ДНК-генеалогия. Вопросы новичков
И ответы опытных ))
Evgeny KolchuginМосковская обл. Сообщений: 863 На сайте с 2013 г. Рейтинг: 976 | Наверх ##
16 марта 2019 19:13 Тампио написал: [q] Из этого списка значимо лишь одно-единственное совпадение на десятой хромосоме 17,88 сМ. И этого очень мало для определения родства "в середине 19 века" между вторым тестируемым и вами. (А не между ними двумя.) Вот, к примеру, один из генетических совпаденцев моего отца имеет с ним 15 общих участков, из которых 14 участков меньше 5 сМ. Общая длина = 73 сМ, а максимальный участок = 38 сМ. Я отношу время жительства их общего предка к 16-17 веку. Это не значит, что ваш общий предок с этим вторым тестируемым не мог жить ранее 17 века. Всё возможно. И это "возможно" может зависеть от разных факторов. Но я не был бы так оптимистичен про 19 век. [/q]
Да я не настаиваю. Предполагаю. Действительно, 18 сМ - единственно значимый участок и даёт множество вариантов. Тем не менее, на таких близких расстояниях исключения бывают нечасто. Вот результаты сравнения одного человека из моей семьи с её известными родственниками (общее совпадение/самый длинный блок): Мать: 3,383/267 - Mother/ Daughter Двоюродные дяди и тёти (6 человек, между собою родные братья и сёстры): 5 человек от 494/73 до 421/46 - 1st Cousin - 2nd Cousin, 1 человек 260/40 - 1st Cousin - 3rd Cousin 2-4 юродный брат (общая бабушка по женской линии и общий прапрадед по мужской линии): 486/67 - 1st Cousin - 2nd Cousin 4-юродный брат (но разные бабушки!): 94/18 - 2nd Cousin - 4th Cousin (у них есть ещё один общий участок 13 сМ и пять участков 5-7 сМ) Справедливости ради скажу, что у моего отца имеется бессчётное количество совпаденцев в западной Европе, в основном в Финляндии. Проверил первых семерых, все оценены как 3rd Cousin - 5th Cousin, у всех общий участок в 4 хромосоме размером от 13 до 15 сМ. Списывался с одной из них (47/14), и как оказалось, с другими ребятами из этого списка она не знакома. Может быть действительно что-то древнее, а может быть недавнее хорошо забытое? В общем, нужно тестировать старшее поколение. --- Жизнь каждого человека достойна романа. /Ирвин Польстер/
kolchugin-story.ru
Пенза: Кольчугины, Мельниковы, Мирясовы, Дудниковы, Мурзины, Зименковы, Курдюковы, Голеневы, Школьниковы, Финогеновы
Калужская губ.: Прошины, Грешновы (Гришновы), Губановы, Романовы, Кузьмины(?), Коршуновы, Барковы | | |
sserg Саранск Сообщений: 658 На сайте с 2014 г. Рейтинг: 654
| Наверх ##
16 марта 2019 19:27 Тампио написал: [q] А ведь троюродный брат - это родственник имеющий общего дедушку/бабушку. Неужели кто-то думает, что у Валуева и Малахова общий дед, о котором они не знают? [/q]
Троюродный брат - это общий прадед/прабабка, дед и бабка, дают двоюродное родство. | | |
Тампио«Спасибо» и лайки не надо. Просто нажмите [+] Санкт-Петербург Сообщений: 1771 На сайте с 2006 г. Рейтинг: 1111 | Наверх ##
16 марта 2019 21:06 16 марта 2019 21:11 Evgeny Kolchugin написал: [q] 4-юродный брат (но разные бабушки!): 94/18 - 2nd Cousin - 4th Cousin (у них есть ещё один общий участок 13 сМ и пять участков 5-7 сМ)[/q]
Надеюсь, вы понимаете, что 94/18 совершенно не равно 54/18? А ведь именно про 54/18 нас и спрашивали. Evgeny Kolchugin написал: [q] (у них есть ещё один общий участок 13 сМ и пять участков 5-7 сМ)[/q]
Я вижу, что ситуация другая. Надеюсь, что и вы это видите -- в обсуждаемом случае лишь два участка около 4,5 сМ. Я понимаю, что может создаться впечатление, что описываемый вами случай и пример Липчанки похож. Но и автомобиль "Ока" чем-то похож на Volkswagen... четыре колеса, руль... даже может ехать по дороге. Evgeny Kolchugin написал: [q] Справедливости ради скажу, что у моего отца имеется бессчётное количество совпаденцев в западной Европе, в основном в Финляндии. Проверил первых семерых, все оценены как 3rd Cousin - 5th Cousin, у всех общий участок в 4 хромосоме размером от 13 до 15 сМ. Списывался с одной из них (47/14), и как оказалось, с другими ребятами из этого списка она не знакома. Может быть действительно что-то древнее, а может быть недавнее хорошо забытое? [/q]
Я вот тоже думаю, что существует какая-то почти неуловимая грань, которая внешне может иметь все признаки относительно недавнего родства, но это похоже на мимикрию недавнего родства. Я не зря упомянул в своём первом ответе о желательности знания этничности тестируемых. У меня таких случаев очень много и я писал о них в своём дневнике. Эти единичные отрезки имеют старое происхождение. Мне это очевидно. Никто из них не имеет никаких сведений о моих далёких предках 19-го века. Я проверял. sserg написал: [q] Троюродный брат - это общий прадед/прабабка, дед и бабка, дают двоюродное родство.[/q]
Да, там речь идёт о генетическом троюродном брате. Это лишь отодвигает родство на одно поколение. Но это не имеет значения, как я думаю. Н.Валуев и А.Малахов наверняка имеют живых родителей. Один из их дедушек/бабушек должен по-идее быть общим и родители должны об этом знать. Но не знают. Это мои мысли, конечно. Поэтому я не зря указал на сбивчивую речь профессора Барановой, когда она различными длинными пассажами о столетиях и 1917 годе пыталась замаскировать своё незнание реальной степени родства. А уж про предка Малахова по материнской линии из Бразилии я и комментировать не хочу -- это бред, когда место жительства далёкого генетического совпаденца воспринимается как место жительства далёкого прямого предка. --- Новг. обл, Маловишерский р-н, д. Поддубье, Горнецкое, Селищи — ЕВПЛОВЫ ИВАНОВЫ
Кировск. обл, Лузский р-н, д. Пятинская — ИГУМНОВЫ
Тамб. обл, Гавриловский р-н — ТЕРЁШКИНЫ ВОЛЧКОВЫ
Белоруссия: Бобруйск, Новогрудок — ПОТАПОВИЧИ ОСИПОВИЧИ
☦ Финны СПб ☦ | | |
Evgeny KolchuginМосковская обл. Сообщений: 863 На сайте с 2013 г. Рейтинг: 976 | Наверх ##
16 марта 2019 21:58 16 марта 2019 22:01 Тампио написал: [q] Надеюсь, вы понимаете, что 94/18 совершенно не равно 54/18? А ведь именно про 54/18 нас и спрашивали.[/q]
Я догадывался. У нас в школе неплохо преподавали математику. Тем не менее, специалисты рекомендуют в первую очередь обращать внимание на наибольший общий фрагмент, а не на общее совпадение. Почему? Давайте разберём технические аспекты. Что такое сантиморган? Сантиморган (сокращенно: сМ) в генетике — единица измерения генетических расстояний между полиморфными фрагментами генома (локусами или маркерами), которая определена как расстояние, на котором вероятность рекомбинации генов в мейозе составляет 1 %. То есть, 18 сМ означает вероятность 18% разделения (дробления, сокращения) данного участка при образовании гамет (т.е. половых клеток: яйцеклеток и сперматозоидов) в течение одного поколения. Довольно большая величина, почти 1/5. Это расчётная величина, она основана на большом количестве наблюдений и различается между хромосомами и даже разными участками одной хромосомы. Т.е. физически более длинный участок может иметь меньше сМ, и наоборот. Передача же отдельных фрагментов наследникам (не дробление фрагмента, а именно передача) подчиняется закону вероятности. Вероятность передачи иллюстрируется кривой нормального распределения. То есть кому-то достаётся больше фрагментов, а кому-то меньше просто случайным образом. Теоретически, два родных брата могут иметь совпадение и 0% и 100% по своему генетическому составу, хотя обычно это около 50%. --- Жизнь каждого человека достойна романа. /Ирвин Польстер/
kolchugin-story.ru
Пенза: Кольчугины, Мельниковы, Мирясовы, Дудниковы, Мурзины, Зименковы, Курдюковы, Голеневы, Школьниковы, Финогеновы
Калужская губ.: Прошины, Грешновы (Гришновы), Губановы, Романовы, Кузьмины(?), Коршуновы, Барковы | | |
Тампио«Спасибо» и лайки не надо. Просто нажмите [+] Санкт-Петербург Сообщений: 1771 На сайте с 2006 г. Рейтинг: 1111 | Наверх ##
16 марта 2019 22:28 Evgeny Kolchugin написал: [q] У нас в школе неплохо преподавали математику. Тем не менее, специалисты рекомендуют в первую очередь обращать внимание на наибольший общий фрагмент, а не на общее совпадение[/q] Напомню мои слова выше: Тампио написал: [q] Надо смотреть на общую длину, на самый большой участок и на количество совпадающих участков. И совокупность этих трёх факторов может приблизительно указать на время жительства общих предков. Ну ещё неплохо бы этничность всех трёх тестируемых знать.[/q] --- Новг. обл, Маловишерский р-н, д. Поддубье, Горнецкое, Селищи — ЕВПЛОВЫ ИВАНОВЫ
Кировск. обл, Лузский р-н, д. Пятинская — ИГУМНОВЫ
Тамб. обл, Гавриловский р-н — ТЕРЁШКИНЫ ВОЛЧКОВЫ
Белоруссия: Бобруйск, Новогрудок — ПОТАПОВИЧИ ОСИПОВИЧИ
☦ Финны СПб ☦ | | |
Evgeny KolchuginМосковская обл. Сообщений: 863 На сайте с 2013 г. Рейтинг: 976 | Наверх ##
16 марта 2019 23:13 Тампио, да я и не спорю, может и 300 лет. Но позвольте же дать человеку надежду! А потом, Гедматч выдаёт следующие оценки (в поколениях) при попарном сравнение лиц с похожими значениями. Мы понимаем, что эти числа расчётные, тем не менее... 45.5/17.2 - 4.2 (имеется три фрагмента, превышающих 7 сМ: 17.2, 12.3, 10.9) 37.2/20.1 - 4.3 (три фрагмента: 20.1, 8.5, 7.3) 37.2/15.3 - 4.3 (два фрагмента: 14.7 и 9.0) 30.1/17.3 - 4.4 (два фрагмента: 17.3 и 7.4) 29.6/9.9 - 4.5 (два фрагмента: 9.9 и 8.2) --- Жизнь каждого человека достойна романа. /Ирвин Польстер/
kolchugin-story.ru
Пенза: Кольчугины, Мельниковы, Мирясовы, Дудниковы, Мурзины, Зименковы, Курдюковы, Голеневы, Школьниковы, Финогеновы
Калужская губ.: Прошины, Грешновы (Гришновы), Губановы, Романовы, Кузьмины(?), Коршуновы, Барковы | | |
Тампио«Спасибо» и лайки не надо. Просто нажмите [+] Санкт-Петербург Сообщений: 1771 На сайте с 2006 г. Рейтинг: 1111 | Наверх ##
16 марта 2019 23:23 16 марта 2019 23:31 Evgeny Kolchugin написал: [q] Но позвольте же дать человеку надежду![/q]
Я думаю, что дать надежду - это одно из основных ваших правил. Я это заметил ещё тогда, когда вы настойчиво рекомендовали пользователю stasyter делать Y-тест с ссылкой на китайцев и "Очарованного странника". Я же подхожу с другой стороны: люди должны знать, что тесты могут не дать желаемого и потраченные деньги могут уйти, на первый взгляд, в песок... чтобы не сокрушались о том, что их надежды были обмануты. Вот вы сказали про середину 19 века. Допустим, Липчанка начнёт копать в эту сторону, потратит год своей жизни и ничего не найдёт. Не думаю, что она этому обрадуется -- её же обнадёжили. А так она будет готова, что 19 век - это просто гипотетическая возможность. У моего отца, например, 37 человек -- 2nd Cousin - 4th Cousin и это только по базе ФТДНА. Заманчиво думать, что общий предок этих всех 37 человек жил в первой половине 19 века. Но я то почти наверняка знаю, что это не так... что он жил раньше Петра I... или даже Ивана IV. Это реальность. Суровая, но реальность. --- Новг. обл, Маловишерский р-н, д. Поддубье, Горнецкое, Селищи — ЕВПЛОВЫ ИВАНОВЫ
Кировск. обл, Лузский р-н, д. Пятинская — ИГУМНОВЫ
Тамб. обл, Гавриловский р-н — ТЕРЁШКИНЫ ВОЛЧКОВЫ
Белоруссия: Бобруйск, Новогрудок — ПОТАПОВИЧИ ОСИПОВИЧИ
☦ Финны СПб ☦ | | |
Evgeny KolchuginМосковская обл. Сообщений: 863 На сайте с 2013 г. Рейтинг: 976 | Наверх ##
16 марта 2019 23:42 Тампио написал: [q] Я думаю, что дать надежду - это одно из основных ваших правил. Я это заметил ещё тогда, когда вы настойчиво рекомендовали пользователю stasyter делать Y-тест с ссылкой на китайцев и "Очарованного странника". Я же подхожу с другой стороны: люди должны знать, что тесты могут не дать желаемого и потраченные деньги могут уйти, на первый взгляд, в песок... чтобы не сокрушались о том, что их надежды были обмануты.[/q]
О, хосподи! Известно, что медицина - наука не точная, гарантий не даёт и гонораров не возвращает. Ну и я, как истинный врач... кручу-верчу, запутать хочу. Тампио написал: [q] У моего отца, например, 37 человек — 2nd Cousin - 4th Cousin и это только по базе ФТДНА. Заманчиво думать, что общий предок этих всех 37 человек жил в первой половине 19 века. Но я то почти наверняка знаю, что это не так... что он жил раньше Петра I... или даже Ивана IV. Это реальность. Суровая, но реальность.[/q]
А почему вы так уверены? 4 поколения назад у каждого человека имеется 16 предковых линий. Ещё одно поколение - уже 32. Вы собрали информацию по всем? --- Жизнь каждого человека достойна романа. /Ирвин Польстер/
kolchugin-story.ru
Пенза: Кольчугины, Мельниковы, Мирясовы, Дудниковы, Мурзины, Зименковы, Курдюковы, Голеневы, Школьниковы, Финогеновы
Калужская губ.: Прошины, Грешновы (Гришновы), Губановы, Романовы, Кузьмины(?), Коршуновы, Барковы | | |
azorvosУчастник Сообщений: 90 На сайте с 2017 г. Рейтинг: 30 | Наверх ##
16 марта 2019 23:46 Evgeny Kolchugin написал: [q] Что такое сантиморган? Сантиморган (сокращенно: сМ) в генетике — единица измерения генетических расстояний между полиморфными фрагментами генома (локусами или маркерами), которая определена как расстояние, на котором вероятность рекомбинации генов в мейозе составляет 1 %. То есть, 18 сМ означает вероятность 18% разделения (дробления, сокращения) данного участка при образовании гамет (т.е. половых клеток: яйцеклеток и сперматозоидов) в течение одного поколения. Довольно большая величина, почти 1/5. Это расчётная величина, она основана на большом количестве наблюдений и различается между хромосомами и даже разными участками одной хромосомы. Т.е. физически более длинный участок может иметь меньше сМ, и наоборот.[/q]
Пользуясь случаем, поможете разобраться, пожалуйста? Пример в аттаче. Не до конца понимаю, ответ А только потому, что расстояние - 10 сМ?
| | |
Evgeny KolchuginМосковская обл. Сообщений: 863 На сайте с 2013 г. Рейтинг: 976 | Наверх ##
17 марта 2019 0:14 Чтобы всем было понятно, мужчина с алкаптонурией женится на женщине с непереносимостью сахарозы. Тип наследования генетического заболевания у каждого - аутосомно-рецессивный. Гены болезни у обоих находятся в 3 хромосоме, но не в совпадающих локусах, а на расстоянии 10 сМ друг от друга. Какова вероятность того, что у их ребёнка проявятся эти заболевания? azorvos написал: [q] Не до конца понимаю, ответ А только потому, что расстояние - 10 сМ? [/q]
Нет, ребёнок не будет болеть, потому что тип наследования обоих заболеваний - аутосомно-рецессивный. То есть, чтобы болезнь проявилась клинически, нужно чтобы у человека было два гена этого заболевания - от отца и от матери. В данном случае, ребёнок получит по поражённому гену от каждого из родителей, который перекроется здоровым геном от второго родителя. Ребёнок будет носителем генов обоих заболеваний, но болеть не будет. К сведению, каждый человек является носителем рецессивных генов наследственных заболеваний. Если правильно помню, в среднем от 4 до 6. Вот почему во многих странах имеется официальный запрет на близкородственные браки. При них риск совпадения поражённых генов и рождения больного ребёнка резко увеличивается. --- Жизнь каждого человека достойна романа. /Ирвин Польстер/
kolchugin-story.ru
Пенза: Кольчугины, Мельниковы, Мирясовы, Дудниковы, Мурзины, Зименковы, Курдюковы, Голеневы, Школьниковы, Финогеновы
Калужская губ.: Прошины, Грешновы (Гришновы), Губановы, Романовы, Кузьмины(?), Коршуновы, Барковы | | |
|