ìû íå çíàåì íàâåðíÿêà, íî âåðîÿòíîñòü òàêàÿ (1 ñÌ). Òàê êàê âåðîÿòíîñòü îïðåäåëÿåòñÿ íà ó÷àñòêå ìåæäó ëîêóñàìè, îíà êîððåëèðóåò ñ ôèçè÷åñêîé äèñòàíöèåé â êîëè÷åñòâå íï, íî íå ÿâëÿåòñÿ ðàññòîÿíèåì èëè äëèíîé. Íà ðàçíûõ ó÷àñòêàõ ãåíîìà ñàíòèìîðãàí ìîæåò îõâàòûâàòü ïîñëåäîâàòåëüíîñòè â ðàçíîì êîëè÷åñòâå. ×åì áîëüøå ëîêóñîâ (SNP) ñîâïàäàåò, òåì áîëüøå îöåíêà âåðîÿòíîñòè â ñÌ è ôàêòè÷åñêàÿ âåðîÿòíîñòü òîãî, ÷òî ñðàâíèâàåìûé ó÷àñòîê ãåíîìà èìååò îáùåãî ïðåäêà. Ýòî âñå î÷åíü óïðîùåííî, äëÿ îáùåãî ïðåäñòàâëåíèÿ. Ñëåäóåò îòìåòèòü òàêæå, ÷òî ó MH è FTDNA àëãîðèòìû ïðèâåäåíèÿ ê åäèíîé åäèíèöå èçìåðåíèÿ ñóùåñòâåííî îòëè÷àþòñÿ, ïîýòîìó îöåíêè äëÿ äâóõ ñðàâíèâàåìûõ îáðàçöîâ ÄÍÊ îòëè÷àþòñÿ. Íàïðèìåð, MH ãîâîðèò î ñîâïàäåíèè â 11 ñÌ, à FTDNA - 15 ñÌ.  õðîìîñîìíûõ áðàóçåðàõ ìîæíî óâèäåòü, ÷òî äàæå ñåãìåíòû õðîìîñîì îòëè÷àþòñÿ. Êîìó âåðèòü - ïðàâî âûáîðà çà âàìè.  ëþáîì ñëó÷àå, ýòî âåðîÿòíîñòíàÿ îöåíêà. È â ñëó÷àå ìàëåíüêèõ ñîâïàäåíèé - ìàëîâåðîÿòíîñòíàÿ. Î ÷åì óæå ãîâîðèëîñü âûøå. ×òîáû ñòàëî åùå ïîíÿòíåé: íà ó÷àñòêàõ ìåæäó èçâåñòíûìè ëîêóñàìè (SNP) ìû òåîðåòè÷åñêè äîñòðàèâàåì ïîñëåäîâàòåëüíîñòü ÄÍÊ, ïðåäïîëàãàÿ, ÷òî îíà â áîëüøèíñòâå ñëó÷àåâ íåèçìåííà. È òàêèì îáðàçîì ïîëó÷àåì ãèïîòåòè÷åñêèé ïîëíûé ñèêâåíñ ãåíîìà. Äåøåâî è ñåðäèòî.  äîïîëíåíèå, ëîêóñû SNP åùå èíîãäà íàçûâàþò ìàðêåðàìè.  íàøåì ñëó÷àå, ìàðêèðóþòñÿ ñàìûå ïîëèìîðôíûå (èçìåí÷èâûå) ó÷àñòêè ãåíîìà. Çíà÷åíèÿ ìàðêåðîâ ñðàâíèâàþòñÿ ëàáîðàòîðèåé-òåñòèðîâùèêîì. Òåõíè÷åñêè ýòîãî äîñòàòî÷íî äëÿ óñòàíîâëåíèÿ áëèçêîãî ðîäñòâà, ñ äàëüíèì - êàê ïîâåçåò. Âñå îñòàëüíûå íÿøêè â âèäå ñÌ è õðîìîñîìíûõ áðàóçåðîâ òîëüêî äëÿ âíÿòíîé âèçóàëèçàöèè è ïðèâëå÷åíèÿ íîâîãî êëèåíòà. Ìû æå, êàê âçðîñëûå ëþäè, ïîíèìàåì, ÷òî ýòî äàëåêî íå ðåàëüíîñòü. tmaua íàïèñàë: [q] Ãåäìàò÷ êîãäà ðèñóåò êàðòèíêó, íåêîòîðûå øèðîêèå êóñêè (æåëòûé) ïî ñÌ èäåíòè÷íû ìàëåíüêèì (çåëåíûì).[/q]
Âîò êñòàòè, íà ñêðèíøîòå tmaua âèäíî, ÷òî ó÷àñòêè ðàçíîãî ðàçìåðà, à îöåíêà â ñÌ ïî÷òè îäèíàêîâàÿ. Íåñîðàçìåðíîñòü óêàçûâàåò íà ñîìíèòåëüíûé ðåçóëüòàò ñîâïàäåíèÿ èëè çàâûøåííûé â îöåíêå ñîâïàäåíèÿ. Ãåäìàò÷ ïîäñâåòèë ó÷àñòîê æåëòûì (íå íàçûâàÿ ñîìíèòåëüíûì, à íàçûâàÿ íàïîëîâèíó ñîâïàäåíèåì ). ---
Ôàìèëèè: Êîëåñíèêîâû, Åôàíîâû (ñ.Äîíñêîå), Äîëåéø (×åõèÿ), Ìàëååâû (Ìàðòûíîâêà), Êîñàðåâû-Êîñûðåâû (Êàðñ, ÑØÀ, Ñàìàðà, Êàâêàç), Íàçàðîâû (õ.Ñêåëüíîâñêèé), Êîíîçà, Ñîëîäîâíèê (Êðèçñêîå), Íåôåäîâû (Íèêóëèíî), Ëèõîâñêèå (Ðîñò. îáë.) ÒÃ:@aleksan_sergeevich | | Ëàéê (3) |
tmauaÊèåâ Ñîîáùåíèé: 989 Íà ñàéòå ñ 2021 ã. Ðåéòèíã: 536 | Íàâåðõ ##
26 íîÿáðÿ 2021 13:13 26 íîÿáðÿ 2021 13:16 yakto íàïèñàë: [q]
Âîò êñòàòè, íà ñêðèíøîòå tmaua âèäíî, ÷òî ó÷àñòêè ðàçíîãî ðàçìåðà, à îöåíêà â ñÌ ïî÷òè îäèíàêîâàÿ. Íåñîðàçìåðíîñòü óêàçûâàåò íà ñîìíèòåëüíûé ðåçóëüòàò ñîâïàäåíèÿ èëè çàâûøåííûé â îöåíêå ñîâïàäåíèÿ. Ãåäìàò÷ ïîäñâåòèë ó÷àñòîê æåëòûì (íå íàçûâàÿ ñîìíèòåëüíûì, à íàçûâàÿ íàïîëîâèíó ñîâïàäåíèåì biggrin1.gif ).[/q]
Åñëè ðàññìîòðåòü äåòàëüíåå æåëòûé è ïåðâûé çåëåíûé êóñî÷åê, îáà èìåþùèå +- 7 ñÌ, òî ïîëó÷èì òàêóþ êàðòèíó. Ñàìîìó õîòåëîñü áû ÷åòêî è îäíîçíà÷òíî ïîíÿòü ýòó êàðòèíêó. 1 - èñõîäíàÿ êàðòèíêà (òóò çåëåíûé è æåëíûé öâåò íå óêàçûâàþò íè íà ÷òî, ïðîñòî öâåò) 2 - äåòàëüíàÿ êàðòèíêà äëÿ æåëêîãî êóñî÷êà 3 - äåòàëüíàÿ êàðòèíêà äëÿ ïåðâîãî çåëåíîãî êóñî÷êà Ïîêà ÿ åå òðàêòóþ òàê: " Æåëòûé êóñî÷åê î÷åíü äëèííûé, íî â íåì î÷åíü ìàëåíüêàÿ ïëîòíîñòü SNP (ò.å. ìàëî SNP åñòü â ýòîì êóñî÷êå).  æåëòîì êóñî÷êå íà âñåé åãî äëèííå (ñ 37Ì ïî 74Ì) íàéäåíî 576 ñîâïàâøèõ SNP. Ãåäìàò÷ èñïîëüçóÿ ìàòàïïàðàò ïîñòàâèë òàêîìó æåëòîìó êóñî÷êó çíà÷åíèå Q-value=162. Ïåðâûé çåëåíûé êóñî÷åê î÷åíü êîðîòêèé, íî â íåì ïðèëè÷íàÿ ïëîòíîñòü SNP (ò.å. ìíîãî SNP åñòü â ýòîì êóñî÷êå).  çåëåíîì êóñî÷êå íà âñåé åãî äëèííå (ñ 136Ì ïî 137Ì) íàéäåíî 215 ñîâïàâøèõ SNP. Ãåäìàò÷ èñïîëüçóÿ ìàòàïïàðàò ïîñòàâèë òàêîìó çåëåíîìó êóñî÷êó çíà÷åíèå Q-value=33. Ò.å. ãåäìàò÷ ñ÷èòàåò áîëåå âåðîÿòíîñòíûì ïðàâèëüíîñòü æåëòîãî êóñî÷êà. " Âàøè ìíåíèÿ?
 --- ( Êóçóá Êîìåíäàíò) - Ëåïëÿâî
(Ïåëûõ Âëàñåíêî Èãíàòåíêî Àíäðóùåíêî) - Êàíåâ
(Ãóáàðü Ðûáàëêî Òàòàðåíêî) - Áåëîïîëüå
(Ùåíÿâñêèé ßíóøåâè÷ Ñîêîëîâñêèé Ïèîíòêîâñêèé | | |
Evgeny KolchuginÌîñêîâñêàÿ îáë. Ñîîáùåíèé: 1009 Íà ñàéòå ñ 2013 ã. Ðåéòèíã: 1298 | Íàâåðõ ##
26 íîÿáðÿ 2021 13:43 yakto, áëåñòÿùåå îáúÿñíåíèå! Ëè÷íî ÿ, ïîëîìàâ ãîëîâó íàä òåìîé, îñòàâèë ïîïûòêè äåòàëüíîãî èçó÷åíèÿ ìåõàíèçìà îöåíêè ðåçóëüòàòîâ è ïîëàãàþñü íà âûâîäû ëàáîðàòîðèè. Äëÿ áëèçêîãî ðîäñòâà èõ ìíåíèå äîñòàòî÷íî íàäåæíî, à äëÿ äàëüíåãî - íå î÷åíü-òî è íóæíî)) Íà ñàìîì äåëå, ìåòîäèêà îöåíêè - ýòî îãðîìíàÿ íàó÷íàÿ òåìà. Âçÿòü õîòÿ áû òîò ôàêò, ÷òî âñå àóòîñîìû ïàðíûå. Ïîýòîìó ñîâïàäåíèå êàæäîãî ìàðêåðà ìîæåò èìåòüñÿ êàê ïî îäíîé, òàê è ïî äâóì õðîìîñîìàì â ïàðå. À ó÷èòûâàÿ, ÷òî ìàðêåðîâ ñîòíè òûñÿ÷...  îáùåì, áîé â Êðûìó, âñ¸ â äûìó. ---
https://kolchugin-story.ru
Æèçíü êàæäîãî ÷åëîâåêà äîñòîéíà ðîìàíà. /Èðâèí Ïîëüñòåð/
Êîëü÷óãèíû è Äóäíèêîâû: ñ. Òåðíîâêà Ïåíçåíñêîãî ó. Ïåíçåíñêîé ãóá.
Ïðîøèíû è Ãðèøíîâû: Áóò÷èíñêàÿ âîë. Æèçäðèíñêîãî ó. Êàëóæñêîé ãóá. | | |
|
Ìîé (Lesla) êàíàë â Òåëåãðàììå, ãäå áóäó ïðîáîâàòü ðàññêàçûâàòü íîâè÷êàì î ïðèìåíåíèè ìåòîäîâ ÄÍÊ-òåñòèðîâàíèÿ â ãåíåàëîãèè - https://t.me/gen_gen25