ДНК-генеалогия
Генетические методы реконструкции родословного дерева
| romaf
Сообщений: 2821
На сайте с 2018 г.
Рейтинг: 12870
| Наверх ##
22 ноября 19:48 22 ноября 20:00 Evgeny Kolchugin написал: [q]
PedigreeResearcher написал:
[q]
Увы, расположение на центромере. Так же, как и в случае с теломерами, это любимое место для т.н. реликтовых гаплоблоков. То есть, совпадающих участков древнего происхождения, характеризующих какие-нибудь популяции.
Говоря проще, да. Предок в приведённом примере у всех был один. Но возможно тысячи лет тому назад.
[/q]
Ага. Есть у моего отца среди аутосомных совпаднцев десяток финнов с общим довольно крупным фрагментом, что-то около 17 сМ. И отец к Финляндии отношения не имел и даже финны между собой не знакомы оказались.[/q]
С финнами как то еще понятно. Хотя они были поданными РИ и могли перемещаться по Империи. А как же поляки ? Тоже не может быть совпаденцев? А с чехами как быть? Поляки рекрутировались в армию РИ. И служили в частях на территории Империи. По окончании службы запасные имели право остаться жить где угодно. Так у меня прапрадед осел в Пятигорске в конце 19 века. Родился в Плонском уезде Варшавской губ. Во второй половине 19 века были переселения чехов из Австро-Венгрии как в США, так и в РИ. На Северном Кавказе были чешские колонии. И Шотландская колония была в районе Пятигорска в начале 19 века. Здесь на форуме был человек с шотландскими корнями по ДНК. ---
GEDmatch YA5712222 SE7262876 | | Лайк (2) |
витус Гомель Сообщений: 654 На сайте с 2008 г. Рейтинг: 540 | Наверх ##
22 ноября 20:29 [/q] Как понять в Гедматч, что сегмент составной? [/q] Напишу Вам лучше в личку ---
Гилевский,Рубкевич,Петрович,Корзун,Шиманский,Пуцято,Бакиновский,Глембоцкий,Довнар,Загоровский,Адамович,Лиходзиевский,Окулич,Пликус, Наркевич, Рубашный - Игум. и Слуц.у. | | |
PedigreeResearcher Сообщений: 3398 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 994 | Наверх ##
23 ноября 17:46 Напомню про составные УПСы. (К слову сказать, термин "составной УПС" на русском языке придумал и ввёл в оборот в своё время я.)
Суть его заключается в том, что Участок Половинного Совпадения (УПС) состоит издвух частей. Одна изкоторых идёт от отца. Другая от матери.
Составной УПС порой больше по размерам, чем УПСы на данном участке хромосомы от каждого из родителей.
На практике это означает, что ребёнку показывают более близкую степень родства по отношению к референтной персоне, нежели каждому из родителей. ---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева | | Лайк (1) |
PedigreeResearcherСообщений: 3398 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 994 | Наверх ##
23 ноября 17:51 23 ноября 17:57 Ещё распространённый случай, когда с референтной персоной не связан никто из родителей. А у ребёнка имеется детектируемый УПС.
Причин этому может быть несколько:
1. Родительские сэмплы просеквенированны плохо (много т.н. no-calls), а потомковый хорошо.
2. Родительские УПСы на данном участке меньше пороговых. (Скажем 5 см у отца. 4 сМ у матери на прилегающем участке. 7.2 сМ у ребёнка. При пороговом значении в 7 сМ.) ---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева | | Лайк (1) |
PedigreeResearcherСообщений: 3398 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 994 | Наверх ##
23 ноября 17:52 Хороший частный случай, когда отец и мать являются генетическими родичами. При таком варианте наверняка будут составные УПСы.
Но для этого необходимо, чтобы обра родителя были протестированы. ---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева | | |
PedigreeResearcherСообщений: 3398 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 994 | Наверх ##
23 ноября 17:55 23 ноября 17:56 Если один, или оба родителя не протестированы, то можно детектировать их относительно близкое родство, используя только сэмпл ребёнка. Соответствующая бесплатная утилита в Гедматч называется Are Your Parents Related? Результаты получаются вот такие, например:   ---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева | | |
PedigreeResearcherСообщений: 3398 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 994 | Наверх ##
23 ноября 17:59 Вот ещё пример, когда родители между собой связаны:
 ---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева | | Лайк (1) |
PedigreeResearcherСообщений: 3398 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 994 | Наверх ##
23 ноября 18:08 Ну, а теперь про "врачей" "вероятностное распределение". Имеем такого протестированного:  Родители которого связаны ближайшим общим предком (БОП) на расстоянии 5.5 поколений (5 поколений от одного, 6 поколений от другой):   ---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева | | |
PedigreeResearcherСообщений: 3398 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 994 | Наверх ##
23 ноября 18:10 Утилита Гедматч оценивает наличие УПСа у родителей вот такого размера:
 ---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева | | |
PedigreeResearcherСообщений: 3398 На сайте с 2020 г. Рейтинг: 994 | Наверх ##
23 ноября 18:13 Вероятности разных видов родства для данного случая оценены вот так:
 ---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева | | |
|
