ДНК-генеалогия. Вопросы новичков

Gedmatch - вообще не лаборатория, хотя может, конечно, по происхождению теста учесть какие-то его особенности, но, я думаю, выводы всё же делаются не из происхождения, а из содержания теста. При сравнении 1:1 в Gedmatch можно выбрать любую минимальную длину, большую 3, но по умолчанию - 7, а в FTDNA - 5. MyHeritage, как писали, вообще использует ту же лабораторию, только алгоритмы сравнения результата дургие. Да, мне уже хочется самому написать функцию сравнения, чтобы понять, у кого как на самом деле.
У Вас, Тампио, видно, что результат сравнения себя с собой уменьшился по сравнению с прошлогодним, значит какие-то участки при текущих настройках по умолчанию выводятся из сравнения за недостаточностью достоверных данных. Или это уже новый тест? Мой новый тест уже тоже на пути в FTDNA, и я с нетерпением жду возможности сравнить их между собой (в сырых данных), понять, насколько результат зависит от лаборатории и случайностей.

Bones, overlap показывает объём данных, количество общих SNP, на которых возможно провести сравнение, и если он низкий, ниже 100000, то результаты будут не слишком надёжными, помечены розовым или красным. Оба показателя длины совпадения важны, и вывод лучше делать по обоим. В таблице, которую я привёл, можно помотреть, оба они соответствуют примерно одной степени родства, или отличаются. Максимальная длина совпавшего участка всё же больше подвержена случайности: этот участок с вероятностью 0.5 мог передаться или не передаться от родителя, причём каждому из вас. Когда он единственный совпавший, это уже совсем рулетка.
FTDNA в сумму длин совпавших участков включает даже самые короткие, от 1 cM, совпадения, к которым не нужно относиться серьёзно. Я в свою таблицу включал сумму совпадений только по участкам от 5 cM.

Bones, мне китайцы сделали бесплатно несколько лет назад почти полный аутосомный геном (20 млн. SNP), покрытие типовых тестов FTDNA - около 85% получилось. Но это тест я смог только на Gedmatch использовать, на FTDNA загрузил в формате 23&me, но он уже месяца два висит в ожидании результата, возможно, что-то не так я всё-таки изобразил.

Bones написал:

[q]

Если задаёшь национальность...
Мой вопрос: насколько можно доверять этому "ораклу"?

[/q]

Почти в той же степени, как и доверие к гороскопам.

Bones написал:

[q]

аутосомного ДНК, унаследованного от таких древних европейских групп людей: Hunter-Gatherers, Early Farmers, and Metal Age Invaders). Насколько достоверна эта карта и процентный подсчет, как думаете?

[/q]

Я думаю, что многие подразумевают под этим не то, что изначально было задумано.

Охотники-собиратели - это не группы, а образ жизни. В Европе, как пишут, все люди были охотниками-собирателями до примерно 5-7 тысячелетия до н.э.

Потом в Европу из района Междуречья стали приходить люди, имеющие навыки сельского хозяйства. Через некоторое время бывшие собиратели стали рубить лес и сажать овощи. Так они стали "фермерами".

Примерно в 1 тысячелетии до н.э. люди научились в Европе плавить не только медь, но и железо.

Аутосомное родство перестаёт 'видиться' примерно через 300-1000 лет. Понятно, что люди, жившие во времена Гомера (ранний железный век) не обнаружат аутосомное родство с "фермерами" 3 тысячелетия до н.э., а эти "фермеры" - с "охотниками" 7 тысячелетия до н.э.

Но гипотетически это может быть одним и тем же родом, который жил в одном и том же месте на протяжении тысячелетий. (Понятно, что в это место были какие-то миграции.)

К чему это я? Да к тому, что упомянутые карты - фикция. Они относятся не к ДНК, а к культурным сообществам.

Bones написал:

[q]

Я ещё думаю, неужели и такая информация закодирована в ДНК?

[/q]

Многие (в том числе и на этом форуме) не только думают, но и уверены в этом и месяцами исследуют разные "этнокалькуляторы" в поисках наилучшего.

Хотя, люди часто доверяют тому, что читают. Вот, к примеру, myheritage рисует у себя на сайте всякое там этническое происхождение. Ну как тут людям не верить — это же учОные пишут!
Ну а о том, что же это за национальность такая: Восточная Азия или Западная Европа — они и не думают.

На самом деле, правильнее говорить не об этническом происхождении, а о популяционном... не о "ближневосточных фермерах", а о миграциях мужчин с ближневосточными гаплотипами.