ДНК-генеалогия
Генетические методы реконструкции родословного дерева
| Mich_Glitch | Наверх ##
19 сентября 2008 0:55 19 сентября 2008 0:56 nmash написал: [q]
Mich_Glitch написал:
[q] Premium 21-Marker Kit
$239.99
Sale Price:
$229.99
21-Marker Premium Kit for one person. [/q]
а ЧЕМ (КРОМЕ КОЛИЧЕСТВА МАРКЕРОВ) ОТЛИЧАЕТСЯ sTANDART KIT?
Ну никак не виу тут аутосомных.... [/q]
Естественно, точностью. Вот например мой результат по 15 маркерам:  А вот образец 21-маркерного теста:  Как видите, точность для данных случаев возросла в 29417.68 / 411.77 = 71.44 раза. | | |
nmash Москва Сообщений: 6499 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 3495 | Наверх ##
19 сентября 2008 1:07 Mich_Glitch написал: [q] мой старый 15-маркерный список[/q]
Из книги: ...лучше всего в руском ареале изучено распределение CCR5.... ...гомозиготы по мутантному гену CCR5del32 почти полностью устойчивы к инфицированию ВИЧ.... (есть таблица частоты его в русских популяциях - по областям и - не везде - по районам даже. Например, Рязань - 0,20, а Спасск-Рязанский 0,110 - частота делеции). ....эта мутация возникла около 2000 лет назад в Европе... практически не встречается в Африке южнее Сахары, в Востояной и Юго-Восточной Азии, у коренного населения Америки.... Встречается в основном у европейцев (в среднем 10%).... ....распределение мутации носит довольно сложный характер .... наибольшие частоты - на русском Севере (Арх. область)....частота мутации падает не столько к югу и с запада на восток.(как в Европе), сколько .. ...к западу! Западные русские популяции (Псковские, Смоленские) обладают существенно меньшей частотой данной мутации (5-9%), чем восточные и центральные (10-15%)..... Это только выдержки из одного из рассмотренных (но и одного из самых главных нынче!) аутосомных маркеров! ---
Наталия. U5a1d2a Лётовы (Ряз.), Суриковы, Башиловы, Суровы (Подмосковье), Субботины, Столяровы, Андриановы, Долженко (Ейск), Щербины (Полтав. и Кубань) Нейгебауер. http://rusgenealogy.clan.su/ Все мои и моих предков данные только для генеалогии. | | |
nmashМосква Сообщений: 6499 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 3495 | Наверх ##
19 сентября 2008 1:10 Mich_Glitch написал: [q] по 15 маркерам:
[/q]
Михаил, мы говорим об одном и том же? МитоДНК я получу у Соренсона - аж но 37 маркерам обещает. А по аутосомным - что этот (тот) сайт даст? Какие конкретно маркеры он мне выдаст? ---
Наталия. U5a1d2a Лётовы (Ряз.), Суриковы, Башиловы, Суровы (Подмосковье), Субботины, Столяровы, Андриановы, Долженко (Ейск), Щербины (Полтав. и Кубань) Нейгебауер. http://rusgenealogy.clan.su/ Все мои и моих предков данные только для генеалогии. | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
19 сентября 2008 1:27 19 сентября 2008 1:30 nmash написал: [q]
Mich_Glitch написал:
[q] мой старый 15-маркерный список[/q]
Из книги: ...лучше всего в руском ареале изучено распределение CCR5....
...гомозиготы по мутантному гену CCR5del32 почти полностью устойчивы к инфицированию ВИЧ.... (есть таблица частоты его в русских популяциях - по областям и - не везде - по районам даже. Например, Рязань - 0,20, а Спасск-Рязанский 0,110 - частота делеции).
....эта мутация возникла около 2000 лет назад в Европе... практически не встречается в Африке южнее Сахары, в Востояной и Юго-Восточной Азии, у коренного населения Америки....
Встречается в основном у европейцев (в среднем 10%)....
....распределение мутации носит довольно сложный характер .... наибольшие частоты - на русском Севере (Арх. область)....частота мутации падает не столько к югу и с запада на восток.(как в Европе), сколько .. ...к западу! Западные русские популяции (Псковские, Смоленские) обладают существенно меньшей частотой данной мутации (5-9%), чем восточные и центральные (10-15%).....
Это только выдержки из одного из рассмотренных (но и одного из самых главных нынче!) аутосомных маркеров![/q]
Вот Вам мой CCR5: del32-normal. Его правильнее называть снип. Так как речь идет об однонуклеотидной мутации. Он показывает насколько Вы устойчивы к Нильской лихорадке и СПИДу. | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
19 сентября 2008 1:30 nmash написал: [q]
Mich_Glitch написал:
[q] по 15 маркерам:
[/q]
Михаил, мы говорим об одном и том же?
МитоДНК я получу у Соренсона - аж но 37 маркерам обещает.
А по аутосомным - что этот (тот) сайт даст? Какие конкретно маркеры он мне выдаст? [/q]
Еще раз посмотрим на картинку:  Соренсон анализирует отдельные участки Y-хромосомы (т.н. STR маркеры) и отдельные зоны мито-ДНК. На рисунке они соответсвенно крайние слева и справа. Аутосомные же маркеры распологаются на неполовых хромосомах с 1 по 22. | | |
nmashМосква Сообщений: 6499 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 3495 | Наверх ##
19 сентября 2008 1:35 Mich_Glitch написал: [q] Аутосомные же маркеры распологаются на неполовых хромосомах с 1 по 22.[/q]
Да это я знаю... Вопрос был в том, что как раз (для примера) про CCR5 на этом сайте я ничего не нашла. Я просто опасалась, что заплатив юолее 200 зеленых, получу те же Мт ДНК, что и от Сорнсона... А где Вы там вычитали, что тестируют именно по аутосомным?? ---
Наталия. U5a1d2a Лётовы (Ряз.), Суриковы, Башиловы, Суровы (Подмосковье), Субботины, Столяровы, Андриановы, Долженко (Ейск), Щербины (Полтав. и Кубань) Нейгебауер. http://rusgenealogy.clan.su/ Все мои и моих предков данные только для генеалогии. | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
19 сентября 2008 1:47 19 сентября 2008 4:05 nmash написал: [q]
Mich_Glitch написал:
[q] Аутосомные же маркеры распологаются на неполовых хромосомах с 1 по 22.[/q]
Да это я знаю...[/q]
 nmash написал: [q] Вопрос был в том, что как раз (для примера) про CCR5 на этом сайте я ничего не нашла.
[/q]
CCR5 называют обычно снипом. Стоит его тестирование, например, на ФТДНА 20 долларов. За штучку. По аутосомным же маркерам рассматривают аллели, т.е. тандемные повторы. nmash написал: [q] Я просто опасалась, что заплатив юолее 200 зеленых, получу те же Мт ДНК, что и от Сорнсона...
А где Вы там вычитали, что тестируют именно по аутосомным?? [/q]
В табличке я Вам привел, какие маркеры рассматриваются. Они (маркеры) составляют так называемый набор CODIS. Набиваете это слово в Гугле - и читаете. А у Соренсона будет что-то вроде DYS461, YGATAA10, GGAAT1B07, DYS463 и тому подобное по Y-хромосоме. И к примеру 16362C, или 16482G по мито-ДНК. Т.е. буковки и цифирки другие.  | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
19 сентября 2008 2:00 19 сентября 2008 2:04 По Y-гаплогруппе (особенно по отдельным субкладам) тоже можно сделать определенные выводы об этнической принадлежности. Различно частотное распределение для разных национальностей и по мито-гаплогруппам. Неплохо работают по ансамблю снипов (имею в виду национальную типизацию)  Видите, поляки и русские образуют одну кучку (салатовенькую). Рядом крутятся украинцы и латыши. Т.е. ДНК-генеалогия использует разные инструменты о чем писал вот тут. Ссылка, кликайте!. | | |
| germanas
Сообщений: 602
На сайте с 2006 г.
Рейтинг: 432
| Наверх ##
19 сентября 2008 16:12 добрый день, вопрос от чайника : не могли бы вы пояснить: если есть совпадение по 35 маркерам и genetical distance-2, что это означает? спасибо ---
www.gulevich.net | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
19 сентября 2008 16:25 germanas написал: [q] добрый день,
вопрос от чайника : не могли бы вы пояснить: если есть совпадение по 35 маркерам и genetical distance-2, что это означает?
спасибо [/q]
Скорее всего это означает следующее: 1. Два человека тестировались по 37 маркерам. 2. 35 маркеров у них совпадают. 3. В двух маркерах имеются одношаговые отличия. 3. С 75% вероятностью эти два человека имели общего предка не далее чем 500 лет тому назад. | | |
|
