ДНК-генеалогия

Vitaliy Savchuk
Описание как строть филогенетическое дерево по намору гаплотипов есть на форуме rodstvo.ru посмотрите там. Если не найдете - я попробую найти.
Строят не для себя, а дла большой группы - чтобы понять своё место в этой группе, понять как эта группа, когда и где возникла

Vitaliy Savchuk написал:

[q]

javax
Я себе сделал исследование по 67 маркерам. На самом сайт ТриДНА есть поиск, но мне сложно понять, какие там выставлять параметры поиска.

По поводу вашего опыта исследования, что значит строю дерево? как оно выглядит? с чем его сравнивать?

[/q]

javax написал:

[q]

Vitaliy Savchuk
Описание как строть филогенетическое дерево по намору гаплотипов есть на форуме rodstvo.ru посмотрите там. Если не найдете - я попробую найти.
Строят не для себя, а дла большой группы - чтобы понять своё место в этой группе, понять как эта группа, когда и где возникла

[/q]

Да, действительно, на родстве есть перепечатки инструкций от remsy, который был первопроходцем и объяснил остальным способ построения деревьев. И от Grigoriev, который потом метод разжевывал для широкой публики.
Ну, а с полной инструкцией самостоятельного построения деревьев для новичков, включая очень подробную иллюстрированную, можно ознакомиться тут (ссылка).

Mich_Glitch - спасибо за ссылку

Vadim Verenich - посадите лучше ее к себе на колени

Vadim Verenich написал:

[q]

Я подразумевал вот этот программный пакет - самое лучшое из того, с чем мне довелось поработать.

http://sourceforge.net/projects/phylomurka/

[/q]

Подтерждаю: ничего лучше на данный момент не найти.

Виталий Савчук, прислушайтесь к совету одного из лучших древостроителей- ув.Маугли . Правда понадобится некоторое время, чтобы выехать во все тонкости. Мурка требует от конечного пользователя много терпения и точного мышления.

От себя замечу: поскольку Вы только начинаете строить филогении, то у Вас может возникнуть соблазн рассматривать филогению как привычное генеалогу родословное древо, то есть пытатся подменить традиционную генеалогию ДНК-генеалогией. На самом деле при анализе с помощью методов ДНК-генеалогии "глубоких" тысячилетних родословных ирландских кланов, я на горьком примере убеждаюсь, что ДНК-генеалогическое древо и традиционное древо не могу заменить друг друга, так же как и ДНК генеалогия не заменит документальную генеалогию. Обычному генеалогу привычнее рассматривать структуру родственных связей в виде некоего графа (в математическом смысле этого слова) или древа, в то время как в ДНК-генеалогии нужно оперировать скорее понятием близким к понятию "ризомы". По сути Вы будете строить сети межди родственными кластерами (или как их обозначает химик Клесов - "облаками" гаплотпов), в которых уже с помощью заданных в программе параметров Вы сможете строить математические абстракты - так называемые "кратчайшие древа" между родственными гаплотипами кластера.



mouglley написал:

[q]

Vadim Verenich написал:

[q]

Я подразумевал вот этот программный пакет - самое лучшое из того, с чем мне довелось поработать.document.write('<a href="http://sourceforge.net/projects/phylomurka/" rel="nofollow" target=_blank>http://sourceforge.net/projects/phylomurka/</a>';http://sourceforge.net/projects/phylomurka/

[/q]

Подтерждаю: ничего лучше на данный момент не найти.

[/q]