ÄÍÊ-ãåíåàëîãèÿ. Âîïðîñû íîâè÷êîâ
È îòâåòû îïûòíûõ ))
Íàòàøà ÑÌÎðãàíèçàòîð Ñìîëåíñêîãî Ãåíåàëîãè÷åñêîãî êëóáà  ãîðîä-ãåðîé Ñìîëåíñê Ñîîáùåíèé: 3085 Íà ñàéòå ñ 2012 ã. Ðåéòèíã: 2628 | Íàâåðõ ##
17 àïðåëÿ 2013 15:30 17 àïðåëÿ 2013 15:31 Áëàãîäàðÿ ôîðóì÷àíàì çàðàçèëàñü èäååé ñäåëàòü ÄÍÊ-òåñò  Íî ïîíÿëà, ÷òî î÷åíü òðóäíî âûáèðàòü íóæíóþ èíôîðìàöèþ ïî êðóïèíêàì èç ðàçíûõ òåì, èç äíåâíèêîâ ó÷àñòíèêîâ è ò.ä. Ïîñòåïåííî çàáûâàåøü, ÷òî ãäå ïðî÷èòàë ,à âòîðîé ðàç íå âñåãäà íàéòè ïîëó÷àåòñÿ. Äà åùå, ÷àñòåíüêî, è ïîíÿòü íå ìîæåøü íåçíàêîìûå àááðåâèàòóðû è ñëîâà, à ïðîñèòü êàæäûé ðàç ïåðåâåñòè " ñ ðóññêîãî íà ðóññêèé" - êàê-òî íåóäîáíî  È òàê, íà ôîíå äèñêóññèé îïûòíûõ ôîðóì÷àí ÷óâñòâóåøü ñåáÿ íå ñîâñåì ðàçóìíûì ñóùåñòâîì))) À âîïðîñîâ êó÷à!!!  Õîòÿ, ÿ óâåðåíà, ó âñåõ íà÷èíàþùèõ, îäíè è òå æå âîïðîñû, ñîìíåíèÿ è ò.ä. Èíòåðåñ ê ýòîìó äåëó âñ¸ ðàñòåò è æåëàþùèõ âñ¸ áîëüøå è áîëüøå. Ïîýòîìó î÷åíü ïðîøó çíàþùèõ è îïûòíûõ â ýòîì äåëå èññëåäîâàòåëåé, ïîìî÷ü íàì, íîâè÷êàì, â îñâîåíèè ÄÍÊ-ãåíåàëîãèè Ïîíèìàþ, ÷òî ìíîãèå ó ñåáÿ âûêëàäûâàëè ðàíåå êàêèå-òî ñîâåòû è ðåêîìåíäàöèè, äåëèëèñü îïûòîì - ïðîñòî îñòàâüòå çäåñü ññûëî÷êè, ïîæàëóéñòà. Äóìàþ, òàê íîâè÷êè (â òîì ÷èñëå, è ÿ) áûñòðåå ðàçáåðóòñÿ è áóäóò Âàì î÷åíü áëàãîäàðíû! Íó è êîíå÷íî, ÿ äóìàþ, ÄÍÊ-ñîîáùåñòâî òîëüêî âûèãðàåò, åñëè áëàãîäàðÿ ýòîé òåìå ê íåìó ïðèñîåäèíÿòñÿ íîâåíüêèå "äíê-íàðêîìàíû", êàê âûðàçèëñÿ êòî-òî èç ôîðóì÷àí
---
Ôèëèìîíîâû - Ñìîëåíñêàÿ ãóáåðíèÿ, Ïîðå÷ñêèé è Äóõîâùèíñêèé óåçäû, ìåùàíå ã.Âåëèæà
Âàéñáëèò - Óêðàèíà
Ðåéñëåð - Àâñòðî-Âåíãðèÿ, Êèøèí¸â
Ìàñëîâû - Ñò.Íåêðàñîâêà, Èçìàèë
----
Ðàáîòàþ â àðõèâàõ Ñìîëåíñêà ñ 2013ã. Ïîìîãó â âàøèõ ïîèñêàõ.
Ìîé òåëåãðàì-êàíàë https://t.me/gen_sysk
| | Ëàéê (8) |
| I_Sokka
Ñàíêò-Ïåòåðáóðã
Ñîîáùåíèé: 501
Íà ñàéòå ñ 2019 ã.
Ðåéòèíã: 472
| Íàâåðõ ##
28 ôåâðàëÿ 2022 23:17 28 ôåâðàëÿ 2022 23:50 evgenij-uscov íàïèñàë: [q] Ñäàë òåñò Y37 â familytreedna. Â ìèíóâøèå âûõîäíûå ïðèøëî ñîîáùåíèå, ÷òî ðåçóëüòàò ãîòîâ.
 ðåçóëüòàòàõ óâèäåë ïðåäñêàçàííàÿ ãàïëîãðóïïà R-M198. ×òî çà ãðóïïà, ÷òî îíà îçíà÷àåò?[/q]
Îòïèøèòåñü íà Ìîëãåíå: https://forum.molgen.org/index...rdseen#newÂñòóïèòå â R1a project â FTDNA: https://www.familytreedna.com/groups/r-1a/about/backgroundÍàïèøèòå íà Ìîëãåíå íîìåð ñâîåãî íàáîðà. Ìîæåòå è ñàìîñòîÿòåëüíî ïåðåêîïèðîâàòü ãàïëîòèï (ïîëó÷åííûå öèâåðêè) íà Nevgen: https://www.nevgen.org/ - âûáåðèòå â óñòàíîâêàõ R1a/Ð1à. R-Ì198 èëè R1a â Âèêèïåäèè: https://ru.wikipedia.org/wiki/...%9D%D0%9A), íî èíòåðåñíåå ÷èòàòü ïðî áîëåå òî÷íûé ñóáêëàä. evgenij-uscov íàïèñàë: [q] Ïî Y25 íàøëîñü 19 ñîâïàäåíöåâ ñ øàãîì 2, à ïî Y37 è Y12 èõ íåò. Ïî÷åìó òàê?[/q]
Íåò áëèçêîãî ðîäñòâåííèêà, ñäàâøåãî òàêîé òåñò. Íà Y12, êàê ïðàâèëî, ñîâïàäåíöû åñòü ó ìíîãèõ. Åñëè íåò ñîâïàäåíöåâ íà Y12, òî âåðîÿòíî, ÷òî ñèëüíî îòëè÷àþòñÿ çíà÷åíèÿ "ìåäëåííûõ" ÑÒÐ-ìàðêåðîâ. Ìîæåò óêàçûâàòü íà î÷åíü ðåäêèé ñóáêëàä è áåç àïãðåéäà òåñòà íå îáîéòèñü.  ëþáîì ñëó÷àå - ïîëó÷èòå ïðåäñêàçàíèå Nevgen, à òàì óæå âèäíî áóäåò. evgenij-uscov íàïèñàë: [q] Ñêà÷àë ôàéë ñ ðàñøèðåíèåì csv, ìîæíî ëè íà êàêèå òî äðóãèå ñàéòû åãî çàãðóçèòü?[/q]
Áàçà FTDNA óíèêàëüíàÿ ïî Y-STR ìàðêåðàì, ïîêà èõ (ïðàêòè÷åñêè) íèêóäà íå çàãðóçèòü. Ïîñëå àïãðåéäà äî BigY èëè ïîëíîãåíîìíîãî ñåêâåíèðîâàíèÿ èõ ìîæíî çàãðóçèòü íà YFull, íî èõ ðîëü ñèëüíî ñíèæàåòñÿ, åñëè óæå îïðåäåëåí ñóáêëàä ïî ñíèïó. ---
Èùó Ñîêêà èëè Ñîêêî (Ïå÷åíêèí), Êàòàëà (Áîíäàðåâ), Ìåòñî (Ñåì¸íîâ), Òóçáåðã. ïðèõîä, è äåðåâíÿ, Ìàðêîâî (Markkova, Markowa), Ìãèíñêèé èëè Êèðîâñêèé ðàéîí Ëåí. Îáë.
Èùó Íèêèòèíñêèå, Ìàðòûíîâû, Áîáèíû, Îíó÷èíû - Ðàêóëî-Êîêøåíñêèé ïîãîñò, Âåëüñêèé óåçä, Âîëîãîäñêàÿ ãóáåðíèÿ. | | |
| Olivka00 Íà÷èíàþùèé
Áåðëèí-Ìèíñê
Ñîîáùåíèé: 36
Íà ñàéòå ñ 2022 ã.
Ðåéòèíã: 39 | Íàâåðõ ##
28 ôåâðàëÿ 2022 23:35 Ñêàæèòå, à åñëè ó ìåíÿ åñòü èñõîäíèêè â ôîðìàòàõ VCF, Fastq, Cram îò nebula (äåëàëà äî÷êå ñåêâåíèðîâàíèå ãåíîìà íà 30õ), ìîæíî ëè èõ ãäå-òî ïðîàíàëèçèðîâàòü íà ïðåäìåò ðîäñòâåííûõ ñâÿçåé? | | |
| I_Sokka
Ñàíêò-Ïåòåðáóðã
Ñîîáùåíèé: 501
Íà ñàéòå ñ 2019 ã.
Ðåéòèíã: 472
| Íàâåðõ ##
28 ôåâðàëÿ 2022 23:42 hikigaeru íàïèñàë: [q] Åñëè îáùàÿ äëèíà è íàèáîëüøèé ó÷àñòîê ñîâïàäàþò - ýòî íå çíà÷èò, ÷òî ïðåäïîëàãàåìîå ðîäñòâî áîëåå áëèçêîå?[/q]
 ïðèíöèïå, äà, íî... Íî ïðè î÷åíü áëèçêîì ðîäñòâå, äà, à ïðè áîëåå óäàëåííîì ãðàíèöû ðàçìûâàþòñÿ. ×åì äàëüøå ðîäñòâî, òåì â ñðåäíåì ìåíüøå îáùàÿ ÄÍÊ, íî è ãðàíèöû ðàçìûâàþòñÿ - îò íóëÿ äî êàêîãî-òî çíà÷åíèÿ, ñîîòâåòñâóþøåìó ðîäñòâó. Òóò íàäî åùå ó÷åñòü âîçìîæíóþ âåðîÿòíóþ ãåíåàëîãèþ - íàïðèìåð, áðàêè â îòíîñèòåëüíî çàêðûòîì ñîîáùåñòâå (óñëîâíî, â äåðåâíå âñå äðóã äðóãó ðîäíÿ, õîòü è óäàëåííî), îáùèå ðåãèîíû ïðîèñõîæäåíèÿ (âîçìîæíàÿ ïåðåäà÷à ãåíåòè÷åñêîãî "ôîíà") è ò.ä. Ïîñìîòðèòå ñõåìó ðîäñòâà ïî ðåçóëüòàòàì àóòîñîìíîãî òåñòà: https://forum.molgen.org/index...#msg504693hikigaeru íàïèñàë: [q] Ãåäìàò÷ ñ÷èòàåò. ÷òî ïåðâûé ÷åëîâåê áîëåå áëèçêèé ðîäñòâåííèê, ÷åì âòîðîé.[/q]
Ãåäìàò÷ ñìîòðèò òîëüêî íà îáùóþ ÄÍÊ, à òîãäà áëèæå. Ñìîòðèòå òàêæå íà êîëè÷åñòâî îáùèõ ñðàâíèâàåìûõ ñíèïîâ - ÷åì èõ ìåíüøå. òåì ìåíåå íàäåæíî ñðàâíåíèå. hikigaeru íàïèñàë: [q] ó îäíîãî ñîâïàäåíöà îáùàÿ äëèíà ñîâïàäåíèÿ 45 ñì, à íàèáîëüøèé ó÷àñòîê 10 ñì, à ó äðóãîãî 35 ñì îáùàÿ äëèíà è òàêàÿ æå äëèíà íàèáîëüøåãî ó÷àñòêà, òîæå 35 ñì.[/q]
Îáà ïîïàäàþò â îáëàñòü ïÿòè-/øåñòèþðîäíîãî ðîäñòâåííèêà è äàëåå. 45 ñÌ è 35 ñÌß áû ïðåäïîëîæèë, ÷òî 35(35) ñÌ ìîãóò óêàçûâàòü íà íàñëåäîâàíèå ïî ìóæñêèì ëèíèÿì, òàê êàê äðîáëåíèå ÄÍÊ ïðîèñõîäèò ÷àùå â æåíñêèõ ãåíîìàõ, ÷åì â ìóæñêèõ. Ýòî íå 100%, íî ÿ áû îáðàòèë âíèìàíèå íà ìóæñêèå ëèíèè â ñåìåéíîì äåðåâå. ---
Èùó Ñîêêà èëè Ñîêêî (Ïå÷åíêèí), Êàòàëà (Áîíäàðåâ), Ìåòñî (Ñåì¸íîâ), Òóçáåðã. ïðèõîä, è äåðåâíÿ, Ìàðêîâî (Markkova, Markowa), Ìãèíñêèé èëè Êèðîâñêèé ðàéîí Ëåí. Îáë.
Èùó Íèêèòèíñêèå, Ìàðòûíîâû, Áîáèíû, Îíó÷èíû - Ðàêóëî-Êîêøåíñêèé ïîãîñò, Âåëüñêèé óåçä, Âîëîãîäñêàÿ ãóáåðíèÿ. | | |
| I_Sokka
Ñàíêò-Ïåòåðáóðã
Ñîîáùåíèé: 501
Íà ñàéòå ñ 2019 ã.
Ðåéòèíã: 472
| Íàâåðõ ##
28 ôåâðàëÿ 2022 23:50 Olivka00 íàïèñàë: [q] Ñêàæèòå, à åñëè ó ìåíÿ åñòü èñõîäíèêè â ôîðìàòàõ VCF, Fastq, Cram îò nebula (äåëàëà äî÷êå ñåêâåíèðîâàíèå ãåíîìà íà 30õ), ìîæíî ëè èõ ãäå-òî ïðîàíàëèçèðîâàòü íà ïðåäìåò ðîäñòâåííûõ ñâÿçåé?[/q]
Æåíñêèå è îñîáåííî ìóæñêèå òåñòû ñëåäóåò ïðîàíàëèçèðîâàòü â YFull - ïåðåíîñ äàííûõ ñî ñòðàíèöû Nebula. Àíàëèç â YFull: æåíñêàÿ ìèòî-ãàïëîãðóïïà - ïðèìåðíî 25 äîëë, ìóæñêàÿ Y-ãàïëîãðóïïà è ìèòî/ãàïëîãðóïïà - 45$. FASTQ èëè CRAM ìîæíî îáðàáîòàòü WGS Extract, èõ ñòðàíèöà: https://wgsextract.github.io/Ñàì ïîêà íå ïðîáîâàë, íî ñëûøàë, ÷òî ìîæíî çàãðóçèòü è íà FTDNA, è íà MyHeritage. GEDmatch òîæå äîëæåí ñüåñòü êîìáèíèðîâàíûé íàáîð. Olivka00 íàïèñàë: [q] äåëàëà äî÷êå ñåêâåíèðîâàíèå ãåíîìà íà 30õ[/q]
Äëÿ ãåíåàëîãè÷åñêîãî ïîèñêà öåëåñîîáðàçíåå òåñòèðîâàòü êàê ìîæíî áîëåå ñòàðøèõ ðîäñòâåííèêîâ, à íå äåòåé èëè âíóêîâ. ---
Èùó Ñîêêà èëè Ñîêêî (Ïå÷åíêèí), Êàòàëà (Áîíäàðåâ), Ìåòñî (Ñåì¸íîâ), Òóçáåðã. ïðèõîä, è äåðåâíÿ, Ìàðêîâî (Markkova, Markowa), Ìãèíñêèé èëè Êèðîâñêèé ðàéîí Ëåí. Îáë.
Èùó Íèêèòèíñêèå, Ìàðòûíîâû, Áîáèíû, Îíó÷èíû - Ðàêóëî-Êîêøåíñêèé ïîãîñò, Âåëüñêèé óåçä, Âîëîãîäñêàÿ ãóáåðíèÿ. | | Ëàéê (1) |
| Olivka00 Íà÷èíàþùèé
Áåðëèí-Ìèíñê
Ñîîáùåíèé: 36
Íà ñàéòå ñ 2022 ã.
Ðåéòèíã: 39 | Íàâåðõ ##
1 ìàðòà 2022 0:20 >> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ I_Sokka îò 28 ôåâðàëÿ 2022 23:50 Íó ó íàñ ïðîñòî öåëü òåñòèðîâàíèÿ ñîâñåì äðóãàÿ áûëà, íàäî áûëî ïðîáèòü íà âîçìîæíóþ ãåíåòè÷åñêóþ ïðè÷èíó çàáîëåâàíèÿ. À âåäü ÿ íà yfull çàãðóçèëà ñðàçó êàê ïîëó÷èëà äàííûå, ïðè÷åì áåñïëàòíî, òî ëè êàêîå-òî ñïåöïðåäëîæåíèå ïîäàðî÷íîå áûëî, òî ëè ÷òî - íå ïîìíþ. Äàííûå çàêèíóëà, âèäåëà 2 íåòî÷íûõ ñîâïàäåíèÿ, íî ÷òî ñ ýòèì äàëüøå äåëàòü òàê è íå ïîíÿëà. Ïîéäó ïî÷èòàþ, ñïàñèáî | | |
| evgenij-uscov Íà÷èíàþùèé
Êèðîâ
Ñîîáùåíèé: 30
Íà ñàéòå ñ 2014 ã.
Ðåéòèíã: 15 | Íàâåðõ ##
1 ìàðòà 2022 9:22 >> Îòâåò íà ñîîáùåíèå ïîëüçîâàòåëÿ I_Sokka îò 28 ôåâðàëÿ 2022 23:17 Ñïàñèáî, áóäó èçó÷àòü))) | | |
Íàòàøà ÑÌÎðãàíèçàòîð Ñìîëåíñêîãî Ãåíåàëîãè÷åñêîãî êëóáà ãîðîä-ãåðîé Ñìîëåíñê Ñîîáùåíèé: 3085 Íà ñàéòå ñ 2012 ã. Ðåéòèíã: 2628 | Íàâåðõ ##
25 ìàðòà 2022 14:05 25 ìàðòà 2022 14:06 Äîáðîãî äíÿ!
 ñåìüå "õîäÿò ñëóõè", ÷òî ìîé îòåö è åãî ñåñòðà áûëè ÿêîáû ðîæäåíû íå îò îäíîãî îòöà. Ìîé äâîþðîäíûé áðàòó (ñûí îòöîâñêîé ñåñòðû) ñäåëàë òåñò.
Ó íàñ ñ íèì ñëåäóþùèå ñîâïàäåíèÿ: îáùèå ÄÍÊ 12,8 (906,5 ñÌ), îáùèå ñåãìåíòû 34, íàèáîëüøèé ñåãìåíò 98,4 ñÌ (òåñò MyHeritage).
Ïîíèìàþ, ÷òî ýòî ãàäàíèå íà êîôåéíîé ãóùå, íî êàê âû äóìàåòå, ìîæíî ëè ïî ýòèì ðåçóëüòàòàì ïîíÿòü, ðîäíûå ëè ìåæäó ñîáîé ìîé îòåö è åãî ìàòü?
Ï.Ñ. Áîëüøå íåêîãî ïðîòåñòèðîâàòü ---
Ôèëèìîíîâû - Ñìîëåíñêàÿ ãóáåðíèÿ, Ïîðå÷ñêèé è Äóõîâùèíñêèé óåçäû, ìåùàíå ã.Âåëèæà
Âàéñáëèò - Óêðàèíà
Ðåéñëåð - Àâñòðî-Âåíãðèÿ, Êèøèí¸â
Ìàñëîâû - Ñò.Íåêðàñîâêà, Èçìàèë
----
Ðàáîòàþ â àðõèâàõ Ñìîëåíñêà ñ 2013ã. Ïîìîãó â âàøèõ ïîèñêàõ.
Ìîé òåëåãðàì-êàíàë https://t.me/gen_sysk
| | |
Darigar Ìîñêâà Ñîîáùåíèé: 231 Íà ñàéòå ñ 2019 ã. Ðåéòèíã: 394 | Íàâåðõ ##
25 ìàðòà 2022 15:29 Íàòàøà ÑÌ íàïèñàë: [q] Äîáðîãî äíÿ!
[/q]
ñîãëàñíî ñòàòèñòèêå DNApainter ó âàñ âïîëíå ñòàíäàðòíûå çíà÷åíèÿ äëÿ 2-þðîäíîñòè. 866ñÌ â ñðåäíåì ó òàêèõ. åñëè áû áûëî ïî ñëóõàì, òî â ñðåäíåì 449ñÌ. | | Ëàéê (1) |
Íàòàøà ÑÌÎðãàíèçàòîð Ñìîëåíñêîãî Ãåíåàëîãè÷åñêîãî êëóáà ãîðîä-ãåðîé Ñìîëåíñê Ñîîáùåíèé: 3085 Íà ñàéòå ñ 2012 ã. Ðåéòèíã: 2628 | Íàâåðõ ##
25 ìàðòà 2022 15:49 Darigar íàïèñàë: [q] ñîãëàñíî ñòàòèñòèêå DNApainter ó âàñ âïîëíå ñòàíäàðòíûå çíà÷åíèÿ äëÿ 2-þðîäíîñòè. 866ñÌ â ñðåäíåì ó òàêèõ.
åñëè áû áûëî ïî ñëóõàì, òî â ñðåäíåì 449ñÌ.[/q]
Darigar, ñïàñèáî! Èíòåðåñíî, à âîçìîæíû ëè òàêèå ðåçóëüòàòû, åñëè ìîé îòåö è ìàòü áðàòà áûëè íå ðîäíûå? ---
Ôèëèìîíîâû - Ñìîëåíñêàÿ ãóáåðíèÿ, Ïîðå÷ñêèé è Äóõîâùèíñêèé óåçäû, ìåùàíå ã.Âåëèæà
Âàéñáëèò - Óêðàèíà
Ðåéñëåð - Àâñòðî-Âåíãðèÿ, Êèøèí¸â
Ìàñëîâû - Ñò.Íåêðàñîâêà, Èçìàèë
----
Ðàáîòàþ â àðõèâàõ Ñìîëåíñêà ñ 2013ã. Ïîìîãó â âàøèõ ïîèñêàõ.
Ìîé òåëåãðàì-êàíàë https://t.me/gen_sysk
| | |
DarigarÌîñêâà Ñîîáùåíèé: 231 Íà ñàéòå ñ 2019 ã. Ðåéòèíã: 394 | Íàâåðõ ##
25 ìàðòà 2022 16:21 25 ìàðòà 2022 18:14 Íàòàøà ÑÌ íàïèñàë: [q]
[/q]
Ñîãëàñíî òîìó æå ðåñóðñó, äà. Íî ñêîðåå íåò, ýòî îêîëî 2% âåðîÿòíîñòè. Åñëè òîëüêî âñå äåéñòâóþùèå ëèöà ðîäñòâååíû ìåæ ñîáîè è åùå äðóãèìè âåòâÿìè äðåâüåâ (âûñîêèé óðîâåíü ýíäîãàìèè). | | Ëàéê (1) |
|
Ìîé (Lesla) êàíàë â Òåëåãðàììå, ãäå áóäó ïðîáîâàòü ðàññêàçûâàòü íîâè÷êàì î ïðèìåíåíèè ìåòîäîâ ÄÍÊ-òåñòèðîâàíèÿ â ãåíåàëîãèè - https://t.me/gen_gen25