НОВОСТИ геногеографии, популяционной генетики, археологии

Вирусы неандертальцев обнаружены в ДНК современных людей

Учёные исследуют возможную связь между эндогенными ретровирусами, которые, поражая ДНК, становятся причиной множества современных болезней таких, как СПИД или рак.

Специалисты сравнили ДНК неандертальцев и другой группы древних людей, называемых денисовцами, с образцами генетического материала, полученными от страдающих онкологическими заболеваниями современных людей.

Исследователи нашли следы вирусов неандертальцев и денисовцев в современной ДНК, что повлекло за собой предположение об их возникновении от общих вирусов-предков более полумиллиона лет назад.

Неандертальцы сосуществовали с нашими предками на территории современной Европы в течение нескольких тысяч лет, но относились к другому человеческому подвиду. В конце концов, они вымерли около 30 тысяч лет назад. Учёные расшифровали геномы неандертальца и денисовца в 2010 году, а в 2012 году Джек Ленц (Jack Lenz) из Медицинского колледжа Альберта Эйнштейна в Нью-Йорке обнаружил в этих ДНК 14 генетических последовательностей эндогенных ретровирусов. Правда, его исследования не обнаружили ни одного совпадения с человеческими ретровирусами.

Теперь же команда исследователей из Оксфордского университета, проанализировав 67 геномов больных раком современных людей, обнаружила, что каждый из них содержал 7 ретровирусов, аналогичных найденным у людей древних. Учёные считают, что в человеческом геноме на самом деле содержатся все 14 разновидностей эндогенных ретровирусов.

Около 8% ДНК человека состоит из эндогенных ретровирусов, которые передаются из поколения в поколение. Они составляют 90% генома, называемого "мусорной" ДНК (такое название появилось из-за того, что эта часть генома не содержит никаких команд для создания белков).

"Я бы не стал списывать её в мусор лишь потому, что мы не знаем, что конкретно делает эта ДНК, – говорит доктор Гкикас Магиоркинис (Gkikas Magiorkinis) с факультета зоологии Оксфордского университета. – При определённых обстоятельствах два мусорных вируса в комплексе могут вызвать заболевание. Мы не единожды наблюдали подобное явление у животных. Например, эндогенные ретровирусы вызывают рак при активации бактерий у мышей с ослабленным иммунитетом".

Теперь команда Оксфордского университета планирует найти возможные связи между этими древними вирусами, принадлежащих к семейству HML2, и смертельными заболеваниями. По невыясненным до сих пор причинам, ВИЧ-инфицированные пациенты по статистике удивительно часто страдают и от всевозможных онкологических заболеваний. Вполне возможно, что некоторые из факторов риска передаются генетически и активируются совместно с HML2. Понимание этого механизма поможет разработать новые виды терапии заболеваний.

"Использование современных технологий секвенирования ДНК у трёхсот пациентов помогло нам увидеть, насколько широко распространены эти вирусы среди современного населения, – говорит соавтор исследования доктор Роберт Белшоу (Robert Belshaw) из Плимутского университета. – Мы знаем, что эти вирусы вызывают заболевания у других животных, а также что они находятся в активном состоянии в тканях, взятых у людей с заболеванием двигательного нейрона. Однако до сих пор не удалось найти однозначных доказательств того, что они способны провоцировать заболевания у человека. В течение ближайших пяти лет мы найдём ответ на этот вопрос".

В настоящее время команда учёных изучает, насколько широко распространены подобные ретровирусы среди современных людей, а также то, находятся ли они в постоянном состоянии активности.

Научная статья была опубликована в журнале Current Biology.

frato написал:

[q]

Власти США велели сервису ДНК-тестирования 23andMe приостановить деятельность.

[/q]

Там дальше есть ссылка на более полную новость.

В FDA компанию обвинили в продаже комплектов для сбора слюны без получения одобрение на распространение медицинских инструментов. В частности, в ведомстве обеспокоены возможными последствиями для здоровья клиентов 23andMe в случае ошибки при анализе генетической информации.

В компании уже заявили, что планируют обсудить этот вопрос с FDA и наладить долговременное сотрудничество.

23andMe стала первой в США компанией, предлагающей диагностику предрасположенности сразу к нескольким десяткам заболеваний. В связи с этим конкурирующие компании заявляют о недостаточной защищенности результатов исследований от ошибок.

Инбридинг как фактор человеческой эволюции

Взахлёб рассказывая о том, что едва ли не все виды Homo скрещивались друг с другом, мы как-то подзабыли о кровосмешении.

Начало не предвещало ничего хорошего. На протяжении тысячелетий наши предки жили маленькими изолированным популяциями, результатом чего становился отчаянный инбридинг, который одаривал людей букетом недугов. Кроме того, небольшие размеры популяций, видимо, служили барьером для развития сложных технологий.



В последнее время генетики активно читают ДНК древних людей и их давно вымерших родственников, и Дэвид Райх из Гарвардской медицинской школы (США) подвизается в первых рядах. Совсем недавно «КЛ» писала о том, что он секвенировал геномы неандертальцев и денисовцев с беспрецедентной точностью и пришёл к выводу о скрещивании последних с каким-то неидентифицированным видом Homo.

Оказывается, на той же конференции Королевского общества Великобритании профессор рассказал ещё об одном открытии. Г-н Райх утверждает, что оба вида (неандертальцы и денисовцы) демонстрируют признаки сильного инбридинга. «Древние популяции обладали низким генетическим разнообразием, ей-богу, чрезвычайно низким, — сказал он. — Одним из самых низких во всём животном царстве».

Один из неандертальцев, ДНК которого была выделена из кости пальца ноги, не обладал практически никакой вариабельностью на протяжении примерно одной восьмой генома: обе копии каждого гена были идентичны. Это свидетельствует о том, что родители данного индивида были очень близкими родственниками, чуть ли не братом и сестрой. И г-н Райх не первый, кто об этом говорит.

http://compulenta.computerra.r.../10010370/
http://www.newscientist.com/ar...pmIpSe3t1I

Удивительно!
Интересен и исторический аспект: новое исследование в чем-то повторяет эксперименты Ивана Петровича Павлова, в которых он дрессировал мышей, сопровождая еду звуком звонка. Павлов писал, что последующим поколениям требуется все меньше и меньше тренингов прежде чем они бросаются искать пищу услышав звонок.
Но в 20-м веке идея, что опыт может быть унаследован биологически, впала в немилость.
И вот - новый виток спирали!

gach написал:

[q]

Отсюда:
http://www.gazeta.ru/health/news/2013/12/01/n_5785065.shtml

[/q]

Здесь чуть подробнее: http://www.gazeta.ru/science/2013/12/02_a_5778657.shtml

И на английском: http://phenomena.nationalgeogr...igenetics/

Ученые "воскресили" древнейший геном человека возрастом 400 тысяч лет

Ученым удалось восстановить и прочитать митохондриальную ДНК - часть генома древнего человека из рода Homo возрастом в 400 тысяч лет, который обитал в испанской пещере Сима де лос Уэсос.
Скелет гейдельбергского человека, найденный в одной из пещер на севере Испании



Ученые восстановили древнейший на сегодня геном древнего человека из рода Homo возрастом в 400 тысяч лет, который обитал в испанской пещере Сима де лос Уэсос и приходился близким родственником "денисовцам", говорится в статье, опубликованной в журнале Nature.

"Тот факт, что митохондриальная ДНК жителя этой пещеры несет в себе следы денисовцев, а не неандертальцев, является крайне неожиданным, так как некоторые черты его скелета являются типично неандертальскими. Мы надеемся, что дальнейшее изучение этих останков поможет прояснить родственные связи между жителем пещеры, неандертальцами и денисовцами", — заявили Матиас Мейер и Хуан-Луис Арсуага из Института эволюционной антропологии в Лейпциге (Германия).

Мейер, Арсуага и их коллеги под руководством Сванте Паабо из Института эволюционной антропологии уже несколько лет работают над восстановлением древних геномов. Так, в 2009 году им удалось восстановить геном неандертальцев, в 2010 — денисовцев, а в 2012 году исследователи сравнили их геномы и опубликовали их "HD"-версии. Возраст этих геномов составляет около 30-38 тысяч лет.

В своей новой работе Паабо и его коллеги опробовали свои силы на более сложной задаче, останках предположительно гейдельбергского человека (Homo heidelbergensis), который умер примерно 400 тысяч лет назад. Это стало возможным благодаря новой методике секвенирования палеогеномов, разработанной Мейером еще в 2012 году при повторном "прочтении" ДНК денисовцев.

Ученым удалось восстановить и прочитать митохондриальную ДНК — часть генома человека, которая содержится в "энергостанциях" клеток. Сравнив ее с мтДНК денисовцев, неандертальцев и людей, ученые с удивлением обнаружили, что житель пещеры был гораздо ближе генетически к "алтайским" Homo, чем к неандертальцам. Учитывая большое расстояние между Алтаем и Испанией, данное открытие породило множество новых вопросов, ответы на которых Паабо и его коллеги планируют найти в своих следующих работах.

http://ria.ru/studies/20131204/981981980.html
http://www.nature.com/nature/j...12788.html