Genotek
| Петр_СПб
Сообщений: 177
На сайте с 2010 г.
Рейтинг: 106
| Наверх ##
9 ноября 2024 18:08 9 ноября 2024 18:45 andrus23 написал: [q] Кто-нибудь пользовался программой для конвертации DNAKitStudio в формат 23andme? У меня по Генотеку rs77542170 TC, а конвертировал он в rs77542170 TT. Получается в первом случае генотипы разные, а при конвертации ставит одинаковые генотипы.[/q]
Я не пользовался этой программой, но просто сравнил данные, выгруженные с Genotek в формате VCF и в формате 23andmeV5. Результаты ошеломили. В формате 23andmeV5 больше 25000 снипов, просто отутствующих в VCF. Больше 1000 - наоборот, есть значения в VCF, но в 23andmeV5 даны минусами. В другом тесте расхождения ещё больше. Кто-то сталкивался с таким? Как это трактовать - саботаж genotek, чтобы не пользовались посторонними компаниями и посторонними программами? И каким данным доверять? Но вот нашёл раньше в этой теме ссылку на объяснение самого Genotek: https://t.me/genotek_genealogy/9865 Тогда следует пользоваться экспортом в 23andme на самом Genotek. | | |
| georgf I1-Y132166/BY35301
Москва
Сообщений: 196
На сайте с 2022 г.
Рейтинг: 142 | Наверх ##
10 ноября 2024 19:55 10 ноября 2024 19:56 Петр_СПб написал: [q]
В формате 23andmeV5 больше 25000 снипов, просто отутствующих в VCF. Больше 1000 - наоборот, есть значения в VCF, но в 23andmeV5 даны минусами. В другом тесте расхождения ещё больше.
Кто-то сталкивался с таким? Как это трактовать - саботаж genotek, чтобы не пользовались посторонними компаниями и посторонними программами? И каким данным доверять?
Но вот нашёл раньше в этой теме ссылку на объяснение самого Genotek: https://t.me/genotek_genealogy/9865 Тогда следует пользоваться экспортом в 23andme на самом Genotek.[/q]
Помимо импьютинга (хотя это обычно предположение/догадки с некоторой степенью достоверности , какие значения надо вписать), генотековская версия заказного чипа вместо 1000 генеалогических (Y и мито ) снипов (myheritage и ftdna) читает 1000 маркеров для здоровья, поэтому как минимум по 2000 маркерам (+1000 -1000) отличия будут даже на чипе Illumina. А у 23andme вообще чип отличается, поэтому и вообще возможный список маркеров/снипов другой (хотя на 90-95% схожий). ---
Y гаплогруппа I1-Y132166/BY35301 Мито U5b2a | | |
| Arine Новичок
Новосибирск
Сообщений: 10
На сайте с 2021 г.
Рейтинг: 15 | Наверх ##
17 ноября 2024 14:39 Добрый день! Собираем киты для создания проекта на gedmatch по Новосибирской области. Если есть желающие вступить, можно отправить свой кит мне в лс или указать его здесь: https://t.me/familio_novosibirsk ---
Денисовы, Дударевы (Сибирячиха), Злётовы, Свиридовы (Березовка-на-Ануе), Шабалдины, Киселевы, Стрельцовы (Хапово, Таскаево), Страшковы/Строжко, Бурим (Сарыбалык, Дубовичи Черниговской, Дар-Надежда Полтавской) | | Лайк (1) |
roflmao Казань Сообщений: 593 На сайте с 2018 г. Рейтинг: 283 | Наверх ##
21 ноября 2024 12:59 Приветствую!
Ситуация простая:
1) сдал аутосомный тест ftdna
2) загрузил результаты аутосомного теста на генотек
3) дозаказал исследование y и mt хромосом
4) как дозагрузить в существующий профиль генотека обновленные результаты?
Нужно создавать новый профиль и загружать все заново? я потеряю данные о здоровье купленные ранее на генотеке?
спасибо! | | |
LeslaМодератор раздела R1a-VK05  Санкт-Петербург Сообщений: 2500 На сайте с 2006 г. Рейтинг: 2193 | Наверх ##
21 ноября 2024 13:47 roflmao написал: [q] как дозагрузить в существующий профиль генотека обновленные результаты?[/q]
Никак. Генотек принимает только аутосомные данные со стороны. | | Лайк (2) |
| Gotham2411Pennyworth1912
Сообщений: 391
На сайте с 2023 г.
Рейтинг: 2675
| Наверх ##
28 ноября 2024 19:48 Уважаемые форумчане, подскажите, пожалуйста, новичку в этом вопросе.
Купила тест у Genotek.
Слюну нужно собирать после сна натощак для чистоты эксперимента?
Есть какая то рекомендация для нубика?)))
Спасибо. ---
Нижегородские с.Глафировка, Ейск; Тишины с.Свестур; Кульновы (Кулины) с.Салаур; Елисеевы Рязань- Петергоф-Санкт-Петербург; Заперецкий Франц Иосифович 1898г, поляк, Витебская г, Жизневские; Ермоленко д.Клюковка Оршанский р-н и д.Филево Богушевский р-н Витебская о.; Титовы Тверь-Санкт-Петербург | | |
Logyn Сообщений: 1108 На сайте с 2023 г. Рейтинг: 864 | Наверх ##
28 ноября 2024 20:21 Коллеги, вопрос у меня не совсем в тему, но всё-таки спрошу. Заказали тест ДНК , на фото виден перечень тестируемых параметров. Имеет ли смысл заказывать полностью аналогичный тест на родного брата первого тестируемого?  | | |
tirael Подмосковье Сообщений: 802 На сайте с 2023 г. Рейтинг: 1633 | Наверх ##
28 ноября 2024 22:26 29 ноября 2024 8:06 Logyn написал: [q] Коллеги, вопрос у меня не совсем в тему, но всё-таки спрошу.
Заказали тест ДНК , на фото виден перечень тестируемых параметров. Имеет ли смысл заказывать полностью аналогичный тест на родного брата первого тестируемого?
[/q]
Имхо, если родители живы, то лучше протестировать маму по мито, и обоим родителям сделать аутосомный тест. ---
Ищу сведения: Хижниковы,Хижняковы,Хижинковы (ст.Новочеркасская), Бродские (Одесса, Туркестанский край), Погореловы (Воронеж. губ до1925, Крым/Кубань с1925, Ленинград с 60х), Саватеевы/Савватеевы (Владимирская губ, Москва и обл. Кулебякино), Моисеевы (Рязанская губ. с. Добрые пчелы) | | |
LogynСообщений: 1108 На сайте с 2023 г. Рейтинг: 864 | Наверх ##
28 ноября 2024 23:03 tirael написал: [q] обоим родителям сделать аутосомный тест.
---[/q]
Их давно нет на свете. А второй тест рекомендовали сделать. Кто -не помню, но на форуме. Так тестирование родного брата смысл имеет? | | |
tiraelПодмосковье Сообщений: 802 На сайте с 2023 г. Рейтинг: 1633 | Наверх ##
28 ноября 2024 23:17 Logyn написал: [q] Так тестирование родного брата смысл имеет? [/q]
Второй тест из списка или второй тест брату? Судя по написанному, мужчинам тест мито днк имеет смысл делать: [q] МтДНК находится не в половых хромосомах, а в митохондриях. Митохондрии матери сохраняются при оплодотворении (в отличие от мужских митохондрий, которые погибают) и передаются всем детям обоих полов без исключения. Однако сын (мужчина) уже не сможет передать материнскую мтДНК следующим поколениям. Поэтому анализ мтДНК предназначен преимущественно для определения родства по материнской линии.[/q]
А что можно будет узнать из второго теста брата я даже и не знаю. По идее если брат полностью родной, то ничего нового появиться не может... но я не специалист ---
Ищу сведения: Хижниковы,Хижняковы,Хижинковы (ст.Новочеркасская), Бродские (Одесса, Туркестанский край), Погореловы (Воронеж. губ до1925, Крым/Кубань с1925, Ленинград с 60х), Саватеевы/Савватеевы (Владимирская губ, Москва и обл. Кулебякино), Моисеевы (Рязанская губ. с. Добрые пчелы) | | |
|
