Genotek
| georgf I1-Y132166/BY35301
Москва
Сообщений: 196
На сайте с 2022 г.
Рейтинг: 141 | Наверх ##
2 января 2024 10:12 vesmi написал: [q]
georgf написал:
[q]
Многие сайты прекратили приём результатов других компаний не только по причинам безопасности (взломы 23andme), но и из-за некорректности конвертации (как DNA kit, так и wgse)
[/q]
Спасибо за замечание. А есть информация где-то, что именно некорректно в конвертации?
[/q]
Нет, прям точных ответов нет, возможно перестраховываются, когда есть подозрения на конвертацию или даже синтетический характер файла (насколько я понимаю, можно "собрать" файлик из интересующих снипов, заматчиться с интересующими людьми и получить их контакты) Необходимо следить за обновлениями wgse (которые усовершенствуют со временем алгоритмы конвертации) (естественно, верно только для обладателей bam после wgs) или каких-нибудь новых свободных утилит | | Лайк (1) |
| AndrianovPA Новичок
Москва
Сообщений: 22
На сайте с 2023 г.
Рейтинг: 15 | Наверх ##
6 января 2024 14:37 arbalet написал: [q] Жду результата пятую неделю, в этом году видимо уже не светит. В принципе обещано сделать в срок от четырех до 12 недель, но в интернете попадался отзыв, что кто-то уже четыре месяца ждет.[/q]
Я сдал тест 6 ноября и до сих пор жду. Почти 9 недель получается. Интересно, всё там у них нормально? | | Лайк (2) |
| arbalet Участник
Сообщений: 101
На сайте с 2011 г.
Рейтинг: 37 | Наверх ##
6 января 2024 15:23 AndrianovPA написал: [q]
Я сдал тест 6 ноября и до сих пор жду. Почти 9 недель получается.
Интересно, всё там у них нормально?[/q]
У меня почти 6 недель получается. Мы тут выше обсуждали, что возможно не все нормально. С другой стороны максимальный срок заявлен до трех месяцев. Будем ждать. Вы проинформируйте, когда получите результат, будьте добры. | | Лайк (1) |
vesmiУчастник Генеалогия не выходя из дома  Москва Сообщений: 50 На сайте с 2022 г. Рейтинг: 178 | Наверх ##
7 января 2024 9:05 7 января 2024 9:05 arbalet написал: [q]
AndrianovPA написал:
У меня почти 6 недель получается. Мы тут выше обсуждали, что возможно не все нормально. С другой стороны максимальный срок заявлен до трех месяцев. Будем ждать. Вы проинформируйте, когда получите результат, будьте добры.
[/q]
ждал результаты 2 месяца: сдавал в конце октября, прислали результаты в ночь с 31 декабря на 1 января  в начале 2023го за 1 месяц было все готово ---
Веселов (Веселых, Веселков, Томская и Воронежская губ.), Анохин (Томская и Воронежская губ.), Анисимов (Мордовия, Пензенская губ.), Гаврилов (Томская губ., Алтайский край, Томбовская губ.), Саушкин (Савушкин, Мордовия, Пензенская губ.), Марьин (Мордовия, Пензенская губ.), Борисков (Мордовия, Пензенс | | Лайк (3) |
| Cmirnov
Сообщений: 522
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 332
| Наверх ##
8 января 2024 8:58  никто не в курсе работает промокод на загрузку? uploadtogenotek | | Лайк (1) |
| karenine Участник
Москва
Сообщений: 73
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 38 | Наверх ##
9 января 2024 16:53 >> Ответ на сообщение пользователя Gregarius от 25 июля 2022 18:49 Добрый день, кажется, утилита эта больше не работает, вы не в курсе? | | |
Gregarius Калуга Россия Сообщений: 172 На сайте с 2022 г. Рейтинг: 194 | Наверх ##
9 января 2024 23:14 9 января 2024 23:15 karenine написал: [q] >> Ответ на сообщение пользователя Gregarius от 25 июля 2022 18:49
Добрый день, кажется, утилита эта больше не работает, вы не в курсе?[/q]
Да, верно - скрипт больше не работает. Генотек внес изменения в код сайта. Автор, возможно скорректирует скрипт, но это маловероятно. Увы, остается только пинать компанию. | | Лайк (1) |
| eugrus Участник
Сообщений: 67
На сайте с 2006 г.
Рейтинг: 36 | Наверх ##
11 января 2024 19:16 vesmi написал: [q] убрали вкладку VCF tool для конвертации из VCF формата в 23andMeV5[/q]
Я бы может написал конвертер, но одну вещь пока ещё не понимаю: как из колонок QUAL и FILTER в VCF получить простую пару аллелей. Если соберусь сделать, спрошу знакомого генетика. Остальное понятно: из второй колонки VCF делается третья в CSV для 23andMe, из третьей в VCF первая в CSV. У MyHeritage такой же порядок колонок, как у 23andMe, только разделители другие. | | |
dearthfu Сообщений: 577 На сайте с 2019 г. Рейтинг: 1111 | Наверх ##
12 января 2024 0:06 eugrus написал: [q] Я бы может написал конвертер, но одну вещь пока ещё не понимаю: как из колонок QUAL и FILTER в VCF получить простую пару аллелей. Если соберусь сделать, спрошу знакомого генетика.[/q]
Недавно узнал что все эти тесты делаются на чипах компании Illumina. eugrus написал: [q] Остальное понятно: из второй колонки VCF делается третья в CSV для 23andMe, из третьей в VCF первая в CSV.
У MyHeritage такой же порядок колонок, как у 23andMe, только разделители другие.[/q]
Вы лучше напишите чем отличаются данные по мужской хромосоме от компаний Генотек, 23&me и ancestry.com? У меня есть 2 теста от родственника который умер, который был протестирован в компаниях 23&me и ancestry.com, то можно ли собрать достаточно данных для сбора BAM файла для проекта yfull.com? | | |
| I_Sokka
Санкт-Петербург
Сообщений: 502
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 459
| Наверх ##
12 января 2024 1:35 12 января 2024 1:40 dearthfu написал: [q] У меня есть 2 теста от родственника который умер, который был протестирован в компаниях 23&me и ancestry.com, то можно ли собрать достаточно данных для сбора BAM файла для проекта yfull.com? [/q]
Безусловно создать BAM-файл по результатам простых аутосомных тестов нельзя. BAM-файл - это полногенмный тест. dearthfu написал: [q]
eugrus написал:
[q]
Остальное понятно: из второй колонки VCF делается третья в CSV для 23andMe, из третьей в VCF первая в CSV.
У MyHeritage такой же порядок колонок, как у 23andMe, только разделители другие.
[/q]
Вы лучше напишите чем отличаются данные по мужской хромосоме от компаний Генотек, 23&me и ancestry.com?[/q]
Сейчас они уже практически ничем не отличаются, так как делаются они все на стандартом чипе GSA. Если результаты старые, то могут отличаться по глубине определения Y-гаплогруппы, но в любом случае это где-то 4000-2000 лет. ---
Ищу Сокка или Сокко (Печенкин), Катала (Бондарев), Метсо (Семёнов), Тузберг. приход, и деревня, Марково (Markkova, Markowa), Мгинский или Кировский район Лен. Обл.
Ищу Никитинские, Мартыновы, Бобины, Онучины - Ракуло-Кокшенский погост, Вельский уезд, Вологодская губерния. | | Лайк (2) |
|
