Genotek
georgf I1-Y132166/BY35301
Москва Сообщений: 196 На сайте с 2022 г. Рейтинг: 142 | Наверх ##
4 июля 2024 10:55 >> Ответ на сообщение пользователя pelevinmm85 от 4 июля 2024 10:24 Вы уверены про вычисляемость???? Сомневаюсь. Чип у генотека и ftdna/mh один и тот же, от Illumina. Генотек только выбрал адаптируемые под "дилера" 1000 позиций медицинские снипы, а ftdna/mh - "генеалогические". Насчёт 23andme точно не скажу, там петрушка с версиями чипов. У ancestry и livingdna какие-то свои чипы. Соответственно форматы и список снипов у 23andme , ancestry, livingdna отличаются и иногда не перекрываются. Генотек и mh отличаются минимально. Про вычисляемость вы наверное имели в виду, что пытаются сопоставить снипы одного чипа и другого. В принципе задачка элементарная, если есть полное соответствие, НО если информация неполная, то приходится предполагать и тут возможны ошибки. При ручном перекодировании, в отличии от автомата DNAkitstudio, наверное ошибок меньше. | | |
LeslaМодератор раздела R1a-VK05  Санкт-Петербург Сообщений: 2500 На сайте с 2006 г. Рейтинг: 2199 | Наверх ##
4 июля 2024 20:10 4 июля 2024 20:39 pelevinmm85 написал: [q] поэтому MyHeritage не примет такой файл[/q]
У меня принимал. Делал не раз. Последний в апреле загружал. pelevinmm85 написал: [q] были выбраны Генотеком для лучшей медицинской диагностики славянского населения - но это не точно[/q]
Это точно неточно. Про славянское население. | | Лайк (1) |
Vikki4 Новичок
Сообщений: 1 На сайте с 2024 г. Рейтинг: 0 | Наверх ##
12 июля 2024 20:36 12 июля 2024 20:36 Подскажите пожалуйста а для мак есть какие то программы чтоб из формата Генотек перенести в 23andmeV3 ? Где можно скачать нужную версию ? | | |
pelevinmm85 Николо-Макарово Сообщений: 274 На сайте с 2017 г. Рейтинг: 259
| Наверх ##
13 июля 2024 13:03 13 июля 2024 13:08 >> Ответ на сообщение пользователя 5alex5 от 4 июля 2024 10:49 Что V3, что V5 - в обоих случаях список позиций отличается от используемого Генотеком. И недостающие позиции импьютируются, а не читаются. Отличия в результатах GedMatch будут по очевидным причинам: снипы частично другие. Будут ли результаты одного формата точнее, лучше, правильнее, чем другого - я не знаю. По моему мнению будет замена "шило на мыло" или "хрена на редьку", то есть будут и преимущества и недостатки. @georgf насчёт импьютирования - я уверен, если Вы имели в виду вопрос "действительно ли Генотек использует импьютирование для получения результата в формате 23andMe V3 / V5". @Lesla спасибо, принял к сведению. | | Лайк (1) |
MVM Санкт-Петербург Сообщений: 757 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 360
| Наверх ##
16 июля 2024 13:53 Добрый день. Получила файл VCF. Выделение ДНК от 12 апреля. Скажите, пожалуйста, DNA Kit Studio - хорошая альтернатива файлам Генотека за 1000 р? | | |
Karel_Bel Санкт-Петербург Сообщений: 1447 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 3141
| Наверх ##
16 июля 2024 18:42 Здравствуйте! Не понимаю результат теста митохондриальной ДНК, сделанный в Генотеке, по выявлению сходства ДНК с жителями регионов. Тест делала моя двоюродная племянница по материнской линии. У нас на протяжении многих поколений (3-х веков) предки её прабабушки (моей бабушки) проживали в Москве. Браки совершались из числа таких же крепостных дворовых людей города Москвы. В Москве до настоящего времени проживают потомки многочисленных ветвей наших предков (отцовская линия прабабушки). Прабабушка также родилась в Москве (по паспорту, но метрика пока не найдена). Однако в число регионов, где выявлено сходство по ДНК, Москва и Московская область не вошли вообще. Что это может означать? Отец прабабушки, его родители и родственники были московскими цеховыми живописного цеха. Художественные способности также проявились и у прабабушки, и у её среднего брата, поэтому версия об удочерении прабабушки кажется маловероятной. Материнская линия прабабушки (моей бабушки) уходит корнями (на 2 века точно) в западную часть Тверской губернии, то есть, к Москве не имела отношения. В перспективе я тоже хотела бы сделать такой же анализ ДНК, чтобы можно было сравнить, но теперь сомневаюсь в точности представленных результатов. Как считаете, произошла ошибка в результатах? С уважением, Елена. | | |
georgf I1-Y132166/BY35301
Москва Сообщений: 196 На сайте с 2022 г. Рейтинг: 142 | Наверх ##
16 июля 2024 20:54 >> Ответ на сообщение пользователя Karel_Bel от 16 июля 2024 18:42 Если у вас генетический паспорт, попросите сразу консультацию генетика, он немного разъяснит и по вашим предкам. Если кратко, то область определяют не по митохондриям, а по аутосомам. И то, москва уже лет 150 проходной двор и Вавилон, поэтому надеяться, что вам что-то напишут со 100% гарантией как национальность в паспорте по одному тесту дальней родственницы просто оптимистично. Вы в самом начале пути, тестируйте дальше, читайте больше про генетику, ... --- Y гаплогруппа I1-Y132166/BY35301 Мито U5b2a | | Лайк (2) |
georgf I1-Y132166/BY35301
Москва Сообщений: 196 На сайте с 2022 г. Рейтинг: 142 | Наверх ##
16 июля 2024 20:56 MVM написал: [q] Добрый день. Получила файл VCF. Выделение ДНК от 12 апреля. Скажите, пожалуйста, DNA Kit Studio - хорошая альтернатива файлам Генотека за 1000 р?[/q]
Сейчас никто не даст никаких гарантий, тем более что вы явно спршиваете с прицелом на заливку в myheritage и familytreedna Ни ручной метод специалистами генотека, ни dnastudio --- Y гаплогруппа I1-Y132166/BY35301 Мито U5b2a | | |
Karel_Bel Санкт-Петербург Сообщений: 1447 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 3141
| Наверх ##
16 июля 2024 22:04 georgf написал: [q] Если кратко, то область определяют не по митохондриям, а по аутосомам. [/q]
В данном конкретном случае я ориентируюсь на полученный результат. Представлены 17 регионов проживания людей на территории России со схожими ДНК по мере убывания, в том числе Крым (на 3-ем месте!!!), где в обозримом прошлом предки никогда не жили (разве, что в 16-17 веках кто-то был в полОне у крымского хана и оставил там свой след). Про другие представленные регионы с достаточным количеством схожих ДНК тоже никогда не слышали, и в изученных архивных документах информация об этих регионах не встречалась, а вот Москва, где в течение 3-х веков жили и живут родственники, вообще в списке отсутствует. За прошедшие 300 лет "половина Москвы" должна была бы ходить в родственниках. Не понимаю, почему не так. georgf написал: [q] Вы в самом начале пути, тестируйте дальше[/q]
Это сложно делать, когда нет понимания, и главное - доверия. Единственное объяснение этому (полагаю для себя на данном этапе) - это всё же, пусть и очень малая, но вероятность удочерения нашей бабушки/прабабушки (метрика в Москве не найдена, даже с использованием ИИ). В любом случае, спасибо за Ваше внимание к моему вопросу. С уважением, Елена. | | |
georgf I1-Y132166/BY35301
Москва Сообщений: 196 На сайте с 2022 г. Рейтинг: 142 | Наверх ##
16 июля 2024 23:15 16 июля 2024 23:15 Karel_Bel написал: [q] Представлены 17 регионов проживания людей на территории России со схожими ДНК по мере убывания, в том числе Крым (на 3-ем месте!!!), где в обозримом прошлом предки никогда не жили (Москва, где в течение 3-х веков жили и живут родственники, вообще в списке отсутствует. За прошедшие 300 лет "половина Москвы" должна была бы ходить в родственниках. Не понимаю, почему не так. georgf написал:
[q] Вы в самом начале пути, тестируйте дальше
[/q]
Это сложно делать, когда нет понимания, и главное - доверия. Единственное объяснение этому (полагаю для себя на данном этапе) - это всё же, пусть и очень малая, но вероятность удочерения нашей бабушки/прабабушки (метрика в Москве не найдена, даже с использованием ИИ). В любом случае, спасибо за Ваше внимание к моему вопросу. С уважением, Елена.
[/q]
"Мы нашли сходства в вашей ДНК с коренными жителями этих регионов" - коренными они считают жителей за последние лет 200, но преимущественно с теми, кто сейчас тестировался в генотеке. Москва слишком смешанная. Для настоящих результатов по областям делайте G25 и сравнивайте с правильными выборками (от Tora sama) - там может и покажет Москву. Если и там не будет, то у вас действительно проблемы с предками. вы на себя распространяете результаты дальней родственницы, с которой у вас хорошо, если 10% общих генов наберется - это абсолютно неправомерно По общим митохондриям уже давно - лет 10 - ничего не меряют. Это максимум может сказать, что вы не из Африки. --- Y гаплогруппа I1-Y132166/BY35301 Мито U5b2a | | Лайк (1) |
|