ДНК. Хромосома. Ген. Наследственность. Простыми словами.

После миграции аутосомного теста с https://www.myheritage.com/ на https://www.familytreedna.com/ и https://www.gedmatch.com/ можно посмотреть результаты.

MyHeritage

Я и отец.
Общие ДНК: 49,6% (3 513,7‎ cM)
Общие сегменты: 26
Наибольший сегмент: 284,3‎ cM

Я и мать.
Общие ДНК: 49,4% (3 505,0‎ cM)
Общие сегменты: 29
Наибольший сегмент: 284,3‎ cM

Gedmatch
One to Many (7cM min)

Я и мать.
Общие ДНК (autosomal): 3568.7
Наибольший сегмент: 151.8
Общие ДНК (X-DNA): 0
Наибольший сегмент: 0

Я и мать. .
Общие ДНК (autosomal): 3570 cM
Наибольший сегмент: 151.8 cM
Общие ДНК (X-DNA): 181.1 cM
Наибольший сегмент: 98.5 cM

Как видим на разных сайтах немного разные калькуляторы и цифры немного разнятся.

Бля примера, буду увеличивать на 1сМ минимальный совпадающий кусок, чтобы примерно понять динамику.
Gedmatch
One to one (7 cM min)
Я и мать.
Largest segment = 146.4 cM
Total Half-Match segments (HIR) 3555.1cM (99.132 Pct)
52 shared segments

One to one (8 cM min)
Я и мать.
Largest segment = 146.4 cM
Total Half-Match segments (HIR) 3548cM (98.935 Pct)
51 shared segments found for this comparison.

One to one (9 cM min)
Largest segment = 146.4 cM
Total Half-Match segments (HIR) 3539.5cM (98.696 Pct)
50 shared segments found for this comparison.

... без изменений

One to one (17 cM min)
Largest segment = 146.4 cM
Total Half-Match segments (HIR) 3491.9cM (97.37 Pct)
47 shared segments found for this comparison.

One to one (18 cM min)
Largest segment = 146.4 cM
Total Half-Match segments (HIR) 3474.3cM (96.878 Pct)
46 shared segments found for this comparison.

При сравнении своего теста ДНК с другими всегда работает правило, чем больше размер наибольшего(largest) куска, тем потенциально ближе родня.
Опять же, каждый сайт считает немного по своему алгоритму, но суть везде одинакова.

Например, на Gedmatch при сравнении моего аутосомного теста ДНК с другими получаем таблицу где есть колонки: (Autosomal) Total cM, Largest.

Если кусочки в совпадении маленькие, это может быть шум, а не совпадении. Есть таблица вероятности составленная каждой компанией в которой указаны вероятность ложного совпадения (шума) в зависимости от размера кусочка.
Пример чтения таблицы.
Компания FTDNA говорит,
что кусочек 6 сМ в 20% будет ложным совпадением(шумом),
а кусочек 10 сМ в 2% будет ложным совпадением (шумом).

Поэтому учитивать маленькие кусочки сМ имеет смысл только если есть документальное подтверждение родства.
Если в двух тестах совпадающие кусочки по 3-4-5 сМ, в большинстве случаев можно игнорировать такие совпадения и считать их шумом.

Близкородственные связи (Multiple relationships) это отдельная головная боль и требует большей квалификации при исследовании.
Приведу лишь самый простой случай близкородственной связи (для общего понимания вопроса).

Есть два типа двоюродных братьев:
Двоюродные братья - те, у кого только мамы являются родными сестрами ИЛИ только папы являются родными братьями.
"Двойные" двоюродные братья - те, у кого мамы являются родными сестрами И папы являются родными братьями.

1st Cousins (двоюродные братья) - имеют примерно 12,5% общего ДНК. Все совпадения ДНК будут только Нalf-match, т.е. только по одной из хромосом (одна от матери, вторая от отца). Потому что они связаны только по одному родителю!
Double 1st Cousins ("двойные" двоюродные братья) - имеют примерно 25% общего ДНК. Могут быть совпадения ДНК типа Full-Match, т.е. по двум хромосомам сразу (одна от матери, вторая от отца). Потому что они связаны как по матери так и по отцу!

В моих тестах и родословной таких связей не замечено, поэтому далее эту тему развивать не буду.

Далее, для более точного анализа, нужно использовать сравнения один-к-одному.
На Gedmatch есть возможность сравнить:
Free Tools -> One-to-One Autosomal DNA Comparison (сравнение один-к-одному по аутосомам)
Free Tools -> One-to-One X-DNA Comparison (сравнение один-к-одному по половой X-хромосоме)

Если идет сравнение с близкими родственниками, имеет смысл ставить опцию "Prevent Hard Breaks (default is to create hard breaks when distance between SNP's exceeds 500,000 base positions)"

Я сравнил свой тест с тестом матери и отца. Наглядно видно, что целая хромосома приходит от отца и целая хромосома приходит от матери.
На рисунке показан совмещенный рисунок обеих сравнений меня с матерью.
Синяя полоска означает совпадение с большой вероятностью.

Как было показано на рисунках ранее, при рождении сына и дочери им приходит разный набор половых хромосом. У девочки XX, мальчика XY.

Рассмотри половую X хромосому поподробнее.

Когда мы делаем аутосомный ДНК тест, то он также тестирует и X хромосому!
На Gedmatch есть возможность сравнить X хромосому из вашего набора:
Free Tools -> One-To-Many - Limited Version, выбрать Filter By: X (сравнить ваш набор со всеми наборами из базы Gedmatch)
Free Tools -> One-to-One X-DNA Comparison (сравнить ваш набор с конкретным одним набором)

Мой результат сравнения представлен на рисунке.
Проанализируем результаты.
У меня и моей матери по X хромосоме совпадение 181.1 сМ Total, 98.5 cМ Largest.
У меня и трех членов какой-то семьи по X хромосоме совпадение 22-30 сМ Total, 22-30 cМ Largest. Причем совпадения по Autosomal нет вообще!

Когда есть совпадение по X, но нет совпадения по аутосомным хромосомам - это означает, что связь достаточно далекая, в пределах 7-8 поколения, но дальше чем 3d cousin (четвероюродный). Т.е надо искать в пределах 5-6-7 юродного родства.
Но это еще не все подсказки, X хромосама наследуется определенным образом:
сын(XY) получает одну из Х хромосом (возможно рекомбинированную) от матери(XX).
дочь(XX) получает одну из Х хромосом (возможно рекомбинированную) от матери(XX) И одну нетронутую Х хромосому от отца(XY).
Есть два шаблона наследования X хромосам для девочек и мальчиков, построенные по вышеозначенному правилу.
(см. два рисунка шаблонов)

Т.е. мы можем построть веерный график своего дерева и дерева совпаденца и позначить те ветви откуда могла прийти X хромосома. Это значительно сузит поиск!

Совпадения по X хромосоме меньше 15 cМ можно считать шумом.

P.S.
They're likely to be from connections within the last 7 or 8 generations, although the absence of any autosomal matching suggests it's more distant than 3rd cousins (i.e. beyond 2nd great grandparents). Smaller X-chromosome matching segments (< 10cM) should be discounted except for the special case of a male-to-male match.

Females have two X-chromosomes and therefore strands of SNPs from both sides can be used to form matching segments to yourself. If any of them are male, then it is probably a real segment but possible a very distant connection.