ДНК-генеалогия

На сайте ВГД собираются люди, увлеченные генеалогией, историей, геральдикой и т.д. Здесь вы найдете собеседников, экспертов, умелых помощников в поисках предков и родственников. Вам подскажут где искать документы о павших в боях и пропавших без вести, в какой архив обратиться при исследовании родословной своей семьи, помогут определить по старой фотографии принадлежность к воинским частям, ведомствам и чину. ВГД - поиск людей в прошлом, настоящем и будущем!

Trish написал:

[q]
Mich_Glitch, а если окажется, что родство по другой линии всё же, не со стороны барина?
[/q]

Не совсем понял вопрос. Поэтому не судите строго, если скажу что не в тему.
С официальными линиями нет особых проблем. Мы просто разрабатываем их в архивах.

Кроме того, по двум своим родовым ареалам (отцовскому и материнскому) я разрабатываю все сохранившиеся фамильные линии. То есть, для каждого из двух сел (одно в России, другое на Украине) вывожу генеалогию его жителей от конца 18 - начала 19 веков до наших дней. Затем проведу забор и обработку хотя бы по сотне генетических образцов для каждого населенного пункта.
Их обработку попытаюсь сделать либо у Балановских, либо у Соренсона, либо в какой-нибудь из западных или российских университетских лабораторий. Ну, а не выйдет на халяву - придется делать за свой счет. Естественно, не в коммерческих лабораториях, делающих штучные тесты по заказу. А там, где на специальном оборудовании обрабатывают большие батчи (иногда по 96 образцов за раз). Это детали. И об этом, если хотите, поговорим позже.

Каким образом будет происходить отбор коренных жителей для тестирования?
Очевидно, что это будут только мужчины.
Для каждой из основных фамилий будут браться два человека с максимально дальним известным документально общим предком. То есть получится 50 пар однофамильцев по каждому селу.
В случае совпадения гаплотипов по обоим тестируемым из пары, данный гаплотип и полагается фамильным. То есть присущим определенной фамильной линии.
Несовпадение означает, что для взятой пары имел место адюльтер хотя бы по одной из линий в течении рассматриваемых 200 лет. Придется брать еще одного однофамильца.
На практике может получиться, что по некоторым фамилиям сразу будет браться 3-4 человека. А по другим едва удастся наскрести 2 человек с достаточно дальним установленным родством.
То есть всего будет изучено по 20-40 фамилий для каждого из двух сел.

Попутно порешается много других интересных задач (т.н. сходимость, определение время повсеместного зарождения и использования фамилий и пр.). Об этом пока не буду особо распространяться.

То есть, принадлежнасть к коренным линиям выяснится в ходе этого тестирования. Заметьте, коренные не означают чисто крестьянские. Так как по моему убеждению, в силу понятных причин, и баре на Руси, и их холопы состояле в близком генетическом родстве.

С помощью теста у 23эндМи я пытаюсь выявить случай, когда позабавился человек пришлый. Скажем, новый собственник села, то есть получивший его во владение не более 50 лет назад на момент рождения моего прадеда (речь идет и о предках барина).

Если я проверю, скажем, по Стенькино ныне живущих потомков Софьи Дубовицкой и выяснится, что у нас нет совпадения, то сразу станет понятно (с определенной вероятностью), что с этой линией пересечения не было.
Если и подобный тест с потомками управляющего фон Розенберга ничего не даст, то опять таки станет ясно, что опять не там рою.
Хотя всегда может статься, что фамильное предание не верно.
Или же имел место еще один адюльтер.

napobo3, Justin Loe:

Mich_Glitch написал:

[q]

napobo3, Justin Loe:
[/q]

Запускаем мою програмку и получаем:

[q]
Justin Loe and napobo3 5th chromosome identical region:

Max. consecutive stretch is: 14263133 bases, 2420 SNPs
Range is: 126966014 - 141229147
[/q]

Теперь, имея эти числа, можем углубиться вот здесь. :

napobo3, отлично!

Меня, честно говоря, меньше интересует зона совпадения. Что более важно (ДЛЯ ОЦЕНКИ РАССТОЯНИЯ ДО ОБЩЕГО ПРЕДКА) так это размеры совпадающего кластера.

Если Вы посмотрите Ваших маму и дочь, то увидите, что графически и округленно у них одни и те же значения (0.02 Гб). Ваша программа позволяет получить точные значения.
Вот если бы мы имели что-то вроде 16514678 для одной и, скажем, 23545567 для другой, то сразу бы стало ясно где мама, а где дочь. Да, и кроме того можно было бы количественно оценить затухание для одного поколенного перехода.

Надеюсь, что Вы проработаете это по Вашей сладкой парочке и представите цифры в студию.

И еще, napobo3, не могли бы Вы представить количественную информацию по всем Вашим приближенцам (их у меня для Вас кажется 10 - сегодня после работы можем сверить лист).

Уверен, что мы с Вами сможем сделать с помощью этих цифр более точную оценку для исчисления поколений до общего предка.

Можете выложить все исходные цифры на Молген.орг (а тут и на Родстве.ру дадим ссылки на тему).

Михаил, я имела в виду, что получив результат из 23эндМи об общем предке с кем-либо, выявленном не по прямым мужской или женской линией, как установить по какой всё же ветке родство, как полученный результат практически использовать? Есть какие-то методики, расчеты? Типа, если на этом участке совпадение, то общий предок должен быть по линии прабабушки через мать отца. Или это настолько непредксазуемо, что останется только путем тестирования других настоящих или предполагаемых родственников пытаться выявить линию родства?

Что касается Вашего всеохватного подхода к изучению родовых деревень - этот масштабный проект очень интересен, надеюсь ознакомиться в будущем с его результатами.
Но в моём случае, так как предки были переселенцами, это не принесло бы тех результатов, на которые рассчитываете Вы, как я это понимаю...

napobo3, вот последние уточненные данные по Вам и Вашим приближенцам из моего листа в 240 человек:

Y-гаплогруппа: не совпадает с Вашей. Мито-гаплогруппа: не совпадает с Вашей. Вероятность родства по прямым линиям отсутствует.

Y-гаплогруппа: отсутствует. Мито-гаплогруппа: не совпадает с Вашей. Возможно родство по прямой мужской линии.

Y-гаплогруппа: совпадает с Вашей. Мито-гаплогруппа: совпадает с Вашей. Вероятно родство по прямым линиям, как по мужской, так и по женской.

Y-гаплогруппа: отсутствует. Мито-гаплогруппа: не совпадает с Вашей. Возможно родство по прямой мужской линии.

Y-гаплогруппа: отсутствует. Мито-гаплогруппа: не совпадает с Вашей. Возможно родство по прямой мужской линии.

Очень надеюсь, что Вам вскорости удастся заполучить от Ваших приближенцев данные по совпадающим кластерам и представить их размеры.
Жду с нетерпением и заранее благодарю.

Trish написал:

[q]
Михаил, я имела в виду, что получив результат из 23эндМи об общем предке с кем-либо, выявленном не по прямым мужской или женской линией, как установить по какой всё же ветке родство, как полученный результат практически использовать? Есть какие-то методики, расчеты? Типа, если на этом участке совпадение, то общий предок должен быть по линии прабабушки через мать отца. Или это настолько непредксазуемо, что останется только путем тестирования других настоящих или предполагаемых родственников пытаться выявить линию родства?
[/q]

Сейчас основная задача научиться вычислять с точностью до 1-2 поколений время до общего предка.

Пока понятным являются размеры самого дальнего детектируемого интервала. Его глубина не превышает 500-600 лет. То есть данные об общих предках живших ранее 15-16 веков не отражаются на диаграмме. Это уже хорошо, так как в Российских условиях мало пользы от общих предков, расположенных , самое дальнее, глубже пятнадцати поколений. (В ДНК- генеалогии за поколение принимается временной интервал в 25-30 лет.)

Mich_Glitch написал:

[q]

napobo3, вот последние уточненные данные по Вам и Вашим приближенцам из моего листа в 240 человек:...Очень надеюсь, что Вам вскорости удастся заполучить от Ваших приближенцев данные по совпадающим кластерам и представить их размеры.Жду с нетерпением и заранее благодарю.
[/q]

Спасибо за разбор полетов, работаю над получением данных. Сообщу.

napobo3, не могли бы Вы сравнить две первых хромосомы, пожалуйста (отправил их Вам почтой)?
По моим прикидкам там должно быть совпадение 1-3 миллиона.

Генетические методы реконструкции родословного дерева