ДНК и прочая генетика

Следующая "одноразовая" кнопка - это сравнение ДНК с конкретными древними образцами. Если про этнический состав рассказали в общем виде, то по кнопке 5 "Ancient Origins" покажут на карте совпадения с конкретными древними людьми (например, найденными в результате раскопок). В самом общем виде эта карта выглядит как метки + по щелчку на метку сбоку откроется предполагаемая история конкретной древней персоны. Подробнее о каждой персоне можно найти в поисковиках.

Кроме того, показывается состав в разрезе... Как бы это назвать, археологических культур, племенных миграций, групп по по роду занятий, что ли?.. В общем, мне достались охотники, земледельцы и немножко культур железного ("металлического", не знаю точно, может, это ближе и к бронзовому?..) века.

Видно, что 50% моих генов - это гены охотничьих племён, которые в течение веков плавно переместились из Египта в Европу. Даже не заходя в Беларусь...
Ещё 33% - это Сирия и Турция, условно аграрии :-) И хотя бульба - наше белорусское всё, но аграрии тоже обошли Беларусь стороной. Кто ж у нас тогда жил-то?

Как известно, если бы Колумб не открыл Америку, белорусов бы не было. (с) Потому что бульбы б им никто не привёз. ))) Поэтому правильно, что аграриям сюда ходить, если до привоза бульбы ещё тысячи лет!
Ходили сюда племена железного века.
Тоже, в общем, молодцы, потому что Беларусь - это такая прекрасная страна, где месторождений железа - с гулькин нос. Ну нету у нас гор, ущелий и прочих изгибов земной коры, хотя если поколупаться в болотах...

Впрочем, греет душу, что два известных месторождения железной руды в Беларуси находятся прямо под моими Баранивичами, да и стрелка миграции случайно нарисована через эту же точку, хотя племена, как вы поонимаете, шли широким фронтом, а не проторённой тропой по трассе М1...

Как я понимаю, пути миграции всем восточноевропейцам покажет примерно так же. Отличие будет только в расположении точечек совпадения ДНК с материалами раскопок, а также в процентном соотношении различных племён. Поэтому вряд ли в этот раздел кто-то будет заходить ежедневно и много над ним размышлять. Познавательно, но на один раз.

А теперь самая главная страница, к которой вы и будете обращаться чаще всего.
По последовательным кликам на 1-2-3 с предыдущей страницы можно попасть на страницу со списком совпаденцев.
Matches
Это результат сравнения вашего теста с другими тестами из этой же лаборатории.

В таблице показаны имя, дата установления совпадения, предполагаемое родство, длина всех общих сегментов, длина самого большого сегмента, наличие совпадений по половой Х-хромосоме, установленное родство (если оно установлено) и фамилии предков.
В поле 4 будут указаны наиболее часто встретившиеся фамилии. Если это Андерсены, Миллеры и Смиты, то не обольщайтесь, мало ли в Бразилии Педров (с). Если это представители одной семьи (протестировались сестра, брат и его дочка), то для каких-то выводов это тоже не пригодится. А вот если это три совершенно разных Кюхельбекера, то есть смысл поискать их общего предка, а от него уже искать возможную связь с вашим предком.
Работает поиск, для него отведено поле 5. Поиск находит не только фамилию человека, но и фамилии из списка его предков. Поиск срабатывает даже по нескольким буквам, это очень удобно для изменчивых фамилий или, например, для Прибалтики, где Кенекене и Кенекайте - это две больших разницы.

Столбец поля 6 показывает степень родства. Не забывайте, что:
кузен - это по определению двоюродный брат/сестра, поэтому
2th cousin , кузен второго уровня - это уже более далёкий кузен, по-нашему - троюродный брат.
К каждой следующей степени надо также прибавлять 1, т.е. 5th cousin - это шестиюродный брат.
Это расчёт по средним величинам. Он примерный! Точно можно говорить только о связи родитель-ребёнок, т.к. мы получили от мамы и папы по 50% ДНК. Мама тоже получила 50% своей ДНК от своей мамы, а 50% от своего папы. НО! Вам-то она не обязательно передала всё пропорционально. Может, эти 50% и вправду взяли ровно 25% дедушкиных генов и 25% бабушкиных. Чаще бывает 20% от одного предка и 30% от второго. А если мамин организм соригинальничал и передал вам всё то, что мама получила от бабушки, то в Вас будет всё тех же 50% генов от мамы, и при этом ни одного гена от дедушки. Такая вот математика. К счастью, так не бывает. почти всегда выдерживается коридор 20 на 30%. Но это с бабушкой. А представьте, что с прабабушкой?! От неё нам при среднем раскладе достаётся 12,5% генов. А от прапрабабушки - всего 6%. И по этой же прапрабабушке у вас будет родственник, какой-нибудь 3th cousin. Ему тоже могло перепасть от прабабушки 6%. А могло и не перепасть. А могло перепасть, и даже 6%, но ДРУГИХ!
Поэтому любые находки дальше 2-3 поколений находятся в области математической вероятности. Т.е. скорее всего так, но может быть и -1 поколение, и +15...

Для оценки этой величины учёные используют 2 параметра: длина участка в снипах и в сантиморганах.
Снип, он же SNP - это такой однонуклеотидный полиморфизм. Если хотите получить много удовольствия, почитайте Википедию:
https://ru.wikipedia.org/wiki/...0%B7%D0%BC
Если сказать человеческим языком, то это маленький участок ДНК, на котором у разных людей может быть отличие в 1 нуклеотид. Участки, которые у всех людей одинаковые и определяют, что мы - люди, а не казюльки, как я понимаю, не будут считаться снипами, т.к. тут отклонение невозможно. Точное понимание вам вряд ли потребуется, поэтому запомните просто, что снип - это кусочек хромосомы, где у разных людей может быть разное значение.
СантиМорган (сМ) - это вообще такая выдуманная и условная величина. Это вероятность. 1сМ - это 1% вероятности, что цепочка ДНК (в которой много-много снипов) у следующего поколения разделится, прервётся, или по-научному рекомбинируется. И вот есть у вас участок хромосомы длиной 1000 снипов. Он может стоять в таком месте хромосомы, которое вообще не склонно рекомбинировать. Такое вот устойчивое место. Тогда вероятность разрыва этой цепочки из 1000 снипов будет, например, 3 сМ. То есть этот кусочек мог дойти вам от пра(20 раз)прабабушки и ни разу не измениться. А мог измениться у прабабушки, дойти до вас и пойдёт дальше ещё 500 лет, не меняясь. Возможно, длина этого участка вообще 2000 снипов, но если он не склонен к рекомбинации, то всё остальное для генеалогии не имеет значения. Раз этот участок не меняется веками, то спрогнозировать на его основании, сколько поколений до общего предка, невозможно. А в другом, более изменчивом месте, участок с таким же количеством снипов может иметь вероятность рекомбинации 18%, и это как бы длина 18 сМ. Уже лучше.
Точно так же со снипами. Достался Вам участок в 300 снипов в месте с высокой склонностью к рекомбинации. Математика говорит, что с вероятностью 20% этот кусочек перемешается. И 20 сМ - красивая такая величина... Но в снипах-то она никудышная! Поэтому такой показатель тоже не может служить для прогнозирования родства.
В общем, я очень постаралась перевести с русского научного на русский человеческий. Переводила так, как поняла сама после чтения очень умных статей. Товарищи учёные, если что не так, поправляйте :-)
Впрочем, эти слова важнее для чтения и понимания, чем для непосредственного поиска родственников.

Ой, прям поэма!
Можно к Вам в друзья?
Или в возможные родственники, типа 5th cousin?

Понятно, что самый логичный вариант - это начать поиск по той линии, по которой есть какие-то идеи или зацепки. Как правило, это линия какого-либо очень близкого совпаденца, т.к. чем ближе, тем проще искать.

Если у Вас с кем-то сразу нашлось совпадение фамилии или хотя бы местности, то именно по этой фамилии и местности начинайте искать.

И подключите к поиску тех, у кого есть/предполагается такой же общий предок. Как это определить?
Воспользуйтесь кнопкой "In Common With" (поле 2 на белой картинке). Если вы поставите галочку на человеке, с которым предполагаете связь по определённой фамилии, и нажмёте эту кнопку, то ФТДНА выдаст список людей, которые являются вашими с этим человеком общими кузенами. Выделите людей в этом списке галочками - и проверьте их на хромосомном браузере. В первую очередь обратите внимание на тех, у кого с вами и со вторым человеком совпадает один и тот же участок ДНК. (Не у всех и не всегда он есть, но это уже тонкости, сами со временем увидите на примерах)

Если у вас есть еврейские корни, а хочется вычленить не-евреев, то можно воспользоваться соседней кнопкой: "не в родстве с".

С помощью всех этих функций вы можете вести поиск по данным ФТДНА. Я очень много переписывалась с людьми, сделавшими аутосомный тест. В общем, мне не попалось вообще никого, кто вот так, просто по данным с сайта взял и нашёл пятиюродного кузена. Были такие, кто подозревал родство и с помощью теста просто его подтвердил (у дворян так, несколько носителей фамилии и так считают себя потомками одного князя, а после теста просто убеждаются в этом).

А вот те несколько человек, которые сделали находки, делали их не по данным сайта. Они вели друг с другом активную переписку, а потом начали совместный поиск, обмен данными, чтобы идти к общему предку по двум разным веткам и в итоге "встретиться на середине сосиски". Они рассказывали друг другу, где хранятся те или иные документы по их сёлам. В поездках по архивам они искали для себя и для того парня. Ещё раз опросили всех возможных родственников. В общем, они рыли, копались и искали, а не сидели на попе ровно и не ждали, что молекула ДНК заговорит...

ФТДНА - очень ответственная контора, поэтому выдаёт в списке только тех, с кем совпало много сегментов.
Посмотреть список тех, с кем совпал только один сегмент 17 сМ, например, там никак нельзя.
Поэтому, когда получите результат ФТДНА, Вам прямая дорога на бесплатный вспомогательный сайт
https://www.gedmatch.com
Существование этого сайта снимает многие споры на тему "в какой лаборатории тестироваться". Если лаборатория выдаёт файл, который заливается на ГедМатч, то кузенов из других лабораторий, которые реально заинтересованы в поиске, вы на ГедМатче непременно найдёте. Мы все там!
Сайт тоже англоязычный. После регистрации вы найдёте там инструкцию по тому, где взять на сайте вашей лаборатории исходный файл и как залить его на ГедМатч.
Вашему тесту присвоят номер, состоящий из буквы и 6 цифр. Буква указывает на лабораторию, где выполнялось тестирование. Значения букв такие:
T или в старой версии F - ФТДНА. Если человек присылает вам свой номер с F, то во всю аналитику так его и вбивайте. Новые букву и цифры программа вычислит сама.
A - ancestry.com Сайт, на котором тотально тестировались мои европейские совпаденцы. Там можно зарегиться и внести какой-то минимум инфы, потому что иностранцы смогут тогда для сверки фамилий и мест давать вам доступ к своему древу.
M - 23andMe . Вот отсюда подтянется ещё некоторое количество русскоязычных.
Есть пара других букв, но они пока представлены минимальным количеством тестов.
Ваш номер программа порекомендует записать. Запишите, он ещё не раз пригодится для сверки на форумах. Но вообще на личной странице он будет виден, но не сверху, а слева посреди страницы.
Данные на сайте обрабатываются несколько дней после загрузки. Почти сразу станет доступна только опция сравнения 2 тестов между собой, и то если знаете номер второго теста.
А вот после обработки данных сформируется список всех совпаденцев.
В таком списке будет неимоверное количество людей, но вам всегда будет показывать только 2000 лучших результатов. Если вдруг захотите покопаться в левых списках, где до общего предка 30 поколений, а совпадение ДНК 6,6 сМ и мелковато по СНИПам, то ограничение легко обойти. Поменяйте сортировку. Например, включите сортировку по Autosomal по Gen не по возрастанию, а по убыванию. :-) Программа пофурычит и выдаст вам нижнюю часть списка.
Делать с ней особо нечего. Рекомендую разве что просмотреть фамилии, а также на всякий пожарный связаться с русскоязычными фигурантами. С ними хотя бы быстро и легко можно свериться.
Если же у какого-то человека вот этот минимальный сегмент совпал с вами и с кем-то ещё, вы всё равно увидите это в другом списке, про который я расскажу позже.