Genotek
| karenine Ó÷àñòíèê
Ìîñêâà
Ñîîáùåíèé: 81
Íà ñàéòå ñ 2019 ã.
Ðåéòèíã: 45 | Íàâåðõ ##
9 ÿíâàðÿ 2024 16:53 >> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Gregarius îò 25 èþëÿ 2022 18:49 Äîáðûé äåíü, êàæåòñÿ, óòèëèòà ýòà áîëüøå íå ðàáîòàåò, âû íå â êóðñå? | | |
Gregarius Êàëóãà Ðîññèÿ Ñîîáùåíèé: 190 Íà ñàéòå ñ 2022 ã. Ðåéòèíã: 225 | Íàâåðõ ##
9 ÿíâàðÿ 2024 23:14 9 ÿíâàðÿ 2024 23:15 karenine íàïèñàë: [q] >> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Gregarius îò 25 èþëÿ 2022 18:49
Äîáðûé äåíü, êàæåòñÿ, óòèëèòà ýòà áîëüøå íå ðàáîòàåò, âû íå â êóðñå?[/q]
Äà, âåðíî - ñêðèïò áîëüøå íå ðàáîòàåò. Ãåíîòåê âíåñ èçìåíåíèÿ â êîä ñàéòà. Àâòîð, âîçìîæíî ñêîððåêòèðóåò ñêðèïò, íî ýòî ìàëîâåðîÿòíî. Óâû, îñòàåòñÿ òîëüêî ïèíàòü êîìïàíèþ. | | Ëàéê (1) |
| eugrus Ó÷àñòíèê
Ñîîáùåíèé: 64
Íà ñàéòå ñ 2006 ã.
Ðåéòèíã: 39 | Íàâåðõ ##
11 ÿíâàðÿ 2024 19:16 vesmi íàïèñàë: [q] óáðàëè âêëàäêó VCF tool äëÿ êîíâåðòàöèè èç VCF ôîðìàòà â 23andMeV5[/q]
ß áû ìîæåò íàïèñàë êîíâåðòåð, íî îäíó âåùü ïîêà åù¸ íå ïîíèìàþ: êàê èç êîëîíîê QUAL è FILTER â VCF ïîëó÷èòü ïðîñòóþ ïàðó àëëåëåé. Åñëè ñîáåðóñü ñäåëàòü, ñïðîøó çíàêîìîãî ãåíåòèêà. Îñòàëüíîå ïîíÿòíî: èç âòîðîé êîëîíêè VCF äåëàåòñÿ òðåòüÿ â CSV äëÿ 23andMe, èç òðåòüåé â VCF ïåðâàÿ â CSV. Ó MyHeritage òàêîé æå ïîðÿäîê êîëîíîê, êàê ó 23andMe, òîëüêî ðàçäåëèòåëè äðóãèå. | | |
dearthfu Ñîîáùåíèé: 606 Íà ñàéòå ñ 2019 ã. Ðåéòèíã: 1382 | Íàâåðõ ##
12 ÿíâàðÿ 2024 0:06 eugrus íàïèñàë: [q] ß áû ìîæåò íàïèñàë êîíâåðòåð, íî îäíó âåùü ïîêà åù¸ íå ïîíèìàþ: êàê èç êîëîíîê QUAL è FILTER â VCF ïîëó÷èòü ïðîñòóþ ïàðó àëëåëåé. Åñëè ñîáåðóñü ñäåëàòü, ñïðîøó çíàêîìîãî ãåíåòèêà.[/q]
Íåäàâíî óçíàë ÷òî âñå ýòè òåñòû äåëàþòñÿ íà ÷èïàõ êîìïàíèè Illumina. eugrus íàïèñàë: [q] Îñòàëüíîå ïîíÿòíî: èç âòîðîé êîëîíêè VCF äåëàåòñÿ òðåòüÿ â CSV äëÿ 23andMe, èç òðåòüåé â VCF ïåðâàÿ â CSV.
Ó MyHeritage òàêîé æå ïîðÿäîê êîëîíîê, êàê ó 23andMe, òîëüêî ðàçäåëèòåëè äðóãèå.[/q]
Âû ëó÷øå íàïèøèòå ÷åì îòëè÷àþòñÿ äàííûå ïî ìóæñêîé õðîìîñîìå îò êîìïàíèé Ãåíîòåê, 23&me è ancestry.com? Ó ìåíÿ åñòü 2 òåñòà îò ðîäñòâåííèêà êîòîðûé óìåð, êîòîðûé áûë ïðîòåñòèðîâàí â êîìïàíèÿõ 23&me è ancestry.com, òî ìîæíî ëè ñîáðàòü äîñòàòî÷íî äàííûõ äëÿ ñáîðà BAM ôàéëà äëÿ ïðîåêòà yfull.com? | | |
| I_Sokka
Ñàíêò-Ïåòåðáóðã
Ñîîáùåíèé: 501
Íà ñàéòå ñ 2019 ã.
Ðåéòèíã: 472
| Íàâåðõ ##
12 ÿíâàðÿ 2024 1:35 12 ÿíâàðÿ 2024 1:40 dearthfu íàïèñàë: [q] Ó ìåíÿ åñòü 2 òåñòà îò ðîäñòâåííèêà êîòîðûé óìåð, êîòîðûé áûë ïðîòåñòèðîâàí â êîìïàíèÿõ 23&me è ancestry.com, òî ìîæíî ëè ñîáðàòü äîñòàòî÷íî äàííûõ äëÿ ñáîðà BAM ôàéëà äëÿ ïðîåêòà yfull.com? [/q]
Áåçóñëîâíî ñîçäàòü BAM-ôàéë ïî ðåçóëüòàòàì ïðîñòûõ àóòîñîìíûõ òåñòîâ íåëüçÿ. BAM-ôàéë - ýòî ïîëíîãåíìíûé òåñò. dearthfu íàïèñàë: [q]
eugrus íàïèñàë:
[q]
Îñòàëüíîå ïîíÿòíî: èç âòîðîé êîëîíêè VCF äåëàåòñÿ òðåòüÿ â CSV äëÿ 23andMe, èç òðåòüåé â VCF ïåðâàÿ â CSV.
Ó MyHeritage òàêîé æå ïîðÿäîê êîëîíîê, êàê ó 23andMe, òîëüêî ðàçäåëèòåëè äðóãèå.
[/q]
Âû ëó÷øå íàïèøèòå ÷åì îòëè÷àþòñÿ äàííûå ïî ìóæñêîé õðîìîñîìå îò êîìïàíèé Ãåíîòåê, 23&me è ancestry.com?[/q]
Ñåé÷àñ îíè óæå ïðàêòè÷åñêè íè÷åì íå îòëè÷àþòñÿ, òàê êàê äåëàþòñÿ îíè âñå íà ñòàíäàðòîì ÷èïå GSA. Åñëè ðåçóëüòàòû ñòàðûå, òî ìîãóò îòëè÷àòüñÿ ïî ãëóáèíå îïðåäåëåíèÿ Y-ãàïëîãðóïïû, íî â ëþáîì ñëó÷àå ýòî ãäå-òî 4000-2000 ëåò. ---
Èùó Ñîêêà èëè Ñîêêî (Ïå÷åíêèí), Êàòàëà (Áîíäàðåâ), Ìåòñî (Ñåì¸íîâ), Òóçáåðã. ïðèõîä, è äåðåâíÿ, Ìàðêîâî (Markkova, Markowa), Ìãèíñêèé èëè Êèðîâñêèé ðàéîí Ëåí. Îáë.
Èùó Íèêèòèíñêèå, Ìàðòûíîâû, Áîáèíû, Îíó÷èíû - Ðàêóëî-Êîêøåíñêèé ïîãîñò, Âåëüñêèé óåçä, Âîëîãîäñêàÿ ãóáåðíèÿ. | | Ëàéê (2) |
| dashoo Íîâè÷îê
Ñîîáùåíèé: 2
Íà ñàéòå ñ 2024 ã.
Ðåéòèíã: 4 | Íàâåðõ ##
13 ÿíâàðÿ 2024 13:00 Äîáðûé äåíü, ãåíîòåê ñèëüíî çàòÿãèâàåò ðåçóëüòàòû òåñòà ãåíåòè÷åñêèé ïàñïîðò. Ïðîøëî ïî÷òè âïðèòûê 3 ìåñÿöà. Ïèñàëà â ïîääåðæêó åñòü ëè ïðîáëåìû, îòâåòèëè, ÷òî âñ¸ èä¸ò â íîðìàëüíîì ðåæèìå. Ïîäñêàæèòå, ñêîëüêî ó âàñ ïðîøëî âðåìåíè ñ ìîìåíòà ñòàòóñà ðàñøèôðîâàëè äíê, îñòàëîñü îáðàáîòàòü ðåçóëüòàòû äî ãîòîâíîñòè ðåçóëüòàòà? | | |
dearthfuÑîîáùåíèé: 606 Íà ñàéòå ñ 2019 ã. Ðåéòèíã: 1382 | Íàâåðõ ##
13 ÿíâàðÿ 2024 19:33 I_Sokka íàïèñàë: [q] Åñëè ðåçóëüòàòû ñòàðûå, òî ìîãóò îòëè÷àòüñÿ ïî ãëóáèíå îïðåäåëåíèÿ Y-ãàïëîãðóïïû, íî â ëþáîì ñëó÷àå ýòî ãäå-òî 4000-2000 ëåò.[/q]
À ýòî òîæå èíòåðåñíî. 23&me âûäàåò ìíå Get the latest 23andMe experience with the V5 genotyping chip. Ïðåäëàãàåò ìíå îáíîâèòü äàííûå íà 5þ âåðñèþ. Êñòàòè, ÿ çàãðóçèë äàííûå 23&me â Ãåíîòåê è ìíå îí âûäàåò ìîþ ìóæñêóþ ãàïëîãðóïïó R1a1a1b1a2b. À ó íåêîòîðûõ ìîèõ ñîâïàäåíöåâ ìóæñêàÿ ãàïëîãðóïïà R1a1a1b1a2b3. Îòëè÷àåòñÿ ÷òî äîáàâëåíà 3 â êîíöå. Ýòî ëè íå óëó÷øåííàÿ ãëóáèíà îïðåäåëåíèÿ Y-ãàïëîãðóïïû? | | Ëàéê (1) |
| arbalet
Ñîîáùåíèé: 104
Íà ñàéòå ñ 2011 ã.
Ðåéòèíã: 38
| Íàâåðõ ##
13 ÿíâàðÿ 2024 20:38 dashoo íàïèñàë: [q] Äîáðûé äåíü, ãåíîòåê ñèëüíî çàòÿãèâàåò ðåçóëüòàòû òåñòà ãåíåòè÷åñêèé ïàñïîðò. Ïðîøëî ïî÷òè âïðèòûê 3 ìåñÿöà. Ïèñàëà â ïîääåðæêó åñòü ëè ïðîáëåìû, îòâåòèëè, ÷òî âñ¸ èä¸ò â íîðìàëüíîì ðåæèìå. Ïîäñêàæèòå, ñêîëüêî ó âàñ ïðîøëî âðåìåíè ñ ìîìåíòà ñòàòóñà ðàñøèôðîâàëè äíê, îñòàëîñü îáðàáîòàòü ðåçóëüòàòû äî ãîòîâíîñòè ðåçóëüòàòà?[/q]
Ó ìåíÿ òîëüêî ïðîèñõîæäåíèå, à íå ïàñïîðò. Óæå ñåìü íåäåëü ïðîøëî, äî ñèõ ïîð äàæå íå ðàñøèôðîâàëè ÄÍÊ. Ïîêà òðè ìåñÿöà íå ïðîøëî, îñíîâàíèé âîçìóùàòüñÿ íåò. Ìû òóò âûøå óæå îáñóæäàëè âîçìîæíûå ïðè÷èíû äîëãîãî îæèäàíèÿ. | | Ëàéê (1) |
| I_Sokka
Ñàíêò-Ïåòåðáóðã
Ñîîáùåíèé: 501
Íà ñàéòå ñ 2019 ã.
Ðåéòèíã: 472
| Íàâåðõ ##
13 ÿíâàðÿ 2024 21:35 dearthfu íàïèñàë: [q] Êñòàòè, ÿ çàãðóçèë äàííûå 23&me â Ãåíîòåê è ìíå îí âûäàåò ìîþ ìóæñêóþ ãàïëîãðóïïó R1a1a1b1a2b. À ó íåêîòîðûõ ìîèõ ñîâïàäåíöåâ ìóæñêàÿ ãàïëîãðóïïà R1a1a1b1a2b3. Îòëè÷àåòñÿ ÷òî äîáàâëåíà 3 â êîíöå. Ýòî ëè íå óëó÷øåííàÿ ãëóáèíà îïðåäåëåíèÿ Y-ãàïëîãðóïïû? [/q]
Ìîæåò áûòü, íàäî ñìîòðåòü êàêîé ýòî ñíèï. Îáîçíà÷åíèÿ òèïà R1a2b3c4d ìîãëè ïîìåíÿòüñÿ, èìè áîëüøå íå ïîëüçóþòñÿ. Åñëè õîòèòå áîëåå òî÷íîãî îïðåäåëåíèÿ ãàïëîãðóïïû, òî íå ñòîèò òðàòèòüñÿ íà íîâûå àóòîñîìíûå òåñòû. Äåëàéòå ïîëíîãåíîìíûé òåñò (DanteLabs, Nebula Genomics, YSEQ, Sequencing, Ãåíîòåê) è àíàëèçèðóéòå äàííûå â YFull. Êàê âàðèàíò BigY-700 â FTDNA. Ýòî äàñò ìàêñèìóì èíôîðìàöèè î ãàïëîãðóïïå ñåé÷àñ, à ñî âðåìåíåì ìîæåò è óòî÷íèòüñÿ áåç äîïîëíèòåëüíûõ òåñòîâ. ---
Èùó Ñîêêà èëè Ñîêêî (Ïå÷åíêèí), Êàòàëà (Áîíäàðåâ), Ìåòñî (Ñåì¸íîâ), Òóçáåðã. ïðèõîä, è äåðåâíÿ, Ìàðêîâî (Markkova, Markowa), Ìãèíñêèé èëè Êèðîâñêèé ðàéîí Ëåí. Îáë.
Èùó Íèêèòèíñêèå, Ìàðòûíîâû, Áîáèíû, Îíó÷èíû - Ðàêóëî-Êîêøåíñêèé ïîãîñò, Âåëüñêèé óåçä, Âîëîãîäñêàÿ ãóáåðíèÿ. | | Ëàéê (1) |
dearthfuÑîîáùåíèé: 606 Íà ñàéòå ñ 2019 ã. Ðåéòèíã: 1382 | Íàâåðõ ##
13 ÿíâàðÿ 2024 22:31 I_Sokka íàïèñàë: [q] Îáîçíà÷åíèÿ òèïà R1a2b3c4d ìîãëè ïîìåíÿòüñÿ, èìè áîëüøå íå ïîëüçóþòñÿ.[/q]
Íî Ãåíîòåê ïîëüçóåòñÿ!
 | | |
|
