Genotek - Генеалогический форум ВГД. Тема №69244

На сайте ВГД собираются люди, увлеченные генеалогией, историей, геральдикой и т.д. Здесь вы найдете собеседников, экспертов, умелых помощников в поисках предков и родственников. Вам подскажут где искать документы о павших в боях и пропавших без вести, в какой архив обратиться при исследовании родословной своей семьи, помогут определить по старой фотографии принадлежность к воинским частям, ведомствам и чину. ВГД - поиск людей в прошлом, настоящем и будущем!

Добрый день. Я так понимаю в генотек можно загрузить только family finder? данные YDNA не принимает?

Скажите пожалуйста, в Генотеке можно как-то отсортировать совпаденцев? Или только листать всех подряд?
И можно ли там как-то сравнить двух или нескольких людей между собой?
Что-то я там вообще разобраться не могу...

Наташа СМ написал:

[q]
как-то отсортировать совпаденцев? Или только листать всех подряд?
[/q]

Листать всех подряд. Сортировка там, видимо, автоматическая - примерно по степени совпадения.
Там разве что переключатель "с именем/без имени" и поиск по имени и месту.

Наташа СМ написал:

[q]
И можно ли там как-то сравнить двух или нескольких людей между собой?
[/q]

Можно сравнить себя с совпаденцем - кликаете на Научные данные и будет видно сколько общих сМ и наибольший сегмент, гаплогруппы. Также показывается примерное положение совпадений на хромосомах.

Наташа СМ написал:

[q]
Что-то я там вообще разобраться не могу...
[/q]

Там не особенно много функций. Все, что есть, интуитивно понятно.

Прошу совета) Получила свой первый тест от Генотек. Предлагают два файла с данными для скачивания, какой из них лучше Купить? И куда лучше загрузить?

brennda1974 написал:

[q]
Прошу совета) Получила свой первый тест от Генотек. Предлагают два файла с данными для скачивания, какой из них лучше Купить? И куда лучше загрузить?
[/q]

скачайте бесплатный (VCF формат) и сконвертируйте с помощью DNA Kit Studio (https://dnagenics.com/dna-kit-studio) в какой надо.

"куда загрузить" - обычно народ советует как можно больше и во все системы, т.е. MyHeritage, 23andme, GEDmatch, ftDNA

brennda1974, вот что писал в одном из чатов в телеге директор по продукту Генотека Александр Ракитько, комментируя отличие их услуги по подготовке файла в альтернативном формате от бесплатной конвертации сторонними приложениями:

В Genotek услуга конвертации предполагает фазирование + импьютирование с большой референсной панелью . Благодаря этому удаётся из 600т получить , например, 900т для 23&meV3. Такие алгоритмы работают по 5-6 часов на 80тиядерных виртуальных машинах.

Представьте, что ваш геном -- это текст в книге. Например, Война и мир. Микрочипы, которые используют компании, не позволяют расшифровать все буквы во всех словах. Они расшифровывают, скажем, каждую третью букву. Это то, что содержится в исходных данных.

Но если вы достаточно начитаны, у вас богатый словарный запас, то в большинстве случаев, вам достаточно взглянуть на каждую третью букву, чтобы восстановить пропущенные буквы по контексту и получить предложение целиком. Так работает импьютинг. Приборы расшифровывают примерно 600 000 точек. Благодаря импьютингу количество расшифрованных + восстановленных из контекста точек возрастает до 8-10 млн. Затем по ним уже можно считать риски и определять происхождение, искать родственников.

Программа-конвертер берет исходные даные (каждую тертью букву) и может менять стиль написания: курсив, полужирный и тд. Когда мы генерируем файлы 23andme в Genotek, мы сначала восстанавливаем по контексту все 8-10 млн, затем вынимаем нужные буквы и сохраняем в файл. Именно поэтому набор мутаций в исходных данных, в 23andmeV3, в 23andmeV5 отличается.

Из-за того, что чипы, которые сейчас использует Генотек и чипы 23andmeV5 очень сильно похожи, у программы-конвертера получается неплохой результат. Но она не сможет сделать файл 23andmeV3 из сырых данных Генотека, потому что не использует восстановление по контексту.

brennda1974 написал:

[q]
Так какой лучше Купить - 23andmeV3 или 23andmeV5?

brennda1974, думается, чем выше номер версии, тем лучше. это мое спекулятивное соображение

>> Ответ на сообщение пользователя Максим Викторович от 25 мая 2022 22:34

Чисто теоретическия понимаю как это работает. Такие алгоритмы известны и работают очень давно, еще с 80х вроде бы.
Правильно ли я понял, что результаты тестов генотек уступают результатам 23andme по "разрешающей" способности? И если да, то насколько такая разница существенна?

Gregarius, я не настоящий сварщик, просто выступил в качестве посредника между форумом и генотековским чатом в телеге. Лучше всего там все вопросы и задать.