ДНК и прочая генетика

На сайте ВГД собираются люди, увлеченные генеалогией, историей, геральдикой и т.д. Здесь вы найдете собеседников, экспертов, умелых помощников в поисках предков и родственников. Вам подскажут где искать документы о павших в боях и пропавших без вести, в какой архив обратиться при исследовании родословной своей семьи, помогут определить по старой фотографии принадлежность к воинским частям, ведомствам и чину. ВГД - поиск людей в прошлом, настоящем и будущем!

Итак, ФТДНА, оно же FTDNA, оно же https://www.familytreedna.com/
Это сайт одной из трёх популярных лабораторий.
Зарегистрироваться и заказать тест вполне реально с использованием онлайн-переводчика.
В ожидании результата можно, нужно и полезно внести в программу своё древо и список фамилий. Если список не слишком длинный, то можно вносить с подробной географией.
Ваша личная страница будет выглядеть примерно так:

Пока тест не сделан, я не знаю, откуда попадать на эту страницу. Кнопки не нашла. Поэтому просто вводила адрес
https://www.familytreedna.com/my/default.aspx
И мне её открывало.
Пока тест не сделан, кнопок гораздо меньше. Но дерево уже точно есть, если вы его создали. Оно доступно по кнопке, обозначенной на моей картинке номером 7.
Определитесь с настройками. Если дерево внесено, но его никто не видит, толку будет мало. Надо делать его видимым. Но если по каким-то причинам не всю информацию вы будете использовать для поиска, можно внести её частично, поставить ограничения, кому и как отображать ныне живущих, или просто о "свеженьких" поколениях внести минимум информации (только фамилию, три буквы инициалов и т.д.).

Но чем больше информации вы предоставите, тем больше зацепок можете дать тем, с кем у вас совпало ДНК.
Я, например, позорник и не указала годы жизни предков, кого-то это может путать. Я исправлюсь :-)

Синий значок у верхнего поколения означает, что для этого человека внесены его предки, можно развернуть схему дальше. Почему-то у меня перестало выбираться в настройках, чтобы можно было показать сразу 9 поколений, а не 4.
Вносить, пожалуй, лучше на английском (как вариант, сложные фамилии типа Чущик дублировать на русском). Наш человек фамилию узнает в любом написании, он к английским буквам привык, а вот иностранцы русских букв часто не понимают.
Это та информация, которую анализ Вам не даёт, её вы можете внести сами, чтобы дальше свеженайденным кузенам было легче.

В поле ниже кнопки 7 до окончания теста будет пусто. Но можно зайти в раздел
Order History
и там следить за состоянием теста.
На моём скрине его не видно, поле чуть ниже, с левой стороны экрана.
Там будут дата заказа, дата отправки набора, потом появится дата получения набора обратно.
С почтой у меня проблем не возникало. Дальше для Беларуси: таможенный сбор за покупку в интернет-магазине не уплачивается. Вы получаете набор стоимостью 2 у.е., а не посылку за 99 у.е., за которые у нас дерут деньги. 2 у.е. будут указаны где-то на упаковке, проблем не будет. В любом случае, львиная доля суммы - это услуга по анализу, а налог у нас только на посылки, а не на услуги.
С обратной отправкой проблем тоже не было. Для описания содержимого я просто пришла на почту с конвертом, в котором получила тест, и попросила списать всё так же, как мне прислали. Получила кит - отправила кит, а что это такое - кто его знает...
Система слежения за отправлениями косячит. Чикаго может показывать, что всё ещё обрабаотывает посылку, а она уже давно в вашем городе. Поэтому даже если Чикаго её ещё не выпустило, проверьте код по сайту Белпочты, она уже могла впустить )))
Срок летания посылки между инстанциями - от 3 до 7 недель, как повезёт
После получения набора придётся ждать четверга. Именно в четверг набор определят в работу. Назначат дату получения результата.
Мне эту дату потом раза три переносили, каждый раз добавляли 2 недели.
После загрузки данных некоторые кнопки начнут работать сразу, некоторый - в течение суток после загрузки. Национальный состав, например, надо будет ждать.

После получения результата некоторыми кнопками в личном кабинете приходится пользоваться постоянно, а некоторыми - всего пару раз.
Постоянная дорожка - это 1-2-3, чтобы увидеть список совпаденцев. Об этом позже и подробно.
Кнопка 4 - my Origins, "Мои истоки". Она показывает географию тех мест, для которых Ваш набор генов является исконным. Таких исходных кластеров ФТДНА выделяет 18. Детальность проработки каждого из них разная. Например, белорусов там не выделяют. Вся моя генетическая история уместилась в понятие "восточноевропейский". Кроме тех 4%, которые определены как финские. Кстати, водятся финны в том числе под Петербургом, поэтому такими уж совсем финскими финнами предки могли и не быть )))))

Поэтому весь винегрет из Беларуси, Украины, Польши, Словакии и т.д. придётся потом разбирать отдельно, есть умельцы и для такого :-) Я пока не разбирала.
А россиянам, как я понимаю, ещё веселее, потому что россиян-то много и разных, и гены на Камчатке совсем не те, что в златоглавой и нерезиновой )))
Но до необходимости детальных разборок доходит не всегда. У нас тут эммиграция, поднятая целина, всяческие военные действия со времён походов племя-на-племя и до водоворота ВОВ, где смешались в кучу ... ну, нет, не кони, конечно, но все, кто мог смешаться в эвакуациях, боях и всяческих "война всё спишет"... Поэтому когда будешь искать, откуда у тебя в роду французы, делить восточноевропейцев на дроби будет не так любопытно.
И за счёт всей этой круговерти средненький европеец оказывается примерно вот таким:

И совершенно непонятно, как его предки бегали туда-сюда мимо Франции и Германии, но ничего там не подцепили :-)
А уж американцам в пятом поколении - вообще хоть вальс танцуй на карте! И куда ни прыгнешь - везде родня :-) У них, конечно, сохранность архивов получше нашей, но до корней им всё равно тянуться ох как далеко...

Иногда для подтверждения семейных легенд достаточно даже такого, простейшего анализа.

Следующая "одноразовая" кнопка - это сравнение ДНК с конкретными древними образцами. Если про этнический состав рассказали в общем виде, то по кнопке 5 "Ancient Origins" покажут на карте совпадения с конкретными древними людьми (например, найденными в результате раскопок). В самом общем виде эта карта выглядит как метки + по щелчку на метку сбоку откроется предполагаемая история конкретной древней персоны. Подробнее о каждой персоне можно найти в поисковиках.

Кроме того, показывается состав в разрезе... Как бы это назвать, археологических культур, племенных миграций, групп по по роду занятий, что ли?.. В общем, мне достались охотники, земледельцы и немножко культур железного ("металлического", не знаю точно, может, это ближе и к бронзовому?..) века.

Видно, что 50% моих генов - это гены охотничьих племён, которые в течение веков плавно переместились из Египта в Европу. Даже не заходя в Беларусь...
Ещё 33% - это Сирия и Турция, условно аграрии :-) И хотя бульба - наше белорусское всё, но аграрии тоже обошли Беларусь стороной. Кто ж у нас тогда жил-то?

Как известно, если бы Колумб не открыл Америку, белорусов бы не было. (с) Потому что бульбы б им никто не привёз. ))) Поэтому правильно, что аграриям сюда ходить, если до привоза бульбы ещё тысячи лет!
Ходили сюда племена железного века.
Тоже, в общем, молодцы, потому что Беларусь - это такая прекрасная страна, где месторождений железа - с гулькин нос. Ну нету у нас гор, ущелий и прочих изгибов земной коры, хотя если поколупаться в болотах...

Впрочем, греет душу, что два известных месторождения железной руды в Беларуси находятся прямо под моими Баранивичами, да и стрелка миграции случайно нарисована через эту же точку, хотя племена, как вы поонимаете, шли широким фронтом, а не проторённой тропой по трассе М1...

Как я понимаю, пути миграции всем восточноевропейцам покажет примерно так же. Отличие будет только в расположении точечек совпадения ДНК с материалами раскопок, а также в процентном соотношении различных племён. Поэтому вряд ли в этот раздел кто-то будет заходить ежедневно и много над ним размышлять. Познавательно, но на один раз.

И ещё одна простая кнопка - №6. Выгрузка результата на компьютер.
Это возможность скачать здоровенную табличку, где будет разложена по нуклеотидам вся та часть ДНК, которая отличает одного человека от другого. Читать это вы вряд ли будете. Но именно скачанный отсюда исходник вы будете загружать на другие ДНК-генеалогические и не только сайты, чтобы автоматика проанализировала эти нуклеотиды за вас и рассказала вам подробности словами и картинками. В частности, именно отсюда будет скачиваться файл для загрузки на GedMatch.

А теперь самая главная страница, к которой вы и будете обращаться чаще всего.
По последовательным кликам на 1-2-3 с предыдущей страницы можно попасть на страницу со списком совпаденцев.
Matches
Это результат сравнения вашего теста с другими тестами из этой же лаборатории.

В таблице показаны имя, дата установления совпадения, предполагаемое родство, длина всех общих сегментов, длина самого большого сегмента, наличие совпадений по половой Х-хромосоме, установленное родство (если оно установлено) и фамилии предков.
В поле 4 будут указаны наиболее часто встретившиеся фамилии. Если это Андерсены, Миллеры и Смиты, то не обольщайтесь, мало ли в Бразилии Педров (с). Если это представители одной семьи (протестировались сестра, брат и его дочка), то для каких-то выводов это тоже не пригодится. А вот если это три совершенно разных Кюхельбекера, то есть смысл поискать их общего предка, а от него уже искать возможную связь с вашим предком.
Работает поиск, для него отведено поле 5. Поиск находит не только фамилию человека, но и фамилии из списка его предков. Поиск срабатывает даже по нескольким буквам, это очень удобно для изменчивых фамилий или, например, для Прибалтики, где Кенекене и Кенекайте - это две больших разницы.

Столбец поля 6 показывает степень родства. Не забывайте, что:
кузен - это по определению двоюродный брат/сестра, поэтому
2th cousin , кузен второго уровня - это уже более далёкий кузен, по-нашему - троюродный брат.
К каждой следующей степени надо также прибавлять 1, т.е. 5th cousin - это шестиюродный брат.
Это расчёт по средним величинам. Он примерный! Точно можно говорить только о связи родитель-ребёнок, т.к. мы получили от мамы и папы по 50% ДНК. Мама тоже получила 50% своей ДНК от своей мамы, а 50% от своего папы. НО! Вам-то она не обязательно передала всё пропорционально. Может, эти 50% и вправду взяли ровно 25% дедушкиных генов и 25% бабушкиных. Чаще бывает 20% от одного предка и 30% от второго. А если мамин организм соригинальничал и передал вам всё то, что мама получила от бабушки, то в Вас будет всё тех же 50% генов от мамы, и при этом ни одного гена от дедушки. Такая вот математика. К счастью, так не бывает. почти всегда выдерживается коридор 20 на 30%. Но это с бабушкой. А представьте, что с прабабушкой?! От неё нам при среднем раскладе достаётся 12,5% генов. А от прапрабабушки - всего 6%. И по этой же прапрабабушке у вас будет родственник, какой-нибудь 3th cousin. Ему тоже могло перепасть от прабабушки 6%. А могло и не перепасть. А могло перепасть, и даже 6%, но ДРУГИХ!
Поэтому любые находки дальше 2-3 поколений находятся в области математической вероятности. Т.е. скорее всего так, но может быть и -1 поколение, и +15...

Для оценки этой величины учёные используют 2 параметра: длина участка в снипах и в сантиморганах.
Снип, он же SNP - это такой однонуклеотидный полиморфизм. Если хотите получить много удовольствия, почитайте Википедию:
https://ru.wikipedia.org/wiki/...0%B7%D0%BC
Если сказать человеческим языком, то это маленький участок ДНК, на котором у разных людей может быть отличие в 1 нуклеотид. Участки, которые у всех людей одинаковые и определяют, что мы - люди, а не казюльки, как я понимаю, не будут считаться снипами, т.к. тут отклонение невозможно. Точное понимание вам вряд ли потребуется, поэтому запомните просто, что снип - это кусочек хромосомы, где у разных людей может быть разное значение.
СантиМорган (сМ) - это вообще такая выдуманная и условная величина. Это вероятность. 1сМ - это 1% вероятности, что цепочка ДНК (в которой много-много снипов) у следующего поколения разделится, прервётся, или по-научному рекомбинируется. И вот есть у вас участок хромосомы длиной 1000 снипов. Он может стоять в таком месте хромосомы, которое вообще не склонно рекомбинировать. Такое вот устойчивое место. Тогда вероятность разрыва этой цепочки из 1000 снипов будет, например, 3 сМ. То есть этот кусочек мог дойти вам от пра(20 раз)прабабушки и ни разу не измениться. А мог измениться у прабабушки, дойти до вас и пойдёт дальше ещё 500 лет, не меняясь. Возможно, длина этого участка вообще 2000 снипов, но если он не склонен к рекомбинации, то всё остальное для генеалогии не имеет значения. Раз этот участок не меняется веками, то спрогнозировать на его основании, сколько поколений до общего предка, невозможно. А в другом, более изменчивом месте, участок с таким же количеством снипов может иметь вероятность рекомбинации 18%, и это как бы длина 18 сМ. Уже лучше.
Точно так же со снипами. Достался Вам участок в 300 снипов в месте с высокой склонностью к рекомбинации. Математика говорит, что с вероятностью 20% этот кусочек перемешается. И 20 сМ - красивая такая величина... Но в снипах-то она никудышная! Поэтому такой показатель тоже не может служить для прогнозирования родства.
В общем, я очень постаралась перевести с русского научного на русский человеческий. Переводила так, как поняла сама после чтения очень умных статей. Товарищи учёные, если что не так, поправляйте :-)
Впрочем, эти слова важнее для чтения и понимания, чем для непосредственного поиска родственников.

Столбцы 7, 8 и 9 рассказывают о подробностях совпадения ДНК.

Поле 7 показывает длину всех общих участков в сМ. ФТДНА - очень ответственная контора, поэтому покажут только тех, с кем совпадение от 19 сМ и более. ГедМатч, про который расскажу позже, цепляет даже самую мелочь, от 7 сМ.

Поле 8 показывает длину самого крупного общего участка. Тоже в сМ. Нужно понимать, что обозримое прошлое - это хотя бы от 20 сМ. Все мелкие фрагменты - это уже из области вероятности, т.к. они могли несколько поколений передаваться без изменений.

Оптимальный вариант - это когда и общих участков много, и самый большой из участков достаточно длинный.

Поле 9 отражает совпадение по Х-хромосоме. Если тестировался мужчина, такое совпадение однозначно показывает, что Х-хромосома - со стороны матери. Если тестировалась женщина, то такое обозначение всего лишь показывает, что родство не будет со стороны папиного папы, но может быть со стороны папиной мамы или любого из родителей мамы. Ещё одна фишка: не факт, что Х-хромосому и совпавший сегмент вы получили от одного родителя. Может быть, сегмент у вас от папы и на расстоянии 5 поколений, а совпадение Х-хромосомы - по маме, от совсем другого предка и удалено на поколений.

Ой, прям поэма!
Можно к Вам в друзья?
Или в возможные родственники, типа 5th cousin?

И вот, наконец-то, переходим к тому, что с этими данными можно делать-то вообще? Как их анализировать? Где обещанные родственники, находки и оправдание потраченным 99, 79 или 59 баксам?!!

Список можно просто читать.
Можно сравнивать фамилии, указанные в поле 10, где некоторые не пишут ничего, некоторые пишут имена и т.д.
Можно открывать деревья особо ответственных пользователей. Дерево находится в столбце Name и открывается щелчком по кнопке, напоминающей схему родового дерева. Если кнопка серого цвета, то щёлкать бесполезно, этот пользователь не внёс данные. Если кнопка голубая, то данные есть. Но они могут состоять из одного человека. Могут быть закрыты для посторонних. Могут содержать только те фамилии, которые вы уже видели в списке фамилий.

Когда у вас появляются мысли, идеи и предположения, можно осваивать прекрасную кнопку 1 - ХРОМОСОМНЫЙ БРАУЗЕР.
Он сравнивает ваши гены с генами людей, выбранных из списка. Одновременно можно сравнивать себя с 1-5 человеками.

Для примера - сравнение меня с двумя человеками из Польши, папой и дочкой.
Мои гены на схеме идут как фон, папины отмечены оранжевым, дочкины - голубым.

Моё совпадение с этими поляками находится на 15 хромосоме. Если навести мышку на цветную полоску, появятся математические подробности (длина участка и его координаты в хромосоме).

Чтобы было интереснее, я на месте, обозначенном цифрой 1, выбрала настройку "показать совпавшие участки длиной от 1 сантиМоргана". Теперь на 5, 11, 14 и других хромосомах появились интересные кусочки, которые у дочки со мной совпали, а у её папы - нет. Значит, эти кусочки - мамины, и мама тоже имеет славянские корни. Ни о каком реальном родстве при участке короче 7 сМ говорить нельзя, а вот при 7-8 участках от 3 сМ можно предполагать, что мы имеем предков из одного региона. Но 1000 лет назад :-) Так что настройка 1+сМ - это скорее побаловаться.

А вот вторая опция, которую я отметила на картинке, - это уже точные науки и выверенные данные. Нажатие этой кнопки выдаст вам экселевскую табличку, где будут расписаны координаты каждого совпадения генов с каждым вашим кузеном. Если вы пользуетесь экселем так же хорошо, как я, то будет очень удобно искать и проверять некоторые вещи. Если захотите узнать, с кем у вас совпал ген зеленоглазости или роста от 180 и выше, - это тоже удобнее находить здесь. Если гадаете, где границы между сегментами бабушки и дедушки в сегменте, который вы получили от мамы, - тоже анализируйте то, что здесь. Опять же, методом исключения пройдясь по определённой хромосоме, вы можете найти участки, которые у вас так уникальны, что пока не совпали ни с кем.
Но, скорее всего, вы не такие зануды, как я, и в этот файл не полезете. По крайней мере, не на начальном этапе...

Собственно, в хромосомном браузере всё просто, понятно и наглядно. Можно увидеть совпадения. Нужно помнить, что совпадения на центромере (перетяжечке хромосомы) не меняются веками, поэтому в прогнозировании родства ненадёжны. Если с кем-то совпал фрагментик хорошего размера - начинайте искать общего предка.

Теперь возвращаемся к нумерации кнопок предыдущей (беленькой, со списком людей) картинки и смотрим, как сразу найти группу людей, имеющих общего предка, и искать прямо со всей группой, а не с каким-то кузеном-одиночкой.

Понятно, что самый логичный вариант - это начать поиск по той линии, по которой есть какие-то идеи или зацепки. Как правило, это линия какого-либо очень близкого совпаденца, т.к. чем ближе, тем проще искать.

Если у Вас с кем-то сразу нашлось совпадение фамилии или хотя бы местности, то именно по этой фамилии и местности начинайте искать.

И подключите к поиску тех, у кого есть/предполагается такой же общий предок. Как это определить?
Воспользуйтесь кнопкой "In Common With" (поле 2 на белой картинке). Если вы поставите галочку на человеке, с которым предполагаете связь по определённой фамилии, и нажмёте эту кнопку, то ФТДНА выдаст список людей, которые являются вашими с этим человеком общими кузенами. Выделите людей в этом списке галочками - и проверьте их на хромосомном браузере. В первую очередь обратите внимание на тех, у кого с вами и со вторым человеком совпадает один и тот же участок ДНК. (Не у всех и не всегда он есть, но это уже тонкости, сами со временем увидите на примерах)

Если у вас есть еврейские корни, а хочется вычленить не-евреев, то можно воспользоваться соседней кнопкой: "не в родстве с".

С помощью всех этих функций вы можете вести поиск по данным ФТДНА. Я очень много переписывалась с людьми, сделавшими аутосомный тест. В общем, мне не попалось вообще никого, кто вот так, просто по данным с сайта взял и нашёл пятиюродного кузена. Были такие, кто подозревал родство и с помощью теста просто его подтвердил (у дворян так, несколько носителей фамилии и так считают себя потомками одного князя, а после теста просто убеждаются в этом).

А вот те несколько человек, которые сделали находки, делали их не по данным сайта. Они вели друг с другом активную переписку, а потом начали совместный поиск, обмен данными, чтобы идти к общему предку по двум разным веткам и в итоге "встретиться на середине сосиски". Они рассказывали друг другу, где хранятся те или иные документы по их сёлам. В поездках по архивам они искали для себя и для того парня. Ещё раз опросили всех возможных родственников. В общем, они рыли, копались и искали, а не сидели на попе ровно и не ждали, что молекула ДНК заговорит...

ФТДНА и с чем её едят. ГедМатч и "где у него кнопка".