ДНК-генеалогия

На сайте ВГД собираются люди, увлеченные генеалогией, историей, геральдикой и т.д. Здесь вы найдете собеседников, экспертов, умелых помощников в поисках предков и родственников. Вам подскажут где искать документы о павших в боях и пропавших без вести, в какой архив обратиться при исследовании родословной своей семьи, помогут определить по старой фотографии принадлежность к воинским частям, ведомствам и чину. ВГД - поиск людей в прошлом, настоящем и будущем!

Trish написал:

[q]
Набор получила, готова отослать обратно свой образец...
[/q]

Поздравляю! добро пожаловать, теперь нас четверо вгд-шников в 23andMe.
Все остальные, присоединяйтесь!

napobo3, спасибо

Я что-то пропустила, а кто был 3-м?

napobo3 написал:

[q]
теперь нас четверо вгд-шников в 23andMe.
[/q]

Я еще в январе передала в США ( и в лаборатории подтвердили получение) тест для приемной дочки.
Результат жду в конце апреля (обещали за 8 недель сделать).

А у кого здесь есть гаплогруппа U??

napobo3 написал:

[q]
теперь нас четверо вгд-шников в 23andMe.
[/q]

Trish написал:

[q]
Я что-то пропустила, а кто был 3-м?
[/q]

Я тоже думал, что нас с ВГД только двое с napobo3.
Trish третьей будет.

А кто четвертый? (Если вопрос приватный, то ответить можно по емэйл, или в личку.)

nmash, поторопился. Не прочел Ваш пост.

Так Ваша приемная дочь и есть четвертая?

Вот очень интересный случай.
Два человека имеют одинаковую фамилию и одинаковый Y-субклад:

А вот участков половинного совпадения (УПС) на их хромосомах не наблюдается.

Сей факт означает только одно, фамилия у этих двух господ появилась ранее 1550-1650 годов, так как последним на сегодня данным 23эндМи детектирует общих предков на максимальной глубине 12-14 поколений.

Пока смогла выяснить, что у девочки гаплогруппа U4.
гаплотип 16086-16356-16519
Кто-то что-то мне, профану, рассказать об этом может??

nmash написал:

[q]
Пока смогла выяснить, что у девочки гаплогруппа U4.
гаплотип 16086-16356-16519
Кто-то что-то мне, профану, рассказать об этом может??
[/q]

Начнем по порядку.
С описания гаплогруппы U4. Она древняя (около 14000-25000 лет) и очень распространенная на территории России:

Теперь по гаплотипу. Что означают 16086-16356-16519?
А означают они что в позициях митоДНК 16086, 16356 и 16519 значения Вашей приемной дочери отличаются от референтных, так называемой Кембриджской референтной последовательности - Cambridge Reference Sequence (CRS).

Судя по всему, для Вашей дочери протестировали только один быстроизменяемый регион митоДНК. Так называемый HVR1. Увы, даже полное совпадение с кем-то по этому региону дает основание предположить, что Ваша дочь имела с совпаденцем общего матриарха 1000-3000 лет тому назад.

Если бы был протестирован и регион HVR2, то случай полного совпадения означал бы общего матриарха лет 600 тому назад.

Точность, начиная с поколения, дает только тест (если мы говорим о мито) FGS (full genome sequence), это если мы говорим только о митоДНК.

Вот так выглядят, например, мои результаты:

Haplogroup - H6a1

HVR1 differences from CRS:
16362C, 16482G

HVR2 differences from CRS:
239C, 263G, 309.1C, 309.2C, 315.1C, 524.1C, 524.2A

CR differences from CRS
750G, 1438G, 3915A, 4727G, 4769G, 5302C

Наверно Вы обратили внимание, что следом за номером позиции следует именование нуклеотида A, C, G, или T.

Вам названия нуклеотидов скорее всего не дали (хотя возможно Вы их просто проигнорировали).
Ох, уж эта снобисткая научная небрежность высоколобых (надеюсь, Вы поняли о ком я сейчас?).

Понятно, что по большинству позиций возможно чередование только двух значений. Скажем, только А, или Т. Или же только А, или С.
Но для того, чтобы занести Ваши данные в базы (SMGF, mtSearch, Ancestry) для поиска приближенцев, придется просматривать по позициям все снипы на CRS и смотреть, какие же буковки у Вас имеются.

Но тест - некоммерческий, а даренному коню в зубы не смотрят. Если у Вас буковок нет, то к вечеру буду их восстанавливать и поввожу их в базы. Хотя и не вижу особого смысла с такой низкой точностью.

Ну, а если буковки имеются, то выложите их - это значительно упростит мою работу.

Mich_Glitch написал:

[q]
(хотя возможно Вы их просто проигнорировали).
[/q]

Щаса!

Mich_Glitch написал:

[q]
а если буковки имеются, то выложите их - это значительно упростит мою работу.
[/q]

Я именно без буковок и пыталась что-тто узнать, но....
Вот, что мне прислали:

"Проведено секвенирование (прямой анализ нуклеотидной последовательности) первого гипервариабельного сегмента митохондриальной ДНК в диапазоне 16000-16559, а также выборочный анализ информативных сайтов кодирующей части молекулы митохондриальной ДНК.
Секвенирование выявило отличия от эталонной кембриджской последовательности в трех позициях (указаны номера нуклеотидов): 16086, 16356, 16519, причем результаты анализы с прямого и обратного праймеров взаимно подтверждают друг друга.
Наличие характерной замены 356 позволяет предположить, что данный образец относится к гаплогруппе (группе родственных линий) обозначаемой как U4. Выборочный анализ сайтов кодирующей части молекулы митохондриальной ДНК доказал принадлежность образца к макрогаплогруппе U.

На этих основаниях результат анализа формулируется:
Гаплогруппа U4, гаплотип 16086-16356-16519"

Далее - только разъяснения, что такое U4 - карта и т.п....

Ладно, не беда. Дам Вам буковки:
Position (rCRS) Versions Genotypes Ваше значение
16086..................C or T.......С.................Т
16356..................C or T.......С.................Т
16519..................C or T.......Т.................С

Итак, для Вашей дочери Вы можете писать следующее:

Haplogroup - U4

HVR1 differences from CRS:
16086Т, 16356Т, 16519С

Сейчас проверю Вас по Соренсону и митоСёч.

Генетические методы реконструкции родословного дерева