ДНК-генеалогия

nmash
Цитата прошлогодняя и не совсем по теме, но почему-то вспомнилось, когда наткнулся на заметку в Газете.Ru.

[q]

Приношу тесты, дочь отдает их учительнице биологии.
Через пару дней та меня вызывает в школу (впервые, кстати, за время учебы дочки).
В чём дело?
Пожилая, заслуженная (это ее титул!) учительница биологии мне говорит: "Я дала тесты заполнить родственникам, у них знакомые в ФСБ и эти знакомые сказали, что ни в коем случае нельзя отправлять генетический материал в США, это очень опасно!".

[/q]

Недавняя работа израильских ученых, опубликованная в журнале Forensic Science International: Genetics - Авторам исследования удалось сделать из образцов крови одного человека кровь, ДНК-анализ которой показал, будто бы она принадлежит другому человеку. Кроме того, они показательно воссоздали профиль ДНК определенного человека из базы данных без участия самого донора. Таким образом, сцена преступления может быть полностью перекроена, причем автор Дан Фрумкин считает, что процедура настолько проста, что ее может провести любой студент-биолог.

С уважением,
Олег

Советы.
Окурки лучше всего смывать в унитазе. В противном случае их может кто-нибудь подобрать. Переправить в Штаты. Там разбросать на месте преступления. ДНК-тест укажет на Вас как на преступника. (Без израильских ученых. Но тесты выдумали, конечно же, евреи.)
При отсутствии туалета, окурки рекомендуется съедать.
По этим же причинам не плюйте где попало - враг не дремлет. Очень практичная вещь - маленькая плёвка. Как у чахоточных 19 века.
Люди, будьте бдительны!!!

Stan_is_love написал:

[q]

Mich_Glitch
Здравствуйте, Михаил!
Прошу Вас о консультации, в порядке оказания шефской помощи: подскажите какова вероятность общего предка и в каком временном промежутке у меня, Ysearch: HEEPR и JCE56, причём у меня 458 маркер не определился, поэтому дистанция большая, заранее признателен.
С уважением. Станислав.

[/q]

То что один маркер не определился, не увеличивает генетическую дистанцию, а просто уменьшает количество сравниваемых маркеров.

Итак имеем.
Количество сравниваемых маркеров: 66.
Генетическая дистанция: 32 одношаговая мутация.
Количество совпадений: 34 (т.е. от 66 отнимаем 34).
Используемый метод расчета времени до общего предка: метод Уолша.
Используемый доверительный вариант: 0.5 (предполагается, что на такой большой глубине имела место явная общность польского и украинского прото субстратов).
Средняя скорость мутаций: 0.0021 мутации на поколение на маркер.
Поколенный интервал: 30 лет.

Получаем:
1. По суммарной вероятности. 161 поколение, или около 4800 лет до общего предка.
2. По пиковой вероятности. 158 поколений, или около 4750 лет до общего предка.

Общий вывод: не родственник.

Mich_Glitch
Здравствуйте, Михаил!
Метод Уолша для меня пока загадка, а простыми арифметическими вычислениями у меня не получилось ничего высчитать.
Я набрался наглости и решил ещё раз обратиться к Вам за советом, ближайший ко мне по базе Ysearch: Z72YQ Sliwinski в 15 шагах из 66. Сколько у нас с ним до общего предка?
С уважением. Станислав.

Stan_is_love написал:

[q]

ближайший ко мне по базе Ysearch: Z72YQ Sliwinski в 15 шагах из 66. Сколько у нас с ним до общего предка?

[/q]

Stan_is_love, для расчета времен по совпадающем (на такой глубине) географическим регионам я использую совпадающие маркеры, а не одношаговые генетические дистанции.
Итак, в Вашем случае, из 66 маркеров не совпадает 12 (т.е. имеем 54 матча).
Воспользовавшись TMRCA Calculator, и приняв скорость мутаций 0.0021, размеры поколения 30, доверительный интервал 50%, получаем следующий результат: Ваш со Сливинским общий предок жил не далее 1500 лет тому назад, наиболее вероятно (с вероятностью 1.433%) 1450 лет тому назад. Короче говоря, родился в начале 6 века.

Кстати, вот тут (ссылка) я даю простую иллюстрированную инструкцию построения филогенетических деревьев по результатам ДНК-тестов.
А тут (ссылка) даю метод расчета времен до общего предка для групп.
Ну, а с попарным расчетом, думаю, мы разобрались.