ДНК-генеалогия
Генетические методы реконструкции родословного дерева
| javax
רחובו—
Сообщений: 563
На сайте с 2004 г.
Рейтинг: 127
| Наверх ##
1 июля 2009 18:40 Mich_Glitch
Ясно. Еще вопрос - УПС 0.04 Gb - это круто? По Вашим линкам это 7 поколений, так? | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
1 июля 2009 18:51 javax написал: [q] Mich_Glitch
Ясно. Еще вопрос - УПС 0.04 Gb - это круто? По Вашим линкам это 7 поколений, так? [/q]
Да. Это ясный и недвусмысленный знак наличия общего предка(-ов). | | |
napobo3 Сообщений: 269 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 76 | Наверх ##
1 июля 2009 22:13 1 июля 2009 22:45 javax написал: [q]
Есть результаты по бабушке на 23андме! [/q]
Поздравляю. Я вернулся из командировки, скоро обновлю табличку ашкенупсов. Пока все работает как часы - каждый новый ашкеназ имеет несколько УПСов (т.е. общих предков) с теми, что уже в 23андме. Последствия бутылочного горлышка 500-летней давности. Сравните мито-данные с Миллером и Марышевым, которые тоже К1а9 - киньте им вот этот линк http://tr.im/mtextract, попросите прислать файл с данными, а дальше - Вы сами знаете (awk'ом или Ruby или чем другим...) | | |
| javax
רחובו—
Сообщений: 563
На сайте с 2004 г.
Рейтинг: 127
| Наверх ##
1 июля 2009 22:42 napobo3
Большое спасибо!
Я тут пока понял, что не могу ответить на секретный вопрос.
Пока пытался вспомнить как записал фамилию английскими буквами первой подруги - заблокировали аккаунт.
Написал им в хелп :(
Объясните, я так и не понял:
1. Что видно в Вашей таблице? Зачем она?
2. С Миллером сравнивал - нет упсов, но вообще упсы есть где то с 7-9 человек. С одним 0.04 Гб. Интересно что он из Моравии и с одном 0.02 - он как раз из Житомира откуда и моя бабушка.
3. Что я получу в результате работы скрипта и как это использовать? | | |
napobo3Сообщений: 269 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 76 | Наверх ##
2 июля 2009 0:57 2 июля 2009 0:59 javax написал: [q] ...1. Что видно в Вашей таблице? Зачем она?[/q]
Видно на какой хромосоме есть УПС у каждой пары людей и его размер. [q] 2. С Миллером сравнивал - нет упсов, но вообще упсы есть где то с 7-9 человек. [/q]
С Миллером и Марышевым надо сравнивать данные по мито. [q] С одним 0.04 Гб. Интересно что он из Моравии и с одним 0.02 - он как раз из Житомира откуда и моя бабушка.[/q]
Пришлите мне все данные: имена, номер хромосомы, размер УПСа (0 это тоже результат), занесу в таблицу. [q] 3. Что я получу в результате работы скрипта и как это использовать? [/q]
Получите файл с данными только по мито. Скрипт их вырезает из полного файла. Как использовать - сначала сравнить файлы (например, diff'ом) | | |
| javax
רחובו—
Сообщений: 563
На сайте с 2004 г.
Рейтинг: 127
| Наверх ##
2 июля 2009 7:42 2 июля 2009 7:42 napobo3 написал: [q]
javax написал:[q] ...1. Что видно в Вашей таблице? Зачем она?[/q]
Видно на какой хромосоме есть УПС у каждой пары людей и его размер.[/q]
А как эти данные потом можно использовать? napobo3 написал: [q]
Пришлите мне все данные: имена, номер хромосомы, размер УПСа (0 это тоже результат), занесу в document.write('<a href="http://tr.im/Ashk23_HIR" rel="nofollow" target=_blank>таблицу</a>' ;таблицу.[/q]
Угу, вот только пустят меня туда обратно ... Спасибо! | | |
| javax
רחובו—
Сообщений: 563
На сайте с 2004 г.
Рейтинг: 127
| Наверх ##
2 июля 2009 8:11 napobo3
А почему ексель у Вас не симметричный??? | | |
napobo3Сообщений: 269 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 76 | Наверх ##
2 июля 2009 8:41 4 июля 2009 19:09 javax написал: [q]
napobo3 написал:[q] javax написал:[q] ...1. Что видно в Вашей таблице? Зачем она?[/q]
Видно на какой хромосоме есть УПС у каждой пары людей и его размер.[/q]
А как эти данные потом можно использовать? [/q]
Во-первых - данные надо сравнивать. Если у УПС Пети и Васи частично совпадает с УПСом Пети и Коли, то это означает, что у всех трех был общий предок. Чем УПС короче, тем предок дальше. Пример: у меня с Адамом и с Майклом УПСы совпадают, причем УПС с Адамом короче (см. таблицу по хр.4, 17я строчка). Значит, общий предок с Адамом - более недавний. Во-вторых - данные надо сопоставлять.По тому же самому примеру имеем дополнительную информацию: из данных ФТДНА мы знаем, что с Адамом у нас был общий предок по мужской линии. Смотрим на гаплогруппу Майкла и видим, что она отличается от нашей с Адамом J1e. Делаем вывод - у Майкла был предок женского пола - племянница (воможно - n-внучатая) нашего с Адамом общего предка. В-третьих - данные надо собирать. Мы в самом начале пути. Все это - сплошная статистика. Больше данных - лучше понимание. | | |
napobo3Сообщений: 269 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 76 | Наверх ##
2 июля 2009 8:56 javax написал: [q]
napobo3А почему ексель у Вас не симметричный??? [/q]
Потому что левая нижняя часть каждой таблицы показывает данные по нечетной хромосоме, а правая верхняя - по четной. Кроме того, "ексель" - это не от хорошей жизни. Вынужденная мера. Нужен нормальный вебсайт. PHP+mySQL или что-нибудь в этом роде, да смышленый программер - вот что нас бы сильно продвинуло. | | |
| javax
רחובו—
Сообщений: 563
На сайте с 2004 г.
Рейтинг: 127
| Наверх ##
2 июля 2009 10:37 napobo3
напишите мне на мейл что именно программа должна делать.
если что то простое, что можно сделать за несколько часов - постараюсь сделать | | |
|
