Genotek
ValenokD Участник
г. Советский ХМАО Сообщений: 92 На сайте с 2016 г. Рейтинг: 262 | Наверх ##
18 июля 2022 21:35 dearthfu написал: [q] Самое интересное в генотеке для меня - это совпаденцы.[/q]
Аналогично! Остальное для меня малоинтересно (возможно пока). --- Крюковы (Тобольская губ. Чернаковская (Адбажская) вол. д.Крюкова)
Сидоровы (Тобольская губ. Байкаловская вол. д.Тахтаир (Хмелево))
Фалалеевы, Оленевы (Нижегородская губ. Ельнинская вол. д.Опалиха, Кстово)
Тверитины (г.Сургут) | | |
Temych Санкт-Петербург Сообщений: 1138 На сайте с 2010 г. Рейтинг: 652 | Наверх ##
18 июля 2022 22:32 Tusya84 написал: [q] Подскажите, у всех, кто загружал файл в генотек из другой компании не определяется гаплогруппа?[/q]
Выгружал из ftdna, не определяет, т.к. в этих данных нет данных о гаплогруппе. На халяву не получится  , нужно сдавать в самом Генотеке. Только вот не понятно на сколько глубоко они определяют гаплогруппу. Такое ощущение, что глубже Y-37 у FTDNA. | | Лайк (1) |
Тампио«Спасибо» и лайки не надо. Просто нажмите [+]  Санкт-Петербург Сообщений: 1791 На сайте с 2006 г. Рейтинг: 1153 | Наверх ##
19 июля 2022 8:58 Temych написал: [q] Такое ощущение, что глубже Y-37 у FTDNA.[/q]
Ощущения к делу не пришить. Кстати, а что дальше с определившейся в Генотиеке гаплогруппой делать будете? --- Новг. обл, Маловишерский р-н, д. Поддубье, Горнецкое, Селищи — ЕВПЛОВЫ ИВАНОВЫ
Кировск. обл, Лузский р-н, д. Пятинская — ИГУМНОВЫ
Тамб. обл, Гавриловский р-н — ТЕРЁШКИНЫ ВОЛЧКОВЫ
Белоруссия: Бобруйск, Новогрудок — ПОТАПОВИЧИ ОСИПОВИЧИ
☦ Финны СПб ☦ | | Лайк (1) |
mila_khmelНовичок  Москва Сообщений: 13 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 36 | Наверх ##
19 июля 2022 14:54 Добрый день, а как корректно сконвертировать Генотек, есть какой-то работающий алгоритм конвертации? у DNA kit studio много разных вариации на тему выходного файла Raw Converter-a из VCF , темплейты разные 23andme, и потом такая же куча темплейтов для RAW-RAW... Пока все 10 попыток разных конвертаций меня приводят только к The specified file 'dna-FTDna.txt' could not be uploaded. The file contains a corrupt or invalid header. Please download the file and try again. polarbear2 написал: [q] brennda1974 написал:
[q] Прошу совета) Получила свой первый тест от Генотек. Предлагают два файла с данными для скачивания, какой из них лучше Купить? И куда лучше загрузить?
[/q]
скачайте бесплатный (VCF формат) и сконвертируйте с помощью DNA Kit Studio (https://dnagenics.com/dna-kit-studio) в какой надо.
"куда загрузить" - обычно народ советует как можно больше и во все системы, т.е. MyHeritage, 23andme, GEDmatch, ftDNA[/q] --- Мои фамилии: Солодков (Арзамасский уезд, д. Булдаково), Скворцов (Бронницкий уезд, д. Головино), Ермолаев и Федоров (Бронницкий уезд, д. Рылеево/Спас-Михнево; Коломна), Космин (Головино, с. Нащекина), Хмель (Бобринец, Елисаветградский уезд), Блинов (Москва, поиск), Куликовский (Киев, поиск) | | |
Gregarius Калуга Россия Сообщений: 176 На сайте с 2022 г. Рейтинг: 201 | Наверх ##
19 июля 2022 15:38 19 июля 2022 15:39 >> Ответ на сообщение пользователя mila_khmel от 19 июля 2022 14:54 Вот вам мои настройки. Все сработало. Выставляете все как на скрине (имена файлов на ваше усмотрение). Жмете Convert. На выходе txt.
 | | Лайк (4) |
voytishko Участник
Москва Сообщений: 64 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 29 | Наверх ##
21 июля 2022 13:23 Максим Викторович написал: [q] voytishko, все вместе (аутосомный + игрек + митоДНК), выгрузка файла есть[/q]
А "игрек" - Y-DNA в Генотеке на какую глубину? с Каким тестом в FTDNA он наиболее сопоставим - 37, 111 или 700? --- Фамилии:
Войтишкин, Войтихин, Войтишко (с. Нивки, Гомельский уезд Могилевской губерни, Хасавюрт, Кизляр, Дагестан, )
Скрибила (Гулькевич, Краснодарский край),
Богуш (Гулькевичи)
Киричук (Котельня подгородская, Брестский повет (уезд))
Зинчук (там же)
Рудко (там же + Малорита Брестского уезда) | | |
Максим Викторович Тула Сообщений: 2114 На сайте с 2017 г. Рейтинг: 1448 | Наверх ##
21 июля 2022 18:50 21 июля 2022 18:50 voytishko, не берусь утверждать категорично, но скорее 37, чем 111 --- Опочка; Кабардино-Балкария; Ленинград: ДОНДУКОВСКИЕ
Кудеверь Новоржев. у. Псковской губ.; Ленинград: БЕЛАВИНСКИЕ
Казачья слобода Чернского у. Тульской губ.: ШАТКОВЫ, ШАЦКИЕ/ШАДСКИЕ
Новосильский у. Тульской губ.: БРУСЕНЦЕВЫ (Полянки); ЗОЛОТУХИНЫ (Высокая; Мелынь; Нижняя Савина), АЛЕКСЕЕВЫ (Мелынь) | | Лайк (1) |
voytishko Участник
Москва Сообщений: 64 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 29 | Наверх ##
22 июля 2022 10:09 Максим Викторович написал: [q] voytishko, не берусь утверждать категорично, но скорее 37, чем 111[/q]
В Генотеке по итогу дали такой ответ (что бы то ни значило): «В тесте «Происхождение» мы анализируем 300 000 SNP-маркеров по этническому составу (аутосомы), 3560 SNP-маркеров по Y-хромосоме и 980 SNP-маркеров по mtDNA.» --- Фамилии:
Войтишкин, Войтихин, Войтишко (с. Нивки, Гомельский уезд Могилевской губерни, Хасавюрт, Кизляр, Дагестан, )
Скрибила (Гулькевич, Краснодарский край),
Богуш (Гулькевичи)
Киричук (Котельня подгородская, Брестский повет (уезд))
Зинчук (там же)
Рудко (там же + Малорита Брестского уезда) | | Лайк (1) |
I_Sokka Санкт-Петербург Сообщений: 502 На сайте с 2019 г. Рейтинг: 461
| Наверх ##
22 июля 2022 17:21 voytishko написал: [q] Максим Викторович написал:
[q] voytishko, не берусь утверждать категорично, но скорее 37, чем 111
[/q]
В Генотеке по итогу дали такой ответ (что бы то ни значило): «В тесте «Происхождение» мы анализируем 300 000 SNP-маркеров по этническому составу (аутосомы), 3560 SNP-маркеров по Y-хромосоме и 980 SNP-маркеров по mtDNA.»
[/q]
Ну как это понимать... Собственно на уровне вашего вопроса - вы спрашиваете "оно мягкое или теплое?", а вам ответили "товар на 90% из хлопка, а на 10% из шерсти." Тесты STR-маркеров и снипов - разные тесты, по разной технологии, разных участков ДНК и с различным применением результатов. Я согласен с Максимом Викторовичем, что это примерно уровень Y-DNA37. STR-маркеры позволяют достаточно уверенно определить вашу гаплогуппу высокого уровня (R1a, N1a1a, I1, I2 и т.д.), а иногда и предсказать ваш субклад (снип) в пределах нескольких тысяч лет. По STR-маркерам, если вы сделали тест в FamilyTreeDNA, можно посмотреть список совпаденцев - есть ли кто в базе результатов с похожими сначениями маркеров, и оценить насколько близко вы можете быть связаны. Здесь вопрос о поиске совпаденцев, выяснение близких семейных связей и оценка переспективы апгрейда теста до большего количества маркеров или до продвинутых тестов. Возможно использовать для скрининга однофамильцев - т.е. отсеивания близких однофамильцев от явно не связанных с вами. Снипы однозначно определяют ваш субклад. По простому генеалогическому генетическому тесту вам определят субклад(снип) на уровне 2000-5000 лет, что будет примерно соответствовать предсказанию на 37 STR-маркерах. Однако поиск совпадений по такому снипу не идет (я не видел такого ни в одной компании - MyHeritage, Ancestry и 23andme определяют в тестах такие снипы, 23andme их выдает в своем отчете, но для поиска они не используются). Если вы уже выяснили свой снип, то такой тест (Генотек, 23andme, даже Ancestry и MyHeritage) подойдет для скрининга однофамильцев и отсеивания возможно связанных с вами от явно не связанных. Для последней цели я все же предпочел бы анализ STR-маркеров - изначально 37, далее апгрейд до 111, а далее уже BigY или WGS (полногеномное секвенирование с анализом в YFull). Полезность того или иного теста зависит от (1) целей генетического генеалогического исследования, (2) какую информацию требуется получить, (3) какие задачи требуется решить. Если вам интересно узнать свою гаплогруппу и узнать о миграции человечества за последние пару сотен тысяч лет, то вам подойдет любой тест. Если вас интересуют связи и происхождение, которые как-то можно привязать к семейному дереву и найти утерянные связи в более современный период, то надо нацеливаться на более продвинутые тесты Y-хромосомы, т.е. BigY или WGS, а также искать дальних родственников и возможных родственников-однофамильцев, которые тоже должны сделать продвинутые тесты. Для предварительного отсеивания однофамильцев тоже подойдет любой из тестов, но тест STR-маркеров пока актуальнее на начальном этапе. Есть и другие стратегии для тестирования возможных родственников по прямой мужской линии, например тест пары снипов, которые вы уже выявили для своей мужской линии. --- Ищу Сокка или Сокко (Печенкин), Катала (Бондарев), Метсо (Семёнов), Тузберг. приход, и деревня, Марково (Markkova, Markowa), Мгинский или Кировский район Лен. Обл.
Ищу Никитинские, Мартыновы, Бобины, Онучины - Ракуло-Кокшенский погост, Вельский уезд, Вологодская губерния. | | Лайк (3) |
voytishko Участник
Москва Сообщений: 64 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 29 | Наверх ##
22 июля 2022 22:07 22 июля 2022 22:11 >> Ответ на сообщение пользователя I_Sokka от 22 июля 2022 17:21 Спасибо Вам большое за столь развернутый ответ! У меня точно нет цели увидеть гаплогруппу и путь миграции. Также, возможно, я предвзято отношусь к интерпретации этнического происхождения - это прям ооочень (с моей точки зрения) большие допущения и условности. Они "красивы" с маркетинговой точки зрения, но к науке имеют опосредованное отношение. Гораздо интереснее обнаружить потерянные семейные связи, дальних родственников. Есть несколько задач, конечно ценно проследить цепочку по отцовской линии. Но есть и другая задача: моей мамы дедушка (отец ее отца) родом из Гомельского уезда (ну такое есть ничем пока не подтвержденное семейное предание). Там много до сих пор однофамильцев. Вероятность того, что, кто-то из ныне живущих однофамильцев из той местности сдал генетический тест минимальна, но все же... Ну и в принципе интересно отследить эту ветку. Следующая проблема - две родственницы уже в преклонных годах и сложность с ожиданием тестов из FTDNA побудила посмотреть в сторону Генотека... --- Фамилии:
Войтишкин, Войтихин, Войтишко (с. Нивки, Гомельский уезд Могилевской губерни, Хасавюрт, Кизляр, Дагестан, )
Скрибила (Гулькевич, Краснодарский край),
Богуш (Гулькевичи)
Киричук (Котельня подгородская, Брестский повет (уезд))
Зинчук (там же)
Рудко (там же + Малорита Брестского уезда) | | Лайк (1) |
|