ÄÍÊ-ãåíåàëîãèÿ. Âîïðîñû íîâè÷êîâ

Ñåé÷àñ äàì ðåçóëüòàòû ñîâïàäåíöåâ ñ Ãåíîòåê (ñòàðîãî, äî ñíèæåíèÿ êà÷åñòâà â ñâÿçè ñ ïðåäïîëàãàåìîé çàìåíîé ÷èïîâ íà òåõ, ÷òî óäàëîñü äîñòàòü):
320982
320069
320541
319443
302934
306998
319758
è ò. ä.

Õîòåë íàéòè ñâåæèå çàëèâêè. Íî íå íàø¸ë. Ðèñêíó ïðåäïîëîæèòü, ÷òî áóäåò â ðàéîíå 250000.

Íîâè÷êàì-ëþáèòåëÿì, êîòîðûå ñ÷èòàþò, ÷òî è 90000 çäîðîâî (ñì. âûøå), êîíå÷íî æå ñîéä¸ò.
Åñëè çàäà÷à ñîñòîèò â òîì, ÷òîáû íàéòè î÷åðåäíóþ òðîþðîäíóþ ñåñòðó, èëè ò¸òþ.

Åñëè æå òåñòû ñäåëàíû äëÿ òîãî, ÷òîáû ïðîôåññèîíàëüíî ðàçáèðàòüñÿ ñ ïðåäêàìè 18-19 ââ., òî õëèïåíüêî êàê-òî.

Mikl1984 íàïèñàë:

[q]

>> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Doble_Ancho îò 19 íîÿáðÿ 2025 17:59
Ìîæåò òàê ïîíÿòíåå áóäåò?
https://forum.vgd.ru/post/527/104275/p5423752.htm#pp5423752

[/q]

Âèäåë ýòîò ïîñò. Íî ê ñîæàëåíèþ ïîíÿòíåå íå ñòàëî, íóæíî íà ïàëüöàõ.
×òî òàêîå èìïüþò (ßíäåêñ íå ïîìîã, îí ññûëàåòñÿ íà âàñ æå, ðîâíî íà ýòîò ïîñò), âåðîÿòíî êîíâåðòàöèÿ ôàéëà VCF â "îáùåïðèçíàííûé" ôîðìàò 5é âåðñèè (çà 1000 ðóáëåé)?
×òî òàêîå "ôàéë ftdna" - îòäåëüíûé òåñò èëè çàãðóæåííûé â ftdna?
Ñíèïîâ áûëî 447218, ñòàëî 493233.  òîì æå ôàéëå VCF ïîñëå êîíâåðòàöèè çà 1000 ðóáëåé? Ñ êàêîé ðàäîñòè èõ êîëè÷åñòâî âûðîñëî?
Äàëåå: otal matches with kit KH è otal matches with kit RJ - ïî÷åìó ïîêàçàòåëè ðàçíûå? Îäèí ìåíüøå äðóãîãî â íåñêîëüêî ðàç, íî KH è RJ - ÷òî ýòî òàêîå? Ìîæåò, ýòî íåñðàâíèìîå ñðàâíèâàåòñÿ.
Ò.å. êàê ïîíèìàþ, Ãåíîòåê, ñàìîñòîÿòåëüíî êîíâåðòèðóÿ ñâîé ôàéë çà 1000 ðóáëåé, äà¸ò â í¸ì áîëüøå ñíèïîâ, íî "ýôôåêòèâíûõ" ñîâïàäåíèé ìåíüøå (õîòÿ âñ¸ ðàâíî ñëèøêîì ìíîãî) - òóò ìîæåò áûòü ìíîãî èíòåðïðåòàöèé (îò çàìåíû îñíîâíîãî òåëà ñíèïîâ äî ÿâíîé çëîíàìåðåííîñòè), âàøà ìûñëü íå ïîíÿòíà.

Âîçâðàùàÿñü ê îðèãèíàëüíîìó ïîñòó, ÿ ïðî ýòó ôðàçó: "Íóæåí ïëàòíûé ïðèäóìàííûé èìïüþò V5, êîòîðûé äàñò êó÷ó ëæåñîâïàäåíöåâ" - ñìûñë ïîëó÷àåòñÿ â òîì, ÷òî íóæíî äîïîëíèòåëüíî çàïëèòèòü Ãåíîòåêó 1000 ðóá., ÷òîáû ïîëó÷èòü ôàéë, ïðèáëèçèòåëüíî íîðìàëüíûé ïî êà÷åñòâó? Æëîáñòâî, ñîãëàñåí, ýòîò âîïðîñ îñòàâèì. Íî êàê â ýòîì ôàéëå ("ñêîíâåðòèðîâàííîì" - ò.å. ïðåîáðàçîâàííîì èç îäíîãî ôîðìàòà â äðóãîé) ìîæåò ðàñòè êîëè÷åñòâî èñõîäíûõ äàííûõ (ñòðîê, SNPS) - íèêàê íå ïîéìó.
Âû æå ñàìè ïèøåòå: "â íåì... ñëèøêîì ìàëî ñíèïîâ... ïîñëå êîíâåðòàöèè ñòàíåò åùå ìåíüøå". À èõ - äàæå ïî ïî âàøåìó æå ïîñòó - áîëüøå, è êà÷åñòâî îò ïëàòíîé êîíâåðòàöèè ðàñò¸ò.

Mikl1984 íàïèñàë:

[q]

>> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Doble_Ancho îò 19 íîÿáðÿ 2025 23:10
Íà÷íèòå ñ ïîèñêà èíôû ïðî impute dna õîòü â âèêè
Åùå áîëüøå ñêàæó - ñ ýòîãî ãîäà Ã... èç-çà ïëîõîãî êà÷åñòâà ñ÷èòûâàíèÿ íà÷àë èìïüþò vcf, çàìå÷åíà êó÷à îøèáîê íà X õðîìîñîìå
À òàê 20-25% íåäîñòîâåðíûõ ñíèïîâ, äîáàâëåííûõ â V5 âåäóò ê óâåëè÷åíèþ ëæåñîâïàäåíöåâ

[/q]

Ïðî ïîÿñíåíèå ïðî òåðìèí impute ñïàñèáî, ñòàëî ïîíÿòíåå.
äëÿ ÷èòàþùèõ: èìïüþò = impute DNA = ìåòîä óâåëè÷åíèÿ êîëè÷åñòâà SNPs (äîáàâëåíèÿ íîâûõ) ïî ìàòåìàòè÷åñêèì ìîäåëÿì, à íå íàïðÿìóþ ñ÷èòàííûõ èç áèî-ìàòåðèàëà ÷èïîì, ñ÷èòûâàþùèì SNPs (ìàêñèìàëüíî óïðîùàÿ, êàê ÿ ïîíÿë)

Íî âñ¸ åù¸ íå ïîíÿòíî â âàøåì îðèãèíàëüíîì ïîñòå:
- "Ýòî ìîé vcf, êîíâåðòèðîâàííûé â ôîðìàò 23&me" - äëÿ óâåðåííîñòè: VCF Ãåíîòåêà, ñêîíâåðòèðîâàííûé ñàìòîñòîÿòåëüíî, âåðíî?
- "A âîò èìïüþò â V5" - äëÿ óâåðåííîñòè: ýòî ïëàòíûé ôàéë Ãåíîòåêà çà 1000 ðóáëåé?
- "ôàéë ftdna" - ÷òî ýòî? ýòî òðåòèé íàáîð ñòàòèñòèêè, âåðíî? îòêóäà îí ïîÿâèëñÿ? Èìåííî îò íåãî âûñ÷èòûâàþòñÿ 20-25%, êàê ïîíèìàþ.
- Total matches with kit KH è Total matches with kit RJ - ïî÷åìó ïîêàçàòåëè (KH è RJ) ðàçíûå? Îäèí ìåíüøå äðóãîãî â íåñêîëüêî ðàç, íî KH è RJ - ÷òî ýòî òàêîå? Ìîæåò, ýòî íåñðàâíèìîå ñðàâíèâàåòñÿ. ChatGPT íå ïîìîã.

Ñïàñèáî, òåïåðü ñòàëî ãîðàçäî áîëåå ïîíÿòíî.

Ó âàñ 736818 âûÿâëåííûõ "ðîäñòâåííèêîâ" ïî áàçå Gedmatch äëÿ VCF-ôàéëà Ãåíîòåê, ñêîíâåðòèðîâàííîãî ñàìîñòîÿòåëüíî, 221630 âûÿâëåííûõ "ðîäñòâåííèêîâ" äëÿ V5 ôàéëà Ãåíîòåê (äîñòðîåííîãî ïî ìàò.ìîäåëè "èìïüþòà", êóïëåííîãî çà 1000 ðóá.) è 125082 âûÿâëåííûõ "ðîäñòâåííèêîâ" ïî ôàéëó FTDNA. Íî ïî÷åìó âû íàçûâàåòå èõ âñåõ "ëæåñîâïàäåíöàìè"? Âû çàãðóçèëè 4 íàñòîÿùèõ ðîäñòâåííèêà, íî íåêîòîðûå èç îñòàëüíûõ 125082 - î÷åíü äàëüíèå âûÿâëåííûå ðîäñòâåííèêè, ðàçâå íåò?

Mikl1984 íàïèñàë:

[q]

Èòàê 736818-221630-125082 ëæåñîâïàäåíöåâ, òàê êàê âñå ðåàëüíûå ðîäñòâåííèêè çàãðóæåíû ìíîé (4)

[/q]

(îðèãèíàëüíûé ïîñò äëÿ óäîáñòâà)

Ëæåñîâïàäåíöàìè, êàê ïîíèìàþ, ìîæíî íàçâàòü 736 818 - 125 082 = 611 736 ÷åëîâåê èç ñàìîñòîÿòåëüíî_ñêîíâåðòèðîâàííîãî_VCF_Ãåíîòåêà è 221 630 - 125 082 = 96 548 ÷åëîâåê èç V5_ìàò.ìîäåëè_Ãåíîòåêà.
Íî ïðî 125 082 ÷åëîâåê èç ôàéëà FTDNA íåëüçÿ ñ óâåðåííîñòüþ ñêàçàòü, ÷òî îíè ëîæíûå ñîâïàäåíèÿ. Ìîæíî òîëüêî ñêàçàòü, ÷òî Ãåíîòåê ïî ñðàâíåíèþ ñ "ýòàëîííûì" FTDNA äà¸ò çíà÷èòåëüíî áîëüøåå êîëè÷åñòâî ñîâïàäåíèé-"ðîäñòâåííèêîâ" (â 5,9 ðàç è 1,8 ðàç ñîîòâåòñòâåííî). È ìû (îáîñíîâàííî) ïðåäïîëàãàåì, ÷òî áîëüøàÿ ÷àñòü èç íèõ - ëîæíûå ñîâïàäåíèÿ. È ïðè÷èíà ýòîãî - íåäîñòàòî÷íîå êîëè÷åñòâî è êà÷åñòâî SNPs â òåñòàõ Ãåíîòåêà.
Òàê?

Äîáðûé äåíü!
Ñêîëüêî íè ÷èòàþ ñòàòåé ïðî ÄÍÊ-òåñòû, ñòîëüêî âñ¸ ðàâíî íè÷åãî íå ïîíèìàþ. Ïîýòîìó ïðîøó ñîâåòà çíàòîêîâ ïî êîíêðåòíîé ñèòóàöèè.

Èìååòñÿ ïðàïðàáàáóøêà, ðîäèòåëè êîòîðîé òî ëè ðîäíûå, òî ëè ïðèåìíûå.
Ïîòåíöèàëüíûé îòåö - åâðåé èç Ôðàíöèè. Åãî ñåìüÿ òàì âåñüìà õîðîøî èçó÷åíà, æèâû ïîòîìêè, â òîì ÷èñëå è ïî ïðÿìîé îò ðîäíîãî áðàòà.

Ñ ïîòåíöèàëüíîé ìàòåðüþ ñëîæíåå. Ñ áîëüøîé äîëåé âåðîÿòíîñòè å¸ îòåö - íåìåö. Ãîðîä â Ãåðìàíèè, îòêóäà îí ðîäîì, èçâåñòåí. Ðîäèòåëè åãî íå óñòàíîâëåíû, íî íîñèòåëè ôàìèëèè â ýòîì ãîðîäå æèëè è èõ ïîòîìêè òàêæå æèâû äî ñèõ ïîð.

Ó ïðàïðàáàáóøêè áûëà äî÷ü - ìîÿ ïðàáàáóøêà. Ó íå¸ äî÷ü - ìîÿ áàáóøêà. Ó íå¸ äî÷ü - ìîÿ ò¸òÿ è ñûí - ìîé îòåö. Âñåãî îíè ñêîí÷àëèñü.
Íà ñåãîäíÿøíèé äåíü æèâû ÿ è ìîÿ êóçèíà, äî÷ü ò¸òè.

Ìîæíî ëè ïðè òàêîì ðàñêëàäå äîêàçàòü/îïðîâåðãíóòü ðîäñòâî ñ ïðåäñòàâèòåëÿìè ñåìåé ïîòåíöèàëüíûõ ðîäèòåëåé ïðàïðàáàáóøêè? Èëè õîòÿ áû äîêàçàòü/îïðîâåðãíóòü íåìåöêèå êîðíè?
Åñëè äà, òî â êàêîé ôèðìå è, ãëàâíîå, êàêîé èìåííî òåñò íàäî çàêàçûâàòü?

Çàðàíåå áëàãîäàðíà çà êîíñóëüòàöèþ