ДНК-генеалогия. Вопросы новичков

Bones, а хромосный браузер или что-то подбное ведь есть и на MyHeritage? На чём он показал эти 30 cM, и что на этом месте показывают другие? Возможно, он показал общую сумму всех совпадений, в том числе и очень коротких, а достаточно длинный был только один? Очень короткие совпадения, т.е. которые могли пережить многократную нарезку через перекрещивания, нужно относить к постороннему шуму: это дейстаительно общие участки, но доставшиеся неизвестными путями через более, причём может быть намного более, чем 10-юродное родство.

Bones написал:

[q]

myheritage показывает shared 30 сM на одном участке:

[/q]

Проблема в алгоритме подсчёта длины. Одна лаборатория может не учитывать определённый отрезок, повторяющийся у многих пользователей, считая его за некий "спам", а другая лаборатория посчитает его за нормальный и приплюсует к соседнему.

Поэтому я думаю, что ходящие по интернету таблицы, связывающие родство и длину отрезков, должны быть не общие, а раздельными по лабораториям, как минимум.

Следует помнить, что лаборатории иногда меняют чипы, влияющие на качество прочитывается.

Bones написал:

[q]

более достоверный результат на FTDNA и gedmatch, раз и там, и там почти одинаковый по длине самый большой участок совпадения выходит.

[/q]

Вполне возможно.
Но не всегда согласованность одних является доказательством их правильности. Это как взять двух троечников и одного отличника, и судить по правильности исходя лишь из похожести ответов.

Кстати, а какой именно гедматч у вас совпадает с ФТДНА?
Мой результат в ФТДНА с моими родителями такие совпадения:
мать - 3,374 общ.
отец - 3,372 общ.

В Geni:
мать - 3374.5 cM
отец - 3371.6 cM

В DNA.LAND:
отец — 3339,34 сМ

Ну а вот и Гедматч:
первая строка — я сам с собой
вторая и третья — мать и отец в старой версии Гедматча
четвёртая и пятая (выделенные синим) строки — мать и отец в версии генезис.гедматч.

Как видим, Гедматч он разный и с ФТДНА не согласуется ни одна версия :-/

В Gedmatch интересующие пары лучше проверять сравнением 1:1. Алгоритмы сравнения они часто совершенстуют, исправляют ошибки. Все пары по всей базе они при этом не пересчитывают. Кроме того, при массовом сравнении, когда таблица заполняется данными о сравнении со множеством других, они могут использовать более упрощённые алгоритмы. При сравнении 1:1 используется полная версия (хотя вроде была ещё более крутая, платная).
Та таблица, что я привёл, никак не учитывает особенности лаборатории. Она показывает зависимость родства от совпавших участков ДНК в их природном состоянии и не учитывает возможных недостатков или неполноты тестов. Там, где есть хотя бы 100 общих SNP/cM, все алгоритмы должны давать приблизительно одинаковые результаты.
Разница в алгоритмах может быть в способе учёта участков ДНК, не очень плотно покрытых SNP, которые удалось протестировать в обоих тестах. В Gedmatch 1:1 для этого есть дополнительные настройки, а как это делают алгоритмы FTDNA и MyHeritage - остаётся только догадываться. Кроме того, Gedmatch обязательно указывает, какое число SNP по позициям совпало в двух тестах и могло в принципе быть использовано для сравнения (overlap). FTDNA даёт это число только для совпавших участков и часто округляет его по не очень понятным причинам.
Те участки, которые не анализировались, и Gedmatch, и FTDNA ("спам" ?) отмечают особым цветом/штриховкой.

Петр_СПб написал:

[q]

Кроме того, Gedmatch обязательно указывает, какое число SNP по позициям совпало в двух тестах и могло в принципе быть использовано для сравнения (overlap)

[/q]

Да, кстати, насколько важен overlap? С одними совпаденцами может быть общий участок длиннее, чем с другими, но зато overlap розовым или красным цветом маркирован. Что важнее: largest seg, total seg или overlap? Или всё вместе?

Тампио написал:

[q]

Мой кит в новой версии PC6133025

[/q]

Проверила, с Вами совпадения нет

Кстати, у меня есть одна совпаденка на myheritage (у меня с ней общих 19,9 сМ на 3 участках, larg.seg. - 7,3 cM). Она также зарегистрирована на FTDNA, но там её нет среди моих совпаденцев. Как такое может быть? Совпадение настолько незначительное, что на FTDNA оно не учитывается или почему её там нет среди моих matches?