ÄÍÊ-ãåíåàëîãèÿ
Ãåíåòè÷åñêèå ìåòîäû ðåêîíñòðóêöèè ðîäîñëîâíîãî äåðåâà
| Mich_Glitch | Íàâåðõ ##
16 àïðåëÿ 2008 17:23 16 àïðåëÿ 2008 17:51 òàòèà íàïèñàë: [q] Mich_Glitch,Óõ, òû! Êàê èíòåðåñíî! À ÿ óæå çàðåãèñòðèðîâàëàñü íà Y-Search, áðîøó Âàì ñâîé ID â ëè÷íûå.Ñïàñèáî Âàì çà çàáîòó.À 67 ìàðêåðîâ ãèïîòåòè÷åñêè äàäóò øàíñ íàéòè îáùåãî ïðåäêà â 16-17 âåêå, íàïðèìåð? [/q]
 âåðîÿòíîñòíîì ïëàíå, òåñò ïî 67 ìàðêåðàì ìîæíî ñ÷èòàòü òåñòîì íà îòöîâñòâî. (Òåçèñ ýòîò ïîêà íå ðàçâèâàþ - åñëè êîìó áóäåò èíòåðåñíî, ïîÿñíþ, ÷òî ÿ èìåþ â âèäó.) Òî åñòü, åñëè åñòü ïîëíîå ñîâïàäåíèå ïî 67 ìàðêåðàì, òî âåëèêà âåðîÿòíîñòü, ÷òî òåñòèðóåìûå ïðîèñõîäÿò îò îäíîãî îòöà. Åñëè ãåíåòè÷åñêàÿ äèñòàíöèÿ 1 (ò.å. â îäíîì èç ìàðêåðîâ çíà÷åíèÿ îòëè÷íû), òî ñêîðåå âñåãî îáùèé ïðåäîê áûë 2-3 ïîêîëåíèÿ íàçàä (ò.å. äåä-ïðàäåä, ðîäèâøèéñÿ íà 50-75 ëåò ðàíåå òåñòèðóåìîãî). Êîíå÷íî, âîçìîæíû òàêèå âàðèàíòû, êîãäà ó îòöà ñ ñûíîì ðàçíèöà â ãàïëîòèïàõ ñîñòàâëÿåò íåñêîëüêî ìóòàöèé. Èëè, íàîáîðîò, ãàïëîòèï ñîõðàíÿåò ñòàáèëüíîñòü íà ïðîòÿæåíèè äîëãèõ ïîêîëåíèé. Åñòü è âîçâðàòíûå ìóòàöèè (ò.å. äîïóñòèì èñõîäíîå çíà÷åíèå ìàðêåðà áûëî 11, çàòåì ñòàëî 13, à çàòåì â ðåçóëüòàòå î÷åðåäíîãî ìóòèðîâàíèÿ âåðíóëîñü ê 11). Íî îáùèé âûâîä òàêîâ: ñ îïðåäåëåííîé âåðîÿòíîñòüþ 67 ìàðêåðíûé òåñò ïîçâîëÿåò âûÿâèòü îáùåãî ïðåäêà â ëþáîì ïîêîëåíèè, íà÷èíàÿ ñ áëèæàéøèõ. Òî, ÷òî ñåé÷àñ ìû ãîâîðèì îá îáùåì ïðåäêå äëÿ Âàñ íà ðàññòîÿíèè îêîëî 1000 ëåò âûçûâàåòñÿ íå ïîãðåøíîñòÿìè èñïîëüçóåìîãî ìåòîäà, à èñêëþ÷èòåëüíî ìàëîé âûáîðêîé ïî èíòåðåñóþùåìó íàñ ðåãèîíó (òåððèòîðèÿ áûâøåãî Ñîâåòñêîãî Ñîþçà). Âûøåñêàçàííîå îòíîñèòñÿ è ê áåñïëàòíîìó 43 ìàðêåðíîìó òåñòó îò Ñîðåíñîíà. Ïðîñòî äîâåðèòåëüíàÿ âåðîÿòíîñòü áóäåò íåñêîëüêî íèæå, ó÷èòûâàÿ ìåíüøåå êîëè÷åñòâî àíàëèçèðóåìûõ ëîêóñîâ. Äëÿ ìåíÿ ïîêà íàèáîëåå èíòåðåñåí ïåðèîä 500-600 ëåò, òàê êàê îí ïîçâîëèò ïðîòÿíóòü ðîäîñëîâèå âãëóáü äî 1400-õ - 1500-õ ãîäîâ. Îñîáåííî åñëè áóäóò äâîðÿíñêèå âêðàïëåíèÿ. | | |
| òàòèà Ìîñêâà Ñîîáùåíèé: 2716 Íà ñàéòå ñ 2006 ã. Ðåéòèíã: 1297
| Íàâåðõ ##
16 àïðåëÿ 2008 18:10 Mich_Glitch, ß â øîêå.  ñìûñëå, ðàäà. Ïðî âêðàïëåíèÿ íàïèøó îòäåëüíî. Âû ìåíÿ âîîáùå î÷åíü âäîõíîâëÿåòå ñâîåé èíôîðìàöèåé. --- Èùó Åñêîâûõ, Ïàíêîâûõ, Ãîëîâèíûõ, Ãîðÿéíîâûõ, Òèøèíûõ, Ïàõîìîâûõ
Ãðîìíèöêèõ, Ðîáàêîâñêèõ, Çåëåíñêèõ, Ñàêóíîâ, Ìèõíî, Ïëîøåíêî, Ïëîõèõ, ßðìàê
Îñòàïåíêî, Áðàò÷åíêî, Ïàíêðàòüåâûõ
ÂÑÅ ÌÎÈ È ÌÎÈÕ ÏÐÅÄÊÎÂ ÄÀÍÍÛÅ ÐÀÇÌÅÙÅÍÛ ÍÀ ÑÀÉÒÅ ÂÃÄ ÄÎÁÐÎÂÎËÜÍÎ. | | |
| Ôóðñîâ Ñîîáùåíèé: 1046 Íà ñàéòå ñ 2006 ã. Ðåéòèíã: 627
| Íàâåðõ ##
16 àïðåëÿ 2008 22:20 Îòïðàâèë ïî ìåéëó çàïðîñ íà áåñïëàòíûõ ÒÐÈ òåñòà! Æä¸ì-ñ... --- Ãåíåàëîãèåé âðåìåííî ÍÅ çàíèìàþñü! ÍÅ ïèøèòå - îòâåòà ÍÅ áóäåò! Ñïàñèáî çà ïîíèìàíèå. | | |
| admiralka Íîâè÷îê
Ñîîáùåíèé: 2 Íà ñàéòå ñ 2008 ã. Ðåéòèíã: 4 | Íàâåðõ ##
17 àïðåëÿ 2008 10:24 Ïîäñêàæèòå, ïîæàëóéñòà, ÿ çàïîëíèëà àíêåòó óæå êàê ìåñÿö íàçàä. ×òî äîëæíî ìíå ïðèéòè è ÷åðåç êàêîå âðåìÿ? È äîëæíû ëè ìíå îíè îòïèñàòüñÿ íà ìîé e-mail? | | |
| òàòèà Ìîñêâà Ñîîáùåíèé: 2716 Íà ñàéòå ñ 2006 ã. Ðåéòèíã: 1297
| Íàâåðõ ##
17 àïðåëÿ 2008 12:39 Mich_Glitch, À ìíå óæàñíî èíòåðåñíî ïðî 67-ìàðêåðíûé òåñò, êàê òåñò íà îòöîâñòâî, Âû íàïèñàëè, ÷òî ðàññêàæåòå, åñëè êîìó-òî áóäåò èíòåðåñíî. Ìíå èíòåðåñíî. --- Èùó Åñêîâûõ, Ïàíêîâûõ, Ãîëîâèíûõ, Ãîðÿéíîâûõ, Òèøèíûõ, Ïàõîìîâûõ
Ãðîìíèöêèõ, Ðîáàêîâñêèõ, Çåëåíñêèõ, Ñàêóíîâ, Ìèõíî, Ïëîøåíêî, Ïëîõèõ, ßðìàê
Îñòàïåíêî, Áðàò÷åíêî, Ïàíêðàòüåâûõ
ÂÑÅ ÌÎÈ È ÌÎÈÕ ÏÐÅÄÊÎÂ ÄÀÍÍÛÅ ÐÀÇÌÅÙÅÍÛ ÍÀ ÑÀÉÒÅ ÂÃÄ ÄÎÁÐÎÂÎËÜÍÎ. | | |
Gontarñåìåéíûé èñòîðèê  Saint Petersburg Ñîîáùåíèé: 2029 Íà ñàéòå ñ 2003 ã. Ðåéòèíã: 2903 | Íàâåðõ ##
17 àïðåëÿ 2008 13:30 admiralka
Îáû÷íî ïðèõîäèò ãäå-òî ÷åðåç ìåñÿö --- Val
Íàì òðóäíî, à êîãäà áûëî ëåãêî? | | |
| Mich_Glitch | Íàâåðõ ##
17 àïðåëÿ 2008 15:40 19 àïðåëÿ 2008 19:18 Mich_Glitch íàïèñàë: [q]  âåðîÿòíîñòíîì ïëàíå, òåñò ïî 67 ìàðêåðàì ìîæíî ñ÷èòàòü òåñòîì íà îòöîâñòâî.[/q]
òàòèà íàïèñàë: [q] Mich_Glitch, À ìíå óæàñíî èíòåðåñíî ïðî 67-ìàðêåðíûé òåñò, êàê òåñò íà îòöîâñòâî, Âû íàïèñàëè, ÷òî ðàññêàæåòå, åñëè êîìó-òî áóäåò èíòåðåñíî. Ìíå èíòåðåñíî. [/q]
Èäåÿ äîñòàòî÷íî ïðîñòà. Ïî ïóíêòàì: 1) Òåñò ïî 12 ìàðêåðàì, èëè ïî 37, èëè ïî 43 (Ñîðåíñîí), èëè ïî 67 è ò.ä. îñíîâàí íà àíàëèçå òîé ÷àñòè Y-õðîìîñîìû, êîòîðàÿ íåèçìåííîé ïåðåäàåòñÿ îò îòöà ê ñûíó (ò.å. âîçìîæåí òîëüêî äëÿ ìóæ÷èí). 2) Ïðè ïåðåäà÷å ýòîé ÷àñòè ãåíåòè÷åñêîãî íàáîðà îò îòöà ê ñûíó èíîãäà ïðîèñõîäÿò ìóòàöèè. Ñðåäíÿÿ ñêîðîñòü ìóòàöèé ðàçëè÷íà äëÿ ðàçíûõ ðàññìàòðèâàåìûõ ðåãèîíîâ ìàðêåðîâ. ß ïîêà ïðèíèìàþ ñêîðîñòü îò À.Àêëåñîâà äëÿ 67 ìàðêåðîâ, êîòîðàÿ ñîñòàâëÿåò 0.0022 ìóòàöèé/(êîëè÷åñòâî ðàññìàòðèâàåìûõ ìàðêåðîâ)*(êîëè÷åñòâî ïîêîëåíèé). Ò.å., åñëè âçÿòü îòöà è ñûíà (ëþäè îòñòîÿùèå äðóã îò äðóãà íà îäíî ïîêîëåíèå) è ïðîâåñòè äëÿ îáîèõ 67-ìàðêåðíûé òåñò, èìååì: 0.0022 * 67 * 1 = 0.1474 ìóòàöèè. ×òî ñèå îçíà÷àåò? Ýòî îçíà÷àåò, ÷òî â ñðåäíåì ïðèìåðíî äëÿ îäíîé èç 7 ðàññìàòðèâàåìûõ ïàð îòåö-ñûí ðåçóëüòàòû 67-ìàðêåðíîãî òåñòà íå ÿâëÿþòñÿ ïîëíîñòüþ èäåíòè÷íûìè. (1 / 0.1474 = 6.78) Íî äëÿ äðóãèõ 6 ïàð èç 7 îíè, â ñðåäíåì, ñîâïàäàþò òþòåëüêà â òþòåëüêó. 3) Ðàññìîòðåíèþ ïîäâåðãàåòñÿ íå âñÿ íåèçìåííàÿ íàñëåäóåìàÿ ÷àñòü, à òîëüêî 67 ìàðêåðîâ. Òî åñòü äàæå åñëè âñå 67 ìàðêåðîâ ñîâïàëè, òî åñòü âîçìîæíîñòü òîãî, ÷òî ìíîãî äðóãèõ íå ðàññìàòðèâàåìûõ ëîêóñîâ íå ñîâïàäàþò. Åñëè áû ïðîâåñòè 100% òåñòèðîâàíèÿ íàñåëåíèÿ Çåìëè, òî áóäåò ìíîãî ãðóïï ñ îäèíàêîâûìè 67-ìàðêåðíûìè ãàïëîòèïàìè. ×òî áóäåò îçíà÷àòü äëÿ íèõ âñåãî íàâñåãî îäíîãî îáùåãî ïðåäêà, îòñòîÿùåãî ïîðîé íà ìíîãèå ïîêîëåíèÿ. Ïðåäêà, à íå îäíîãî ñîâðåìåííîãî ïàïó. Ïîýòîìó è ãîâîðþ, ÷òî òàêæå êàê è ñòàíäàðòíûé òåñò íà îòöîâñòâî (êîòîðûé òîæå íå äàåò â òåîðèè 100% ãàðàíòèè), 67-ìàðêåðíûé òåñò ñ îïðåäåëåííîé âåðîÿòíîñòüþ ìîæíî ñ÷èòàòü òåñòîì íà îòöîâñòâî. Âåðîÿòíîñòü ýòà, ïðè ó÷åòå è äðóãèõ ôàêòîðîâ, ïîðîé ìîæåò áûòü î÷åíü âûñîêà. | | |
| òàòèà Ìîñêâà Ñîîáùåíèé: 2716 Íà ñàéòå ñ 2006 ã. Ðåéòèíã: 1297
| Íàâåðõ ##
18 àïðåëÿ 2008 12:07 Mich_Glitch, ñïàñèáî. --- Èùó Åñêîâûõ, Ïàíêîâûõ, Ãîëîâèíûõ, Ãîðÿéíîâûõ, Òèøèíûõ, Ïàõîìîâûõ
Ãðîìíèöêèõ, Ðîáàêîâñêèõ, Çåëåíñêèõ, Ñàêóíîâ, Ìèõíî, Ïëîøåíêî, Ïëîõèõ, ßðìàê
Îñòàïåíêî, Áðàò÷åíêî, Ïàíêðàòüåâûõ
ÂÑÅ ÌÎÈ È ÌÎÈÕ ÏÐÅÄÊÎÂ ÄÀÍÍÛÅ ÐÀÇÌÅÙÅÍÛ ÍÀ ÑÀÉÒÅ ÂÃÄ ÄÎÁÐÎÂÎËÜÍÎ. | | |
| ryabchenko Ñîîáùåíèé: 600 Íà ñàéòå ñ 2007 ã. Ðåéòèíã: 154
| Íàâåðõ ##
19 àïðåëÿ 2008 14:21 Î÷åíü èíòåðåñíî. Ñàìà ïî ñïåöèàëüíîñòè ãåíåòèê. Ïî íåêîòîðûì ëèíèÿì ïðåäêîâ (êðåñòüÿí è ñâÿùåííèêîâ) äîõîæó äî êîíöà 17 â. Ïîíÿëà, ÷òî íóæíî ïèñàòü e-mail, ÷òîáû ïîëó÷èòü ñðàçó íåñêîëüêî íàáîðîâ. Ñïàñèáî çà èíôîðìàöèþ. | | |
| Mich_Glitch | Íàâåðõ ##
19 àïðåëÿ 2008 19:42 19 àïðåëÿ 2008 19:43Ìèòî òåñòû Åñëè âçÿòü áîëüøèíñòâî êîììåð÷åñêèõ êîìïàíèé, òî ïî ìèòî-ÄÍÊ îíè ðàññìàòðèâàþò çîíû HVR1 è HVR2. Êîíå÷íî ìîæíî ñäåëàòü è ïîëíûé àíàëèç ìèòîõîíäðèàëüíîé ÄÍÊ, òàê íàçûâàåìîå ïîëíîå ñåêâåíñèðîâàíèå (mtDNA Full Sequence) - FGS. ß, íàïðèìåð, òàê è ïîñòóïèë. Íî ìèíèìàëüíàÿ öåíà äëÿ òàêîãî òåñòà 495 äîëëàðîâ ( Ñì., íàïðèìåð, òóò.)×òî êàñàåòñÿ Ñîðåíñîíà, òî îí áåñïëàòíî ðàññìàòðèâàåò òðè çîíû: HVR1, HVR2 è HVR3! Êàæäàÿ äîïîëíèòåëüíàÿ ðàññìàòðèâàåìàÿ çîíà äîáàâëÿåò òî÷íîñòè ïðè ïîñòðîåíèè ôèëîãåíåòè÷åñêèõ äåðåâüåâ. Ïðè ðåêîíñòðóèðîâàíèè ðîäîñëîâíîé, ãîâîðÿ èíà÷å. Íàïðèìåð, ïðè ðàññìîòðåíèè òîëüêî çîí HVR1 è HVR2, äàæå ïðè ïîëíîì ñîâïàäåíèè ó òåñòèðóåìûõ âñåõ ìàðêåðîâ ýòî îçíà÷àåò íàëè÷èå îáùåãî ìàòðèàðõà (ïðåäêà æåíùèíû ïî ìàòåðèíñêîé ëèíèè) íà ãëóáèíå 330 ëåò! Äà è òî ñ âåðîÿòíîñòüþ 50%. Åñëè åñòü îäíî ðàçëè÷èå â ãàïëîòèïàõ, òî îáùàÿ ïðàìàìà  ñ âåðîÿòíîñòüþ â òå æå 50% áûëà ó òåñòèðóåìûõ 800 ëåò íàçàä!!! Íå ãóñòî, ñêàæåì. Äîïîëíèòåëüíàÿ, ðàññìàòðèâàåìàÿ Ñîðåíñîíîì, çîíà HVR3 ïîçâîëÿåò ïåðåâåñòè ðåçóëüòàòû â óæå èíòåðåñíûå â ãåíåàëîãè÷åñêîì ïëàíå èíòåðâàëû íà÷èíàÿ ñ ãëóáèíû 100-150 ëåò òîìó íàçàä. | | |
|