ÄÍÊ-ãåíåàëîãèÿ. Âîïðîñû íîâè÷êîâ
È îòâåòû îïûòíûõ ))
Íàòàøà ÑÌÎðãàíèçàòîð Ñìîëåíñêîãî Ãåíåàëîãè÷åñêîãî êëóáà  ãîðîä-ãåðîé Ñìîëåíñê Ñîîáùåíèé: 3085 Íà ñàéòå ñ 2012 ã. Ðåéòèíã: 2628 | Íàâåðõ ##
17 àïðåëÿ 2013 15:30 17 àïðåëÿ 2013 15:31 Áëàãîäàðÿ ôîðóì÷àíàì çàðàçèëàñü èäååé ñäåëàòü ÄÍÊ-òåñò  Íî ïîíÿëà, ÷òî î÷åíü òðóäíî âûáèðàòü íóæíóþ èíôîðìàöèþ ïî êðóïèíêàì èç ðàçíûõ òåì, èç äíåâíèêîâ ó÷àñòíèêîâ è ò.ä. Ïîñòåïåííî çàáûâàåøü, ÷òî ãäå ïðî÷èòàë ,à âòîðîé ðàç íå âñåãäà íàéòè ïîëó÷àåòñÿ. Äà åùå, ÷àñòåíüêî, è ïîíÿòü íå ìîæåøü íåçíàêîìûå àááðåâèàòóðû è ñëîâà, à ïðîñèòü êàæäûé ðàç ïåðåâåñòè " ñ ðóññêîãî íà ðóññêèé" - êàê-òî íåóäîáíî  È òàê, íà ôîíå äèñêóññèé îïûòíûõ ôîðóì÷àí ÷óâñòâóåøü ñåáÿ íå ñîâñåì ðàçóìíûì ñóùåñòâîì))) À âîïðîñîâ êó÷à!!!  Õîòÿ, ÿ óâåðåíà, ó âñåõ íà÷èíàþùèõ, îäíè è òå æå âîïðîñû, ñîìíåíèÿ è ò.ä. Èíòåðåñ ê ýòîìó äåëó âñ¸ ðàñòåò è æåëàþùèõ âñ¸ áîëüøå è áîëüøå. Ïîýòîìó î÷åíü ïðîøó çíàþùèõ è îïûòíûõ â ýòîì äåëå èññëåäîâàòåëåé, ïîìî÷ü íàì, íîâè÷êàì, â îñâîåíèè ÄÍÊ-ãåíåàëîãèè Ïîíèìàþ, ÷òî ìíîãèå ó ñåáÿ âûêëàäûâàëè ðàíåå êàêèå-òî ñîâåòû è ðåêîìåíäàöèè, äåëèëèñü îïûòîì - ïðîñòî îñòàâüòå çäåñü ññûëî÷êè, ïîæàëóéñòà. Äóìàþ, òàê íîâè÷êè (â òîì ÷èñëå, è ÿ) áûñòðåå ðàçáåðóòñÿ è áóäóò Âàì î÷åíü áëàãîäàðíû! Íó è êîíå÷íî, ÿ äóìàþ, ÄÍÊ-ñîîáùåñòâî òîëüêî âûèãðàåò, åñëè áëàãîäàðÿ ýòîé òåìå ê íåìó ïðèñîåäèíÿòñÿ íîâåíüêèå "äíê-íàðêîìàíû", êàê âûðàçèëñÿ êòî-òî èç ôîðóì÷àí
---
Ôèëèìîíîâû - Ñìîëåíñêàÿ ãóáåðíèÿ, Ïîðå÷ñêèé è Äóõîâùèíñêèé óåçäû, ìåùàíå ã.Âåëèæà
Âàéñáëèò - Óêðàèíà
Ðåéñëåð - Àâñòðî-Âåíãðèÿ, Êèøèí¸â
Ìàñëîâû - Ñò.Íåêðàñîâêà, Èçìàèë
----
Ðàáîòàþ â àðõèâàõ Ñìîëåíñêà ñ 2013ã. Ïîìîãó â âàøèõ ïîèñêàõ.
Ìîé òåëåãðàì-êàíàë https://t.me/gen_sysk
| | Ëàéê (8) |
| Mikl1984
Ñîîáùåíèé: 114
Íà ñàéòå ñ 2025 ã.
Ðåéòèíã: 86
| Íàâåðõ ##
19 íîÿáðÿ 2025 18:31 | | |
| PedigreeResearcher | Íàâåðõ ##
19 íîÿáðÿ 2025 19:10 19 íîÿáðÿ 2025 20:28 Áåñïîëåçíî ðàññêàçûâàòü, ÷òî ñ îäíîé ñòîðîíû èìååì óíèâåðñèòåòñêóþ êîìïàíèþ, ïèîíåðà ðûíêà êîììåð÷åñêîãî òåñòèðîâàíèÿ. Ñ îãðîìíîé áàçîé, îòëè÷íûì êà÷åñòâîì è ïðîôèëüíûìè ñïåöèàëèñòàìè.
Íà äðóãîé ÷àøå âåñîâ ôèðìà-îäíîäíåâêà, êîòîðûõ òîëüêî íà ìîåé ïàìÿòè êàíóëî â ëåòó ñ ïîëäþæèíû. Ñ ïðîáëåìàìè ïîñòàâêè êîìïëåêòóþùèõ. È... íî ïðî ïåðñîíàë âåæëèâî ïðîìîë÷ó.
Áûëî òðè î÷åíü âåñîìûõ ïðåèìóùåñòâà.
1. Ôèðìà ñâîÿ. Îòå÷åñòâåííàÿ. Íå çàáóãîðíî-âðàæåñêàÿ.
2. Â ÔÒÄÍÀ íàïðÿìóþ èç Ðîññèè íå çàïëàòèøü ðîññèéñêîé êàðòîé.
3. Â ÑØÀ ïî÷òà îòïðàâëåíèÿ íå ïðèíèìàëà.
Òåïåðü êîëè÷åñòâî ïðåèìóùåñòâ ñíèçèëîñü äî äâóõ. Ðåøàéòå, íàñêîëüêî îíè äëÿ Âàñ âåñîìû.
Ó ìåíÿ â ëàáîðàòîðèè Ñîðåíñîíà (à ýòî, êòî ïîíèìàåò è ïîìíèò, íå ÷åòà øàðàøêàì òèïà Ãåíîòåêà) ïðîïàëî ñ äåñÿòîê ñýìïëîâ.
Äàæå íå òàê. Ñýìïëû íå ïðîïàëè. Îò÷¸òû ïðåäîñòàâèëè è ÿ èõ õðàíþ.
À âîò ìíîãèõ ëþäåé, êîòîðûõ òåñòèðîâàë - óæå íåò.
Êàê æå ÿ æàëåþ, ÷òî â 2007-2008 ãîäàõ òåñòèðîâàë ñâîåãî îòöà, ñâîåãî òðîþðîäíîãî áðàòà ó Ñîðåíñîíà, à íå â ÔÒÄÍÀ.
Ñî ñâîèìè îáðàçöàìè ìîæåòå ìóäðèòü êàê óãîäíî. Õîòü ó öûãàí íà ðûíêå òåñòèðóéòåñü. Âû ñàìè îò ñàìîãî ñåáÿ íèêóäà íå äåíåòåñü.
À âîò ðîäñòâåííèêîâ, îñîáåííî ñòàðøåãî ïîêîëåíèÿ, íàäî òåñòèðîâàòü òîëüêî â ÔÒÄÍÀ. Òî÷êà. | | Ëàéê (2) |
| PedigreeResearcher | Íàâåðõ ##
19 íîÿáðÿ 2025 19:23 Ïðî êà÷åñòâî.
Ïîêàæó ðåàëüíûé ïðèìåð.
Ñåáå ñäåëàë àóòîñìîíûå òåñòû (íå òðàíñôåðû. à èìåííî ðîäíûå òåñòû) â ñë. êîìïàíèÿõ:
1. ÔÒÄÍÀ
2. 23ýíäÌè
3. ÌÍ
4. Àíñåòðè
5. Äàíòå (ïîëíîãåíîìíûé)
6. Äàíòå (ïîëíîãåíîìíûé ëîíã ðèä)
Çàëèë èõ íà Ãåäìàò÷.
Ïîíÿòíîå äåëî, ïîëíîãåíîìíûé ñýìïë óðåçàëè óòèëèòîé äî ñòàíäàðòà îñíîâíûõ ëàáîðàòîðèé.
Ëîíã ðèä, òàê è îñòàëñÿ ëåæàòü ì¸ðòâûì ãðóçîì.  ñèëó ìèçåðíîãî êîëè÷åñòâà ïðîòåñòèðîâàííûõ, íèêòî óòèëèòó íå ñâàÿë. Òàê, ïîñìàòðèâàþ ïîä íàñòðîåíèå ìåäèöèíó.
ÌÍ íå çàëèâàë.
Âñå ñýìïëû îáúåäèíèë â îäèí.
Êà÷åñòâî ìîæíî îöåíèòü âîò ïî ýòîé êàðòèíêå:
 | | Ëàéê (2) |
| PedigreeResearcher | Íàâåðõ ##
19 íîÿáðÿ 2025 19:27 19 íîÿáðÿ 2025 19:35 Òî åñòü, ó ìîåãî îáúåäèí¸ííîãî ôàéëà ñ ïîëíîãåíîìíûì ñðàâíèâàåòñÿ 971122 ñíèïîâ.
Ñ Àíñåñòðè 347984 ñíèïîâ.
Ñ äðåâíèì ÔÒÄÍÀ (àïãðåéä ïðè ñìåíå ÷èïà äåëàë íîâûì çàêàçîì) 446018 ñíèïîâ.
Ñ 23ýíäÌè (òîæå äâàæäû îòïðàâëÿë ñýìïë ïðè ñìåíå ÷èïîâ) 601489 ñíèïîâ.
| | Ëàéê (1) |
| PedigreeResearcher | Íàâåðõ ##
19 íîÿáðÿ 2025 19:35 Ñåé÷àñ äàì ðåçóëüòàòû ñîâïàäåíöåâ ñ Ãåíîòåê (ñòàðîãî, äî ñíèæåíèÿ êà÷åñòâà â ñâÿçè ñ ïðåäïîëàãàåìîé çàìåíîé ÷èïîâ íà òåõ, ÷òî óäàëîñü äîñòàòü):
320982
320069
320541
319443
302934
306998
319758
è ò. ä.
Õîòåë íàéòè ñâåæèå çàëèâêè. Íî íå íàø¸ë. Ðèñêíó ïðåäïîëîæèòü, ÷òî áóäåò â ðàéîíå 250000.
Íîâè÷êàì-ëþáèòåëÿì, êîòîðûå ñ÷èòàþò, ÷òî è 90000 çäîðîâî (ñì. âûøå), êîíå÷íî æå ñîéä¸ò.
Åñëè çàäà÷à ñîñòîèò â òîì, ÷òîáû íàéòè î÷åðåäíóþ òðîþðîäíóþ ñåñòðó, èëè ò¸òþ.
Åñëè æå òåñòû ñäåëàíû äëÿ òîãî, ÷òîáû ïðîôåññèîíàëüíî ðàçáèðàòüñÿ ñ ïðåäêàìè 18-19 ââ., òî õëèïåíüêî êàê-òî.
| | Ëàéê (1) |
Evgeny Kolchugin Ìîñêîâñêàÿ îáë. Ñîîáùåíèé: 1009 Íà ñàéòå ñ 2013 ã. Ðåéòèíã: 1298 | Íàâåðõ ##
19 íîÿáðÿ 2025 19:45 19 íîÿáðÿ 2025 19:50 romaf íàïèñàë: [q] Ïîäñêàæèòå ïîæàëóéñòà, ò.å. äîëæíî áûòü ñîâïàäåíèå íå ïðîñòî â îäíîé õðîìîñîìå, íî è â îäíîì åå ó÷àñòêå ó âñåõ òðîèõ ? Òèïà òàêîãî? Ñïàñèáî
[/q]
Èìåííî òàê, îáùèé ó÷àñòîê (èëè íåñêîëüêî) ó âñåõ òðîèõ - ëó÷øåå äîêàçàòåëüñòâî íàëè÷èÿ îáùåãî ïðåäêà. Ïðàâäà, äëÿ óðîæåíöåâ îäíîé äåðåâíè íóæíî ó÷èòûâàòü âîçìîæíîñòü ðîäñòâà ïî ðàçíûì ëèíèÿì è, ñîîòâåòñòâåííî, âîçìîæíîñòü ïîëó÷åíèÿ îáùåãî ôðàãìåíòà îò ðàçíûõ îáùèõ ïðåäêîâ. ---
https://kolchugin-story.ru
Æèçíü êàæäîãî ÷åëîâåêà äîñòîéíà ðîìàíà. /Èðâèí Ïîëüñòåð/
Êîëü÷óãèíû è Äóäíèêîâû: ñ. Òåðíîâêà Ïåíçåíñêîãî ó. Ïåíçåíñêîé ãóá.
Ïðîøèíû è Ãðèøíîâû: Áóò÷èíñêàÿ âîë. Æèçäðèíñêîãî ó. Êàëóæñêîé ãóá. | | Ëàéê (1) |
Doble_Ancho Ìîñêâà Ñîîáùåíèé: 176 Íà ñàéòå ñ 2025 ã. Ðåéòèíã: 92 | Íàâåðõ ##
19 íîÿáðÿ 2025 23:10 Mikl1984 íàïèñàë: [q] >> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Doble_Ancho îò 19 íîÿáðÿ 2025 17:59
Ìîæåò òàê ïîíÿòíåå áóäåò?
https://forum.vgd.ru/post/527/104275/p5423752.htm#pp5423752
[/q]
Âèäåë ýòîò ïîñò. Íî ê ñîæàëåíèþ ïîíÿòíåå íå ñòàëî, íóæíî íà ïàëüöàõ. ×òî òàêîå èìïüþò (ßíäåêñ íå ïîìîã, îí ññûëàåòñÿ íà âàñ æå, ðîâíî íà ýòîò ïîñò), âåðîÿòíî êîíâåðòàöèÿ ôàéëà VCF â "îáùåïðèçíàííûé" ôîðìàò 5é âåðñèè (çà 1000 ðóáëåé)? ×òî òàêîå "ôàéë ftdna" - îòäåëüíûé òåñò èëè çàãðóæåííûé â ftdna? Ñíèïîâ áûëî 447218, ñòàëî 493233.  òîì æå ôàéëå VCF ïîñëå êîíâåðòàöèè çà 1000 ðóáëåé? Ñ êàêîé ðàäîñòè èõ êîëè÷åñòâî âûðîñëî? Äàëåå: otal matches with kit KH è otal matches with kit RJ - ïî÷åìó ïîêàçàòåëè ðàçíûå? Îäèí ìåíüøå äðóãîãî â íåñêîëüêî ðàç, íî KH è RJ - ÷òî ýòî òàêîå? Ìîæåò, ýòî íåñðàâíèìîå ñðàâíèâàåòñÿ. Ò.å. êàê ïîíèìàþ, Ãåíîòåê, ñàìîñòîÿòåëüíî êîíâåðòèðóÿ ñâîé ôàéë çà 1000 ðóáëåé, äà¸ò â í¸ì áîëüøå ñíèïîâ, íî "ýôôåêòèâíûõ" ñîâïàäåíèé ìåíüøå (õîòÿ âñ¸ ðàâíî ñëèøêîì ìíîãî) - òóò ìîæåò áûòü ìíîãî èíòåðïðåòàöèé (îò çàìåíû îñíîâíîãî òåëà ñíèïîâ äî ÿâíîé çëîíàìåðåííîñòè), âàøà ìûñëü íå ïîíÿòíà. Âîçâðàùàÿñü ê îðèãèíàëüíîìó ïîñòó, ÿ ïðî ýòó ôðàçó: "Íóæåí ïëàòíûé ïðèäóìàííûé èìïüþò V5, êîòîðûé äàñò êó÷ó ëæåñîâïàäåíöåâ" - ñìûñë ïîëó÷àåòñÿ â òîì, ÷òî íóæíî äîïîëíèòåëüíî çàïëèòèòü Ãåíîòåêó 1000 ðóá., ÷òîáû ïîëó÷èòü ôàéë, ïðèáëèçèòåëüíî íîðìàëüíûé ïî êà÷åñòâó? Æëîáñòâî, ñîãëàñåí, ýòîò âîïðîñ îñòàâèì. Íî êàê â ýòîì ôàéëå ("ñêîíâåðòèðîâàííîì" - ò.å. ïðåîáðàçîâàííîì èç îäíîãî ôîðìàòà â äðóãîé) ìîæåò ðàñòè êîëè÷åñòâî èñõîäíûõ äàííûõ (ñòðîê, SNPS) - íèêàê íå ïîéìó. Âû æå ñàìè ïèøåòå: "â íåì... ñëèøêîì ìàëî ñíèïîâ... ïîñëå êîíâåðòàöèè ñòàíåò åùå ìåíüøå". À èõ - äàæå ïî ïî âàøåìó æå ïîñòó - áîëüøå, è êà÷åñòâî îò ïëàòíîé êîíâåðòàöèè ðàñò¸ò. | | |
| Mikl1984
Ñîîáùåíèé: 114
Íà ñàéòå ñ 2025 ã.
Ðåéòèíã: 86
| Íàâåðõ ##
20 íîÿáðÿ 2025 7:50 >> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Doble_Ancho îò 19 íîÿáðÿ 2025 23:10 Íà÷íèòå ñ ïîèñêà èíôû ïðî impute dna õîòü â âèêè Åùå áîëüøå ñêàæó - ñ ýòîãî ãîäà Ã... èç-çà ïëîõîãî êà÷åñòâà ñ÷èòûâàíèÿ íà÷àë èìïüþò vcf, çàìå÷åíà êó÷à îøèáîê íà X õðîìîñîìå À òàê 20-25% íåäîñòîâåðíûõ ñíèïîâ, äîáàâëåííûõ â V5 âåäóò ê óâåëè÷åíèþ ëæåñîâïàäåíöåâ | | |
Doble_AnchoÌîñêâà Ñîîáùåíèé: 176 Íà ñàéòå ñ 2025 ã. Ðåéòèíã: 92 | Íàâåðõ ##
22 íîÿáðÿ 2025 8:01 22 íîÿáðÿ 2025 8:03 Mikl1984 íàïèñàë: [q] >> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Doble_Ancho îò 19 íîÿáðÿ 2025 23:10
Íà÷íèòå ñ ïîèñêà èíôû ïðî impute dna õîòü â âèêè
Åùå áîëüøå ñêàæó - ñ ýòîãî ãîäà Ã... èç-çà ïëîõîãî êà÷åñòâà ñ÷èòûâàíèÿ íà÷àë èìïüþò vcf, çàìå÷åíà êó÷à îøèáîê íà X õðîìîñîìå
À òàê 20-25% íåäîñòîâåðíûõ ñíèïîâ, äîáàâëåííûõ â V5 âåäóò ê óâåëè÷åíèþ ëæåñîâïàäåíöåâ
[/q]
Ïðî ïîÿñíåíèå ïðî òåðìèí impute ñïàñèáî, ñòàëî ïîíÿòíåå. äëÿ ÷èòàþùèõ: èìïüþò = impute DNA = ìåòîä óâåëè÷åíèÿ êîëè÷åñòâà SNPs (äîáàâëåíèÿ íîâûõ) ïî ìàòåìàòè÷åñêèì ìîäåëÿì, à íå íàïðÿìóþ ñ÷èòàííûõ èç áèî-ìàòåðèàëà ÷èïîì, ñ÷èòûâàþùèì SNPs (ìàêñèìàëüíî óïðîùàÿ, êàê ÿ ïîíÿë) Íî âñ¸ åù¸ íå ïîíÿòíî â âàøåì îðèãèíàëüíîì ïîñòå: - "Ýòî ìîé vcf, êîíâåðòèðîâàííûé â ôîðìàò 23&me" - äëÿ óâåðåííîñòè: VCF Ãåíîòåêà, ñêîíâåðòèðîâàííûé ñàìòîñòîÿòåëüíî, âåðíî? - "A âîò èìïüþò â V5" - äëÿ óâåðåííîñòè: ýòî ïëàòíûé ôàéë Ãåíîòåêà çà 1000 ðóáëåé? - "ôàéë ftdna" - ÷òî ýòî? ýòî òðåòèé íàáîð ñòàòèñòèêè, âåðíî? îòêóäà îí ïîÿâèëñÿ? Èìåííî îò íåãî âûñ÷èòûâàþòñÿ 20-25%, êàê ïîíèìàþ. - Total matches with kit KH è Total matches with kit RJ - ïî÷åìó ïîêàçàòåëè (KH è RJ) ðàçíûå? Îäèí ìåíüøå äðóãîãî â íåñêîëüêî ðàç, íî KH è RJ - ÷òî ýòî òàêîå? Ìîæåò, ýòî íåñðàâíèìîå ñðàâíèâàåòñÿ. ChatGPT íå ïîìîã. | | |
| Mikl1984
Ñîîáùåíèé: 114
Íà ñàéòå ñ 2025 ã.
Ðåéòèíã: 86
| Íàâåðõ ##
22 íîÿáðÿ 2025 10:31 >> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ Doble_Ancho îò 22 íîÿáðÿ 2025 8:01 Äà Äà Ìîé ñîáñòâåííûé òåñò ftdna, êîòîðûé ÿâëÿåòñÿ ðåôåðåíñîì äî ïîëó÷åíèÿ ðåçóëüòàòà WGS 30x Ýòî íîìåðà êèòîâ â gedmatch äëÿ óêàçàííûõ ôàéëîâ | | Ëàéê (1) |
|
Ìîé (Lesla) êàíàë â Òåëåãðàììå, ãäå áóäó ïðîáîâàòü ðàññêàçûâàòü íîâè÷êàì î ïðèìåíåíèè ìåòîäîâ ÄÍÊ-òåñòèðîâàíèÿ â ãåíåàëîãèè - https://t.me/gen_gen25