Наверх ##
30 июня 2009 21:23 30 июня 2009 21:24 javax написал: [q] Mich_Glitch
1.Как считать время до общего предка?[/q]
javax, я сейчас придерживаюсь того принципа, что для низких процентов (ниже 75) общее совпадение (Global Similarity) характеризует только популяционный фон. Заметьте, говорю не этно-популяционный, а именно популяционный. Вы заметили, у Chia есть кто-то совсем неродственный с почти 77%? То есть речь идет о сильной гомогенности китайской популяции из некого определенного региона. Поэтому я оставил на время всякие попытки оценивать время до общего предка по общему совпадению. javax написал: [q] 2. Почему бывает что процент совпадения выше, а синеньких полусовпадений не показывает? Вообще как интерпретировать эти проценты и голубые полоски? [/q]
2. УПСы (синенькие участки половинного совпадения) - это совпадающие участки хромосом. А общее совпадение показывает непродолжаемые (то есть выборочные) совпадения значений маркеров. Могут быть значительные УПСы и низкое общее совпадение. Пример: прадедушка негр у ирландского ребенка. Этот же ребенок может иметь высокое совпадение с ирландцами своего ареала, даже несмотря на темноту кожи и кучерявость черных волос, унаследованные от прадеда. | 