ДНК-генеалогия
Генетические методы реконструкции родословного дерева
napobo3 Сообщений: 269 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 76 | Наверх ##
7 марта 2009 1:27 7 марта 2009 1:44 javax написал: [q]
Блииин ...а теперь объясните мне как интерпретировать этот жуткий эксель с 23andme?во первых - как понять какой из этих снипов это по известной мне терминологии M285, M342 (отличающие G1) и P20 отличающий G1a?во вторых - что вообще из этой таблики можно понять? как её использовать? [/q]
Можно так: берете интересующий Вас снип, находите его RefSNP номер (типа rsxxxxxxx) здесь, ищете его в таблице. Спрячьте (Hide) колонки всех гаплогрупп, кроме интересующей Вас G, так будет удобнее. Если видете в полях результатов много пар минусов - так называемый no call - имейте в виду, что 23andme не умеет распознавать этот снип. Но большую часть этой работы уже до Вас проделали, поэтому можно начать со столбца Remarks - ищите там Ваши снипы. Как использовать? можно увидеть, проверяют ли данный снип или нет. Найти его значение для разных протестированных. Если егo значение совпадает с Ancestral (предпоследняя колонка) - значит снип не случился. Например, ни у кого из G там нет M285 - стало быть, там нет G1. | | |
napobo3Сообщений: 269 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 76 | Наверх ##
7 марта 2009 1:52 Trish написал: [q]
Спасибо всем откликнувшимся! Как я поняла, своей картой оплатить не смогу... :(Что касается хендлайна - вопрос в силе! [/q]
handling не должен Вас беспокоить, это все те же деньги за доставку. Shipping+Handling=доставка, если смотреть на денежную сторону и не вдаваться в филологию. | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
7 марта 2009 1:54 7 марта 2009 1:59 javax, в качестве результатов от 23эндМи, наряду с интерпретациями написанными простым английским языком  , Вы получите и полмиллиона явных значений Ваших снипов. Например, я знаю, что по-простому  снип для гаплогруппы J2b1 (т.е. для моей гаплогруппы) обзывается М205. А вот полное его название rs2032657. Вот тут (ссылка, кликайте!) дается его описание. Если в приведенной napobo3 экселовской табличке Вы с помощью CTRL+F найдете линию для rs2032657, то увидите, что для всех значения по этому маркеру ТТ, и лишь у меня АА. Подчеркну еще раз, интерпретацию Вам дадут. Табличка сия лишь для особо любознательных. К примеру проскакивает в печати заметка, что найден локус шизофрении (или, напротив, повышенного интеллекта). Какой-нибудь rs1234567. Вы раз, и проверили его значеньице для себя. Данные в таблицу засылаются добровольно, поэтому на всеохватывающую полноту она и не претендует. | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
7 марта 2009 2:09 7 марта 2009 2:12 javax написал: [q] как понять какой из этих снипов это по известной мне терминологии M285, M342 (отличающие G1) и P20 отличающий G1a?[/q]
1. Смотрим новое (февраль 2009) дерево ISOGG 2009 Y-DNA. Выясняем, что нас интересуют M285, M342 и Р20. 2. Идем на страницу описания снипов (ссылка, кликать!). Выясняем, что нужные нам снипы обзываются rs13447378, 21653330 и 25029911/23396163. 3. Смотрим в табличку от napobo3. А можно просто пройти тест и Вам скажут гаплогруппу. Более того обещают при введении новой номенклатуры делать апдейт и давать новые субклады. Обещать-то обещают, но пока продолжают использовать не то что номенклатуру ISOGG 2009, а обветшавшую ISOGG 2007. А ведь после неё была уже и ISOGG 2008.  | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
7 марта 2009 2:15 Trish написал: [q] Как я поняла, своей картой оплатить не смогу...[/q]
Это совсем не факт. Со многими российскими картами есть проблемы, но не со всеми. | | |
| татиа
Москва
Сообщений: 2741
На сайте с 2006 г.
Рейтинг: 1285
| Наверх ##
7 марта 2009 14:32 Mich_Glitch, Только что заметила, что тема "ДНК генеалогия" попала в список самых популярных тем сайта. Оправдываете однако почетное звание "популяризатора"... Поздравляю!  ---
Ищу Есковых, Панковых, Головиных, Горяйновых, Тишиных, Пахомовых
Громницких, Робаковских, Зеленских, Сакунов, Михно, Плошенко, Плохих, Ярмак
Остапенко, Братченко, Панкратьевых
ВСЕ МОИ И МОИХ ПРЕДКОВ ДАННЫЕ РАЗМЕЩЕНЫ НА САЙТЕ ВГД ДОБРОВОЛЬНО. | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
7 марта 2009 16:34 татиа, спасибо! | | |
| Trish | Наверх ##
7 марта 2009 22:40 По российским картам:
при заказе набора, в разделе информации об оплате нужно заполнять сведения:
Billing Country и Billing Address.
По своей карте я не могу туда внести данные, потому как России нет в списке...
Кроме того, появился ещё вопрос:
что представляет из себя набор внешне и каково содержание? --- Располагаю обширными сведениями по ст. Суворовской, Бекешевской и с. Старомарьевке (ныне Ставропольский край). И не столь обширными по некоторым другим населенным пунктам Северного Кавказа.
Мой дневник | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
8 марта 2009 0:01 Trish написал: [q] Кроме того, появился ещё вопрос:
что представляет из себя набор внешне и каково содержание? [/q]
Тестовый набор представляет из себя небольшую пластмассовую баночку (скорее даже пробирку) и воронку. Процедура забора слюны для теста - не для самых брезгливых: просят наплевать через воронку в пробирку. Без соплей и без пены. Затем воронку выбрасываете и закручиваете пробирку специальной пробкой. При сильном закручивании из пробки в пробирку выливается консервирующая жидкость. Все это кладете в целофанновый пакетик. А пакетик вместе с бумажкой-формой кладете в предоплаченный пакет от FedEx (или Purolator - не помню уже). Обратите внимание Вашего заграничного помощника, что пакет закрывается в пункте приема экспресс-доставки. В декларации пишете образец для генеалогического теста. Во всех странах, кроме России (ну, может еще КНДР) - это не запрещается. По поводу карты. А опции Other, т.е. Иные в разделе Страны нет, случаем? И каков список стран? Больше всего мня интересует, что там есть из ближнего зарубежья. | | |
| Trish | Наверх ##
8 марта 2009 0:15 Mich_Glitch написал: [q]
Trish написал:[q] Кроме того, появился ещё вопрос:
что представляет из себя набор внешне и каково содержание? [/q]
Тестовый набор представляет из себя небольшую пластмассовую баночку (скорее даже пробирку) и воронку.
Процедура забора слюны для теста - не для самых брезгливых: просят наплевать через воронку в пробирку. Без соплей и без пены.
Затем воронку выбрасываете и закручиваете пробирку специальной пробкой. При сильном закручивании из пробки в пробирку выливается консервирующая жидкость.
Все это кладете в целофанновый пакетик. А пакетик вместе с бумажкой-формой кладете в предоплаченный пакет от FedEx (или Purolator - не помню уже). Обратите внимание Вашего заграничного помощника, что пакет закрывается в пункте приема экспресс-доставки. В декларации пишете образец для генеалогического теста. Во всех странах, кроме России (ну, может еще КНДР) - это не запрещается.
[/q]
Спасибо за развернутый ответ Вопрос-размышление: Что написать отправителю из США, чтобы через нашу таможню посылка прошла ко мне?.. Mich_Glitch написал: [q]
По поводу карты. А опции Other, т.е. Иные в разделе Страны нет, случаем?
[/q]
Нет :( Mich_Glitch написал: [q]
И каков список стран? Больше всего мня интересует, что там есть из ближнего зарубежья.
[/q]
Yes. 23andMe ships to the following countries: Albania ArmeniaAustralia Austria AzerbaijanBelarusBelgium Bosnia and Herzegovina Bulgaria Canada Croatia Cyprus Czech Republic Denmark EstoniaFinland France GeorgiaGermany Greece Hungary Iceland Ireland Israel Italy LatviaLiechtenstein LithuaniaLuxembourg Macedonia Malta MoldovaMonaco Montenegro Netherlands New Zealand Norway Poland Portugal Romania San Marino Serbia Singapore Slovakia Slovenia Spain Sweden Switzerland United Kingdom United States Vatican City We accept credit card payments using Visa, MasterCard, American Express, Discover and Diners Club. Orders are shipped via FedEx International Priority. A pre-paid airbill is included for returning the saliva samples back to our contracted laboratory. Customs documents are also enclosed and need to be filled out accurately in order for us to receive your sample. Your saliva sample is considered an Exempt Human Specimen and does not come under the category of hazardous shipments. Your genetic data will be accessible via the secure account you set up on our website. Our website content and all applicable instructions are currently available in English only. Copyright © 2009 23andMe, Inc. All rights reserved. --- Располагаю обширными сведениями по ст. Суворовской, Бекешевской и с. Старомарьевке (ныне Ставропольский край). И не столь обширными по некоторым другим населенным пунктам Северного Кавказа.
Мой дневник | | |
|
