НОВОСТИ геногеографии, популяционной генетики, археологии

ДНК – эффективный метод хранения информации
Сэмюэл Джонсон английский критик в своё время назвал творения Шекспира «зеркальным отражением жизни». Наконец слова Барда переведены на базовый язык, который использует сама жизнь – специалисты записали на маленьких цепочках ДНК 154 сонета Шекспира.

Начиналось всё с беседы в пивной. Однажды европейские ученые Ник Голдман и Юэн Берни из института биоинформатики решили встретиться, дабы выпить пива и обговорить одну проблему.

Их учреждение собирает громадную базу генетической информации: много тысяч генов различных живых существ. Полученные данные, хранящиеся на потребляющих много электроэнергии жестких дисках, обходятся исследовательской структуре достаточно дорого.

Голдман объясняет - «Объемы информации, которые нам необходимо хранить, по сравнению с нашим бюджетом, по показателям растут».

Данная дилемма стоит перед большинством крупных компаний, архивы которых всё время расширяются. Однако решение было у специалистов прямо перед носом, и они ежедневно с ним работали.

Голдман говорит - «Мы, наконец, поняли, что ДНК – это весьма эффективный метод хранения информации».

ДНК является жестким диском природы, постоянной базой хранения генетической информации, которая записана химическим языком. В ДНК алфавите есть четверка нуклеотидов - всего четыре буквы, которые, как правило, обозначаются Т, Г, Ц и А.

От порядка расположения этих букв, зависит то, какие наши клетки получат инструкции. Приблизительно три млрд. этих букв составляют полную инструкцию нашего существования - геном человека. Данная информация имеется в любой клетке нашего организма. ДНК в миллионы раз меньше, нежели жесткий диск персонального компьютера.

Перед коллегами Голдмана и перед ним самим стоял вопрос, что необходимо сделать, чтобы вместо генетической информации ДНК смогла хранить цифровой файл.

Голдман вспоминает - «После второй порции пива мы начали делать наброски на салфетках и в итоге набросали некоторые задумки касательно того, как этого можно достичь».

Начало было положено при помощи текстового файла, который содержал один из Шекспировских сонетов. На базовом компьютерном языке он представлял собой последовательность единиц и нулей. При помощи простого шифра специалисты перевели эти единицы и нули в ДНК буквы.

После чего, то же самое они сделали с другими Шекспировскими сонетами, фотографией своего офиса и аудиозаписью «У меня есть мечта» (речь Мартина Лютера). Полученный код был послан в биотехнологическую организацию Агилент Течнологиес. Компания синтезировала ДНК и отправила ее обратно.

Голдман говорит - «Сначала я подумал, что они всё перепутали, так как я получил от них маленькие пробирки, которые вроде бы были пустыми».

Но ДНК на самом дне в пробирках все же обнаружилась – это были мельчайшие крупинки. Для прочтения сонеты, специалисты определили в ДНК последовательность нуклеотидов и обратно перекодировали результат на компьютерный язык. Абсолютно все файлы стопроцентно были целыми и ошибок не содержали.

Они присоединились к другим научным группам, которые экспериментируют с хранением данных в ДНК и опубликовали свои результаты. Ранее Джордж Черч генетик из Гарварда, один из авторов проекта «Геном человека», закодировал файл ХТМЛ своей новой книги в ДНК.

Метод Берни и Голдмана предусматривает, что для страховки от ошибок ДНК полоски должны повторяться и друг на друга накладываться. По их мнению, процесс записи без проблем можно будет запустить в огромных масштабах.

Если все, что когда-то написал человек собрать воедино – а это приблизительно 50 млрд. мегабайт текста, а затем ретранслировать всё это в ДНК, получившийся информативный носитель по весу будет меньше зернового батончика.

Голдман говорит - «Проблема не в том, чтобы в ДНК поместить большое количество информации, вопрос в том, что для этого нужны средства».

Агилент не говорит, сколько стоил ДНК синтез для данного проекта, однако, по исследовательским оценкам, речь идёт приблизительно о 12 тыс. 400 долларов за один мегабайт.

Голдман отмечает - «Подобное хранение информации на сегодня стоило бы весьма дорого – однако это только на сегодня».

Голдман со своими коллегами, которые решают проблемы ДНК, отлично знают, что стоимость ДНК синтеза сильно падает. По мнению научных работников, скорее всего, уже спустя десять лет крупные фирмы начнут считать, что хранить архив в качестве ДНК будет дешевле, нежели возиться с целым хранилищем жестких дисков.

http://ria.ru/science/20130205/921262483.html

МОСКВА, 5 фев — РИА Новости. Последние неандертальцы исчезли из Европы примерно 45 тысяч лет назад, а не 30 тысяч лет назад, как считалось ранее, что исключает возможность их контактов с предками современных европейцев, заявляют антропологи в статье, опубликованной в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

"Полученные нами данные позволяют говорить о перспективе ревизии пособий по истории эволюции человека. И хотя подобные предложения пока вызывают неприятие у некоторых ученых, идея об отсутствии контактов между кроманьонцами и неандертальцами продолжает обрастать аргументами", — заявил Хесус Хорда (Jesus Jorda) из Национального университета дистанционного образования в Мадриде (Испания).

Хорда и его коллеги пришли к такому выводу после повторной датировки челюстей и некоторых других останков неандертальцев, найденных в пещерах Харама-6 и Сафаррайя в центральной и южной Испании, которые считаются одними из нескольких последних прибежищ Homo neanderthalensis на территории Европы.

И еще ссылка на проект самой популярной в России гаплогруппы: http://www.familytreedna.com/public/r1a/default.aspx
Участников уже довольно много, есть карта предполагаемых путей миграции носителей субкладов.

пенелопа написал:

[q]

проект самой популярной в России гаплогруппы

[/q]

Восточные славяне (белорусы-русскиеукраинцы) там названы померанцами?

Матерью Тутанхамона могла быть Нефертити.

В 2005 году археологи, радиологи и генетики с помощью компьютерной томографии и генетического анализа показали, что отцом Тутанхамона следует считать Эхнатона, а матерью — не одну из его известных ныне жён, а одну из пяти сестёр. Какую именно — сказать трудно. Учитывая многочисленные врождённые дефекты Тутанхамона, в том числе деформированную ногу, слегка расщеплённое нёбо, умеренный сколиоз (искривление позвоночника), нетрудно поверить в то, что он был плодом инцеста, широко распространённого в царской семье.

Последующий анализ под надзором Захи Хавасса (главного на тот момент чиновника по египетским древностям), проведённый в 2010 году, подтвердил предположение об отцовстве Эхнатона. Тем не менее некоторые специалисты продолжают отвергать эту гипотезу, считая, что Тутанхамон заключил брак с Анхесенамон, дочерью Эхнатона, только для того, чтобы легитимизировать свои претензии на корону.

Марк Габольд, директор археологической экспедиции Университета Монпелье III им. Поля Валери (Франция) в Царском некрополе Эль-Амарны, пришёл к выводу, что данные о ДНК неверно истолкованы. По его словам, генетическая близость стала результатом браков между двоюродными братьями и сёстрами на протяжении трёх поколений. Именно поэтому ДНК отпрыска этого третьего поколения выглядит как ДНК дитяти брата и сестры. В действительности Тутанхамон, скорее всего, был плодом союза кузенов, и на эту роль больше всего подходят Эхнатон и Нефертити.

http://science.compulenta.ru/736270/?r1=yandex&r2=news