Генетический проект "Пермская губерния"

Viki22 написал:

[q]

До gedmatch я ещё не добралась, что такое киты не поняла. Пошла своим путём. Все перечисленные фамилии поискала в древах своих Пермских совпаденцев.
Вот кто есть: Старковы, Устюжанин, Юрков, Трапезников, Шадрин.

[/q]

Кит это ссылка или номер генетического теста в базе данных лаборатории или агрегатора(gedmatch)
Можете пока занести информацию о своих фамилиях в таблицу, потом добавите тесты, как пройдете.

Тест сдала моя семья в Генотек. Но у моего отца только мать из Перми, HV9b . Так что китом он быть не сможет. Но как я выше писала, есть генетическая связь с некоторыми фамилиями из вашего списка. Как раз через Генотек и искала я их.

Viki22 написал:

[q]

Тест сдала моя семья в Генотек. Но у моего отца только мать из Перми, HV9b . Так что китом он быть не сможет. Но как я выше писала, есть генетическая связь с некоторыми фамилиями из вашего списка. Как раз через Генотек и искала я их.

[/q]

Пока в проекте упор на аутосомные тесты, обычно их сдают в первую очередь. Если тест сдавали Вы, то у вас на четверть пермская кровь. Соответственно, можно включить в проект, как минимум, девичью фамилию вашей бабушки. Может быть Вы знаете девичью фамилию Вашей прабабушки, если она из Пермской губернии, то ее тоже можно включить.

Результаты теста из Генотека можно выгрузить двумя способами - платным (рекомендация Генотека) и бесплатным(Генотек говорит, что часть данных при конвертации может потеряться/исказиться). В группе ВК есть видеоролик, как это можно сделать.

Друзья, всех приветствую. Через полгода существования группы сложилось определенное понимание как со всем этим работать. Сегодня хотел бы его здесь изложить.
Как правило, все начинается со сдачи аутосомного генетического теста(atDNA) в одной из лабораторий. По ссылке изложена основная информация про генеалогические генетические тесты: https://ru.wikipedia.org/wiki/Генеалогический_ДНК-тест
Вот основные лаборатории, где такие тесты делают: Ancestry, 23andMe, MyHeritige, FamilytreeDNA(FTDNA), Генотек. В связи с текущей ситуацией, для граждан России проще всего сдать тест в российской лаборатории Генотек. Стоимость такого теста в разных лабораториях от 3 до 10 тысяч рублей, включая почту в две стороны. Процесс сдачи генетического материала заключается или в его соскребании с внутренней поверхности щеки щеточкой или наполнении емкости слюной. Обе процедуры безболезненны.
После получения лабораторией ваших биоматериалов процесс анализа и подготовки отчета длится, в среднем, около месяца.
У большинства таких лабораторий есть своя база генетических "совпаденцев", у которых есть одинаковые цепочки ДНК, что, как правило, говорит о том, что они являются друг другу родственниками в каком-то колене.
Некоторые лаборатории в рамках одного теста могут также выдать информацию по митохондриальной ДНК(прямая женская линия) и Y-хромосоме(прямая мужская линия). Такие тесты позволяют найти "родственников", с которыми ваша линия разошлась много сотен или даже тысяч лет назад.
Многие лаборатории предоставляют инструменты для построения генеалогических деревьев, что делает более простым процесс нахождения общих родственников с вашими "совпаденцами" по аутосомному тесту.
Также существует агрегатор аутосомных тестов, который позволяет их загружать из разных лабораторий. Этот инструмент называется gedmatch.com. В настоящее время, он позволяет бесплатно загружать пять аутосомных тестов на один аккаунт и предоставляет набор инструментов для поиска и анализа "совпаденцев" по своей базе. Инструкция по загрузке результатов на Гедматч в группе есть.
Весь проект "Пермская губерния" построен на функционале Гедматч, который называется Ancestor Projects (Surname, Geographical, Historical Roots) или, если переводить литературно, проекты для людей с общими предками. Как правило, по аутосомным тестам можно определить, что есть общие предки где-то до 7-го поколения. Если у Вас есть информация, что ваши предки проживали на территории Пермской губернии до революции 1917 года или Вы достоверно этого не знаете, но хотите проверить есть ли у Вас общие предки с участниками проекта, то вы делаете заявку на вступление в проект, который называется "Descendants of residents of Perm province". Надо найти его в списке проектов и нажать кнопку "Join".
Мне на Гедматче приходит запрос на вступление в проект и я его одобряю. На Гедматч я захожу не каждый день, поэтому если хотите ускорить процесс, то напишете мне здесь в группе.
После вступления в проект Вам становится доступным функционал сравнивания своего теста(его еще называют кит) с тестами всех участников проекта. Сравнивание происходит с каждым участником проекта по каждой хромосоме. Вы можете указать нижнюю и верхнюю границу сравнивания в сантиморганах, а также упорядочить результаты по опциям. Я чаще всего пользуются упорядочиванием по началу совпадающего сегмента(Segment Start), а границы совпадений оставляю по умолчанию.
Если у Вас все получилось с загрузкой теста в Гедматч и вступлением в проект, то следующий этап это ввод предковых фамилий(по Пермской губернии) по каждому тесту(киту) в таблицу китов.
Таблица китов находится по ссылке:
https://vk.com/away.php?to=https://docs.google.com/sp..

Таблица заполняется следующим образом:
1. Номер генетического теста(кита) на Гедматч, если тест пока на Гедматч не загружен, то ничего не указываем.
2. Контактное лицо, с которым можно общаться по вопросам поиска общих предков по тесту.
3. Электронный адрес контактного лица. Т.к. таблица, по сути, находится в открытом доступе, то я заменяю символ @ в e-mail на другой псевдосимвол, чтобы у роботов не было возможности использовать e-mail'ы из файла для рассылки спама.
4. Предковая фамилия для теста, представители которой до 1917 года проживали на территории Пермской губернии. Можно указать несколько. Например - фамилия деда по матери, деда по отцу, прадеда по матери и т.д. Фамилии нужно указывать, которые имеют кровное родство с человеком, который сдавал тест, иначе вы вводите в заблуждение других участников
5. Y-гаплогруппа. Если Вы сдавали тест на определение y-гаплогрупы, то здесь ее можно указать для конкретной фамилии. Как правило, она указывается для одной фамилии из предковых.
6. mt-гаплогруппа. Если Вы сдавали тест на определение mt-гаплогрупы, то здесь ее можно указать для конкретной фамилий. Это гаплогруппа по прямой женской линии и она может быть указана для нескольких фамилий из предковых. Например - фамилия деда по матери, фамилия прадеда по бабке по матери и т.д.
7. Основные места проживания в Пермском крае. Я в этой колонке указываю те места, на которых предки с этой фамилией жили незадолго до революции 1917 года. Таких локаций может быть несколько.
8. Информация о наиболее раннем известном предке по этой фамилии. Можно указать ФИО, дату рождения и смерти, место(места) проживания.

Вот вроде бы пока и все. Если видите какие-то неточности - то пишите, будем совершенствовать инструкцию вместе

В настоящее время в проекте более 70 участников и более 170 предковых фамилий.

Новые фамилии с китами:
Давыдов
Губин
Пряженников
Юрлов