Загрузите GEDCOM-файл на ВГД   [х]
Всероссийское Генеалогическое Древо
На сайте ВГД собираются люди, увлеченные генеалогией, историей, геральдикой и т.д. Здесь вы найдете собеседников, экспертов, умелых помощников в поисках предков и родственников. Вам подскажут где искать документы о павших в боях и пропавших без вести, в какой архив обратиться при исследовании родословной своей семьи, помогут определить по старой фотографии принадлежность к воинским частям, ведомствам и чину. ВГД - поиск людей в прошлом, настоящем и будущем!
Вниз ⇊

ДНК-генеалогия

Генетические методы реконструкции родословного дерева

← Назад    Вперед →Страницы: ← Назад 1 2 3 4 5 ... ... 462 463 464 465 466 * 467 Вперед →
Модераторы: Lesla, kbg_dnepr, Andrey Maslennikov
Nikita Hartschenberg

Nikita Hartschenberg

🇩🇪 München
Сообщений: 379
На сайте с 2022 г.
Рейтинг: 248
Воссоздание ДНК умершего предка на базе аутосомальных тестов его потомков.

Коллеги, у меня стоит задача найти место исхода на Кубань из Украины моего прадеда: Харченко Пантелей Трофимович, 1908 гр.
В условиях нулевой сохранности как метрик, так и записей ЗАГС в месте его проживания на Кубани с 1922 по 1965 год - ДНК генеалогия остается единственным путем для выхода на родовое гнездо.

Имея на руках нижеуказанный объем данных, задумал исследовать возможность создания искусственно скомбинированного нового набора данных аутосомальной ДНК, который будет содержать максимальное количество данных, относящихся именно к искомому человеку.
Наличие такого набора данных на руках, подгруженного в базы данных MyHeritage, GedMatch, etc - позволит выявить совпаденцев с максимально длинными общими цепочками ДНК = ближайших к прадеду потомков родственников из места, где он родился.

Что мы имеем на сегодняшний день?
  • BIG Y - тест по линии Харченко, гаплогруппа R-Y55469
  • Два аутосомальных теста внуков Харченко П. Т. по разным детям - Вера 1930, Алексей 1928 (обведены синим на фрагменте древа)
  • Два аутосомальных теста внуков Троян А.Г. по разным детям - Александр 1915, Нина 1931 (обведены фиолетовым на фрагменте древа) - сделанные с целью отсекать ДНК совпаденцев по ветке Троян-Нелины для проведения исследований по месту исхода/рождения Харченко П.Т.
  • Все тесты подгружены во все значимые базы данных ДНК (за исключением 23andMe)[/li]
  • За два года работы не обнаружено совпаденцев с длиной общей цепочки ДНК более 30 см, что мы можем отнести к родственникам Харченко П.Т.

screenshot_2025-05-11_at_14.37.26.png
Способ предполагаемого построения искуственного набора данных ДНК:

1. Взять аутосомальные анализы ДНК у 3 из 5 живых внуков Харченко П.Т., чтоб получить по набору ДНК от внука каждого из 5 детей прадеда.
2. Разместить их в базах данных MyHeritage, после чего:
- выделить в совпаденцах ДНК для этих внуков тех персоналий, кто имеют общие участки ДНК сразу с одним и более других внуков одновременно.
- удалим из выборки тех совпаденцев, у кого места проживания относятся к Кубани, а не Украине и имеют большое число совпаденцев там.
С очень высокой долей вероятности это родственники жены Харченко П.Т., Стасюк Елизаветы Михайловны 1906, коренной казачке с Кубани, а не его.
- триангулированные участки совпадающих ДНК - поместить в пространство данных новой искуственной ДНК
- участки ДНК от 6 см длиной, совпадающие у совпаденца с одним из внуков, но не совпадающие у другого для выделенной группы совпаденцев - также помещаем в пространство создаваемой искуственной ДНК.

На этом этапе у нас получится ДНК с подгруженными участками, относящимися только к Харченко П.Т., но с пустыми участками (см визуальный пример такой ДНК на фото из DNA Painter).
2025_may_dna_painter_profile_for_panteley_liza_(v._kharchenko_s._poddubniy).png
После этого переходим к шагам 3 и 4:
3. Заполняем пустые участки данными аутосомальных ДНК от внуков Харченко П.Г., исключая участки, которые относятся к ДНК родителю не по линии их деда Харченко П.Т.
4. Подгружаем получившийся искусственный образец raw data аутосомальной ДНК в базы базы данных MH, Генотек, GedMatch.
5. Внимательно изучаем родословную/места проживания предков - совпаденцев с этим ДНК профилем, имеющими 50+ см общей ДНК.
В случае успеха - выходим на точное место рождения моего деда.

[!] Готов выслушать Вашу критику такой модели выхода на результат.

[?] Позволю спросить Вас, знаете ли вы инструмент или специалиста, компанию, с помощью которых можно было бы синтезировать описанный искусственный ДНК профиль прадеда на основе данных из аутосомальных тестов его потомков
---
Исследую историю родов:
Харченко (станица Екатериновская, Кубань),
Нелины (х. Тимашевка, Кубань),
Архиповы (Семиречье, Туркестан и Оренбург),
Зачупейко (Острогожский уезд)
PedigreeResearcher

PedigreeResearcher

Сообщений: 3124
На сайте с 2020 г.
Рейтинг: 855
Есть такой метод реконструкции ДНК.
Называется фазирование.

Есть такая программа.
Называется Лазарус (встроена в платный Гедматч).
Вот описание.

Идея хорошая. А вот реализация, увы, никудышная. 2015 года. Слеплена на коленке.

*** Пытался реконструировать аутосомную ДНК отца. Несмотря на десятки использованных сэмплов, результат получился очевидно дрянным.
---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева. Помогите, кто знает. Спасибо.
Лайк (1)
PedigreeResearcher

PedigreeResearcher

Сообщений: 3124
На сайте с 2020 г.
Рейтинг: 855
Ой, какая прелесть!

Чирикал я в этой теме ещё 18 лет назад!!!

Под другим ником.
Будучи ещё поклонником Клёсова.
И лаборатория Соренсона была жива.

Эх...
Время птицей над нами мчится.
---
Ищу родителей (девичью фамилию) Ульяны Матвеевны, жены стольника Тимофея Ивановича Лихарева. Помогите, кто знает. Спасибо.
Лайк (1)
Nikita Hartschenberg

Nikita Hartschenberg

🇩🇪 München
Сообщений: 379
На сайте с 2022 г.
Рейтинг: 248
PedigreeResearcher
Интересно. Огромное спасибо.
Попробую сделать заход.
---
Исследую историю родов:
Харченко (станица Екатериновская, Кубань),
Нелины (х. Тимашевка, Кубань),
Архиповы (Семиречье, Туркестан и Оренбург),
Зачупейко (Острогожский уезд)
Darigar

Darigar

Москва
Сообщений: 223
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 357
>> Ответ на сообщение пользователя Nikita Hartschenberg от 11 мая 2025 16:41

При наличии достаточного количество родственных днк лучше использовать сайт
borlandgenetics.tools
для реконструкции днк предка.
можно бесплатно, но тогда надо изучать тему.
платно проще.
можно использовать наборы других пользователей. что удобно в случае если человек не хочет передавать свой файл.
Лайк (1)
Nikita Hartschenberg

Nikita Hartschenberg

🇩🇪 München
Сообщений: 379
На сайте с 2022 г.
Рейтинг: 248

Darigar написал:
[q]
для реконструкции днк предка.
[/q]

Огромное спасибо, новый сайт для меня.

Видео прослушал, вызывает доверие инструмент.
Бюджет есть.
Одно у меня не сложилось, фазированный ДНК предка нельзя скачать с сайта.
Он находит совпадения только внутри днк наборов пользователей сайта, я прав?
---
Исследую историю родов:
Харченко (станица Екатериновская, Кубань),
Нелины (х. Тимашевка, Кубань),
Архиповы (Семиречье, Туркестан и Оренбург),
Зачупейко (Острогожский уезд)
Nikita Hartschenberg

Nikita Hartschenberg

🇩🇪 München
Сообщений: 379
На сайте с 2022 г.
Рейтинг: 248

PedigreeResearcher написал:
[q]
Называется Лазарус (встроена в платный Гедматч).
[/q]

Михаил Иванович, похоже:
1) Инструмент Lazarus убрали с сайта
2) Он не давал возможности скачать Raw Data DNA с сайта GedMatch, а затем подгрузить ее в MyHeritage и/или Генотек, к примеру.
Не решает задумку до конца.

Но, спасибо за ссылки. Буду копать дальше!
---
Исследую историю родов:
Харченко (станица Екатериновская, Кубань),
Нелины (х. Тимашевка, Кубань),
Архиповы (Семиречье, Туркестан и Оренбург),
Зачупейко (Острогожский уезд)
Darigar

Darigar

Москва
Сообщений: 223
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 357

Nikita Hartschenberg написал:
[q]

фазированный ДНК предка нельзя скачать с сайта.
[/q]


если вы фазировали его на борланде, то можно скачивать и фазированный и сегментированный восстановленный и др.


Nikita Hartschenberg написал:
[q]

Он находит совпадения только внутри днк наборов пользователей сайта, я прав?
[/q]


на самом сайте да. но по моему можно загрузить результат и на гедмач. раньше можно было. правда если он слишком мал то 1 ко всем вам не дадут результатов. но 1 к 1 можно было сравнивать.
Лайк (1)
Darigar

Darigar

Москва
Сообщений: 223
На сайте с 2019 г.
Рейтинг: 357

Nikita Hartschenberg написал:
[q]


2) Он не давал возможности скачать Raw Data DNA с сайта GedMatch,
[/q]



по моему в начале то он как раз и давал. и кто то придумал днк людей копировать указывая только их днк как источник для лазаруса. после того как набор появлялся в учетке его можно было скачать.
Лайк (1)
romaf

Сообщений: 2741
На сайте с 2018 г.
Рейтинг: 11539
Уважаемые форумчане, может у кого есть код в FTDNA на май для загруженных сторонних тестов для разблокировки этнических данных, гаплогрупп и возможность сравнивать в другими участниками? Заранее благодарен.
---
GEDmatch YA5712222
← Назад    Вперед →Страницы: ← Назад 1 2 3 4 5 ... ... 462 463 464 465 466 * 467 Вперед →
Модераторы: Lesla, kbg_dnepr, Andrey Maslennikov

Вверх ⇈