Family Finder
аутосомный тест на ФТДНА / FTDNA
| Nikitoss | Наверх ##
9 мая 2020 10:05 Misslipa написал: [q] В таком случае применяется статистический алгоритм, суть которого заключается в том, что смотрится, какой самый популярный вариант конкретного снипа имеет место быть, если окружающие снипы такие-то и такие-то. Ну это упрощенно.[/q]
Я так понимаю статистический алгоритм применяет сам сайт, после вашего подтверждения с кем-либо близкого родства. Есть ли программы, утилиты, которые могли бы позволить таким образом восстановить чью-то днк? Misslipa написал: [q] Проделав так со всеми 700 000 снипами, можно получить цепочку ДНК вашего отца.[/q]
Спасибо все доходчиво объяснили! ---
поиск в РГАДА
https://t.me/arkhivnik
https://t.me/arkhivniki
https://forum.vgd.ru/?f=8767 | | |
Darigar Москва Сообщений: 226 На сайте с 2019 г. Рейтинг: 362 | Наверх ##
9 мая 2020 12:03 9 мая 2020 12:09 >> Ответ на сообщение пользователя Nikitoss от 9 мая 2020 10:05 При наличии у вас ДНК вашего и 1 из родителей, то "отделение" о котором идет речь выше можно сделать достаточно просто самому в Excel или через спейциальные сайты. Сам этот процесс называется Phasing. Есть еще в GedMatch метод Лазарус для симуляции ДНК человека, на основании ДНК близких и не очень людей. ПС: о Х матче на FTDNA. Прошу вас обратить внимание на то, что точность этих Х матчей крайне мала и может вас сподвинуть на поиски в неверном направлении. Другое дело, если вы сравните на GedMatch Х хромосом и там вам дадут по нему родство. Значительно точнее. | | |
Misslipa Таллин Сообщений: 172 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 106 | Наверх ##
9 мая 2020 17:10 9 мая 2020 17:11 >> Ответ на сообщение пользователя Darigar от 9 мая 2020 12:03 У меня напротив некоторых совпаденцев стоит X-match, а идешь смотреть в Chromosome Browser - у половины из них и не виден общий участок на этой хромосоме  | | |
DarigarМосква Сообщений: 226 На сайте с 2019 г. Рейтинг: 362 | Наверх ##
9 мая 2020 17:16 Misslipa написал: [q] >> Ответ на сообщение пользователя Darigar от 9 мая 2020 12:03
У меня напротив некоторых совпаденцев стоит X-match, а идешь смотреть в Chromosome Browser - у половины из них и не виден общий участок на этой хромосоме [/q]
Я так понял, что мы об одном и том же. На FTDNA Х-match не значит то что есть Х-match. Нужно проверять на более усовершенствованных инструментах. | | |
MisslipaТаллин Сообщений: 172 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 106 | Наверх ##
9 мая 2020 17:48 Darigar написал: [q]
Misslipa написал:
[q]
>> Ответ на сообщение пользователя Darigar от 9 мая 2020 12:03
У меня напротив некоторых совпаденцев стоит X-match, а идешь смотреть в Chromosome Browser - у половины из них и не виден общий участок на этой хромосоме
[/q]
Я так понял, что мы об одном и том же. На FTDNA Х-match не значит то что есть Х-match.
Нужно проверять на более усовершенствованных инструментах.[/q]
Да, мы про одно и то же. Я сейчас внимательнее изучила: FTDNA показывает X-match, если хотя бы один отрезок длиной 1 cM есть, а когда заходишь в браузер хромосом, по умолчанию стоит "показывать отрезки длиной как минимум 5 cM". И да, согласна: 1 cM - это ничтожно мало. Впрочем, как и 5 сM. | | |
| Nikitoss | Наверх ##
9 мая 2020 21:40 Darigar написал: [q] Другое дело, если вы сравните на GedMatch Х хромосом и там вам дадут по нему родство. Значительно точнее.[/q]
Из вышесказанного я должен скачать из FTDNA файл Х хромосом Raw Data и загрузить для сравнения? В моем случае я только объединенный файл загружал на GedMatch. В чём плюсы файлов аутосомный Raw Data и Х хромосомный Raw Data? ---
поиск в РГАДА
https://t.me/arkhivnik
https://t.me/arkhivniki
https://forum.vgd.ru/?f=8767 | | |
DarigarМосква Сообщений: 226 На сайте с 2019 г. Рейтинг: 362 | Наверх ##
9 мая 2020 23:45 Если объедененный загружали, то другого не нужно.
Моё сообщение в том, что если вы хотите теоретизировать родство с мачем, основываясь на том что у вас FTDNA предположил родство по Х. Лучше проверить это его предположение в Гедмач, если это возможно (1 к 1 по Х).
Или же просто зайти в хромозом браузер на FTDNA и там выбрать свой Х мач и проверить, какой длинны мач. Если менее 7-10 сМ. То возможно ошибка. Если менее 5сМ. То это уже вероятнее всего ошибка а не Х мач. | | |
MisslipaТаллин Сообщений: 172 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 106 | Наверх ##
20 мая 2020 18:36 20 мая 2020 18:37 У меня есть три совпаденца из одной семьи: мать и ее дети.
Прилагаю скриншот.
Мать обозначена красным цветом, дети - зеленый и синий.
С 19ой хромосомой все понятно: с матерью общий участок длиной 31 сM, с ее сыном - 29.
А что происходит на 20ой хромосоме? Там с детьми у меня по 8 сM общий участок, но у матери его нет.
Неужели такой длинный false positive?
 | | |
DarigarМосква Сообщений: 226 На сайте с 2019 г. Рейтинг: 362 | Наверх ##
20 мая 2020 20:27 Misslipa написал: [q] [/q]
Или просто у Матери он не виден по причине no-call зоны в её тесте по этой части 20го, либо родство есть и с отцом у вас? что еще возможно, это когда тестируются в разных фирмах и заливают на FTDNA. Результат - с родителями миньше бывает общих SNP чем с детьми. Потому что оказывается что мать в Ancestry на пример тестировалась, а дети там же где и вы. | | |
MisslipaТаллин Сообщений: 172 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 106 | Наверх ##
20 мая 2020 22:32 Darigar написал: [q]
Misslipa написал:
[q]
[/q]
Или просто у Матери он не виден по причине no-call зоны в её тесте по этой части 20го, либо родство есть и с отцом у вас?
что еще возможно, это когда тестируются в разных фирмах и заливают на FTDNA. Результат - с родителями миньше бывает общих SNP чем с детьми. Потому что оказывается что мать в Ancestry на пример тестировалась, а дети там же где и вы.[/q]
Родство с отцом конечно теоретически может быть, но мне кажется это таким маловероятным | | |
|
