ÄÍÊ-ãåíåàëîãèÿ
Ãåíåòè÷åñêèå ìåòîäû ðåêîíñòðóêöèè ðîäîñëîâíîãî äåðåâà
| Mich_Glitch | Íàâåðõ ##
25 àïðåëÿ 2008 22:57 25 àïðåëÿ 2008 23:04 napobo3 íàïèñàë: [q] Ïðèøëè ïåðâûå ðåçóëüòàòû. Genographic îêàçàëñÿ áûñòðåå âñåõ, óïðàâèëñÿ çà 25 äíåé (áðóòòî). Îáúÿñíèòå, ïîæàëóéñòà! Type: mtDNA Haplogroup: H (subclade H) Your Mitochondrial HVR I Sequence 16362C, 16482G[/q]
Ïîçäðàâëÿþ, ñ ïîëó÷åíèåì ðåçóëüòàòîâ! Èòàê, ÷òî èìååì? Ïî ïåðâîé çîíå ìèòî-ÄÍÊ, ò.í. HVR I, ó Âàñ ñàìàÿ ðàñïðîñòðàíåííàÿ â Çàïàäíîé Åâðîïå ãàïëîãðóïïà (subclade) Í. Âîçìîæíî Âû îáðàòèëè âíèìàíèå, îíà ïîëíîñòüþ ñîâïàäàåò ñ ìîåé. (Ñì. ìîþ ïîäïèñü íà ôîðóìå www.dnatree.ru.) ×òî ñèå îçíà÷àåò? Ñ âåðîÿòíîñòüþ â 50% îêîëî 800 ëåò íàçàä ìû èìåëè îáùåãî ïðåäêà. Êàê ïîíèìàòü ýòè 50%. Ñëåäóþùèì îáðàçîì, äëÿ 800 ëåò èìååì 50%, à ñêàæåì äëÿ 750 ëåò, óæå 8%. Åñòü òàêæå íåáîëüøàÿ âåðîÿòíîñòü (íó, ê ïðèìåðó, 0.04%), ÷òî ó íàñ ñ Âàìè áûëà îäíà áàáóøêà. ×òî ìîæíî ñäåëàòü äàëüøå? Íà ñàéòå FTDNA (FamilyTreeDNA), âûïîëíÿþùåãî òåñòû äëÿ Genographic, çàêàçàòü ïî ëüãîòíîé öåíå àïãðåéä çîíû HVR II. Íîâûé îáðàçåö âûñûëàòü Âàì íå íàäî, òàê êàê áèîëîãè÷åñêèé ìàòåðèàë (âûäåëåííàÿ ÄÍÊ) óæå òàì è áóäåò õðàíèòüñÿ â ëàáîðàòîðèè 25 ëåò. Çîíû HVR I è HVR II ìèòîõîíäðèàëüíîé-ÄÍÊ ÿâëÿþòñÿ áûñòðîìóòèðóþùèìè. Íà ïðàêòèêå ýòî îçíà÷àåò, ÷òî åñëè îíè, íàïðèìåð, ó íàñ ñ Âàìè ñîâïàäóò, òî ñ 50% âåðîÿòíîñòüþ ìû èìååì îáùåãî ìàòðèàðõà 330 ëåò òîìó íàçàä. Ìîæíî ñäåëàòü, êàê ýòî ñäåëàë ÿ, ò.í. ïîëíîå ñåêâåíñèðîâàíèå ìèòî-ÄÍÊ. Òî åñòü ïîìèìî áûñòðîìóòèðóþùèõ çîí HVR I è HVR II ïðîàíàëèçèðîâàòü ìåäëåííîìóòèðóþùóþ îáëàñòü, òàê íàçûâàåìûé CR ( Coding Region). Ñîâïàäåíèå ðåçóëüòàòîâ FGS (ýòî àááðåâèàòóðà äëÿ ïîëíîãî ñåêâåíñèðîâàíèÿ) ñ áîëüøîé âåðîÿòíîñòüþ óêàçóåò íà îáùóþ ìàìó. Íî ÿ áû íå ðåêîìåíäîâàë çàêàçûâàòü mtFullSequence (ýòî íàèìåíîâàíèå òåñòà, ïðèíÿòîå íà ÔýìèëèÒðèÄÍÀ) ñåé÷àñ: 1) Äîðîãî. 2) ×àñòî áûâàþò î÷åíü õîðîøèå ñêèäêè - íàäî èõ äîæäàòüñÿ. 3) Âîçìîæíî äàæå ïî HVR I è HVR II ó Âàñ áóäåò ìàëî ñîâïàäåíèé. Öåíû íà òåñòû îáâàëèâàþòñÿ. Òàê ÷òî â ýòîì ñëó÷àå ñïîêîéíî ìîæíî ïîäîæäàòü ïîëãîäà-ãîä. | | |
napobo3 Ñîîáùåíèé: 269 Íà ñàéòå ñ 2007 ã. Ðåéòèíã: 80 | Íàâåðõ ##
25 àïðåëÿ 2008 23:15 Mich_Glitch íàïèñàë: [q] Âîçìîæíî Âû îáðàòèëè âíèìàíèå, îíà ïîëíîñòüþ ñîâïàäàåò ñ ìîåé.[/q]
Êîíå÷íî, çàìåòèë, Âû - â ñïèñêå 512 ñîâïàäàþùèõ ïî HVR I Mich_Glitch íàïèñàë: [q] ×òî ìîæíî ñäåëàòü äàëüøå? Íà ñàéòå FTDNA (FamilyTreeDNA), âûïîëíÿþùåãî òåñòû äëÿ Genographic, çàêàçàòü ïî ëüãîòíîé öåíå àïãðåéä çîíû HVR II. [/q]
Êàêîé èç ýòèõ äâóõ: mtDNARefine çà 75 èëè mt-H çà 89? Ðàçíèöà îò ìåíÿ óñêîëüçàåò. Ñïàñèáî! | | |
| Mich_Glitch | Íàâåðõ ##
26 àïðåëÿ 2008 0:12 napobo3 íàïèñàë: [q] Êàêîé èç ýòèõ äâóõ: mtDNARefine çà 75 èëè mt-H çà 89? Ðàçíèöà îò ìåíÿ óñêîëüçàåò.[/q]
Åñëè íå îøèáàþñü, òî mtDNARefine çà 75 ñäåëàåò Âàì ïðîâåðêó çîíû HVR II. ×òî äî mt-H çà 89, òî îí ïðîâåðèò îòäåëüíûå ñíèïû, ñ òåì, ÷òîáû òî÷íî îïðåäåëèòü Âàøó ïîäãðóïïó. (Íàïðèìåð Í6à1, êàê ó ìåíÿ.) Ïîýòîìó íàäî äåëàòü mtDNARefine, òàê êàê çíàíèå ôîðìàëüíîé ïîäãðóïïû íå ñòîëü ïîêà âàæíî. Äëÿ êàæäîãî àïãðåéäà åñòü îïèñàíèÿ, äîñòàòî÷íî íà íèõ êëèêíóòü. | | |
napobo3 Ñîîáùåíèé: 269 Íà ñàéòå ñ 2007 ã. Ðåéòèíã: 80 | Íàâåðõ ##
26 àïðåëÿ 2008 11:20 26 àïðåëÿ 2008 12:01 À âîò è ñëåäóþùèå ðåçóëüòàòû ïðèáûëè (ïðåäûäóùèå áûëè ïî ìèòîÄÍÊ îòöà, à ýòè - ìîè):
HVR1 ãàïëîãðóïïà: N1b
HVR1 : 16145A 16176A 16223T 16390A 16519C
HVR2 : 73G 152C 263G 309.1C 315.1C
 ôàìòðèÄÍÀ íàøëîñü 45 ïîëíûõ ñîâïàäåíèé (áîëüøèíñòâî - â ÑØÀ). Êàê ïðèíÿòî ñ íèìè îáùàòüñÿ? Âàðèàíòû: 1.Ïîñëàòü 45 ïåðñîíàëüíûõ å-ïèñåì 2.Ïîñëàòü îäíî ïèñüìî âñåì 45 3.Ñîçäàòü ãðóïïó äëÿ îáùåíèÿ â Èíòåðíåòå, ÷òî â íàøè äíè äåëàåòñÿ ëåãêî. 4.Ñîçäàòü âåòêó â ôîðóìå ôàìòðèÄÍÀ 5.Âñå îòâåòû ïðàâèëüíûå Åñëè ó âàñ åñòü îïûò, áóäó ðàä î íåì óñëûøàòü. | | |
| Mich_Glitch | Íàâåðõ ##
26 àïðåëÿ 2008 16:14 26 àïðåëÿ 2008 16:29 napobo3 íàïèñàë: [q] À âîò è ñëåäóþùèå ðåçóëüòàòû ïðèáûëè (ïðåäûäóùèå áûëè ïî ìèòîÄÍÊ îòöà, à ýòè - ìîè): HVR1 ãàïëîãðóïïà: N1b HVR1 : 16145A 16176A 16223T 16390A 16519C HVR2 : 73G 152C 263G 309.1C 315.1C
 ôàìòðèÄÍÀ íàøëîñü 45 ïîëíûõ ñîâïàäåíèé (áîëüøèíñòâî - â ÑØÀ). Êàê ïðèíÿòî ñ íèìè îáùàòüñÿ? Âàðèàíòû: 1.Ïîñëàòü 45 ïåðñîíàëüíûõ å-ïèñåì 2.Ïîñëàòü îäíî ïèñüìî âñåì 45 3.Ñîçäàòü ãðóïïó äëÿ îáùåíèÿ â Èíòåðíåòå, ÷òî â íàøè äíè äåëàåòñÿ ëåãêî. 4.Ñîçäàòü âåòêó â ôîðóìå ôàìòðèÄÍÀ 5.Âñå îòâåòû ïðàâèëüíûå Åñëè ó âàñ åñòü îïûò, áóäó ðàä î íåì óñëûøàòü. [/q]
×òî æ ìîæíî ñêàçàòü, ÷òî Âàì ïîâåçëî, à ìîæíî ñêàçàòü, ÷òî è íå î÷åíü. Ñóäÿ ïî øèðîêîé ðàñïðîñòðàíåííîñòè Âàøåãî ãàïëîòèïà, îí ñ áîëüøîé âåðîÿòíîñòüþ ÿâëÿåòñÿ äðåâíèì. Ê ïðèìåðó ó ìåíÿ âñåãî 6 ñîâïàäåíèé ãàïëîòèïà íåñìîòðÿ íà òî, ÷òî ãàïëîãðóïïà îäíà èç ñàìûõ ðàñïðîñòðàíåííûõ. Ó Âàñ æå âðåìÿ ðîæäåíèÿ îáùåé ïðàìàòåðè ñäâèãàåòñÿ, åãî ìîæíî îöåíèòü êàê ëåò 700-800 òîìó íàçàä. Âñå ïîñëåäóþùèå øàãè Âû ñäåëàëè ñîâåðøåííî ïðàâèëüíî: çàðåãèñòðèðîâàëèñü íà ìèòîñ¸÷ è ñïåöèàëèçèðîâàííûõ ôîðóìàõ.  áëèæàéøåå âðåìÿ ê Âàì íà÷íóò ïðèõîäèòü ïèñüìà îò êîîðäèíàòîðîâ ïðîåêòîâ ïî Âàøåé ãàïëîãðóïïå.  íèõ ðàññìàòðèâàþò èìåííî Âàøó âåòâü.  ïðîåêòû âñòóïàòü ïîëåçíî. Âû çàìåòèëè íàâåðíÿêà, èç 45 ïîëíûõ ñîâïàäåíèé â ìèòîñ¸÷ çàðåãèñòðèðîâàëèñü òîëüêî 12 ÷åëîâåê.  ãàïëîãðóïïíûõ ïðîåêòàõ æå, êàê ïðàâèëî, ó÷àñòâóþò ïî÷òè âñå ñîâïàäàþùèå. Òî åñòü àíàëèç è òî÷íåå è øèðå. Ïî ïîâîäó ïèñåì. ß ðàçîñëàë âñåì òèïîâîå ïèñüìî. (Ïèñüìî òî òèïîâîå, à âîò àäðåñ êàæäûé ðàç ââîäèë îäèí.). Îòâåòèëè âñå øåñòåðî ñîâïàäåíöåâ. Ó äâîèõ áûëè ðîäîñëîâíûå. Ïðàâäà î÷åíü êóöèå, ãîäà äî 1850. Íî íà ðåãèîíû óêàçûâàëà áåç ýêèâîêîâ - Ðîññèÿ è Ïîëüøà (Ðîññèéñêàÿ Èìïåðèÿ). À òåïåðü ïî ïîâîäó ñòàðèíû íàøåãî, Ñîðåíñîíà. Âîò ñîâïàäåíèÿ ïî Âàøåìó ïðîôèëþ: ññûëêà, êëèêàéòå!Èìååì 16 ñîâïàäåíèé. Îäíî ñðàçó ñðàçó îòáðàñûâàåì, òàê êàê äâà ñîâïàäåíèÿ ïðèíàäëåæàò ìàòåðè è ðåáåíêó. Òî åñòü âåäóò ê îäíîìó ïðåäêó. Ó äâóõ ñîâïàâøèõ íå ðàññìîòðåíû íåêîòîðûå ìàðêåðû èç Âàøåãî íàáîðà. Òîæå îòáðîñèì. Èòîãî èìååì 13 ñîâïàäåíèé. Êàçàëîñü áû íå âåëèêà ðàçíèöà ñ ìèòîñ¸÷åì. Íî èç 12 ñîâïàäåíèé â ìèòîñ¸÷å íåò íè îäíîãî ÷åëîâåêà ñ ðîäîñëîâíîé, à ó Ñîðåíñîíà ñâîå ðîäîñëîâèå ïðåäîñòàâèëè âñå. Òî åñòü íå íàäî çàìîðà÷èâàòüñÿ ñ ïåðåïèñêîé. Îáùèé ñïèñîê äëèíåí, ÷òîáû åãî ïðîâåðÿòü, íî ÿ óâåðåí, ÷òî ìíîãèå ëþäè ñ ñîâïàâøèìè ãàïëîòèïàìè âñòðå÷àþòñÿ òîëüêî â áàçå Ñîðåíñîíà. | | |
napobo3 Ñîîáùåíèé: 269 Íà ñàéòå ñ 2007 ã. Ðåéòèíã: 80 | Íàâåðõ ##
27 àïðåëÿ 2008 0:41 Ñïàñèáî! Èç 45 ñîâïàäàëüöåâ äîâîëüíî áûñòðî îòâåòèëî 15. Îñìûñëÿþ.
×ÀÂÎ: à Ñîðåíñîí àíàëèçèðóåò Y èëè òîëüêî ìèòî? | | |
| Mich_Glitch | Íàâåðõ ##
27 àïðåëÿ 2008 1:21 27 àïðåëÿ 2008 3:45 napobo3 íàïèñàë: [q] Ñîðåíñîí àíàëèçèðóåò Y èëè òîëüêî ìèòî? [/q]
Ñîðåíñîí äåëàåò ìèòî-ÄÍÊ òåñò âûñîêîãî ðàçðåøåíèÿ, ò.å. HVR I + HVR II è Y-õðîìîñîìíûé òåñò ïî 43 ìàðêåðàì. Âû óæå â òåìå è ïîýòîìó ñîãëàñèòåñü, ñîâñåì íå ïëîõî äëÿ äàðìîâùèíû. Áîëåå òîãî, ëàáîðàòîðèÿ àíîíñèðîâàëà ñîçäàíèå ñîáñòâåííîé áàçû äàííûõ ïî àóòîñîìíûì ìàðêåðàì. Áóäåò ëè ýòî îçíà÷àòü áåñïëàòíîå òåñòèðîâàíèå òàêæå è ïî àóòîñîìíûì ìàðêåðàì, ïî ñêîëüêèì è ïî êàêèì èìåííî, à òàêæå êîãäà - âñå ýòî ïîêà íåèçâåñòíî. | | |
napobo3 Ñîîáùåíèé: 269 Íà ñàéòå ñ 2007 ã. Ðåéòèíã: 80 | Íàâåðõ ##
28 àïðåëÿ 2008 16:49 28 àïðåëÿ 2008 16:51 Mich_Glitch íàïèñàë: [q] Âû óæå â òåìå è ïîýòîìó ñîãëàñèòåñü, ñîâñåì íå ïëîõî äëÿ äàðìîâùèíû.[/q]
Î÷åíü äàæå íåïëîõî, êîãäà ýòà õàëÿâà êîí÷èòñÿ, ìíîãèå áóäóò êóñàòü ëîêòè. Íî îíè îá ýòîì ïîêà íå äîãàäûâàþòñÿ. | | |
| Mich_Glitch | Íàâåðõ ##
28 àïðåëÿ 2008 19:49Odnoklassniki.ru Êñòàòè, Âû ìîæåòå ñîçäàòü ôàìèëüíûå ïðîåêòû è íà Îäíîêëàññíèêàõ.ðó. ß òàê è ñäåëàë ïî ñâîèì ôàìèëèÿì (íå âñåì, íàïðèìåð Åâäîêèìîâû, Äçþáåíêî è Ëàðèîíîâû â ñèëó ñâîå ðàñïðîñòðàíåííîñòè è ìîëîäîñòè ÷îõîì àíàëèçèðîâàòü íå ïîëó÷èòñÿ). Ïîýòîìó áðàë òîëüêî òå, ÷òî îòñòîÿò íå áëèæå ïðàäåäîâ. Öåëè âñå òå æå. Ïûòàþñü ïðèâëå÷ü êîíòåíòîì, ïîäáèðàÿ èíòåðåñíûå ìàòåðèàëû. È êîíå÷íî æå ñàãèòèðîâàòü íà ïðîõîæäåíèå òåñòà. | | |
napobo3 Ñîîáùåíèé: 269 Íà ñàéòå ñ 2007 ã. Ðåéòèíã: 80 | Íàâåðõ ##
30 àïðåëÿ 2008 23:08 Mich_Glitch íàïèñàë: [q] Åñëè íå îøèáàþñü, òî mtDNARefine çà 75 ñäåëàåò Âàì ïðîâåðêó çîíû HVR II.×òî äî mt-H çà 89, òî îí ïðîâåðèò îòäåëüíûå ñíèïû, ñ òåì, ÷òîáû òî÷íî îïðåäåëèòü Âàøó ïîäãðóïïó. (Íàïðèìåð Í6à1, êàê ó ìåíÿ.)Ïîýòîìó íàäî äåëàòü mtDNARefine, òàê êàê çíàíèå ôîðìàëüíîé ïîäãðóïïû íå ñòîëü ïîêà âàæíî.Äëÿ êàæäîãî àïãðåéäà åñòü îïèñàíèÿ, äîñòàòî÷íî íà íèõ êëèêíóòü. [/q]
Çàêàçàë mtDNARefine | | |
|