ДНК-генеалогия
Генетические методы реконструкции родословного дерева
napobo3 Сообщений: 269 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 78 | Наверх ##
29 мая 2008 10:51 29 мая 2008 14:13 Mich_Glitch написал: [q] napobo3 написал:[q] А вот и результаты по mtDNARefine приехали (ZN9CA): 239C,263G,309.1C,315.1C,524.1C,524.2A ФТДНА показывает два полных совпадения.По митоsearchу полного совпадения нет ни с кем, один шаг в сторону от Вас и еще от двоих.[/q]
По этой линии у нас с Вами с 50% вероятностью имеется общий матриарх не далее 920 лет тому назад.С 75% вероятностью не далее 1475 лет тому назад.И если с 95% вероятностью, то не далее 2600 лет тому назад.(Использовал сл. значения: количество рассматриваемых маркеров 1148; скорость мутаций 0.00002 на маркер в поколение; 25 лет на поколение).Всего у меня 6 полных совпаденцев. Значит и с ними у Вас таже степень родства. В митоСёч, как видим, занесены всего 3 человека из 7. (Это если двое других совпадают со мной.)В базе Соренсона не смотрели? Рекомендую глянуть. [/q]
С Соренсоном выходит странно - он засчитывает полное совпадение даже когда информация по мутации отсутствует. Нашел 7 человек, с которыми совпадаю по 6 из 8 значений. Более полных совпадений не нашел. И Вас там не вижу. Может не так ищу? А что еще можно сделать с новыми данными? Какую-нибудь филогенетическую схему построить, чтобы было что показать потенциальным тестируемым... | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
29 мая 2008 13:57 29 мая 2008 13:59 napobo3 написал: [q] С Соренсоном выходит странно - он засчитывает полное совпадение даже когда информация по location отсутствует.
Нашел 7 человек, с которыми совпадаю по 6 из 8 значений. Более полных совпадений не нашел. И Вас там не вижу. Может не так ищу?
А что еще можно сделать с новыми данными? Какую-нибудь филогенетическую схему построить, чтобы было что показать потенциальным тестируемым...[/q]
А меня и нет пока в Соренсоне. Что до схемы, то вот Вам схема. Брал людей с предиктом Н6а (Вы туда тоже вписываетесь). Из проекта, не митоСёч. Построение древовидное, а не кластерное.  Вы заметили на схеме вокруг себя, что такое разница +1 и -1? Речь идет о парах MichGlitch - N11448 и N54270 - 98452. И о мутационной разнице отсюда: ссылка, кликайте! | | |
napobo3Сообщений: 269 На сайте с 2007 г. Рейтинг: 78 | Наверх ##
29 мая 2008 14:20 Mich_Glitch написал: [q] Вы заметили на схеме вокруг себя, что такое разница +1 и -1? [/q]
+1 - это когда, например, 309.2С присутствует, которого у меня нет, а -1 - например 309.1С отсутствует, кот. есть у меня. А есть ли соответствие со временной осью? - например +1 значит, что мутация возникла ближе позднее, чем жила общая прародительница? По-моему ответ отрицательный, проверяю. | | |
| Mich_Glitch | Наверх ##
30 мая 2008 0:08 30 мая 2008 0:10 napobo3 написал: [q]
Mich_Glitch написал:
[q] Вы заметили на схеме вокруг себя, что такое разница +1 и -1? [/q]
+1 - это когда, например, 309.2С присутствует, которого у меня нет, а -1 - например 309.1С отсутствует, кот. есть у меня.
А есть ли соответствие со временной осью? - например +1 значит, что мутация возникла ближе позднее, чем жила общая прародительница? По-моему ответ отрицательный, проверяю. [/q]
Это лучше смотреть по кластерной схеме. Потому как модальный гаплотип, как Вы понимаете, в этом построении не предковый. Да и выборка кривовата. Но нет пока особого интереса копать глубже в виду мизерности совпаденцев. И потом точность слабовата в принципе. Если рассматривать только HVR1+HVR2 без учета географического фактора, то даже полное совпадение означает общего матриарха: с 95% вероятностью - 1640 лет тому назад; с 75% вероятностью - 750 лет тому назад; с 50% вероятностью - 375 лет тому назад. Вот когда появится обширная база по FGS, тогда можно будет мерять с точностью до поколения. Наберемся терпения.  | | |
zasoba Сообщений: 96 На сайте с 2008 г. Рейтинг: 50 | Наверх ##
30 мая 2008 2:10 17 апреля 2009 20:59 ---
Засоба: http://zasoba.info
Убейсобака: http://sites.google.com/site/ubeisobakin
Бурба: http://sites.google.com/site/burbaname
Барышев:Барышевка,Семей
Должиков:Сорокино,Оренбург.
Соколов:Девятовка,Мосальский,Калуж.
Трифонов:Свирково,Мосальский | | |
Gontarсемейный историк  Saint Petersburg Сообщений: 2039 На сайте с 2003 г. Рейтинг: 2884 | Наверх ##
30 мая 2008 9:36 zasoba
В базе Соренсена вы можете пополнять ваше родословие. Об остальных проектах ничего сказать не могу. ---
Val
Нам трудно, а когда было легко? | | |
| татиа
Москва
Сообщений: 2726
На сайте с 2006 г.
Рейтинг: 1289
| Наверх ##
30 мая 2008 9:38 zasoba
В DNA тоже можете, без проблем. ---
Ищу Есковых, Панковых, Головиных, Горяйновых, Тишиных, Пахомовых
Громницких, Робаковских, Зеленских, Сакунов, Михно, Плошенко, Плохих, Ярмак
Остапенко, Братченко, Панкратьевых
ВСЕ МОИ И МОИХ ПРЕДКОВ ДАННЫЕ РАЗМЕЩЕНЫ НА САЙТЕ ВГД ДОБРОВОЛЬНО. | | |
zasobaСообщений: 96 На сайте с 2008 г. Рейтинг: 50 | Наверх ##
30 мая 2008 20:32 17 апреля 2009 21:00
---
Засоба: http://zasoba.info
Убейсобака: http://sites.google.com/site/ubeisobakin
Бурба: http://sites.google.com/site/burbaname
Барышев:Барышевка,Семей
Должиков:Сорокино,Оренбург.
Соколов:Девятовка,Мосальский,Калуж.
Трифонов:Свирково,Мосальский | | |
| javax
רחובו—
Сообщений: 567
На сайте с 2004 г.
Рейтинг: 129
| Наверх ##
3 июня 2008 11:16 Gontar
Не подскажете когда будет очередное обновление базы данных у Соренсена?
Тесты присланные до какого времени в него войдут?
Спасибо! | | |
Gontarсемейный историк Saint Petersburg Сообщений: 2039 На сайте с 2003 г. Рейтинг: 2884 | Наверх ##
4 июня 2008 19:11 javax
Ваши тесты в лаборатории. Пока точно не могу сказать, потому что Директор в отъезде. ---
Val
Нам трудно, а когда было легко? | | |
|
