ДНК-генеалогия

татиа написал:

[q]

Mich_Glitch,
У меня как раз платный. Причем, говорили, что через 2 недели будет предварительная информация,
очевидно, по малому количеству маркеров, а через 2 месяца полная (я заказала 67).
Сил уже нет никаких терпеть. Интересно же.

[/q]

Я делаю дип-снип (то есть точное, максимально подробное на сегодня определение подгруппы) в ФэмилиТриДНА.
Это апгрейд, то есть работают на основании уже имеющихся у них моих биологических образцов. Так вот, не могу получить результаты четвертый месяц!!! Дату их (результатов) получения переносили три раза, а потом вообще перестали обещать хоть какую-нибудь дату. Говорят, что тест с первого ряда не дал достоверного результата по всем маркерам и необходима перепроверка.
Вообще, из личного опыта, быстро работает только www.DNATribes.com . Но это и понятно, они делают только аутосомный анализ (этно-популяционный) на основании стандартного судебного набора CODIS. А для его проведения сейчас уже есть портативная аппаратура, позволяющая делать тесты даже на месте преступления во время первичного осмотра.

Скоро в Москве будет своя лаборатория, которая обещает выпонять тесты по 67-маркерам за 1.5-2 месяца по ценам от ФэмилиТриДНА.

татиа написал:

[q]

А что даст апгрейд, или что Вы надеетесь узнать, делая апгрейд?

[/q]

Сейчас апгрейд дает не очень много - знание формальной группы, т.е., огрубляя, принадлежность к клану с общим предком 2-3 тысячи лет назад.
Но это все равно имеет пользу при построении филогенетических деревьев, то есть установлении родства.
Представьте себе листья на дереве. Некоторые из них могут быть очень рядом (выражаясь языком ДНК-генеалогии, расположены на малой генетической дистанции). А вот ветви их могут иметь общую точку очень отдаленную. Общая точка соответствует общему предку, а ветки - субкладам, которые и определяются дип-снип апгрейдом.
Для того чтобы определить общих предков на глубину не дальше 10-11 поколений (250-275 лет) разумнее рассматривать данные только по своим субкладам.
Все это делается на перспективу.
Пока определяющим является количество рассматриваемых маркеров.
12 маркеров - это как выезжать на пикник выходного дня, пользуясь для выбора места и проезда к нему политической картой мира.
25 маркеров уже дают подробную детализацию, но с привкусом технологии вчерашнего дня.
37 маркеров - это уже здорово.
Ну, а 67 маркеров - это для перфекционистов и людей увлеченных.

Theodor написал:

[q]

Mich_Glitch

Вот получил я бесплатный наборчик из фонда Соренсона, но не очень понимаю, что теперь с этим делать. Во-первых, там что-то говорится про белые и розовые страницы - но у меня все страницы белые. Во-вторых, неясно, в каком виде отсылать им родословную; в частности, надо ли изощряться и пытаться изобразить все это латиницей или можно кириллицей; можно ли оформить родословную как картинку (например, при помощи Древа жизни). Буду благодарен за разъяснения.

[/q]

Привожу письмо с объяснением, которое я делал на другом форуме:

[q]

1)А листок с родословной от руки заполнять или напечатать?

[/q]

1) Заполните от руки. Если есть файл GEDCOM (латиницей!), то можете приложить на CD диске.

[q]

То есть я могу указать только отца и мать?
Воспитанник интерната, который не знает своих горе-родителей, может написать только себя?

[/q]

2) Я во избежание сюрпризов, вместо неизвестных мне имен некоторых прадедов, написал простые имена (без фамилий и отчеств) с потолка.
Сколько я понимаю, потом можно будет сделать апдейт на сайте Соренсона. Хотя возможно это просто лишняя
перестраховка.

[q]

3)Тут про какие то РОЗОВЫЕ страницы написано, мне пришли только белые

[/q]

3) Что пришло, то и заполняйте.


4) Учитывая недостаток места на листке-форме, имена (латиницей!) пишите без отчеств, а место рождения указывайте
"Россия". Думаю, что потом можно будет на сайте добавить, или подправить родословную.

5) Опять же за недостатком места, можете из дат указывать только годы рождения, или только годы смерти.
Если не знаете точно даты, то можно написать так: Abt 1903, Bef 1903, Aft 1903, Cir 1900.
Что означает соотвественно: about - около, before - перед, after - после, circa - приблизительно в.

Только, пожалуйста, не надо никаких потолочных предков. Там ведь сказано - если Вы не живете в США, то неполное древо не будет препятствием для проведения анализа.

napobo3 написал:

[q]

Только, пожалуйста, не надо никаких потолочных предков. Там ведь сказано - если Вы не живете в США, то неполное древо не будет препятствием для проведения анализа.

[/q]

Я бы не был столь категоричен, особенно подписав перед заказом тестового набора в дисклаймере:

[q]

My pedigree lists at least three generations of biological ancestors

[/q]

Мое родословие включает, как минимум, три поколения биологических предков. Толковать сие можно разно. От того я и сделал оговорку:

Mich_Glitch написал:

[q]

Я во избежание сюрпризов, вместо неизвестных мне имен некоторых прадедов, написал простые имена (без фамилий и отчеств) с потолка.

[/q]

Известны случаи не внесения в текущую базу и "перенос на потом". Справьтесь у Clavis на форуме ДНАТри.ру. По-моему, представляется вполне логичным при составлении батчей для секвенсирования выбрать сначала наиболее интересные, т.е. наиболее полные случаи.

Такого же мнения и о ремарке по поводу русского языка от уважаемой Gontar - наверняка переведут, но время это дополнительное несомненно отнимет, да и транслитерацию имен могут переврать (одну только мою фамилию записывали 5 разными методами - это из личного, более 12 лет опыта, жизни на Западе).

На розовых листках раньше печатали Ваш экземпляр договора, теперь посылки стали более экологичными - экономят бумагу, а текст можно прочесть по ссылке, предоставленной Gontar