⮉

Загрузите GEDCOM-файл на ВГД   [х]
Всероссийское Генеалогическое Древо
На сайте ВГД собираются люди, увлеченные генеалогией, историей, геральдикой и т.д. Здесь вы найдете собеседников, экспертов, умелых помощников в поисках предков и родственников. Вам подскажут где искать документы о павших в боях и пропавших без вести, в какой архив обратиться при исследовании родословной своей семьи, помогут определить по старой фотографии принадлежность к воинским частям, ведомствам и чину. ВГД - поиск людей в прошлом, настоящем и будущем!
Раздел Генетическая генеалогия » ДНК-генеалогия
Вниз ⇊

ДНК-генеалогия

Генетические методы реконструкции родословного дерева

← Назад    Вперед →Страницы: ← Назад 1 2 3 4 5 ... 121 122 123 124  125 126 127 128 129 ... 462 463 464 465 466 467 Вперед →
Модераторы: Lesla, kbg_dnepr, Andrey Maslennikov
Mich_Glitch
Наверх   ## 21 октября 2008 0:05
Похоже и по мито- используется старая номенклатура:
102252526.jpg
Был я Н6а1, а стал Н6а*.
remsy

Москва
Сообщений: 112
На сайте с 2005 г.
Рейтинг: 32
Наверх   ## 21 октября 2008 0:11
[q]
Был я Н6а1, а стал Н6а*.
[/q]

Я уверен, что это из-за того, что они не делают FGS 101.gif мутации для H6a1 находятся в CR, а они видимо сделали HVS1+HVS2 вот и записали в H6a*
татиа

Москва
Сообщений: 2741
На сайте с 2006 г.
Рейтинг: 1284
Наверх   ## 21 октября 2008 0:13 21 октября 2008 0:22
Mich_Glitch, Ваше мнение, где мне этот тест делать?
---
Ищу Есковых, Панковых, Головиных, Горяйновых, Тишиных, Пахомовых
Громницких, Робаковских, Зеленских, Сакунов, Михно, Плошенко, Плохих, Ярмак
Остапенко, Братченко, Панкратьевых
ВСЕ МОИ И МОИХ ПРЕДКОВ ДАННЫЕ РАЗМЕЩЕНЫ НА САЙТЕ ВГД ДОБРОВОЛЬНО.
Mich_Glitch
Наверх   ## 21 октября 2008 0:15

remsy написал:
[q]
А что снипы они не показывают какие тестировали?
[/q]

Показывают.
Суммарный документ состоит из полумиллиона строк.
Например вот фрагмент из мито:

rs41531144 MT 217 T
i3002253 MT 222 C
i3002262 MT 223 T
i3002267 MT 225 G
i3000535 MT 226 T
i3000546 MT 227 A
rs41323649 MT 228 G
i3001447 MT 228 G
i3000561 MT 234 A
i4001195 MT 235 --
i3000578 MT 236 --
i3000585 MT 237 --
i4001196 MT 238 --
i3000595 MT 239 C
i3000603 MT 241 A
i3000612 MT 242 C
i4001318 MT 244 A

Закавыка в том, что я не знаю перевода из одной номенклатуры в другую
Как к примеру будет М205 из Y хромосомы?
Может Gontar подскажет? shok.gif Шучу, шучу...

Например, когда я знаю, что в мито у меня в 239 позиции С, то найти этого не составляет труда.
А вот CRS в качестве референтного образца они не приводят. То есть, я как бы имею FGS, но для того чтобы выдернуть все значения по отличиям, надо брать fasta файл для CRS и один за одним все снипы сравнивать. Все 16 с половиной тысяч!!!
Это, я скажу, будут помуторнее извлечения данных из соренсоновского заменителя. dntknw.gif
remsy

Москва
Сообщений: 112
На сайте с 2005 г.
Рейтинг: 32
Наверх   ## 21 октября 2008 0:21
[q]
Суммарный документ состоит из полумиллиона строк.
[/q]


Вообще - жесть... столько всего и за 3 недели!
remsy

Москва
Сообщений: 112
На сайте с 2005 г.
Рейтинг: 32
Наверх   ## 21 октября 2008 0:25

Mich_Glitch написал:
[q]

Как к примеру будет М205 из Y хромосомы?
[/q]


rs2032657 (position 14096903)
Mich_Glitch
Наверх   ## 21 октября 2008 0:26

remsy написал:
[q]
[q]
Был я Н6а1, а стал Н6а*.
[/q]


Я уверен, что это из-за того, что они не делают FGS мутации для H6a1 находятся в CR, а они видимо сделали HVS1+HVS2 вот и записали в H6a*
[/q]

Ну, как же не делают. Очень даже делают. Где-то 80% от мито- делают.
Беда в том, что большинство моих отличий от CRS в CR туда не попали.
А, например, в позиции 5302 имею значение С, а у 23andMe указано А:
rs28690990 MT 5294 G
i3002229 MT 5302 A
i3002231 MT 5320 A


remsy

Москва
Сообщений: 112
На сайте с 2005 г.
Рейтинг: 32
Наверх   ## 21 октября 2008 0:26

татиа написал:
[q]

Mich_Glitch, Ваше мнение, где мне этот тест делать?
[/q]

А какой тест, Татия? У вас mt-FGS! 101.gif
Mich_Glitch
Наверх   ## 21 октября 2008 0:30 21 октября 2008 0:35

татиа написал:
[q]
Mich_Glitch, Ваше мнение, где мне этот тест делать?
[/q]

Я бы пока вообще не советовал этот тест делать.
1) Дорого.
2) Мизерная база для сравнения.
3) Прекрасен для сравнительного анализа (читай, теста на установление родства) и хорош для медицинских нужд (об этом чуть позже).
Mich_Glitch
Наверх   ## 21 октября 2008 0:33

remsy написал:
[q]
Mich_Glitch написал:
[q]

Как к примеру будет М205 из Y хромосомы?
[/q]



rs2032657 (position 14096903)
[/q]


Есть такое:
...
rs2032656 Y 14096856 T
rs2032657 Y 14096903 A
rs17307070 Y 14099736 G
...
← Назад    Вперед →Страницы: ← Назад 1 2 3 4 5 ... 121 122 123 124  125 126 127 128 129 ... 462 463 464 465 466 467 Вперед →
Модераторы: Lesla, kbg_dnepr, Andrey Maslennikov

Изгнанные пользователи | Объединить тему | Разбить тему | Модерировать
Генеалогический форум » Генетическая генеалогия » ДНК-генеалогия » ДНК-генеалогия [тема №15931]
Вверх ⇈