Gedmatch
сайт для интерпретации аутосомных тестов
| ElenaFilippova77
Сообщений: 175
На сайте с 2018 г.
Рейтинг: 77
| Наверх ##
4 декабря 2025 18:26 PedigreeResearcher написал: [q]
ElenaFilippova77 написал:
[q]
предполагаемого правнука его дяди по отцу
[/q]
Не очень понятно описание родства.
Что-то вот такое:
[/q]
Вот такое предполагаемое родство.
 ---
Андреев Петр С. (Нижегородская губерния, с.Абрамовка Симбирской губ.), Черных Андрей А. (ОКВ, станица Березинская, отряд Бородинский), Филипповы (Порховский уезд д.Сопша), Трусовы (д.Максаков Бор, Порховский уезд), Воронцовы (Порховский уезд, д.Пальцево) Алексахины, Марковы (Рязань) | | |
| PedigreeResearcher | Наверх ##
4 декабря 2025 18:39 4 декабря 2025 18:46 2 поколения от первого тестируемого.
4 поколения от второго тестируемого.
Родство не полное, а половинное (по одному родителю).
Итого, документальный (предполагаемый) ВБОП (время до ближайшего общего предка) составляет:
(2 + 4) / 2 + 1 = 4 поколения.
Против 6.3 поколений, указанных ГЕДматч. | | |
| PedigreeResearcher | Наверх ##
4 декабря 2025 18:42 На глубине 4 поколения и глубже, проявляет себя случайный характер наследования.
Иными словами, если от отца и матери мы получаем по 50% генома (почти ровно), то от бабушек-дедушек уже редко имеем точных 25%. А что-то вроде 23%, 24%, 26%... | | |
| PedigreeResearcher | Наверх ##
4 декабря 2025 18:45 Следующее соображение, ГЕДматч указывает только наиболее вероятную степень родства. На деле же, имеем вероятностное распределение. То есть, набор разных вероятностей для разных степеней родства. Типа, вот такого:  | | Лайк (1) |
| PedigreeResearcher | Наверх ##
4 декабря 2025 18:54 Дальше.
ГЕДматч использует кроссплатформенное сравнение. Говоря иначе, результаты от разных лабораторий.
Хорошо, когда сравниваются два сэмпла (образца) из "достойной" (заслуживающей доверия) компании, типа, ФТДНА.
Ну, а когда имеем что-то от необременённых опытом и квалификацией (какой-нибудь Генотек, скажем), то обязательно надо смотреть на т.н. "перекрытие" (overlap).
По меньшей мере, это значение не должно быть выделено красным цветом при настройках по умолчанию. Как вот тут в примере:
 | | |
| PedigreeResearcher | Наверх ##
4 декабря 2025 18:58 Продолжаем.
Очень важно качество секвенирования. То есть, качество самого образца. Количество использованного биологического материала. Его чистота.
ГЕДматч позволяет проверить, насколько хороши сравниваемые сэмплы.
Для этого необходимо использовать бесплатную утилиту GEDmatch DNA Kit Diagnostic Utility. | | |
| PedigreeResearcher | Наверх ##
4 декабря 2025 19:00 4 декабря 2025 19:01 Ну, а теперь подходим к не очень обнадёживающему выводу:
Результаты теста не опровергли, но и не подтвердили на 100% предполагаемую степень родства.
Увы. | | |
| ElenaFilippova77
Сообщений: 175
На сайте с 2018 г.
Рейтинг: 77
| Наверх ##
4 декабря 2025 19:14 PedigreeResearcher написал: [q] Продолжаем.
Очень важно качество секвенирования. То есть, качество самого образца. Количество использованного биологического материала. Его чистота.
ГЕДматч позволяет проверить, насколько хороши сравниваемые сэмплы.
Для этого необходимо использовать бесплатную утилиту GEDmatch DNA Kit Diagnostic Utility.[/q]
файл от Генотек, GМ утилита написал качество хорошее, второй образец от МН, да образцы от разных. Вот и я не могу не опровергнуть, не подтвердить))) Спасибо за разъяснения! ---
Андреев Петр С. (Нижегородская губерния, с.Абрамовка Симбирской губ.), Черных Андрей А. (ОКВ, станица Березинская, отряд Бородинский), Филипповы (Порховский уезд д.Сопша), Трусовы (д.Максаков Бор, Порховский уезд), Воронцовы (Порховский уезд, д.Пальцево) Алексахины, Марковы (Рязань) | | |
| PedigreeResearcher | Наверх ##
4 декабря 2025 19:22 Ещё побубню.
По английски, предполагаемая сепень родства из Вашего примера называется half second cousins.
Если бы наследование всегда шло в пропорциях 50% на 50%, то для данной степени родства совпадение генома (% shared) составило бы 1.563%.
Тот же самый критерий нов сантиМорганах (Total cM shared half-identical (or better)) был бы равен 106.25 сМ. | | |
| PedigreeResearcher | Наверх ##
4 декабря 2025 19:24 Генотек, это такая, брат, штука, Генотек. Никому не порекомендую.
МН - суть ФТДНА. В части физического выполнения тестов. Нормально так.
Что с перекрытием (overlap)? | | |
|
